BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | B6Ng01-275J16.b | B6Ng01-275J16.g |
ACC | GA076599 | GA076600 |
length | 828 | 1,127 |
definition | B6Ng01-275J16.b | B6Ng01-275J16.g |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (56,174,318 - 56,175,158) | (56,056,847 - 56,057,961) |
---|
sequence | gaattcacccagaccaatagaacagtatctattcctaccagtgaaactgg
gcaaccttgtaattcatgagacagcagagacagtacctgatagagtcctt
ccttggtaatagcaatcagtttgttactctcactttaacaaacaataaac
atacccatatctttaaaaacaaaactcttgaaactaccacacaactttca
gataatgtaatcatgtctcagaaagctgaaacgcttcaagaaactaaaca
atattcaatcttccttaaaaaatgtcaaacatgcaaagctacaaagcatg
attcataaaaaagaaaaaaacagcacctaatgccaatccataatttacac
aggcagatagatagatagatagatagatagacagacagacaaatagatgt
cattagaattgtattcccatgtgaaagataaaataaactaaactgaattt
ctagagactttaaggtgtatgtctataaatttgtgataatgtgagatcct
gagcctttgggactagaataaaataaaattatgaataaaaatggcaatct
aaatgatagtaattttatttgagaaggcgctcttaaggtctaaaccacca
accaaggagtacacatggagggacccatgactccagccgcatatgtagca
gaagatagctttgttgggtatcaatgggaggagaaactcttggtcccatg
aaggctcaatgaatgccccagtgaaggggggaattcaagggcgggaaggc
aagagtggatgggtaggcgtacaacctcatagaagcaagaggagggagag
tgggatagagggtttctggggaaagggg
| ctttttggttagcgcgaatttaaatttaggggggaaagatgaggctttgg
gcatctaagtggattgcttcaaaaacaaaaacagagcaaacaaattgtgt
cagataccttttactatataaacattacaattgctatgaggtgatcaaag
ggttattttagcccacacttgtgatattttgatccatgattaggtacctc
aggtatagaccatcaaagtggagaaggcaaagtgacagaagaatgagttg
gctggtcacagtgccttggtcacaaagcaaagagatgaattccactgctc
cgttcattgtctccttctattcagttgggccccagcctagagatgtccta
cccacattcgggtaaggctgtccctcttcagctaagcccttctgaaagca
ctttgaaagatgcattcaagccaggcgtggtggcgcatgcctttaatcct
agcacggctatacagagaaaccctgtctcaaaaaaccaaaaaaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaagaaagaaagatgcattcagaagtgtgtttccatggt
gattctaaatccattcaggttgacagattaatcatcacagctggtttgca
caaaaatgcagtgctctttcaagtctcaaactcttttgtctattcaggtg
ctatgctgtaaaaacatagctttctgtgctaaaaataaaaaggatacagg
acatgtaaagcaaagaaccttgttaactagtgggttattttgtttagcta
ctgaacacataaagaaaatatttcctggtaatgaacactatacagtgtcc
ttttattctcttgcagattttttttttggtatgtgtgtatccagttgaag
aagagacaattatgaacgaatgaacgtcagtgggctggaaaacaaaaaca
gcacagacagataaagtgagtggagtgggctgagtaggggaagcaaggta
gacattattcttatagaataaaaagggagacatttttagaagcagtgtct
atgtagtcaactgctgtctaaaactggcaattctctgcctcgacttcatg
tagcaaagaataatagtcccacagcacaggactgttagaacaattctttg
tgtgtgtgccatggttattggttatgt
|
quality values | Open.Hide.52 31 22 38 62 34 26 54 62 47 38 62 47 62 41 42 62 62 62 62 54 62 51 47 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 59 59 59 62 62 59 62 62 62
62 59 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 59 59 59 62 62 62 59 62 62 42 42 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 59 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 49 49 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 54 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 56 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 58 58 58 58 58 58 58 58 54 58 58 58
58 58 54 58 58 58 58 58 58 58 58 54 46 58 58 58 58 58 54 54 58 58 58 58 54 58 58 58 58 58 58 58 58 58 58 58 58 58 58 49 44 54 58 58 54 58 58 58 58 54
58 58 58 58 58 58 50 58 58 58 58 58 45 58 58 58 51 58 58 58 58 58 50 49 47 43 58 41 58 58 58 58 58 51 50 50 45 58 49 51 51 50 58 49 54 46 50 58 41 40
54 58 44 49 51 47 58 51 53 58 49 49 44 44 51 58 58 58 39 37 41 49 46 37 58 58 50 58 58 46 40 51 51 58 39 53 58 58 50 54 52 53 53 54 58 53 53 52 51 51
34 58 58 35 46 24 52 50 51 54 54 51 51 53 52 54 54 54 40 39 45 53 52 54 49 54 54 54 38 17 44 51 34 54 54 35 38 51 53 51 39 54 47 40 53 54 51 31 52 49
49 44 32 54 32 51 37 30 47 47 51 40 47 45 51 27 54 46 44 38 32 32 51 46 53 32 54 53 53 49 40 25 31 31 53 32 32 36 36 49 36 34 47 49 37 32 42 31 51 26
33 52 31 53 28 32 51 40 33 28 41 47 46 30 45 26 40 31 30 43 34 32 30 32 30 33 42 42 34 31 33 19 31 33 18 36 29 45 31 51 11 33 33 17 47 46 31 21 30 26
35 46 47 41 36 29 43 43 38 13 47 21 16 47 27 26 31 31 47 46 40 13 46 13 12 47 21 9 | Open.Hide. 5 3 3 3 3 4 4 11 5 6 4 5 5 8 8 9 5 5 4 4 8 7 7 5 7 6 7 7 8 17 31 41 39 22 40 46 31 15 23 12 10 18 35 41 43 47 56 32 43 46
47 51 35 31 37 39 32 39 31 31 44 44 38 36 35 20 50 49 51 59 49 56 59 56 59 59 49 51 59 56 49 56 43 49 59 46 59 59 38 48 50 38 50 51 59 59 59 59 59 59
59 46 36 54 54 50 56 51 56 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 49 54 59 62 54 54 62 59 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 59 59 59 62 59 59 59 59 59 59 59
62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 54 40 56 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59
62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 59 59 62 62 62 62 62 59 62 62 59 62 62 59 62 62 59 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 49 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 56 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 56 62 62 47 54 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 54 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 58 58 58 58 58 58 58 58 54 52 52 53 50 54 47 47 47 52 52 32 47 38 16 31 46 28 47 52 52 33 22 41 52 34 52 54 47 39 47 52 52 42 38 34 47 48 52 50
54 54 42 54 54 42 47 52 52 52 54 45 54 43 41 58 50 50 58 48 41 39 45 49 50 37 51 41 40 44 47 50 52 50 48 48 52 53 53 46 52 50 58 58 50 50 47 48 48 50
46 43 31 24 41 25 37 49 50 50 35 42 58 50 54 52 51 54 41 40 50 50 52 53 49 50 50 50 40 44 42 48 44 58 58 51 39 44 43 51 42 39 53 58 50 35 40 44 25 44
50 50 50 43 44 44 44 50 34 58 54 58 58 44 43 33 50 50 22 39 54 44 49 52 35 37 35 52 53 39 53 54 54 49 40 40 40 54 39 46 47 50 51 40 31 42 53 39 51 51
44 30 32 42 52 40 44 54 47 52 37 34 54 51 23 49 40 34 45 54 23 35 37 28 33 33 32 32 33 37 31 53 54 53 37 18 40 30 54 52 41 34 21 46 31 32 29 45 31 31
52 34 41 41 32 31 31 35 31 31 34 52 42 32 45 53 49 32 31 32 32 53 31 34 43 30 41 40 16 32 35 31 31 29 18 26 30 31 31 31 32 33 31 36 31 18 33 26 31 37
38 51 47 30 34 32 35 34 29 27 21 30 30 28 31 13 31 32 48 48 46 48 46 46 46 48 31 31 31 29 30 31 31 28 31 32 31 31 28 30 27 29 23 31 25 24 23 35 31 17
33 32 13 31 8 21 16 32 25 34 41 20 25 26 27 33 25 24 41 24 28 27 17 17 31 24 38 32 27 25 23 29 44 29 25 29 31 33 36 48 43 22 21 32 48 44 41 23 27 27
28 25 27 26 31 22 30 16 27 13 11 8 24 43 5 5 9 10 21 24 32 24 19 8 10 6 18 43 26 22 29 22 32 14 34 33 33 47 47 13 10 21 12 30 12 12 13 26 10 10
5 11 12 12 30 10 11 7 10 10 34 10 12 5 5 6 24 16 12 18 28 34 24 9 16 32 8 20 7 14 6 25 11 40 47 40 23 14 7 12 3 3 5 27 16 7 18 11 16 18
24 14 16 18 24 10 21 13 11 14 14 14 25 9 9 12 3 5 10 19 40 40 11 13 27 7 6 18 5 7 22 14 10 12 18 4 6 20 8 19 19 10 12 11 7 8 11 8 5 8
8 21 16 11 17 21 6 7 22 6 23 5 10 6 11 6 13 11 18 11 10 16 8 8 5 5 9 5 6 10 11 10 7 2 3 3 3 6 16 6 5 9 13 10 7 12 4 16 5 6
4 5 3 5 8 7 6 6 5 12 6 5 6 5 4 5 4 7 9 6 7 3 3 8 5 6 13 |