BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-301P03
Chromosome16 (Build37)
Map Location 28,266,685 - 28,418,134
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFgf12
Upstream geneOstn, Uts2d, Ccdc50
Downstream gene1600021P15Rik, EG666717, Hrasls, Atp13a5, Atp13a4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-301P03.bB6Ng01-301P03.g
ACCGA096127GA096128
length1,1481,105
definitionB6Ng01-301P03.b B6Ng01-301P03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,416,973 - 28,418,134)(28,266,685 - 28,267,797)
sequence
gaattccatgtattctagaaggcaggtattttattagtttcatagctttg
ctgatttatgaacagacttggacctttgaaagtgtcccttgtgttcttta
catttcttcctttattaccatcgtgtcagaaagacacaggcatttgtagt
gacatcttcctaagaagttatagattcatggcaaaacagagtagaaaata
cagaaaatttccaatatatcctctcccactcaaagagacaattctgacat
tttgggtttggtagtcctgtaaatagtttgtcattcatatatatatatat
acatctttaggaagtactgtagatgtgaattgcatggccctttggacatg
caggcatgtactattgaagatggataggaaatactcctgataccatagct
ttgggataataagtttaaaatcaaatgtcacaaatcactgttgttttctt
aaatcaaagtgtaaacttactagagaatacttcaaaagagatttctgcta
cagaaaattaactctcattccatcaccgatgtaacccaagcagatagtgt
ttataataggcagcctttaaattttcaatgtaaatggactaaactatttt
aactaaactatattaacctaaggtttagctatttagatttatggctgcaa
acatagttgagcttatatatttgagttttaagcagaagtactgtggtagt
taaaagggtctgactgacagctggtgaccttgaaatacatctcagaagtc
acttcttccatgtaggtgctccatgccctcacttgtgaaataagggtgtg
gaatagcagtaggtttctgataagtggtttgtagtcctctaggggaaata
cctatttaaatcagaatcttcctaagccacagagtagatgactgataata
cttttaagattaaagttcaggaacaaataactaaggggcttcctgctgcg
tctcaagatctttgcatagaaattggctctattactcttcagtgctgata
cttggatgggatctgatgggcatgcctgtgccctgtcttctggcatcttt
ctttcaatccgttttgacgtagtctcatagtggtgctgttgtaagacagc
aagtgtatggaacgttagtgatgatgaatccttgactgtaagaatgtg
gaattcctaggttgtgccgtgactgtggtactctttccccctaattaaga
atgctatcctttagatttgaaatgatatttaacaactcttgtcatgaagg
ctgatcttcagctgtgtgctattttgaggtaggagagcctccaggagcta
aggtcttagagctgggaagatggctcagcgattaaaagcatgtactgttc
ttgcaggggacacaagctgggtttccagaaatcacatcaggtagctaaca
actgcctatgcctcctgctccaggagatgtagtacctttttctaactttt
gcaggcaatgttctcacattgggacaaacccaaaccgatatacacataaa
tgaaagtaaaatcaaatttttgtaaacagatgcgtgacttaatgggaagt
cttatttgctgcgtcagatgaccataagccctgtcctcttcctctgactt
cacaagccagccatgaggtaagtggctctttgtcctttatgagtgcacac
agttcttcacaaccccacgccagcccctaagcaaaggggcgaaatgacca
tgtgttcaaagccacaaaattgctgagagtcaaaataaacttttcctctt
tatatggtgatatctcaggtattcaactccaaagccagaacacttccctg
gagagaattggaaatatttaatcaggcaataactgtgcactactctccac
taattgagtatttgctgggattcaatcccatgccagatggcatgtaaaga
gaatagaaagctgcactattgtggctctgctctcaagagctcacaggaac
ctcatacaggaagaggagggcttggtagaatgtgatttgggtccttctgt
ttagaccagtatccatgagaaacagtgagagtaatgaaggctgaagcagc
gagaaacgtagaggctcagagggtcttacaaactaactgatacacacatt
ggggctcctggaggtaagggtggcaagagtcttgcttcatggcactgtta
taccaaatagataaaagtggtgattatgagctataaagttgacttctcag
tttggagatgcacatgcatatccactcggctcattggatttcatacattg
gctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_28416973_28418134
seq2: B6Ng01-301P03.b_47_1194 (reverse)

seq1  CACATTCTAACAGTCAAAGTATCATCATTTCACCAACGTTTCATACACTT  50
      |||||||| |||||||| |  ||||||  |||| |||||| |||||||||
seq2  CACATTCTTACAGTCAAGGATTCATCA--TCACTAACGTTCCATACACTT  48

seq1  CCTGTCTTTAACAAACAGCA-CACTATGAGACTAATGTCAAAAAGGGATG  99
       |||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||| 
seq2  GCTGTCTT--AC-AACAGCACCACTATGAGACT-ACGTC-AAAACGGATT  93

seq1  GAAAGGAAAGATGCCAAGAAGGACAGGGGCACAGGCATGCCCATCAGATC  149
      |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAA-GAAAGATGCC-AGAA-GACA-GGGCACAGGCATGCCCATCAGATC  139

seq1  CCATCCAAGTATTCAGCAACTGAAAGAGTAATAGAGCCAATTTCTATGCA  199
      ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCAAGTA-TCAGC-ACTG-AAGAGTAATAGAGCCAATTTCTATGCA  186

seq1  AAGATCTTGAGACGCAGCAGGAAGCCCCTTAGTTATTTGTTCCTGAACTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCTTGAGACGCAGCAGGAAGCCCCTTAGTTATTTGTTCCTGAACTT  236

seq1  TAAATCTTAAAAGTATTATCAGTCATCTACTCTGTGGCTTAGGAAGATTC  299
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-AATCTTAAAAGTATTATCAGTCATCTACTCTGTGGCTTAGGAAGATTC  285

seq1  TGATTTAAATAGGTATTTCCCCTAGAGGACTACAAACCACTTATCAGAAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTAAATAGGTATTTCCCCTAGAGGACTACAAACCACTTATCAGAAA  335

seq1  CCTACTGCTATTCCACACCCTTATTTCACAAGTGAGGGCATGGAGCACCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTGCTATTCCACACCCTTATTTCACAAGTGAGGGCATGGAGCACCT  385

seq1  ACATGGAAGAAGTGACTTCTGAGATGTATTTCAAGGTCACCAGCTGTCAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGAAGAAGTGACTTCTGAGATGTATTTCAAGGTCACCAGCTGTCAG  435

seq1  TCAGACCCTTTTAACTACCACAGTACTTCTGCTTAAAACTCAAATATATA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACCCTTTTAACTACCACAGTACTTCTGCTTAAAACTCAAATATATA  485

seq1  AGCTCAACTATGTTTGCAGCCATAAATCTAAATAGCTAAACCTTAGGTTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAACTATGTTTGCAGCCATAAATCTAAATAGCTAAACCTTAGGTTA  535

seq1  ATATAGTTTAGTTAAAATAGTTTAGTCCATTTACATTGAAAATTTAAAGG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGTTTAGTTAAAATAGTTTAGTCCATTTACATTGAAAATTTAAAGG  585

seq1  CTGCCTATTATAAACACTATCTGCTTGGGTTACATCGGTGATGGAATGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTATTATAAACACTATCTGCTTGGGTTACATCGGTGATGGAATGAG  635

seq1  AGTTAATTTTCTGTAGCAGAAATCTCTTTTGAAGTATTCTCTAGTAAGTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAATTTTCTGTAGCAGAAATCTCTTTTGAAGTATTCTCTAGTAAGTT  685

seq1  TACACTTTGATTTAAGAAAACAACAGTGATTTGTGACATTTGATTTTAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTTGATTTAAGAAAACAACAGTGATTTGTGACATTTGATTTTAAA  735

seq1  CTTATTATCCCAAAGCTATGGTATCAGGAGTATTTCCTATCCATCTTCAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTATCCCAAAGCTATGGTATCAGGAGTATTTCCTATCCATCTTCAA  785

seq1  TAGTACATGCCTGCATGTCCAAAGGGCCATGCAATTCACATCTACAGTAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACATGCCTGCATGTCCAAAGGGCCATGCAATTCACATCTACAGTAC  835

seq1  TTCCTAAAGATGTATATATATATATATGAATGACAAACTATTTACAGGAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAAAGATGTATATATATATATATGAATGACAAACTATTTACAGGAC  885

seq1  TACCAAACCCAAAATGTCAGAATTGTCTCTTTGAGTGGGAGAGGATATAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAACCCAAAATGTCAGAATTGTCTCTTTGAGTGGGAGAGGATATAT  935

seq1  TGGAAATTTTCTGTATTTTCTACTCTGTTTTGCCATGAATCTATAACTTC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATTTTCTGTATTTTCTACTCTGTTTTGCCATGAATCTATAACTTC  985

seq1  TTAGGAAGATGTCACTACAAATGCCTGTGTCTTTCTGACACGATGGTAAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAGATGTCACTACAAATGCCTGTGTCTTTCTGACACGATGGTAAT  1035

seq1  AAAGGAAGAAATGTAAAGAACACAAGGGACACTTTCAAAGGTCCAAGTCT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAGAAATGTAAAGAACACAAGGGACACTTTCAAAGGTCCAAGTCT  1085

seq1  GTTCATAAATCAGCAAAGCTATGAAACTAATAAAATACCTGCCTTCTAGA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATAAATCAGCAAAGCTATGAAACTAATAAAATACCTGCCTTCTAGA  1135

seq1  ATACATGGAATTC  1162
      |||||||||||||
seq2  ATACATGGAATTC  1148

seq1: chr16_28266685_28267797
seq2: B6Ng01-301P03.g_65_1169

seq1  GAATTCCTAGGTTGTGCCGTGACTGTGGTACTCTTTCCCCCTAATTAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAGGTTGTGCCGTGACTGTGGTACTCTTTCCCCCTAATTAAGA  50

seq1  ATGCTATCCTTTAGATTTGAAATGATATTTAACAACTCTTGTCATGAAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTATCCTTTAGATTTGAAATGATATTTAACAACTCTTGTCATGAAGG  100

seq1  CTGATCTTCAGCTGTGTGCTATTTTGAGGTAGGAGAGCCTCCAGGAGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTTCAGCTGTGTGCTATTTTGAGGTAGGAGAGCCTCCAGGAGCTA  150

seq1  AGGTCTTAGAGCTGGGAAGATGGCTCAGCGATTAAAAGCATGTACTGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTAGAGCTGGGAAGATGGCTCAGCGATTAAAAGCATGTACTGTTC  200

seq1  TTGCAGGGGACACAAGCTGGGTTTCCAGAAATCACATCAGGTAGCTAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGGGACACAAGCTGGGTTTCCAGAAATCACATCAGGTAGCTAACA  250

seq1  ACTGCCTATGCCTCCTGCTCCAGGAGATGTAGTACCTTTTTCTAACTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCTATGCCTCCTGCTCCAGGAGATGTAGTACCTTTTTCTAACTTTT  300

seq1  GCAGGCAATGTTCTCACATTGGGACAAACCCAAACCGATATACACATAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCAATGTTCTCACATTGGGACAAACCCAAACCGATATACACATAAA  350

seq1  TGAAAGTAAAATCAAATTTTTGTAAACAGATGCGTGACTTAATGGGAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTAAAATCAAATTTTTGTAAACAGATGCGTGACTTAATGGGAAGT  400

seq1  CTTATTTGCTGCGTCAGATGACCATAAGCCCTGTCCTCTTCCTCTGACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTGCTGCGTCAGATGACCATAAGCCCTGTCCTCTTCCTCTGACTT  450

seq1  CACAAGCCAGCCATGAGGTAAGTGGCTCTTTGTCCTTTATGAGTGCACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGCCAGCCATGAGGTAAGTGGCTCTTTGTCCTTTATGAGTGCACAC  500

seq1  AGTTCTTCACAACCCCACGCCAGCCCCTAAGCAAAGGGGCGAAATGACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTTCACAACCCCACGCCAGCCCCTAAGCAAAGGGGCGAAATGACCA  550

seq1  TGTGTTCAAAGCCACAAAATTGCTGAGAGTCAAAATAAACTTTTCCTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTCAAAGCCACAAAATTGCTGAGAGTCAAAATAAACTTTTCCTCTT  600

seq1  TATATGGTGATATCTCAGGTATTCAACTCCAAAGCCAGAACACTTCCCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGGTGATATCTCAGGTATTCAACTCCAAAGCCAGAACACTTCCCTG  650

seq1  GAGAGAATTGGAAATATTTAATCAGGCAATAACTGTGCACTACTCTCCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAATTGGAAATATTTAATCAGGCAATAACTGTGCACTACTCTCCAC  700

seq1  TAATTGAGTATTTGCTGGGATTCAATCCCATGCCAGATGGCATGTAAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGAGTATTTGCTGGGATTCAATCCCATGCCAGATGGCATGTAAAGA  750

seq1  GAATAGAAAGCTGCACTATTGTGGCTCTGCTCTCAAGAGCTCACAGGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGAAAGCTGCACTATTGTGGCTCTGCTCTCAAGAGCTCACAGGAAC  800

seq1  CTCATACAGGAAGAGGAGGGCTTGGTAGAATGTGATTTGGGTCCTTCTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATACAGGAAGAGGAGGGCTTGGTAGAATGTGATTTGGGTCCTTCTGT  850

seq1  TTAGACCAGTATCCATGAGAAACAGTGAGAGTAATGAAGGCTGAAGCAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACCAGTATCCATGAGAAACAGTGAGAGTAATGAAGGCTGAAGCAGC  900

seq1  GAGAAACGTAGAGGCTCAGAGGGTCTTACAAACTAACTGATACACACATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACGTAGAGGCTCAGAGGGTCTTACAAACTAACTGATACACACATT  950

seq1  GGGGCTCCTGGAGGTAAGGGTGGCAAAGAGTTCTTGCTTCATGGCACTG-  999
      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| 
seq2  GGGGCTCCTGGAGGTAAGGGTGGC-AAGAG-TCTTGCTTCATGGCACTGT  998

seq1  TATACCAAAATAGATTAAAAGTTGTGATTATTGAGCTAATTAAAGTTTGA  1049
      |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||
seq2  TATACC-AAATAGA-TAAAAGTGGTGATTA-TGAGCTA--TAAAG-TTGA  1042

seq1  CTTCTCAGTTT-GAGATGCACATTGCATATCCACTCGGCTCATT-GATTT  1097
      ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTTCTCAGTTTGGAGATGCACA-TGCATATCCACTCGGCTCATTGGATTT  1091

seq1  CCAATACATTTGCTGG  1113
      |  ||||||| |||||
seq2  C--ATACATTGGCTGG  1105