BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302J10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 23,727,780 - 23,869,495
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043023
Upstream geneCrygs, Tbccd1, Dnajb11, Ahsg, Fetub, Hrg, Kng2, LOC624311, LOC666486, LOC666489, Kng1, LOC666493, Eif4a2, Rfc4, Adipoq, LOC100043541, EG625835, BC106179, St6gal1, Rtp1, Masp1, LOC100043018, Rtp4, EG625969
Downstream geneSst, Rtp2, Bcl6, EG433009, LOC666580, LOC100043564, 1110054M08Rik, Lpp, A730098P11Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302J10.bB6Ng01-302J10.g
ACCGA096599GA096600
length560803
definitionB6Ng01-302J10.b B6Ng01-302J10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,868,930 - 23,869,495)(23,727,780 - 23,728,446)
sequence
cagaacctgtaagcgagcacaaattgaatgtcgtcctttataagagtagc
cttggtcatggtgtctcttcacagcaatgaaaaccctaactaagacagtg
actgtccctttgaaattaatattgatcctccttccccctttaagataaaa
gtcttgttattctggtaggttggtcatgaactcagagctcaggtgatccc
ttgcctcaggcttctgaatagctgggattacacatatatgtcaccatatt
tgaatgttctacttttaagtaattgcatttgactataaagtttttgacac
attcatgcatgtataaaatgtattacaatcctattcacctcattactatc
tcttatcccccaattctgctgactccatttaattctcctcctttttatta
gttataggaattcacacctcttgtgggtctatgactatgcaaccatgcca
ggcccagaggacaatcttccacattgctccttcctcccctctgcgtcttc
caatgtctgtttcctgttctgcagtgattccattgtcccgtgggggtggg
ggtggaggag
gaattctttgacttaaatttccacatcagagggcaggaatctggaggcag
gaactgatgcagagtccatggaggagtgctgcttacttacccatctgatt
tgcttagcatgctttgttatagaacccaggaccaccagccccaggatgtg
ggttaaaaggtggttgactcatctgctcagagcttgggccactgggtgag
gtgggacacagacaggggagttttgactgctcattccccatgcagttgcc
aggcgtgcatcaagctgtgagaagccacagggctctgatccaggggtggg
gaagcacagtctgaagtccctgtgagttgggctcaggggtcagggacctg
cacagaggctgaggactgcaggttctcagactcttgggcaccacagacac
tgttggatgccgcagaagaactgagaatgaagcgccctcccccttaggct
ggatatagcctggggccaaagggaaaaggatgggaggagagatctggctg
gatttccttggcttgttcagtgggctgcttggcttggtggaatccatagc
tgggagtgcagagagacctcctgcgggagattagatgtgactctttagag
gaagtcttgctccattgttctccacatgggtcctaatgagaatttacagt
ccatggttttaaggtatttattgtcatggcagagagttgtaatgagtaaa
accatagccccctatctcaggacaggtctgaggctaaataccttttgtgg
ggaggagtgtctgggaaggggagcttaactagctaacccttcaggccttt
aga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_23868930_23869495
seq2: B6Ng01-302J10.b_47_612 (reverse)

seq1  CTCCTCCACCCCCACCCCCACGGGACAATGGAATCACTGCAGAACAGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCACCCCCACCCCCACGGGACAATGGAATCACTGCAGAACAGGAA  50

seq1  ACAGACATTGGAAGACGCAGAGGGGAGGAAGGAGCAATGTGGAAGATTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACATTGGAAGACGCAGAGGGGAGGAAGGAGCAATGTGGAAGATTGT  100

seq1  CCTCTGGGCCTGGCATGGTTGCATAGTCATAGACCCACAAGAGGTGTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGCCTGGCATGGTTGCATAGTCATAGACCCACAAGAGGTGTGAA  150

seq1  TTCCTATAACTAATAAAAAGGAGGAGAATTAAATGGAGTCAGCAGAATTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTATAACTAATAAAAAGGAGGAGAATTAAATGGAGTCAGCAGAATTG  200

seq1  GGGGATAAGAGATAGTAATGAGGTGAATAGGATTGTAATACATTTTATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATAAGAGATAGTAATGAGGTGAATAGGATTGTAATACATTTTATAC  250

seq1  ATGCATGAATGTGTCAAAAACTTTATAGTCAAATGCAATTACTTAAAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGAATGTGTCAAAAACTTTATAGTCAAATGCAATTACTTAAAAGT  300

seq1  AGAACATTCAAATATGGTGACATATATGTGTAATCCCAGCTATTCAGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACATTCAAATATGGTGACATATATGTGTAATCCCAGCTATTCAGAAG  350

seq1  CCTGAGGCAAGGGATCACCTGAGCTCTGAGTTCATGACCAACCTACCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGCAAGGGATCACCTGAGCTCTGAGTTCATGACCAACCTACCAGA  400

seq1  ATAACAAGACTTTTATCTTAAAGGGGGAAGGAGGATCAATATTAATTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAGACTTTTATCTTAAAGGGGGAAGGAGGATCAATATTAATTTCA  450

seq1  AAGGGACAGTCACTGTCTTAGTTAGGGTTTTCATTGCTGTGAAGAGACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGACAGTCACTGTCTTAGTTAGGGTTTTCATTGCTGTGAAGAGACAC  500

seq1  CATGACCAAGGCTACTCTTATAAAGGACGACATTCAATTTGTGCTCGCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACCAAGGCTACTCTTATAAAGGACGACATTCAATTTGTGCTCGCTT  550

seq1  ACAGGTTCTGGAATTC  566
      ||||||||||||||||
seq2  ACAGGTTCTGGAATTC  566

seq1: chr16_23727780_23728446
seq2: B6Ng01-302J10.g_68_734

seq1  GAATTCTTTGACTTAAATTTCCACATCAGAGGGCAGGAATCTGGAGGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGACTTAAATTTCCACATCAGAGGGCAGGAATCTGGAGGCAG  50

seq1  GAACTGATGCAGAGTCCATGGAGGAGTGCTGCTTACTTACCCATCTGATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGATGCAGAGTCCATGGAGGAGTGCTGCTTACTTACCCATCTGATT  100

seq1  TGCTTAGCATGCTTTGTTATAGAACCCAGGACCACCAGCCCCAGGATGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGCATGCTTTGTTATAGAACCCAGGACCACCAGCCCCAGGATGTG  150

seq1  GGTTAAAAGGTGGTTGACTCATCTGCTCAGAGCTTGGGCCACTGGGTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAAAGGTGGTTGACTCATCTGCTCAGAGCTTGGGCCACTGGGTGAG  200

seq1  GTGGGACACAGACAGGGGAGTTTTGACTGCTCATTCCCCATGCAGTTGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGACACAGACAGGGGAGTTTTGACTGCTCATTCCCCATGCAGTTGCC  250

seq1  AGGCGTGCATCAAGCTGTGAGAAGCCACAGGGCTCTGATCCAGGGGTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGTGCATCAAGCTGTGAGAAGCCACAGGGCTCTGATCCAGGGGTGGG  300

seq1  GAAGCACAGTCTGAAGTCCCTGTGAGTTGGGCTCAGGGGTCAGGGACCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCACAGTCTGAAGTCCCTGTGAGTTGGGCTCAGGGGTCAGGGACCTG  350

seq1  CACAGAGGCTGAGGACTGCAGGTTCTCAGACTCTTGGGCACCACAGACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGGCTGAGGACTGCAGGTTCTCAGACTCTTGGGCACCACAGACAC  400

seq1  TGTTGGATGCCGCAGAAGAACTGAGAATGAAGCGCCCTCCCCCTTAGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGATGCCGCAGAAGAACTGAGAATGAAGCGCCCTCCCCCTTAGGCT  450

seq1  GGATATAGCCTGGGGCCAAAGGGAAAAGGATGGGAGGAGAGATCTGGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATAGCCTGGGGCCAAAGGGAAAAGGATGGGAGGAGAGATCTGGCTG  500

seq1  GATTTCCTTGGCTTGTTCAGTGGGCTGCTTGGCTTGGTGGAATCCATAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCCTTGGCTTGTTCAGTGGGCTGCTTGGCTTGGTGGAATCCATAGC  550

seq1  TGGGAGTGCAGAGAGACCTCCTGCGGGAGATTAGATGTGACTCTTTAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGTGCAGAGAGACCTCCTGCGGGAGATTAGATGTGACTCTTTAGAG  600

seq1  GAAGTCTTGCTCCATTGTTCTCCACATGGGTCCTAATGAGAATTTACAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCTTGCTCCATTGTTCTCCACATGGGTCCTAATGAGAATTTACAGT  650

seq1  CCATGGTTTTAAGGTAT  667
      |||||||||||||||||
seq2  CCATGGTTTTAAGGTAT  667