BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302P14
Chromosome16 (Build37)
Map Location 80,076,233 - 80,199,921
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePrss7, EG383172, 1700066C05Rik
Downstream geneLOC621365, LOC100039724
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302P14.bB6Ng01-302P14.g
ACCGA096888GA096889
length1,101768
definitionB6Ng01-302P14.b B6Ng01-302P14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,198,820 - 80,199,921)(80,076,233 - 80,076,998)
sequence
gaattcctgtcacattctctttctgtttctggattaggaatgcaaaatag
tcatagctcatactaatgtactttctctgatgtgggtacttctacacaat
catttattttcatatagaccataagtctgacaatttatttagggagactc
tttataagactatgccacttgggttggagagatggctctgtggttaagag
caccgactactcttccaaaggacatgagttcaaatcccagcaaccacatg
atggctcacaaccatccgtaatgagatctgacgccctcttctggggtgtc
tgaagacagctacagtggacaagtagggccagggtgagaagaaaaagtgt
cggaagacagctactgtgtacttacatataataaataaataaatctttta
aaaagactattctgcttatatcacatacataaaggtatacatttaaaacg
ataaaacaaatatggaaataaataaactgcatcattgttattgaattaga
aactaatgatctaagcaaataactactcatatgtaattacctgttactta
gaaaagatttacaataacaaaatccttagaatctgtgataaatgtgctag
aacatggtttccttagaaattacattggaggaagctggagagatggctca
gcagttaagagcattgacttctcttccaaaggtcctgagttcaaatccca
gcaaccacatggcagctcaccaccatccataatgtgatctgacaccctct
tctggtgtgtcagaagacagctacagtgtacttaataataataaataaat
ctttgggctggaacaagcagggccaacctaattgagcagaggtcctaaat
tcaattcccagcaactacataaaggctcacaatcatctctacagctacag
tatactcatatacacaaaataaataaaataaattaaaaaaaagaaattta
aattggactatgccatttgacatatatcaaacaggaaagatcttctatgt
aaaatatatgatattatcatctcatagaatcttgggtcagtattcacttt
ctagctttgtttcattaagcagagggagaaaaaagaacgtaattatattt
a
gaattcctgtcattgcttaggaggcatggattaaggtgcatgactgagca
tagttcaaggtgactactaatagtcattggaattacatgactagaaatgc
aaaagcagtgccccattctatgtaaaggtttgcacatgccttttaacact
gccaagtagaaattcatagggaaaagtaggttggggtttcgaaatttgga
agaatctattttctgttgatttgctaagcagcttcttttagaaagtaatt
ccactttcttcttttataaacatagacccatggtatcattagaattgcat
acctataataacgtggatgctgcttataaacctaactcataattcagaaa
aacttgcaagcattctaaggctttattcagaaggagaagaaaagtgcaaa
ggcaagaaaatggaggggtagggattaagggggaaagccagagggagggg
gtgttgagacagagacagacagagacaggaagacacacagagacatatag
agatacggacacacatacatacacacacacacacacatgcatgcagagag
agacagagagagaaaggtacatggagagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagacagacagacaaaaagacagagacatagagag
agacagacacatatacacacatacacctccacaggcatgcagagagagac
agaaagagatagacatgcacacaggtgcagagagagagagagagagagag
agagagatccagagagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_80198820_80199921
seq2: B6Ng01-302P14.b_46_1146 (reverse)

seq1  TAAATATAATTAATGTC-TTTTTCTCCCTCTGGTTTTATGAAAACAAAGC  49
      ||||||||||||   || ||||||||||||| | || ||| |||||||||
seq2  TAAATATAATTACGTTCTTTTTTCTCCCTCT-GCTTAATG-AAACAAAGC  48

seq1  CAGAAAGTGAATTACTGACCCAAGATTCTATGAGATGATAATTATCATAT  99
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TAGAAAGTGAA-TACTGACCCAAGATTCTATGAGATGATAA-TATCATAT  96

seq1  ATTTTACATAGAAGATCTTTCCTGTTTGATATATGTCAAATGGCATAGTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACATAGAAGATCTTTCCTGTTTGATATATGTCAAATGGCATAGTC  146

seq1  CAATTT-AATTTC-TTTTTTTAATTTATTTTATTTATTTTGTGTATATGA  197
      |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTAAATTTCTTTTTTTTAATTTATTTTATTTATTTTGTGTATATGA  196

seq1  GTATACTGTAGCTGTAGAGATGATTGTGAGCCTTTATGTAGTTGCTGGGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACTGTAGCTGTAGAGATGATTGTGAGCCTTTATGTAGTTGCTGGGA  246

seq1  ATTGAATTTAGGACCTCTGCTCAATTAGGTTGGCCCTGCTTGTTCCAGCC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATTTAGGACCTCTGCTCAATTAGGTTGGCCCTGCTTGTTCCAGCC  296

seq1  CAAAGATTTATTTATTATTATTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCTGACACA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATTTATTTATTATTATTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCTGACACA  346

seq1  CCAGAAGAGGGTGTCAGATCACATTATGGATGGTGGTGAGCTGCCATGTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGAGGGTGTCAGATCACATTATGGATGGTGGTGAGCTGCCATGTG  396

seq1  GTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGAAGTCAATGCTCTTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGAAGTCAATGCTCTTA  446

seq1  ACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCTTCCTCCAATGTAATTTCTAAGGAAACC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCTTCCTCCAATGTAATTTCTAAGGAAACC  496

seq1  ATGTTCTAGCACATTTATCACAGATTCTAAGGATTTTGTTATTGTAAATC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCTAGCACATTTATCACAGATTCTAAGGATTTTGTTATTGTAAATC  546

seq1  TTTTCTAAGTAACAGGTAATTACATATGAGTAGTTATTTGCTTAGATCAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTAAGTAACAGGTAATTACATATGAGTAGTTATTTGCTTAGATCAT  596

seq1  TAGTTTCTAATTCAATAACAATGATGCAGTTTATTTATTTCCATATTTGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTCTAATTCAATAACAATGATGCAGTTTATTTATTTCCATATTTGT  646

seq1  TTTATCGTTTTAAATGTATACCTTTATGTATGTGATATAAGCAGAATAGT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCGTTTTAAATGTATACCTTTATGTATGTGATATAAGCAGAATAGT  696

seq1  CTTTTTAAAAGATTTATTTATTTATTATATGTAAGTACACAGTAGCTGTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAAAAGATTTATTTATTTATTATATGTAAGTACACAGTAGCTGTC  746

seq1  TTCCGACACTTTTTCTTCTCACCCTGGCCCTACTTGTCCACTGTAGCTGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGACACTTTTTCTTCTCACCCTGGCCCTACTTGTCCACTGTAGCTGT  796

seq1  CTTCAGACACCCCAGAAGAGGGCGTCAGATCTCATTACGGATGGTTGTGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGACACCCCAGAAGAGGGCGTCAGATCTCATTACGGATGGTTGTGA  846

seq1  GCCATCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCATGTCCTTTGGAAGAGTAGT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCATGTCCTTTGGAAGAGTAGT  896

seq1  CGGTGCTCTTAACCACAGAGCCATCTCTCCAACCCAAGTGGCATAGTCTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTGCTCTTAACCACAGAGCCATCTCTCCAACCCAAGTGGCATAGTCTT  946

seq1  ATAAAGAGTCTCCCTAAATAAATTGTCAGACTTATGGTCTATATGAAAAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAGTCTCCCTAAATAAATTGTCAGACTTATGGTCTATATGAAAAT  996

seq1  AAATGATTGTGTAGAAGTACCCACATCAGAGAAAGTACATTAGTATGAGC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATTGTGTAGAAGTACCCACATCAGAGAAAGTACATTAGTATGAGC  1046

seq1  TATGACTATTTTGCATTCCTAATCCAGAAACAGAAAGAGAATGTGACAGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACTATTTTGCATTCCTAATCCAGAAACAGAAAGAGAATGTGACAGG  1096

seq1  AATTC  1102
      |||||
seq2  AATTC  1101

seq1: chr16_80076233_80076998
seq2: B6Ng01-302P14.g_66_833

seq1  GAATTCCTGTCATTGCTTAGGAGGCATGGATTAAGGTGCATGACTGAGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTCATTGCTTAGGAGGCATGGATTAAGGTGCATGACTGAGCA  50

seq1  TAGTTCAAGGTGACTACTAATAGTCATTGGAATTACATGACTAGAAATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCAAGGTGACTACTAATAGTCATTGGAATTACATGACTAGAAATGC  100

seq1  AAAAGCAGTGCCCCATTCTATGTAAAGGTTTGCACATGCCTTTTAACACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAGTGCCCCATTCTATGTAAAGGTTTGCACATGCCTTTTAACACT  150

seq1  GCCAAGTAGAAATTCATAGGGAAAAGTAGGTTGGGGTTTCGAAATTTGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTAGAAATTCATAGGGAAAAGTAGGTTGGGGTTTCGAAATTTGGA  200

seq1  AGAATCTATTTTCTGTTGATTTGCTAAGCAGCTTCTTTTAGAAAGTAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCTATTTTCTGTTGATTTGCTAAGCAGCTTCTTTTAGAAAGTAATT  250

seq1  CCACTTTCTTCTTTTATAAACATAGACCCATGGTATCATTAGAATTGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTCTTCTTTTATAAACATAGACCCATGGTATCATTAGAATTGCAT  300

seq1  ACCTATAATAACGTGGATGCTGCTTATAAACCTAACTCATAATTCAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATAATAACGTGGATGCTGCTTATAAACCTAACTCATAATTCAGAAA  350

seq1  AACTTGCAAGCATTCTAAGGCTTTATTCAGAAGGAGAAGAAAAGTGCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGCAAGCATTCTAAGGCTTTATTCAGAAGGAGAAGAAAAGTGCAAA  400

seq1  GGCAAGAAAATGGAGGGGTAGGGATTAAGGGGGAAAGCCAGAGGGAGGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGAAAATGGAGGGGTAGGGATTAAGGGGGAAAGCCAGAGGGAGGGG  450

seq1  GTGTTGAGACAGAGACAGACAGAGACAGGAAGACACACAGAGACATATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGAGACAGAGACAGACAGAGACAGGAAGACACACAGAGACATATAG  500

seq1  AGATACGGACACACATACATACACACACACACACACATGCATGCAGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACGGACACACATACATACACACACACACACACATGCATGCAGAGAG  550

seq1  AGACAGAGAGAGAAAGGTACATGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGAGAGAAAGGTACATGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  600

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAAAGACAAAAAGACAGAGACATAGAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGACAAAAAGACAGAGACATAGAGAG  650

seq1  AGACAGACACATATACACACATACACATCCACAGGCATGCAGAGAGAGAC  700
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGACACATATACACACATACACCTCCACAGGCATGCAGAGAGAGAC  700

seq1  AGAAAGAGATAGACATGCACACAGGTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAGATAGACATGCACACAGGTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  750

seq1  AGAGAGA--GAGAGAGAG  766
      |||||||   ||||||||
seq2  AGAGAGATCCAGAGAGAG  768