BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326J19
Chromosome16 (Build37)
Map Location 74,709,743 - 74,921,646
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRobo2
Downstream geneLOC665042, D930038D03Rik, Rbm11, Stch, LOC546667, Samsn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326J19.bB6Ng01-326J19.g
ACCGA114378GA114379
length1,1191,123
definitionB6Ng01-326J19.b B6Ng01-326J19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,920,527 - 74,921,646)(74,709,743 - 74,710,876)
sequence
gaattccagatgagaaaatcaaataaggatactgataagttttgagagat
tgtcaagtccacagctgggcatagacccaaatgaaatgaattgggatgca
tgcaatcccatctgagtctcagttctgagaggttccaaatccacccttgt
tttttgcagaaactgtttgcttgttgtggaatttacagatttacttacct
gttaaccatttataggagcagcaagtcctctgagctgcctttacagcatc
tatcatgccatctcatctgatttcttcaaagccattaaagaagatgaact
gcaccctgttatgacacagatttgtgcaacgcactataatcagaggaatg
ccacctcatcacatttgctacactatgctgttgaaagctagaaggggaca
cttgtagtaaatggcagggttggcaggatgataagaatcaagactcactg
gaggattctttattttctgtatgctgaaaaaaaggaaagtgtctgcaatc
aggtttctgaattgacttcagtttagcaataataatttgaaagtctgacc
aataggctctccagatgttcagtcagtaaagggcttgttatacgagtatg
aggacctgaacaggatcactaaaatccaggccatgatgtatgacctgtaa
tccagtgctgggaagacaatagacagatccatgagattagtggcttacta
ttcatgacagtgttgtgaatagtaaggtgggagtgagtgagagagagaca
tccaatgttgactcctggcctctatctcaaacacatattagtctacataa
tgagtggcaggatccaaaccacgcataaagcagaggtgaaggtgaccttg
gaggatgttatttcatatgagacttgtgattcttcttttcagtctcatca
gaggtattgacaactctgaatctctgtagttgtaaagccactctgccttt
tgtttcatgttgacaaatagaattgtgcccccttgcaacttgtgaagagt
cagggcaatgtttgagggacgcctaagaggacatgatcccaacagaaaga
accaaaggtcaactaacctggaccatagaggcttacagagactaaccaac
tacagagaacacccataga
gaattctgttacgtctccaacatcatgtctgcctacttgttaccctgctc
cctgccatggtggtaatgtactaaaactctaaaaaatgtaagcaagccac
aattaaatgctttcttttacaggactttctagggtcatgctgtctcttct
cagcaggagaacagtccctaagacaaaagtagctcctcatctcaagctct
tcccccatagatggaaaaatcatttctataagctagaaatacaacttatt
ggcagcgcacatgccttgcatctgcgagagaagagaaacaaataatagta
gtaataataatacttgatgatgatgaggaggaggaggaggaggataacca
cctaactggagctaacaggccaggatttaaggcaagatatcctggaggtt
aatattaagcacagtattgacattttattgtaaaccaccataaaaaaaac
ttctaaagggtattcctaggaagtaaatagacactggagtctcatggaag
aaaagggaagaacataaatacatacatacatacatacatacatacataca
tacatacatacgtaaatattatgttctgtgagtggcctttcttgtttctg
aggtagagtatatatcatagtgcatgctgggtgattggtttgccacttta
agaccttggtcacttcagagatcagcttcagtctggagaatctagaccat
ataccataaagtttgcacctttggatgaaggagaataggcttttctatga
atgggcagatcttggagaatatgatggagtataagcaaactcaaagctga
gaagacaatgaaagttaaaacatcccccacttgtttcagggaagttggta
tgtctggtacttctgccatgctgcctaggacgactgcctttcttactctc
tctttaagcttttttcctctcatgttttcctaatgggatgaaagctctcc
gttttccatatcaaggcttcatcatattttatgatatattattgtctctt
ctatgcttttccaccccaaagttcacttggttcttatggttacaggcctc
atgctctttattcagctcattctagtgaatcctcacctatttcgtctgga
atctgcacatactaacagtgtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_74920527_74921646
seq2: B6Ng01-326J19.b_52_1170 (reverse)

seq1  TCTATGGTTGTTCTCTGGTTGTTGGTTAAGTCTCTGTAAGCCTCTATGGG  50
      ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  TCTATGGGTGTTCTCT-GTAGTTGGTT-AGTCTCTGTAAGCCTCTAT-GG  47

seq1  TCCAGGTTAGTTGACTTTTGGTTCTTTCTGTTGGGATCCTGTCCTCTTA-  99
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TCCAGGTTAGTTGACCTTTGGTTCTTTCTGTTGGGATCATGTCCTCTTAG  97

seq1  GCGTCCCTCAAACATTGCCCTGACTCTTCCACAAGTTGCAAGGGGGCACA  149
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GCGTCCCTCAAACATTGCCCTGACTCTT-CACAAGTTGCAAGGGGGCACA  146

seq1  ATTCTATTTGTCAACATGAAAACAAAGGCAGAGTGGCTTTACAACTACAG  199
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATTTGTCAACATGAAACAAAAGGCAGAGTGGCTTTACAACTACAG  196

seq1  AGATTCAGAGTTGTCAATACCTCTGATGAGACTGAAA--GAGAATCACAA  247
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
seq2  AGATTCAGAGTTGTCAATACCTCTGATGAGACTGAAAAGAAGAATCACAA  246

seq1  GTCTCATATGAAATAACATCCTCCAAGGTCACCTTCACCTCTGCTTTATG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCATATGAAATAACATCCTCCAAGGTCACCTTCACCTCTGCTTTATG  296

seq1  CGTGGTTTGGATCCTGCCACTCATTATGTAGACTAATATGTGTTTGAGAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGTTTGGATCCTGCCACTCATTATGTAGACTAATATGTGTTTGAGAT  346

seq1  AGAGGCCAGGAGTCAACATTGGATGTCTCTCTCTCACTCACTCCCACCTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCCAGGAGTCAACATTGGATGTCTCTCTCTCACTCACTCCCACCTT  396

seq1  ACTATTCACAACACTGTCATGAATAGTAAGCCACTAATCTCATGGATCTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTCACAACACTGTCATGAATAGTAAGCCACTAATCTCATGGATCTG  446

seq1  TCTATTGTCTTCCCAGCACTGGATTACAGGTCATACATCATGGCCTGGAT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTGTCTTCCCAGCACTGGATTACAGGTCATACATCATGGCCTGGAT  496

seq1  TTTAGTGATCCTGTTCAGGTCCTCATACTCGTATAACAAGCCCTTTACTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGATCCTGTTCAGGTCCTCATACTCGTATAACAAGCCCTTTACTG  546

seq1  ACTGAACATCTGGAGAGCCTATTGGTCAGACTTTCAAATTATTATTGCTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACATCTGGAGAGCCTATTGGTCAGACTTTCAAATTATTATTGCTA  596

seq1  AACTGAAGTCAATTCAGAAACCTGATTGCAGACACTTTCCTTTTTTTCAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAAGTCAATTCAGAAACCTGATTGCAGACACTTTCCTTTTTTTCAG  646

seq1  CATACAGAAAATAAAGAATCCTCCAGTGAGTCTTGATTCTTATCATCCTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAGAAAATAAAGAATCCTCCAGTGAGTCTTGATTCTTATCATCCTG  696

seq1  CCAACCCTGCCATTTACTACAAGTGTCCCCTTCTAGCTTTCAACAGCATA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCCTGCCATTTACTACAAGTGTCCCCTTCTAGCTTTCAACAGCATA  746

seq1  GTGTAGCAAATGTGATGAGGTGGCATTCCTCTGATTATAGTGCGTTGCAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGCAAATGTGATGAGGTGGCATTCCTCTGATTATAGTGCGTTGCAC  796

seq1  AAATCTGTGTCATAACAGGGTGCAGTTCATCTTCTTTAATGGCTTTGAAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTGTGTCATAACAGGGTGCAGTTCATCTTCTTTAATGGCTTTGAAG  846

seq1  AAATCAGATGAGATGGCATGATAGATGCTGTAAAGGCAGCTCAGAGGACT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGATGAGATGGCATGATAGATGCTGTAAAGGCAGCTCAGAGGACT  896

seq1  TGCTGCTCCTATAAATGGTTAACAGGTAAGTAAATCTGTAAATTCCACAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTCCTATAAATGGTTAACAGGTAAGTAAATCTGTAAATTCCACAA  946

seq1  CAAGCAAACAGTTTCTGCAAAAAACAAGGGTGGATTTGGAACCTCTCAGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAACAGTTTCTGCAAAAAACAAGGGTGGATTTGGAACCTCTCAGA  996

seq1  ACTGAGACTCAGATGGGATTGCATGCATCCCAATTCATTTCATTTGGGTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGACTCAGATGGGATTGCATGCATCCCAATTCATTTCATTTGGGTC  1046

seq1  TATGCCCAGCTGTGGACTTGACAATCTCTCAAAACTTATCAGTATCCTTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCCAGCTGTGGACTTGACAATCTCTCAAAACTTATCAGTATCCTTA  1096

seq1  TTTGATTTTCTCATCTGGAATTC  1120
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTTTCTCATCTGGAATTC  1119

seq1: chr16_74709743_74710876
seq2: B6Ng01-326J19.g_65_1187

seq1  GAATTCTGTTACGTCTCCAACATCATGTCTGCCTACTTGTTACCCTGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTACGTCTCCAACATCATGTCTGCCTACTTGTTACCCTGCTC  50

seq1  CCTGCCATGGTGGTAATGTACTAAAACTCTAAAAAATGTAAGCAAGCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCATGGTGGTAATGTACTAAAACTCTAAAAAATGTAAGCAAGCCAC  100

seq1  AATTAAATGCTTTCTTTTACAGGACTTTCTAGGGTCATGCTGTCTCTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAATGCTTTCTTTTACAGGACTTTCTAGGGTCATGCTGTCTCTTCT  150

seq1  CAGCAGGAGAACAGTCCCTAAGACAAAAGTAGCTCCTCATCTCAAGCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGGAGAACAGTCCCTAAGACAAAAGTAGCTCCTCATCTCAAGCTCT  200

seq1  TCCCCCATAGATGGAAAAATCATTTCTATAAGCTAGAAATACAACTTATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCATAGATGGAAAAATCATTTCTATAAGCTAGAAATACAACTTATT  250

seq1  GGCAGCGCACATGCCTTGCATCTGCGAGAGAAGAGAAACAAATAATAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCGCACATGCCTTGCATCTGCGAGAGAAGAGAAACAAATAATAGTA  300

seq1  GTAATAATAATACTTGATGATGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAATAATACTTGATGATGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATAACCA  350

seq1  CCTAACTGGAGCTAACAGGCCAGGATTTAAGGCAAGATATCCTGGAGGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACTGGAGCTAACAGGCCAGGATTTAAGGCAAGATATCCTGGAGGTT  400

seq1  AATATTAAGCACAGTATTGACATTTTATTGTAAACCACCATAAAAAAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTAAGCACAGTATTGACATTTTATTGTAAACCACCATAAAAAAAAC  450

seq1  TTCTAAAGGGTATTCCTAGGAAGTAAATAGACACTGGAGTCTCATGGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAGGGTATTCCTAGGAAGTAAATAGACACTGGAGTCTCATGGAAG  500

seq1  AAAAGGGAAGAACATAAATACATACATACATACATACATACATACATACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGGAAGAACATAAATACATACATACATACATACATACATACATACA  550

seq1  TACATACATACGTAAATATTATGTTCTGTGAGTGGCCTTTCTTGTTTCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACATACGTAAATATTATGTTCTGTGAGTGGCCTTTCTTGTTTCTG  600

seq1  AGGTAGAGTATATATCATAGTGCATGCTGGGTGATTGGTTTGCCACTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGAGTATATATCATAGTGCATGCTGGGTGATTGGTTTGCCACTTTA  650

seq1  AGACCTTGGTCACTTCAGAGATCAGCTTCAGTCTGGAGAATCTAGACCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTTGGTCACTTCAGAGATCAGCTTCAGTCTGGAGAATCTAGACCAT  700

seq1  ATACCATAAAGTTTGCACCTTTGGATGAAGGAGAATAGGCTTTTCTATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATAAAGTTTGCACCTTTGGATGAAGGAGAATAGGCTTTTCTATGA  750

seq1  ATGGGCAGATCTTGGAGAATATGATGGAGTATAAGCAAACTCAAAGCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCAGATCTTGGAGAATATGATGGAGTATAAGCAAACTCAAAGCTGA  800

seq1  GAAGACAATGAAAGTTAAAACATCCCCCACTTGTTTCAGGGAAGTTGGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAATGAAAGTTAAAACATCCCCCACTTGTTTCAGGGAAGTTGGTA  850

seq1  TGTCTGGTACTTCTGCCATGCTGCCTAGGACGACTGCCTTTCTTACTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGGTACTTCTGCCATGCTGCCTAGGACGACTGCCTTTCTTACTCTC  900

seq1  TCTTTAAGC-TTTTTCCTCTCATGTTTTCCTAATGGGATGAAAGCTCTCC  949
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAGCTTTTTTCCTCTCATGTTTTCCTAATGGGATGAAAGCTCTCC  950

seq1  GTTTTCCCATATCAAGGCCTTCATCATAATTTTTATGATATAATTATTGT  999
      ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||
seq2  GTTTT-CCATATCAAGG-CTTCATCATA--TTTTATGATAT-ATTATTGT  995

seq1  CTCTTCTAATGCTTTTCCACCCCAAAGTTCAACCTTGG-TCCTATGGTTA  1048
      ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||
seq2  CTCTTCT-ATGCTTTTCCACCCCAAAGTTCA--CTTGGTTCTTATGGTTA  1042

seq1  CAAGGCTCATGCTCTTAATCAAGCTCATTCCTAAGGTGATTCCTCAACTA  1098
      || | ||||||||||| ||  |||||||| |||  |||| |||||| |||
seq2  CAGGCCTCATGCTCTTTATTCAGCTCATT-CTA--GTGAATCCTCACCTA  1089

seq1  TTCCCTTCTTGAATCTGCCACTATCTAACAGTGTCT  1134
      ||  | ||| ||||||| |||   ||||||||||||
seq2  TT-TCGTCTGGAATCTG-CACATACTAACAGTGTCT  1123