BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-330J10
Chromosome16 (Build37)
Map Location 32,093,450 - 32,125,620
singlet/doubletdoublet
Overlap genePigx, 1500031L02Rik
Upstream geneCentb2, Ppp1r2, Apod, 1700007E05Rik, Bdh1, Gm536, Dlg1, Mfi2, LOC677155, Pigz, 0610012G03Rik, Ncbp2, Senp5, Pak2
Downstream geneLrrc33, Bex6, Fbxo45, Wdr53, 2310010M20Rik, Rnf168, LOC666966, Ubxd7, Tm4sf19, 0610012D17Rik, Pcyt1a, Osta, Zdhhc19, LOC385820, Tfrc, Tnk2, ENSMUSG00000075265, LOC672302, Muc4, Muc20, 1700021K19Rik, Fyttd1, Lrch3, EG625660, Iqcg, Rpl35a, Lmln
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-330J10.bB6Ng01-330J10.g
ACCGA117207GA117208
length1,181983
definitionB6Ng01-330J10.b B6Ng01-330J10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,124,443 - 32,125,620)(32,093,450 - 32,094,429)
sequence
gaattctgggaaatagagaataaagagtctcatggagagacactgtaggg
agacactgaggaagaagtaggttgggactgaaggagcgatagctaaccat
gtggaagacatagaatagtttgaatgggttcaataacttatgagctactc
tgtgagcttaaggcaaagtcatctaattataaataattagtctcagagtc
gtcatttcaggactaaggggctaagagtagaaaaatggatttttttaaat
ggaccccccaacccccctcccccgtcttaagtgcctcccagatgggctgg
aattccccttcctgagttcccaaatcaaaggacatcaagcagagaggaca
gggctaaagaaagattagatgttactgagcataacaaagggaacagccca
cgggtttcttgatatcggtcaagtggtgttttagagaaatcgcttcgtca
gcccacccgcacatcctcaaacctgagggttacatgagacacggggtctt
ctgtgatttcagcggcatgagcctgaggcgcatcaacctttaggagcatg
cattcgttatttcagcttattttatgtgtgaacacacggaaatacccttg
attccttgcccttctgtgtttgccaaggaggaaatggccactcactcact
caggaaacatctacagttcccatctccagctctgtgccaagtgctgctta
gctctggggatacacacagcttggggctggggcttcctttgtttggtttt
cttattggttgtcacttataaatcctctctccttgtctgcatctctggtc
cctgcactgtttgactcctcagcatccttgagagccaagaactgacttgt
gctggctgaggtactctgtcgtatgtgggcaatagcagggaaggtgtgtg
tagtaatgtcgtccctcttctgtcccttgagatttcttaatcagtgaggt
ccccagagaggcgtcagtttctgttcctgtgtgatctgtgcatttgcttc
gtaatgtaacacagttgcctcttttttattttcggttccaaaggctgggt
tgaccagaacaccaaactgtcacagatttagtcatcacacagtaatctga
gttccagtctctctggatcataagaagttaaccattagcagtttatcctg
atatccggacagggccctcttcacccttaga
gaattcactctgtagaacaggctggcctccaattcacagagatctacctg
cctctgattaaagtgctgggattaaaggcaggcactactatccttggcta
aaataaacttctttaaaaattagtttaagccaggaggttatcttgaaaaa
caaaaataaaataaaaagttaattaattagttaattaattaaaataataa
taaaaattagtttaaaataggctacaaactgggggaagagggaacgtacc
tataatttctgctcttgggccaatgcagaaggatctctgaaactttaaac
ccagtttaggctatttggtgagatcttatctcaaaacaagccgaacaccg
acataaaataaggtgtgtaattgtcccagctctctgtccagaggcaaatt
ctggaccacagtgcagaggagacccaagtacagtatggtgctctgcttaa
gaaaatagcgaaacaggtcatgagagaccagagcggctggaagccacggc
attaagtccagaaaagagcttatattaaaattaaataaataaaatttaaa
aatccaaatagaaattcttggatgctaagatgaaagtccagaagcctgag
caaaaaagtgaccaaggagctgggaactaaagcattccaaaacttcattc
cagattagaaagcaatcgagttctgaccggtcaccacataaaacacaagc
attcagtacagaccccaacaggataagggcttagagaagttagcctcaaa
gtgaagacctccgtaactctgtactaaacaaacgaaaggttataggctca
atcggataaataaaagccttctctgacagcaggaagagcccaagagtctc
taaaggaagaaaacaagagctacaaacaacagcgctttgacagggtcaac
attcatcacacgctcctgaccatgtagagagtcaaaacatgaacaacagc
agaaaaataccaggtcccaccaggcgggtggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr16_32124443_32125620
seq2: B6Ng01-330J10.b_47_1227 (reverse)

seq1  TCTAAGGGTGAAGA-GGCCATGGTCTGGTATCAGGATAAACTGCTATTGT  49
      |||||||||||||| |||| ||  | | |||||||||||||||||| || 
seq2  TCTAAGGGTGAAGAGGGCCCTGTCCGGATATCAGGATAAACTGCTAATGG  50

seq1  TTAACTTCTTTATGATTCAGAGA-ACTTGGACTCAGATACCTGTGTGATG  98
      |||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||  ||||||||||
seq2  TTAACTTC-TTATGATCCAGAGAGACTGGAACTCAGATTACTGTGTGATG  99

seq1  ACTAAATCTGTGACAGTTTGGTGTTCTGTGTC-ACCCAG-CTTTGGAACC  146
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||
seq2  ACTAAATCTGTGACAGTTTGGTGTTCTG-GTCAACCCAGCCTTTGGAACC  148

seq1  GAAAAT-AAAAAGAGGCAACTGTGTTACATTACGAAGCAAATGCACAGAT  195
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATAAAAAAGAGGCAACTGTGTTACATTACGAAGCAAATGCACAGAT  198

seq1  CACACAGGAACAGAAACTGACGCCTCTCTGGGGACCTCACTGATTAAGAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGGAACAGAAACTGACGCCTCTCTGGGGACCTCACTGATTAAGAA  248

seq1  ATCTCAAGGGACAGAAGAGGGACGACATTACTACACACACCTTCCCTGCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAAGGGACAGAAGAGGGACGACATTACTACACACACCTTCCCTGCT  298

seq1  ATTGCCCACATACGACAGAGTACCTCAGCCAGCACAAGTCAGTTCTTGGC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCCACATACGACAGAGTACCTCAGCCAGCACAAGTCAGTTCTTGGC  348

seq1  TCTCAAGGATGCTGAGGAGTCAAACAGTGCAGGGACCAGAGATGCAGACA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGGATGCTGAGGAGTCAAACAGTGCAGGGACCAGAGATGCAGACA  398

seq1  AGGAGAGAGGATTTATAAGTGACAACCAATAAGAAAACCAAACAAAGGAA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAGAGGATTTATAAGTGACAACCAATAAGAAAACCAAACAAAGGAA  448

seq1  GCCCCAGCCCCAAGCTGTGTGTATCCCCAGAGCTAAGCAGCACTTGGCAC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAGCCCCAAGCTGTGTGTATCCCCAGAGCTAAGCAGCACTTGGCAC  498

seq1  AGAGCTGGAGATGGGAACTGTAGATGTTTCCTGAGTGAGTGAGTGGCCAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTGGAGATGGGAACTGTAGATGTTTCCTGAGTGAGTGAGTGGCCAT  548

seq1  TTCCTCCTTGGCAAACACAGAAGGGCAAGGAATCAAGGGTATTTCCGTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCTTGGCAAACACAGAAGGGCAAGGAATCAAGGGTATTTCCGTGT  598

seq1  GTTCACACATAAAATAAGCTGAAATAACGAATGCATGCTCCTAAAGGTTG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACACATAAAATAAGCTGAAATAACGAATGCATGCTCCTAAAGGTTG  648

seq1  ATGCGCCTCAGGCTCATGCCGCTGAAATCACAGAAGACCCCGTGTCTCAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCGCCTCAGGCTCATGCCGCTGAAATCACAGAAGACCCCGTGTCTCAT  698

seq1  GTAACCCTCAGGTTTGAGGATGTGCGGGTGGGCTGACGAAGCGATTTCTC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCCTCAGGTTTGAGGATGTGCGGGTGGGCTGACGAAGCGATTTCTC  748

seq1  TAAAACACCACTTGACCGATATCAAGAAACCCGTGGGCTGTTCCCTTTGT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACACCACTTGACCGATATCAAGAAACCCGTGGGCTGTTCCCTTTGT  798

seq1  TATGCTCAGTAACATCTAATCTTTCTTTAGCCCTGTCCTCTCTGCTTGAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTCAGTAACATCTAATCTTTCTTTAGCCCTGTCCTCTCTGCTTGAT  848

seq1  GTCCTTTGATTTGGGAACTCAGGAAGGGGAATTCCAGCCCATCTGGGAGG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTTGATTTGGGAACTCAGGAAGGGGAATTCCAGCCCATCTGGGAGG  898

seq1  CACTTAAGACGGGGGAGGGGGGTTGGGGGGTCCATTTAAAAAAATCCATT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAAGACGGGGGAGGGGGGTTGGGGGGTCCATTTAAAAAAATCCATT  948

seq1  TTTCTACTCTTAGCCCCTTAGTCCTGAAATGACGACTCTGAGACTAATTA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTACTCTTAGCCCCTTAGTCCTGAAATGACGACTCTGAGACTAATTA  998

seq1  TTTATAATTAGATGACTTTGCCTTAAGCTCACAGAGTAGCTCATAAGTTA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAATTAGATGACTTTGCCTTAAGCTCACAGAGTAGCTCATAAGTTA  1048

seq1  TTGAACCCATTCAAACTATTCTATGTCTTCCACATGGTTAGCTATCGCTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACCCATTCAAACTATTCTATGTCTTCCACATGGTTAGCTATCGCTC  1098

seq1  CTTCAGTCCCAACCTACTTCTTCCTCAGTGTCTCCCTACAGTGTCTCTCC  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTCCCAACCTACTTCTTCCTCAGTGTCTCCCTACAGTGTCTCTCC  1148

seq1  ATGAGACTCTTTATTCTCTATTTCCCAGAATTC  1178
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACTCTTTATTCTCTATTTCCCAGAATTC  1181

seq1: chr16_32093450_32094429
seq2: B6Ng01-330J10.g_67_1049

seq1  GAATTCACTCTGTAGAACAGGCTGGCCTCCAATTCACAGAGATCTACCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTAGAACAGGCTGGCCTCCAATTCACAGAGATCTACCTG  50

seq1  CCTCTGATTAAAGTGCTGGGATTAAAGGCAGGCACTACTATCCTTGGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGATTAAAGTGCTGGGATTAAAGGCAGGCACTACTATCCTTGGCTA  100

seq1  AAATAAACTTCTTTAAAAATTAGTTTAAGCCAGGAGGTTATCTTGAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAACTTCTTTAAAAATTAGTTTAAGCCAGGAGGTTATCTTGAAAAA  150

seq1  CAAAAATAAAATAAAAAGTTAATTAATTAGTTAATTAATTAAAATAATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATAAAATAAAAAGTTAATTAATTAGTTAATTAATTAAAATAATAA  200

seq1  TAAAAATTAGTTTAAAATAGGCTACAAACTGGGGGAAGAGGGAACGTACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATTAGTTTAAAATAGGCTACAAACTGGGGGAAGAGGGAACGTACC  250

seq1  TATAATTTCTGCTCTTGGGCCAATGCAGAAGGATCTCTGAAACTTTAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTTCTGCTCTTGGGCCAATGCAGAAGGATCTCTGAAACTTTAAAC  300

seq1  CCAGTTTAGGCTATTTGGTGAGATCTTATCTCAAAACAAGCCGAACACCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTTAGGCTATTTGGTGAGATCTTATCTCAAAACAAGCCGAACACCG  350

seq1  ACATAAAATAAGGTGTGTAATTGTCCCAGCTCTCTGTCCAGAGGCAAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAATAAGGTGTGTAATTGTCCCAGCTCTCTGTCCAGAGGCAAATT  400

seq1  CTGGACCACAGTGCAGAGGAGACCCAAGTACAGTATGGTGCTCTGCTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCACAGTGCAGAGGAGACCCAAGTACAGTATGGTGCTCTGCTTAA  450

seq1  GAAAATAGCGAAACAGGTCATGAGAGACCAGAGCGGCTGGAAGCCACGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATAGCGAAACAGGTCATGAGAGACCAGAGCGGCTGGAAGCCACGGC  500

seq1  ATTAAGTCCAGAAAAGAGCTTATATTAAAATTAAATAAATAAAATTTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGTCCAGAAAAGAGCTTATATTAAAATTAAATAAATAAAATTTAAA  550

seq1  AATCCAAATAGAAATTCTTGGATGCTAAGATGAAAGTCCAGAAGCCTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCAAATAGAAATTCTTGGATGCTAAGATGAAAGTCCAGAAGCCTGAG  600

seq1  CAAAAAAGTGACCAAGGAGCTGGGAACTAAAGCATTCCAAAACTTCATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAAGTGACCAAGGAGCTGGGAACTAAAGCATTCCAAAACTTCATTC  650

seq1  CAGATTAGAAAGCAATCGAGTTCTGACCGGTCACCACATAAAACACAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTAGAAAGCAATCGAGTTCTGACCGGTCACCACATAAAACACAAGC  700

seq1  ATTCAGTACAGACCCCAACAGGATAAGGGCTTAGAGAAGTTAGCCTCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTACAGACCCCAACAGGATAAGGGCTTAGAGAAGTTAGCCTCAAA  750

seq1  GTGAAGACCTCCGTAACTCTGTACTAAACAAACGAAAGGTTATAGGCTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGACCTCCGTAACTCTGTACTAAACAAACGAAAGGTTATAGGCTCA  800

seq1  ATCGGATAAATAAAAGCCTTCTCTGACAGCAGGAAGAGCCCAAGAGTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGGATAAATAAAAGCCTTCTCTGACAGCAGGAAGAGCCCAAGAGTCTC  850

seq1  TAAAGGAAGAAAACAAGAGCTACAAACAACAGCGCTTTGACAGGGTCAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGAAGAAAACAAGAGCTACAAACAACAGCGCTTTGACAGGGTCAAC  900

seq1  ATTCATCACACGCTCCTGACCATGTAGAGAGTCAAAACATGAACAACAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATCACACGCTCCTGACCATGTAGAGAGTCAAAACATGAACAACAGC  950

seq1  AAGAAAAATACCAG---TCACCAGGC-GGTGGTG  980
       |||||||||||||    |||||||| |||||||
seq2  -AGAAAAATACCAGGTCCCACCAGGCGGGTGGTG  983