seq1: chr18_4938788_4939944
seq2: B6Ng01-340F16.b_49_1195 (reverse)
seq1 CTCACATGTATGTGTATGTATATTCACAAGCCCTGGGAGAATGAATAGAG 50
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||
seq2 CTCACATGAATGTGTATGTATATTCACAAG-CCTTGGAG-ATGAATAGAG 48
seq1 TAGTTTTAGTTCACTCCGTCCTGGGCCCCATGATAG-ATATTTTGACAGC 99
||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2 TAGGTTTAGT--CCTCCGTC--TGGCCCCATGATAGAATATTTTGACAGC 94
seq1 AACTCTGTAGTGGAGCAGTAACTATTTGAGTAAATCATTGCAGAAGAGAA 149
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 AACTCTGTAGTGGAGCAGT-ACTATTTGAGTAAATCA-TGCAGAAGAGAA 142
seq1 AGGTGAACCTCAAATCGTCTTCCTTGACCCTGTGGGTGATCATTTGTTCT 199
| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
seq2 A-GTG-ACCTCAAATCGTCTCCCTTGACCCTGTGGGTGATCA-TTGTTCT 189
seq1 GTGAGGTTCCTCAGTGACTTAGGACAGCTCTTTGTATGTTGCCCTTTCAT 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAGGTTCCTCAGTGACTTAGGACAGCTCTTTGTATGTTGCCCTTTCAT 239
seq1 TATCGTGTATAAACACCATGCCAGGCATTTATACATGTGCGTGTTTATTT 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATCGTGTATAAACACCATGCCAGGCATTTATACATGTGCGTGTTTATTT 289
seq1 GCTCATGTGCACAGCTTATTGTAATGTGTATGAGGTGCAAGGGATGCAGT 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTCATGTGCACAGCTTATTGTAATGTGTATGAGGTGCAAGGGATGCAGT 339
seq1 GAGCTGGCCTAGTCCCCAGGGAGCTTTAGTCTAGAAAGGGACCAGGCATG 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGCTGGCCTAGTCCCCAGGGAGCTTTAGTCTAGAAAGGGACCAGGCATG 389
seq1 CAGCTAGGAAACACAGTTACATTCACGGGACACTCAGGGAGTAGCAATGG 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCTAGGAAACACAGTTACATTCACGGGACACTCAGGGAGTAGCAATGG 439
seq1 TGAAGAGCCTCTAGCCTGGCGCTCCCTGAGGACTTCGTAGAAGAGGTTCC 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAAGAGCCTCTAGCCTGGCGCTCCCTGAGGACTTCGTAGAAGAGGTTCC 489
seq1 CTGTAGGTTGGAATTGAAAGTTCGATGAGTTCGCACCCCTGGTGGGTGGC 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGTAGGTTGGAATTGAAAGTTCGATGAGTTCGCACCCCTGGTGGGTGGC 539
seq1 AACAAATATAAGAGTCCATGCTTGCCTCCACTCCCCCAAGCTGGGTTGAG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACAAATATAAGAGTCCATGCTTGCCTCCACTCCCCCAAGCTGGGTTGAG 589
seq1 GGCACCATGCCTGCTGCAGGAGGCTTGTCAGGATAGTGCTATGTTTTGTG 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCACCATGCCTGCTGCAGGAGGCTTGTCAGGATAGTGCTATGTTTTGTG 639
seq1 ATAGATTATTAAATCCCCAAAGGAATATTAGTAAGTGGTTGCAGCCTTTT 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAGATTATTAAATCCCCAAAGGAATATTAGTAAGTGGTTGCAGCCTTTT 689
seq1 AAACACGATTTCCTTATTTGATGAGTTTGTGTCCCATAATAAAGCCTTTT 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACACGATTTCCTTATTTGATGAGTTTGTGTCCCATAATAAAGCCTTTT 739
seq1 CATCTTCATAAATAAAAGGGAGGGGAACTTGAGACAAGACTTTAAGTCTG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATCTTCATAAATAAAAGGGAGGGGAACTTGAGACAAGACTTTAAGTCTG 789
seq1 TTTAGGTTAGGTGTTTCCCCCAGGAAAAGGGTTGGAAGAAGAGCGAGAGA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTAGGTTAGGTGTTTCCCCCAGGAAAAGGGTTGGAAGAAGAGCGAGAGA 839
seq1 ATCCTAGCTAGCAAGAGACAGAGTGAACACTTCGGAATGAATGTAAAACT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCCTAGCTAGCAAGAGACAGAGTGAACACTTCGGAATGAATGTAAAACT 889
seq1 GCATAAACATCTTTACATTTTAAACTGACACCCAATCACAGGTGCTTCTG 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCATAAACATCTTTACATTTTAAACTGACACCCAATCACAGGTGCTTCTG 939
seq1 CAGGTGCATTGTGGTATTTGCATACACATGTGCAACGCGTAATGATCAAA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGTGCATTGTGGTATTTGCATACACATGTGCAACGCGTAATGATCAAA 989
seq1 CCATGCTAGTTGAGAGTTGTCACCTTGTGCATTTATTGTTTCTTTGTGAA 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATGCTAGTTGAGAGTTGTCACCTTGTGCATTTATTGTTTCTTTGTGAA 1039
seq1 AATAGCGTCGTATGCTCTGATTTGCTGTGTGCTCACTTCCTGTGAGCGCC 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATAGCGTCGTATGCTCTGATTTGCTGTGTGCTCACTTCCTGTGAGCGCC 1089
seq1 CACTCTGCAAGGCTGTGGTCCCAGGAAGAGGCTGTGCATGGCTTTAGACC 1149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACTCTGCAAGGCTGTGGTCCCAGGAAGAGGCTGTGCATGGCTTTAGACC 1139
seq1 TGGAATTC 1157
||||||||
seq2 TGGAATTC 1147
| seq1: chr16_20518266_20518296
seq2: B6Ng01-340F16.g_145_175 (reverse)
seq1 CACACACACACACACACACACACACACCCCT 31
|||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACACACACACACACACACACACACACCCCT 31
|
