| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-089A10.T7 (MSMg01no089_a10.b1) | MSMg01-089A10.TJ (MSMg01no089_a10.g1) |
|---|
| ACC | AG307630 | AG307631 |
|---|
| length | 686 | 1,215 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 480 (40 - 519) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no089_a10.b1 PHD_FILE: MSMg01no089_a10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:41:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no089_a10.g1 PHD_FILE: MSMg01no089_a10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:41:42 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCCGCGGAATT
CCTTAGGTACCCCCTAGATTGTCCTGGGCTGTACAGGAGATAGATGATCT
GGTGGGAAAACATTGAATAATTCATGGTAGTAGAGGTGCCAAAATGAAAG
ATACTTATTTGAGGCTTTAAATGAGTACCAACTTGGGTCTTTTGGAGGGT
AGCCATGGTAGATCCCCTTTTGTGAGTGCTCCACAGCCTCAGCAGTAGTG
TCAGGCCTTGGGACCTCCCCTTGAGATGGATCCCATTTTGGGCCTGTTGA
TGGACCTTCATTTCCTCAGGCTCCTCTCCATTTCCATCCCTGTAATTCTT
ACAGACAGGAACAATTATGGGTCAGAGGTGTAACTGTGGGATGGCAATCC
CATCCCTCACTTGATGTCCTGTCTTCCTGCTACAACTGAAAGAGTCAGGT
GCAGATATTTGCACTCAACCAATGGACAGAAGCAGCTGACCCCTGTGGTT
GAATTAGGGGAAGGCTGAAAGAAGCTGCGGAGAAAGGCGATTCTGTACGA
GAACCAGCAGTCTCAATTAATCTGGACCCCTAAGATCTTCTCAATACTGG
ACCACCAATCAGACAGCATACATCAGTCAATATGAAGTCCAGCAACTTTC
ATACCGTAGAGAACTTTCGGGTCTGTGTTCATTTAT
| NTTCCGGTTCNCTTTGGTNTTNNCTTTTTTTCGGTTCCTTGGTTTTNCGG
CGGCGCTGGNCGCTCGCCGNGTCCGGTGTGGCCGCGGGCGTGCCGCGCGT
GGTTTGCGTGGTGCGGGGNTNTGTGTGTGGGGGCGGTCGCCGTGGGTGCG
GTAGGTGGCGGAGGGTGGTGTGGTGTGGCCCGGCGGCGCGGTGNTTGATA
CCACCANCTGCGTCCCGTCTCTCTCGTTCGGGCTTACTCGTGCTGCGCGC
CTTGGGGTGGGCCCTTAGCTGCCGCCGTATGCGTCGCGTTCNTTTGCTTG
CCGCCTCTCCTTTTGCTCTCACTTCCTTGCTCGTCTGCGCGCCGCCGCGT
CGGTGCGCTCGCGTCTTGAGTGCGGCGCACGCCCTCCACTTGCGATCGTA
TTGTTTGGTGATCCGATAACAACCATCTAGGCCAGGATCGCATCCGCGCG
GTGTCGATATCGGGATAGGCTTACTGCGTTTATCAAACCCATAACCACAC
CTTGATACGTTTCGCATACCGAGCACTCCATCGATCGATATCGCGACGAA
GAGTACATATGTACCCGCGGGCACTTAGTCGAACGCGCTAATATAATGAA
TAATATAGTTATAATACGCGCGGAGTGTCAAAGACGCGTCATATACATAT
ATCACACAATCACCATCTCGAACTCCATACCCATAATAATTCACATAATA
TCATATCATCACCCATATTCCATACCCATCCATTCCAATCCTTAATAATA
TATACAATAAATTCGCCCGATCTACACCACCGCTACAGTTCACAATACGA
GGACAATACACTACACGTAATAATATGCCGCGGCGTCGGGTCGTGGCCAT
TTACGAAAAAATAATACAAATACACAATTATATCCCCTATTAGTCATCGT
ACTTATACATATGGCCACCGTACACCTGAACGACACCATACAAAAAAAAT
ATAAATCATGCTGACACAACGTATATAGCCACGCACAGACGCANCTAGGC
ACATGGAGTTTATGTTACATTCATACACGGTTATCACAATGTGATATGAA
ATACCTGGCCGCGGGTAGGCAGCTGTATGAGATCGACGTGAAAGAGTTAT
CGTGACTCGCGCATATGAAAGTATATAATGATTAGAGAACTCAATACAAT
CATCATAGATATCTGTTTGACCACACACCNCCGATATAATACCCGGTGTA
TGCCGCGGGACAACG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 23 27 30 28 22 10 10 14 22 22 32 32 32 32 43 48 48 27 21 10 11 11 22 19 9 9 9 9 12 13 21 21 10 10 10 15 26 27 53 50 36 36 36 36 36
33 50 41 28 22 12 11 13 14 11 11 11 27 23 37 31 30 30 30 30 36 36 36 36 57 48 57 44 34 43 42 42 42 47 42 42 36 42 48 48 48 48 42 42 47 47 47 47 50 50
50 50 50 50 50 54 54 57 57 57 53 50 50 50 57 57 54 54 54 54 47 47 50 41 41 41 57 57 57 54 47 47 47 47 48 47 48 48 50 57 57 57 50 50 50 50 50 57 50 50
50 50 50 50 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 47 50 50 50 51 68 68 57 57 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52
52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 62 43 52 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 52 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 52 62 52 52 52 62 52
52 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 41 35 35 43 43 62 62 62 68 68 62 62 68 68 68 68 62 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 59 59 59 57
57 43 43 35 43 35 39 39 43 39 39 35 27 27 33 33 33 28 21 14 16 16 23 28 27 29 38 43 43 57 43 43 43 43 52 52 57 57 43 43 35 50 43 57 57 44 44 42 42 52
52 52 52 59 59 68 59 59 59 59 48 50 50 44 43 23 23 43 43 43 43 44 59 59 59 59 54 54 47 57 46 46 41 43 44 42 42 42 31 31 33 36 42 32 39 39 36 36 23 23
23 36 28 35 39 44 44 48 42 42 32 30 30 30 41 36 36 43 59 47 47 35 35 28 28 23 28 23 20 32 32 37 32 32 32 32 37 37 39 39 39 39 33 33 28 31 28 28 23 23
28 28 32 21 19 11 11 12 19 19 24 28 28 23 28 21 28 14 14 18 23 28 21 21 12 18 12 13 13 18 18 23 23 28 28 20 19 10 9 13 19 25 12 19 10 12 8 8 8 8
10 18 28 22 15 12 11 12 15 21 21 24 22 15 17 17 18 22 23 18 15 19 19 14 18 21 37 30 34 23 19 15 12 12 14 26 23 27 15 8 8 8 10 10 10 11 16 23 12 14
13 25 17 13 11 11 11 11 11 15 10 12 8 8 8 8 10 10 10 14 10 10 11 12 15 15 15 12 12 12 12 19 21 30 22 13 11 11 11 13 12 12 12 12 12 12 8 8 8 8
8 9 19 12 11 12 9 9 9 10 18 16 28 28 28 29 18 12 12 12 12 14 24 16 10 9 9 9 10 18 19 19 21 21 19 15 | Open.Hide. 0 3 7 7 9 9 9 7 7 3 0 3 13 14 6 6 6 3 0 3 3 0 0 3 11 11 17 9 10 11 14 12 10 6 6 8 6 6 6 8 8 7 7 7 7 3 0 3 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 6 6 6 3 0 3 10 11 9 10 8 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 11 7 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6
8 8 8 8 9 11 8 8 10 7 7 7 6 6 13 13 13 3 0 3 0 3 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 10 10 11 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 3 0 3 10 9 8 6 6
6 7 7 8 6 3 0 3 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 15 7 9 9 8 11 8 7 7 6 6 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 11 12 10
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 14 11 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 13 10 10 9 8 8 8
8 8 9 9 6 8 7 7 8 8 12 7 6 6 6 8 8 8 7 7 7 8 10 10 8 8 10 9 9 10 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 9 10
10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 8 6 6 6 8 8 11 12 18 14 11 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 13 12 6 6 7 6 8 6 7
6 6 9 10 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 8 8 8 13 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 8 7 9 10 10 15 8 10 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9
11 11 10 8 8 8 8 8 9 7 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10
10 9 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 13 11 8 8 6 6 10 6 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 6 6 6 8 10 6
6 6 6 6 8 6 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 7 6 8 8 10 11 10 12 11 11 15 10 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 8 8 8 8 8 12 7 6 8 6 6 8 8 10 9 11 9 9 9 9 7 8 8 6 6 6 6 8 8 12 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 11 11
10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 9 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 10 8 7 6 10 6 11 10 11 11 8 8 8 8 8 8 12 10 10 8 8 8 8 8 10
12 16 10 11 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 8 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 11 6 6 6 6 8 6 9 10 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 6 6 6 6 8 11 9 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 9 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 10
8 8 6 6 8 8 16 18 17 10 8 8 8 8 8 11 11 11 11 6 6 6 6 6 6 11 11 11 9 10 8 8 8 8 12 15 10 8 8 8 6 6 6 8 8 16 8 8 6 6
8 8 7 8 8 8 8 8 7 8 13 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 14 17 22 22 11 11 8 6
6 6 6 7 6 6 6 6 7 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 12 10 6 8 6 6 8 8 8 6 8 10 10 8 6 6 6 8 6 3 0 3 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 12 12 10 11 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 10 9 9 8
8 8 8 8 8 12 12 12 12 11 17 11 10 10 10 9 6 6 6 6 6 8 8 6 7 7 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 11 11 11 8 8 7 7 7 7 7 8 10
8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 6 6 7 7 10 10 6 6 8 6 8 8 8 8 13 8 8 7 7 10 8 8 8 7 6 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6
6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 11 3 0 3 6 6 8 8 10 8 7 7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 6 6 6 7 6 6 8 10 10 8 6 6 6 6 |
|---|
