BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-094C19.T7 (MSMg01no094_c19.b1) | MSMg01-094C19.TJ (MSMg01no094_c19.g1) |
ACC | AG311418 | AG311419 |
length | 1,645 | 702 |
length of high quality (start - end) | --- | 522 (73 - 594) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no094_c19.b1 PHD_FILE: MSMg01no094_c19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:49:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no094_c19.g1 PHD_FILE: MSMg01no094_c19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:49:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AAAAAAACANTNNNAAANNNNNNATNNNTANNAANATTAAATAAAANTAT
TAAATANNNNNAANAANATAANNNATTAAAAAAAANNNTTATTNNTTTTT
NCATCTCNACATANGNTTTGTTTTGCGATATTTTTGTGCTACCCTGCTTC
AAACCATATAGTATAAGACTTTGTCGGCGGCGCCGTNACAGTATAGTGTT
NATCTTATGTTATAATGGGCGTGAGTGGCGGCACATACTTGAGGATATGA
CCGATATTATACGTCATCGATATCAATATATTTCTCACTGTCTCTACTCC
CACCCATCCCTAACTGTGATCACAGGCNAGTTGTTATAATAGGTGTCTTG
AGATGTGTGCATAATGCTGAACGGATGGCACATAGCTCTAATAATACTGC
ACATATTATCATACCCCGAATATCTGTGCTGTGTCGCGGCCGGTGTGCGA
GCGCCGTATCTCGTGTGCTGGCCACGAGCGCGTGTCGTTTGGTACTGCTT
TACGACGCAATCTGTCTTCTATCCCACAACATCCCATCAAGTACACCACA
CTCACCGTGCCACTAAGGCCCACGCCAATTCGCCGCAGTATCGCCNCACA
CACAATTCTCTCTATGTATGATGCGTTATACTGATAATTACACAACATCC
GTTATATGTCGTACGTACTATAGGATATTATATAGTCTACACACCGACTG
TACAGCACCGCTTGTACTCACTNTTGTCGCGCGATTATGCGCTTATTCTC
TCTCCTCCGTCGTACGATCGCGACCATGCACATTGCTACAGAAGCATGTT
TGCAATATATAATAGATCACGGGACGATTATAGTGACGTGACGTTGTGCG
TGAGTTGTGAGACGAACGTATGAGTCTAATGTGACGCTGTATGTAGTGAA
CGATGTCGAGCGCATGTATTGCGCCGCTGTCATATCTCTNGACGTGACAG
AGTCACTTCGAGGCATCTCTCGTGTCTGACATAGCGATATAATCGCGCGC
AATCACGTCTACGCTTATATTAACGTNAGTGCGCGCATAGTGCACTGTCG
TGTATGCACTCATGCACAACTGATCACTCCGACTGCCGTACCTCATTATA
CATTGCTATATATCTGTCGCGACCGACACACATATACCACGACCGCTCGC
CACTGATGTACTGTNCGTCGTTGTACGCTCGCTCCTTATTTAGAGACGTC
CACCTGTGTGTACGACTGANATCTAGTCTGTCTATATGTGTCGTGATAAT
ATACGCGCGCGCTCCGCATACGTGGCGGTCCGCGCTGATACTCTGTGATC
GACTGCGCGCNGCACGCTCGTGACGCACTGTGATGTGTATACGACTCTCA
CTATTAACTTATCTCGTGTGCCCACGTCGGACAGCTATGNCGTTCTCTGT
GCTCGTCTCTGCTTTCTCCGCCGCTATCTGAACCGTCTGTCTACAGCTAT
AGTATGTGATTATGCGTGCGCCACGCGCTATATATTCATCTCTACATTCT
TCTATACTAGTAAGTATAGTAGTAGGACCACCGTGATAGCTGAGGNATTG
TCACGATATATACGTGTGAAGACTACGCATGATGAGTCATATNGATAGTA
GTGTAATGCTGCTATGAAGATACTATACGATACTACATGATATGN
| CATTGATGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGGACT
CAGAAATCCTCCTGCCTCTGCCTCTGGAGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTG
TGCCACCACACCTGGCTGTATCTTTGATTTTTAATTATTGAATACATGAA
TATATATTGAGATACATTGGAGAAGGAACCCAGGTCTAAACATTAAACTC
TTTTATATTACGTGTGTACCTTATACATGTAGTCTGATGGTAATTTTGTA
CATTTTTTCAATGCTTTTACATTTTGAATGTAATCACAGTAGATCAGGTA
TGAAATTTTCTCTTTGTGGAAAAGGCTAACTTTTGGAACATCTGGGATTT
TGTATATTTGGATTATGGATCTTCAACCTGTACTTGATATAATTCTTTTT
GATATTATGATTTTAGATGTGTAACAATGCATTTGTATATATTATTACTG
ACATTCACATTTTTATTTCCTATATTAAAATTTAAATTTAAACTTAGATT
TAAATGTTAATATAGAAAATATTACATTTAATATAGGAAATATTACACTT
AATAAGAGAAAATATTTGCATATCAGAACATCCTCTTATTGTGACTCTAT
TATAATTTTAAAATTTATTTAATATTTTCTAAACCATTAAGCTTTCTACC
TA
|
quality values | Open.Hide.19 19 10 12 10 11 6 6 3 0 3 0 0 0 3 11 3 0 0 0 0 0 0 3 3 0 0 0 3 3 0 0 3 3 0 3 14 7 7 7 6 6 6 7 7 3 0 3 6 6
8 7 15 11 11 3 0 0 0 0 0 3 3 0 3 3 0 3 7 7 3 0 0 0 3 8 6 6 10 13 9 9 7 7 3 0 0 0 3 13 8 8 3 0 0 3 14 15 21 3
0 3 9 9 9 21 3 0 3 6 8 8 3 0 3 0 3 8 8 8 8 12 12 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 10 10 13 10 11 6 8 6 6 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 3 0 3 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 3
0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8
8 6 8 8 8 19 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 10 10 12 8 8 9 8 8 8 8
8 10 10 8 8 7 7 8 8 12 10 10 10 8 8 10 8 8 8 6 6 6 7 8 8 10 10 10 10 11 11 10 9 7 8 6 6 8 8 9 10 8 10 8 8 8 10 8 8 6
6 6 8 8 8 8 9 8 11 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 11 8 8 8 11 15 10 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 8 11 8 8 8 9 7 10 7 6 6 8 13
8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 12 10 8 7 6 6 6 6 7 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 6 11 8 8 7 7 7 6 8 8 10 10 6 6 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 7 7
7 8 8 6 6 6 6 8 10 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 7 7 7 8 13 10 10 9 8 8 8 3 0 3 6 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 13 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 9 9 10 13 12 11 11 11 10 8 6 6 6 6 6 6
8 6 6 6 6 6 9 11 11 12 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 11 3 0 3 16 14 12 12 10 8 8 6 6 6 8 7 13 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 9
9 10 11 11 10 10 10 10 12 10 11 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 8 6 7 6 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8
6 6 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 7 6 6 6 9 9 11 9 10 8 10
8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 11 12 12 22 11 9 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 9 10 10 9 9 9 9 14 14 12 8 8 6 6 6 6 3 0 3 9 9 9 7 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 9 9 9 10 10 11 12 12 10 8 8 6 6 8 8 10 11 6 8 6 6 6 6 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8
8 6 6 9 11 11 8 8 6 6 8 6 9 8 8 8 8 9 8 12 11 13 10 8 8 3 0 3 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 11 11 12 11 13 11 11
10 9 9 8 6 6 6 8 6 8 6 8 7 6 6 6 7 7 9 9 10 7 8 8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11
9 9 8 7 7 7 10 10 14 13 12 10 9 9 9 12 19 10 8 8 6 6 8 6 7 11 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6
10 13 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 11 3 0 3 6 6 6 8 10 9 9 10 9 9 9 10 8 6 6 8 10 8 6 6 6 6 7 7 6 6 8 6 10 9 11 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 11 11 13 18 19 8 8 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 10 8 8 7 7 7 8 12 12 11 10 8 8 8 6 6 6 6 6
8 8 10 11 8 6 6 6 6 6 10 11 17 12 9 10 8 8 7 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 6 6 7 7 8 7 7 10 10 10 10 10 11 11 11 11
11 10 11 8 8 7 7 8 8 3 0 3 9 9 9 9 9 8 8 8 6 8 6 6 6 8 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 6 6
6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 8 10 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 10 10 6 6 6 6 6
6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 9 7 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 8 8 6 8 8 8 8 6 6 8
8 8 10 13 10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 8 10 8 7 6 6 6 6 8 8 10 10 10 9 6 6 6 6 6 6 7 6 7 8 6 9 9 9 9 9 10 10 8 8 6
6 6 6 6 6 9 8 6 6 6 6 6 8 6 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 12
18 11 11 11 11 11 14 11 9 9 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 9 11 11 11 11 11 11 3 0 3 8 8 7 6 6 6
6 6 6 9 10 8 6 6 6 6 6 8 13 10 10 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 11 11 11 9 10 8 6 6 3 0 | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 8 8 21 3 0 3 10 8 16 28 30 30 37 37 33 33 33 33 33 33 48 37 37 28 15 11 10 10 10 9 11 11 12 21 21 32 31 31 31 21 21 11 13 14
26 21 42 37 42 40 40 43 30 30 19 23 18 16 16 18 18 42 42 46 48 48 42 42 50 57 57 68 51 51 51 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57
57 47 57 47 51 42 50 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 43 47 43 44 43 57 57 57 51 50 50 50 50 57 68 46 46 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57
57 50 57 57 57 52 52 54 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62
62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 57 59 59 43 43 31 31 31 38 41 24 24 11 11 11 28 28 52 57 57 47 59 59 57 57 57 57 52 52 52 43 43 39 39 43 57 57 57
59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 52 52 52 52 52 59 59 68 68 68 57 57 57 57 59 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 48 47
50 57 47 54 57 57 57 57 57 57 48 48 42 44 39 57 57 57 57 57 43 43 43 44 44 43 43 57 57 57 47 47 46 46 43 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 46 57 46 48 43
44 43 57 57 57 48 48 48 48 48 57 53 50 50 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 46 46 41 41 39 39 35 31 31 35 41 41 41 46 59 59 48 37 39 30 32 28 37 37
57 48 48 48 57 57 48 48 48 48 47 40 34 28 28 30 33 42 43 42 42 43 43 43 34 34 39 43 39 39 37 37 32 31 25 28 30 29 25 30 24 24 13 14 9 9 9 12 17 12
11 11 16 18 22 32 28 30 30 37 37 37 48 37 37 37 32 30 24 25 25 25 21 11 11 11 17 17 28 34 28 30 33 34 32 28 28 39 32 31 23 22 19 27 21 28 28 37 37 34
13 12 12 17 17 25 18 19 12 12 12 12 15 18 27 34 19 10 9 8 8 10 10 12 17 17 24 20 17 13 18 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 9 15 19 26 11 11 10 19 19
19 14 |