| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-122L17.T7 (MSMg01no122_l17.b1) | MSMg01-122L17.TJ (MSMg01no122_l17.g1) |
|---|
| ACC | AG332514 | AG332515 |
|---|
| length | 1,110 | 1,099 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 630 (128 - 757) | 330 (130 - 459) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_l17.b1 PHD_FILE: MSMg01no122_l17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_l17.g1 PHD_FILE: MSMg01no122_l17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:31 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CCTATTTTNNNNNATACATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCAAATAGATTCACACCCCTTCCCTTAAATAAAATTCAACT
CCAAATGGATCTAAGACCTTTACATAAAACCAGATACACTGACTCTGATA
GAAAAGAAAGTGGAATATAGTTGTAAACCCATCAGCTCAGAAGACTTCCT
GAACAGAACACTGTTAGTACAGGTACTAGATCAACAGTTAAAAAAAGGAA
CCTCAGGACACCTAGAACCTTCCGAACTGCAAATGACATTGCCATTCAAA
CAAAAGTGAGCCTACAGAATGGAAGACTTTTATCAACTACATCCAATAAA
GAGCTACTATCCAAAATACACCAAGAACAAAAACACAAAAACAAACCAAA
AGAACAACAACAACAACCACCACAACCACTGGATGTCAAGAAAACAAATA
ACCTGACTTTAAAACAGGATCTAAACAGAATTCTCAAAAAAGGAACCTCA
AGTGGCCTAGAAACACTTAAAGAAATGTTCAGCATCCTTAGCCATCAGGG
ACATGCAAATCAAAACTATTTTGCAATTCCATCCTACACCTGTCAGAATG
GCTAAGATCAATAAAACAAGAGATAGCTCATGCTGGCAAGTTTGTAAAGT
ATGGGGAACACTCATCCATTGTTGCTGGTAATGCAAAGTTGTGCAGCCAT
TATGGAAATCAGTATGGTGATCCCTCAGGAAGGTGGGAATCAATGTATTT
TAAGACCCAGCTATACCACTCTTGGCCATATACCAAAAGCATGCTTCATC
TTATCACAGAGACAGTACACAATAATGTCCATTGCTGCTCCATTCTTGAT
AGCCAAAAACTGGGAAGACCCTAGATTTTCCTCACCAGAAAAATAACTAA
TATTTTGCCCATTGGAATATTGCTCAGCCCCTCAAAAAAGAAAAACTTTT
TTAAAATTTTGCAGGGTTAATAAATGGAACCCTAAGGGGGGGAAAATTCA
TTTCTGGAATGGAGGTAAGCTCCCGAACCGTAAAGGATATAAACTATGGG
TTTTAATATTTCCACCCCATTCCGGGGTGAAATATTTAAGCTTGTTTAAA
AGTCCACATT
| CAAGAATANNNNAAAACATTGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTTCAGTAAAGAATGAAGCAG
GATTTTTTAAAAGAAGCCTTTTTTAAAACGAAAAAAAAAAGTGTATTTTC
TCCCTGAATTAAATTCACTTGGTCCATAAATGATTACATTTGGGAGAGAA
TAGAAACCCTGGGAAAAGGCAAGAAAGAAAAAGAAAAAAAGCAACCAAAT
CTATTACAACCCAAAAAAGAATGTCAGGAGCATCATAAAGTGTGCCAGGT
CCTAAGGAAACCTCAACAAAACAGTTGCATTCGGGTGCCAGATATTCCAC
CATGGTGAGAGACAGTTGGGACTGGTAGGAGGTTCAGCACACCTCAGAAG
CTCATGATGGGAAGCATAGCGACAGACTAAACAATGCAGATGTGGTTTCA
GGAAACTATTTATTACTAAAACCAATAAAGGACTGCTTCAGGAAGAAAAA
ATTAGACTTGCAGAAAATAGCAATAAAGACAAGACCGATCCCCTTGCTCA
AAGAATAAGATGTTTTAAAAAGCCATTGAGTGAAAGAAGGCAGAGGCACT
TGATTTTATTTTGAGTTCTTCCTTCAGAAGGAAAAATTGTTTTACGGTAA
GGTGGAACGCTCAAGATTGATGGAGCCAAATGGTTGTTAAGGGAATACCA
CTTACATCTTGTGGTATCACAGGGCTGGGTAGTTAAACAAGCAAGCAGTA
TTCCCGAACAGGATGGTAGTTATGATGTCTTATCCATAACAGCAAGATGC
TAGAAAGAGGCAGTAACCAGTAACATTTCTTGGGAGGATGGCGTAACTCC
TAGCTACCTGTGGAACTCACCTGTAGCAACTTTTAAGCATGTATTTAAAA
CAGACTCCCTCCAAACACTGTTAAGTTAGAATATCCTTACAAACGGATGG
GATTCAGAACGCCTGCATAACCAACAAAACACTTAGCCCTGCCTGGTCTA
ATAAAAACCGGAACTAACCTTGAAACCCTTTGGTGCCTCTTCAAATACCG
GAAACCCCTTATTTCAAAAGAAACCATAATGTGAAGTTTGGAACCTCAN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 8 6 6 8 8 3 0 0 0 0 0 3 8 8 6 6 8 8 8 8 9 13 13 14 15 10 8 8 8 15 19 9 8 8 15 14 22 29 29 42 37 33 37 37 40 40 50 57
57 48 48 48 37 34 43 42 47 57 57 50 50 53 53 53 50 47 36 33 37 39 37 23 23 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 16 19 19 23 34 34 57 57 50 50 50 50
50 50 50 48 50 57 53 53 33 31 31 31 31 29 23 11 8 6 6 10 8 16 15 16 21 17 19 23 23 24 28 28 30 39 37 50 50 50 50 53 53 50 50 50 50 50 50 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 48 48 48 48 50 50 53 47 43 50 50 50 50 50 50 53 57 59 50 50 50 42 50 42 41 29 25 22 12 12 12 21 27 36 46 46 50 59 59 59
48 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 50 48 53 50 50 50 54 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 54 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 57 54 54 57 57 57 57 42 44 42 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 44 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 52 52 52 52
52 52 57 57 59 59 57 59 57 59 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 57 52 52 59 59 59 59 57 57 59 59 57 57 59 59 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 57 52 52 62 62 62 62 62 62 45 45 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 52 52 43 30
26 16 21 27 23 23 34 43 43 43 47 43 39 26 16 14 20 20 27 43 39 39 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43
43 27 28 27 27 17 23 23 39 39 31 31 31 31 35 35 35 43 44 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 39 39 23 26 26 27 43 43 43 43 39 35
39 47 62 43 43 39 32 38 23 23 31 44 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 35 39 43 43 43 45 52 62 62
52 62 62 62 62 52 52 43 57 43 43 39 57 43 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 59 59 68 57 57 57 57 57 57 41 39 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52
52 52 59 44 43 35 35 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 50 50 38 38 43 44 43 43 43 57 57 57 54 50 50 43 43 59 43 43 44 59 59 59 59 59 43 43 43 43 44
43 57 44 40 47 44 48 57 57 57 57 57 40 40 26 33 30 42 36 42 37 57 57 57 44 39 37 42 42 42 39 39 39 43 39 43 39 43 43 42 42 35 30 31 24 24 17 22 22 40
43 48 57 48 48 48 43 43 39 39 30 39 39 36 34 28 24 24 19 26 26 32 39 32 28 24 12 12 11 21 21 26 26 30 34 30 21 12 8 8 8 12 12 23 23 23 37 37 48 48
43 43 32 26 24 24 23 15 24 12 12 15 27 32 19 17 10 10 10 12 20 19 30 22 30 25 25 26 30 31 23 28 22 22 17 26 30 37 18 23 18 19 12 12 19 27 15 15 11 18
19 30 22 23 19 19 14 12 12 11 11 11 11 11 11 21 19 9 9 9 10 14 26 23 18 16 12 12 16 19 21 22 22 19 17 17 14 19 12 8 8 8 11 19 10 8 8 10 10 16
11 17 17 11 11 11 15 10 11 11 10 10 12 21 17 16 15 9 9 9 11 12 9 8 8 9 9 8 8 8 10 11 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 14 13 13 12 12 10
8 8 8 9 14 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 13 12 10 15 10 10 13 11 11 11 9 11 11 14 10 9 9 9 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 15 13 18 17
14 11 11 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 8 7 7 10 9 9 12 11 12 13 11 13 8 9 8 12 12 12 13 11 11 11 11 11 11 19 11 16 10 14 10 10
10 13 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 9 10 10 10 9 9 9 11 10 10 6 8 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 7 7 6
8 8 10 15 10 10 10 10 7 6 6 6 8 8 10 8 8 10 9 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 7 9 12 10 12 12 9 9 9 10 10 9 8 8 8 8 6 6
9 8 8 8 9 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 8 8 8 6 8 8 3 0 0 0 0 3 7 7 7 9 6 6 6 7 9 9 6 7 8 6 6 8 10 10 10 11 8 6 8 6 10 10 15 19 21 22 9 9 12 19 17 29 17
24 23 28 28 35 35 42 42 37 42 37 42 36 36 42 38 50 50 50 48 48 30 27 10 9 9 10 13 14 20 8 8 8 8 8 10 10 14 19 32 34 46 48 50 50 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 36 36 33 33 33 33 59 59 36 27 20 9 11 12 13 12 12 12 12 18 12 10 8 8 8 10 17 34 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 48 48 48 42
42 42 48 48 54 57 57 54 54 68 68 53 53 48 48 41 41 41 48 43 47 48 47 47 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 48 32 24 15 19 19 12 12 24 32 47 48 57 44 37
36 23 23 27 36 43 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 57 52 52 52 57 52 54 54 59 57 54 54 52 52 52 52 52 57 57 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 37 37 37 52 57 54 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 50 50
37 43 43 50 43 54 54 59 59 57 57 57 57 50 57 57 44 44 33 33 33 32 44 44 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 59 47 46 40 40 40 57 57 59 59 57 57 57 59
59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 48 54 54 54 57 48 41 32 23 23 32 32 32 57 57 48 57 48 57 57 48 48 43 47 41 43 43 59 43 46 48 59 34 34 25 25 23 34 25
34 13 13 8 6 8 8 8 8 8 10 15 32 32 48 47 59 59 46 43 43 43 43 43 36 43 43 43 59 59 48 48 48 48 48 47 47 47 43 41 47 43 48 48 59 59 48 48 37 47
40 32 32 23 18 10 8 6 6 8 8 11 13 21 21 14 13 12 12 12 15 21 32 32 43 43 59 47 47 37 37 32 39 36 43 37 33 32 28 28 28 20 23 11 11 11 15 15 26 26
28 21 23 15 21 24 34 39 39 24 28 32 32 39 39 39 43 43 43 43 43 46 48 48 54 54 47 42 32 30 30 42 42 35 39 39 47 47 46 46 43 47 47 43 46 43 48 44 44 46
46 54 57 57 43 42 36 28 28 28 40 37 44 48 57 57 57 57 57 57 57 46 43 43 43 44 44 57 50 57 43 43 50 50 43 36 36 43 50 43 50 50 54 54 44 44 32 33 42 44
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 44 44 43 43 36 32 28 32 32 32 42 42 48 48 48 54 57 57 44 42 36 32 33 42 33 39 37 37 33 37 43 43
43 42 40 30 30 30 39 39 31 31 19 18 15 18 19 28 37 37 42 41 41 39 34 33 28 24 22 20 20 28 28 28 25 33 33 33 37 37 48 39 39 30 30 30 37 37 42 42 42 34
42 34 43 34 34 40 40 39 39 39 35 28 31 29 28 28 24 24 22 20 18 22 20 15 18 21 21 17 13 21 15 11 11 18 25 33 33 39 34 28 23 23 32 34 24 24 12 12 11 11
17 16 9 9 9 9 9 19 22 40 37 37 32 30 27 27 30 30 20 20 24 28 28 33 33 24 20 20 20 19 22 12 10 10 19 21 39 39 37 37 30 30 32 30 32 32 28 19 14 10
10 8 11 8 8 8 8 9 22 22 33 35 26 26 20 21 21 19 16 16 15 15 15 10 10 11 19 15 8 8 8 13 10 10 11 12 12 12 11 12 17 22 32 19 13 10 10 10 12 15
12 9 8 8 8 8 8 9 12 12 16 20 26 23 10 10 8 13 8 8 8 11 9 12 10 10 10 10 12 15 10 9 10 10 9 9 10 16 13 15 20 28 28 22 18 15 12 12 23 14
16 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 16 10 15 12 15 15 12 11 10 15 11 8 8 8 10 10 9 9 11 10 12 14 11 13 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 23 10
10 10 15 12 12 11 11 11 14 10 10 10 11 11 8 10 10 8 9 9 9 9 10 10 10 11 11 11 9 9 9 9 9 12 9 11 8 13 8 8 8 6 8 8 8 6 8 6 6 6
6 8 10 8 9 8 8 15 10 9 9 10 10 10 10 13 10 12 8 8 6 7 7 6 8 12 19 24 13 13 7 6 6 6 6 6 6 12 9 8 8 8 11 6 6 8 9 9 11 13
11 11 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 10 13 15 15 15 13 11 11 11 11 12 10 10 8 6 6 8 6 6 9 9 8 8 8 8 8 10 12 12 13 8 6 6 8 3 0 |
|---|
