| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-122N24.T7 (MSMg01no122_n24.b1) | MSMg01-122N24.TJ (MSMg01no122_n24.g1) |
|---|
| ACC | AG332622 | AG332623 |
|---|
| length | 1,127 | 1,247 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 373 (88 - 460) | 107 (302 - 408) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_n24.b1 PHD_FILE: MSMg01no122_n24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_n24.g1 PHD_FILE: MSMg01no122_n24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:50 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | plural | no hit data |
|---|
| sequence | CCAATTTATNNNNAAGTCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTGAGATTTTTCAGCCCATTAAGACAAAATTATAGCCT
GGAAATAGACTTATACAGCCCTTTAGAAGGGAAATTAATTAAAGTTAAAC
ACAGAGATGAGTCAATACTTTGAGGCTTTTGATCTTATATTATAGGTCAA
GAGCAGAGAGTTAGTTGAAAACACTTAACTCAGACAGAAAAAGAAACTTA
GGTTAGTTCAATTTACATAAAGAAAAGGGAAATATATACCAACAGAGATA
TTAATCTCCATAGAAGGGAGGATTTAAATATACATAGATGCATAAACAAT
TGAAGCTTTTGATCTTAACTTGAGGGTCCAAAAAAGGGCCCAGGGAGCCT
AACCTTATCTCAGAGTGTAGAAACTTAGGTCTTAACCTCAGTATTAAAAA
CTAATCATGCTTGAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACCAGGAGATAG
TGGAGGAGTACTGTGTCAACAGATAATATTTGTTTTGATTGTTTTAATTA
TCAAAATGAAGATATTTATGTTTGGTGGTATTAATGGTACTAAAATTCTT
CTGGCCAGGCAGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCTCAGCACTCGTGAGGCA
GAGGCAGGTGCATTTCTGAGTTCGAGGCCAACCAGGTCTACAGAGTGGGC
AACCTGGTCTACAACTGGGACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCCTGTTT
GAAAAAAATAATTCCTCTGGAAGAGAGATCCAGCTACTAAATTAATTCCA
TCTATACTTTTAATGATTTCGAGTTAGTGGACCAAGGAAATTTTTTTTCA
GAGAGAGACTCTGTATTTGTGTTGACAGGAAAGAAGAAAAGGACCTGGAC
CCTTTCCAGAATGATATGAATCAGATATGACCGGGGAAGACCCCCTGAAG
ATCCTGGCCACCCAAGGAAAAAAAATTTTTGAAAAAATCCAACAGGAAAG
GGTAACTTGATCCGCTTGATCAAGGGGACCAACCCCTACCACCTGGGCTT
TAGCCCTTAAAACCCCTCTCCTAGACCAAACTTTTCTTCTGAAATTTTTA
ACAATAAAACCCTTACCGGGGTGGTGC
| NGAACCTTANNNAAAAGATGCGAGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCACCCTGAGGAATACCGA
ATGGCAGAGAAGCACTTGACTTAATGTTCACCATCCTTAATCCTCAGGGA
AATGCCAATCAAAACCACCCTGAGATTCCCCCCTCCCACCAGTCAGAATG
GCTAAGATCCAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGA
AAGAGGAACACTCCCTCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCCC
TCTGGAAATTAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCC
GGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAA
CAGGTAAGAAGGATACATGCTCCCCTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATA
ATAGCCAGAATCTGTTTTGAACCTAGATGACCCTCCCCAGACGAATGGAT
ACAGAAAATGTGGTACCTCTACCCAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAA
AGAATGAATTTATGAAATTCCTACCCAAATGCATGGACCCGGAGGCCATC
ATCCTGAGTGAGGTAACCCATTCCCAAAGAAACTCCCACCATATGTATTC
ACTGATAACTGGATATTACCCCCACACCTAGGATACCCCCCATATAAGAT
ATAATTTGCTAAACCCCTTGACACTCCCGAACAATGCAACACTGACGTGC
TGGACCCTATGCCCCCCCCTTAGATTCGCCACCCACACCCCCCTTCGTAA
GCATTTTCCTCACACCGCACTTTGCAGCTCTACCTGCACCGCACGCCCCC
CATGTCCACACCGCCCTTATCCCCTGGCCTCCCCCCCCCCAACCCCCCCC
ATCCCCCCCCCCTGCACCCCTTTTGCCCTACCCCTCCCCAAGACTTCTTT
TCTGAAAAGCGACCCCCCTATGTCCCCCTCGTCCCCTTTGCTCAAACCCA
CTGCCCCCTGCCCCCCTTCCTACACCCTCCAATCTCCCATTGCTCCCCTC
CCTCCCCCCTCAATCGCCAGCGTCTCCCCATCTCGCTCCCCCCCCTCGGC
CACCCACCCCTACTCGACAATTCCTCCCCCCCTCGGCCTTCTTCACGTGC
TCTCTCCTCCTCACCCTCCTTTTTCCTTCGTGCCAACTCCCCCTTCCTCA
TTTCTCTCTCTATCCTCACTTNACTCCCTCCGCTAACTCTCTCTTTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 9 9 9 10 10 9 9 9 3 0 0 0 0 3 9 11 11 9 9 9 9 10 9 14 14 14 10 10 8 8 8 13 19 28 24 24 24 23 23 22 24 29 37 42 33 33 37 37 40 42
50 48 48 42 42 40 40 40 47 47 48 48 48 47 42 38 38 36 36 50 59 33 33 33 30 21 21 8 8 8 9 8 8 9 9 12 13 20 23 23 28 32 37 37 53 53 47 47 42 47
42 47 47 42 42 53 53 36 36 33 33 33 33 33 30 22 18 12 10 10 10 10 10 13 16 18 23 28 28 23 23 23 28 33 37 47 47 50 50 50 53 53 53 53 53 53 50 48 48 48
48 48 48 48 57 57 68 68 68 68 57 57 48 48 48 48 50 48 48 48 53 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 43 42 39 32 32 24 28 32 44 48 54 48
59 48 47 47 47 47 50 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 52 52 52 57 57 57 59 52 50 43 35 35 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 54 54 57 57 57 57 68 57 57 47 54 57
57 57 47 39 44 37 44 43 36 26 21 13 30 30 59 59 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 59 59 59 48 48 57 57 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 47 39 29 28 13 13 13 13 12 15 15 21 20 22 25 20 20 20 22 28 32 39 43 48 43 43 40 59 43 43 43 43 43 42 39 37 43 43 43 42 42 31 31 25 28 28 23
23 32 37 39 43 59 59 59 59 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 57 57 59 59 57 57 57 59 59
59 57 59 59 68 59 59 59 59 52 52 52 57 57 59 59 59 59 43 35 35 43 44 57 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 48 59 59 59 57 59 59 59 44 48 48 59
59 57 57 57 57 54 57 54 59 59 57 48 48 57 48 48 54 57 57 44 47 44 48 48 57 57 57 59 59 59 59 57 59 47 43 43 43 43 57 57 57 57 54 54 54 54 54 48 48 48
48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 43 41 41 41 41 43 43 37 31 31 31 31 31 31 35 35 35 35 35 37 37 33 37 43 43 48 46 47 39 36 36
36 37 31 29 34 25 25 33 37 47 47 24 24 12 15 18 28 22 35 35 39 39 43 43 39 39 33 33 25 33 31 32 23 23 28 32 39 39 37 37 32 32 32 37 33 33 30 37 37 39
39 31 31 35 36 40 40 59 41 28 24 17 24 24 34 34 37 35 31 30 37 36 36 36 37 26 30 21 19 19 28 28 43 37 37 39 33 28 23 21 17 9 9 9 21 25 24 22 12 12
12 28 28 39 32 32 23 23 23 32 26 35 35 23 20 10 10 10 21 18 22 22 29 27 27 22 25 19 21 12 13 21 22 19 31 31 28 29 24 17 16 10 10 10 23 30 30 25 12 11
10 10 10 10 16 15 21 21 19 19 18 19 22 21 26 28 29 28 24 24 24 28 28 23 13 8 8 8 8 15 24 22 16 15 8 8 8 9 9 15 25 27 37 37 18 18 10 12 10 15
18 24 27 28 24 23 18 24 24 11 9 9 9 13 15 16 14 12 9 9 10 10 9 12 12 17 11 12 15 10 17 13 9 8 8 8 8 8 9 12 12 12 12 11 13 13 13 10 10 10
10 10 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 14 15 14 14 24 24 13 12 9 9 9 10 14 14 9 12 10 8 9 9 9 9 9 15 10 12 12 9 9 9 11 6 7 8 6
8 8 9 8 8 8 8 10 9 14 12 13 13 10 6 6 6 6 8 8 10 10 10 11 10 9 10 8 10 10 12 8 10 10 10 10 10 13 18 10 10 9 9 12 9 12 11 18 8 8
10 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 12 11 19 18 14 10 8 8 8 8 8 6 6 9 9 9 9 11 10 8 8 8 10 10 10 12 9 9 9 9 9 9 12 15 11 10 10 10 10
12 12 12 10 10 8 9 13 8 10 11 13 13 16 10 10 10 9 9 8 12 9 8 6 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 9 9 3 0 0 0 3 8 8 8 9 10 8 10 8 8 8 8 19 9 9 9 9 10 11 9 11 8 10 6 6 8 19 8 8 8 10 10 16 17 24 19 19 10
19 19 24 24 33 23 23 10 12 13 21 21 35 38 47 38 50 47 27 27 13 12 11 11 11 11 10 9 14 13 15 11 11 10 8 8 8 9 9 9 9 17 26 35 35 32 24 14 20 14
23 21 31 30 17 19 17 28 28 21 21 11 11 9 10 10 19 15 8 8 8 8 10 16 16 13 12 8 6 6 6 6 6 16 32 19 21 21 30 30 30 12 12 12 15 12 14 30 30 42
41 34 23 16 10 10 11 21 25 12 12 12 19 21 10 10 10 14 15 13 13 13 19 21 37 39 23 32 18 18 10 17 19 19 11 9 12 15 15 13 12 8 15 9 11 14 19 39 39 22
17 11 11 17 12 12 10 13 9 11 11 22 30 40 23 16 11 11 14 19 37 35 39 39 28 25 12 11 11 19 19 21 24 24 15 19 14 14 15 28 34 33 40 28 28 23 32 34 43 39
39 39 43 39 43 39 21 24 20 20 16 16 9 9 8 8 8 8 11 23 30 37 39 43 48 48 47 40 40 39 39 25 27 11 11 12 11 12 12 23 21 21 21 11 11 9 13 8 9 12
12 12 25 25 37 47 48 48 34 34 22 15 15 20 22 24 24 28 28 22 25 25 22 15 14 11 9 14 20 59 37 41 37 37 33 24 22 22 18 19 20 29 19 12 19 24 30 34 29 37
30 30 26 36 33 33 33 33 25 25 25 31 31 35 35 39 42 42 43 42 42 42 37 40 20 28 28 29 28 28 26 33 28 21 21 23 23 30 28 25 23 14 17 17 15 15 17 19 20 20
28 25 31 25 23 23 18 16 12 12 11 11 11 11 11 13 10 10 14 12 10 10 9 9 12 19 20 37 37 20 20 20 14 14 18 23 28 18 13 10 13 17 32 43 59 59 43 48 43 43
33 40 24 24 14 15 15 20 16 13 9 9 9 10 10 12 11 12 11 14 14 13 12 14 10 11 12 22 23 9 9 9 9 15 8 8 8 8 8 8 8 12 12 13 12 12 12 21 20 23
12 16 12 12 12 25 25 30 32 21 19 9 9 8 8 8 8 13 19 17 17 16 16 14 23 13 19 14 18 24 28 22 25 16 18 22 17 21 10 8 8 8 14 12 14 21 17 19 23 28
25 22 22 12 12 13 21 21 29 28 28 32 24 24 15 15 14 15 22 26 22 17 9 9 9 10 10 20 22 21 23 21 19 16 15 12 17 9 9 9 9 10 10 11 13 13 10 10 12 10
12 10 15 16 15 22 12 11 11 11 12 18 15 18 11 8 8 13 10 13 10 12 8 9 10 12 13 17 20 23 15 15 10 15 12 13 8 11 8 8 8 10 10 15 9 9 9 10 13 10
10 10 12 12 17 12 11 11 10 10 10 10 12 21 21 24 24 18 15 11 17 15 9 9 9 9 9 14 14 10 10 16 12 13 13 14 15 15 10 9 9 9 10 10 11 15 11 11 11 11
11 11 11 11 11 15 15 15 12 11 11 12 12 12 19 17 21 14 11 13 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 12 13 13 10 10 11 12 16 8 8 7 6 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 8 10 13 12 10 10 10 11 9 9 14 19 17 16 9 11 10 10 10 10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 12 19 21 27 23 13 8 8 6 6 8 8 10
10 9 9 9 10 8 11 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 9 9 9 8 9 9 10 10 10 10 9 11 11 12 10 10 8 10 6 6 8 8 9 10 7 7
6 6 12 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 15 12 9 9 8 6 8 8 8 8 8 8 11 13 13 11 11 12 9 9 11 11 9 9 9 9 10 12 21 12 12 7
7 10 15 10 10 8 8 8 10 16 11 9 8 8 12 8 8 11 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 9 8 8 7 7 7 9 12 11 12 9
9 9 10 9 9 10 10 11 10 10 10 12 17 22 26 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 8 8 6 6 8 8 11 8 10 9 9 9 9 10 10 11 11 10 10 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 13 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 7 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 13 12 23 24 17 13
16 10 8 8 12 8 9 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 9 13 11 10 10 10 8 8 8
10 8 8 8 10 11 11 11 8 8 8 8 10 6 6 8 6 8 8 8 8 12 8 10 8 12 14 15 24 26 11 11 7 6 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 7 6 6 8 6 6 8 10 10 8 8 8 10 6 6 8 7 6 8 8 8 6 6 12 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 13 10 22 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8
8 13 13 12 12 9 14 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 3 0 3 10 13 10 12 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 12 13 8 7 7 6 6 8 8 6 |
|---|
