BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123A12.T7 (MSMg01no123_a12.b1) | MSMg01-123A12.TJ (MSMg01no123_a12.g1) |
ACC | AG332741 | AG332742 |
length | 1,265 | 1,181 |
length of high quality (start - end) | 419 (49 - 467) | 652 (127 - 778) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_a12.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_a12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_a12.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_a12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:11 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (73,818,841 - 73,819,248) | (73,728,127 - 73,728,778) |
---|
sequence | NNAAGTTTTNNNNNNNGATCACTGCGCGCTATAGACTCCTATANGGAGAG
GATCCGCGGAATTCCATTAGTAAATACATTTACTTTGCTCTCTACCTTTT
CCTTTATTTAATGGTATGGATTGCAAAAAAAAATCTTGGCCTGGGAACCC
TGGCATTTCTGTCCGTTATAAAATGTGCTATTCAGGGAAGCCATGCCACC
AAATGAAAGCAGAGGCTTTGAAAATGAAGGAAGGGTGGCAGAGGTCAAGG
GCTTGGGAAACCTCTGGGGTGATGTCTTTATGATTCAGGAACCAGTTGCA
GGAAGTGTACCAGCACATGTAAAGCAATGGTTACCATATTGAATGCAGTA
AAGTTGAGTTTGTGCTGTCTGTTGGATGATTTGTCGGTATTGTACCATGC
CATAGGGAAACCTTTTAATCCAAACATGACTTACCTTCATTCTCTGACAA
CTTGAGAAAGTTCATTTTCTTAGGACACATGTTGGTGATGATTATGAATA
CATGAGAAATAATATTCATAAACAGCAGCCTCAAAAAATAATAAAAGCAG
GAACTTGGCCCCAAAATTTCAAAACCAATCTCCAGCTTACTCTTTCTCAT
ACTTCAGAACTCTCTGCAACATAAAATCTTTTAACTTATACAATTTAACT
TGAAAATCTGTTTTATGATGTGTCCATCCAGATAAAAGCATCTAGAATTA
AATTCATGTGACATTGTCACATGTATTAGGAAGCATACAATACATCACAA
ACATCTGTTGGAACTGTCCTAAGTATATGTGTCTATTTATCATTGTTTGA
TAACATACCATATTAACTGAGCATTATATCAGATGTTTATAGTTCTAGAA
ATCAGGAAACTGAGTCAGGGAAGATTGCAGTGAGTTACTTATCCTGACCT
ACCTAGTGAGTTCAAAGCCAGCCTTGAAATACTAAACCAAATTCTCTCTC
TAATTCCCCACTCTCCGCATAAAATAAAGAATTGGCATCAAACCTAATCG
ACTTAACGTTGTAATAATTAATCTAACTTTCCCATATGTTTTGTTCCTTT
GGAAACCAAATGTTTTCCCCTTTTTAAAATCCGGAATTTCACATATTTTA
TCTATTCAAAAATACCCCTCTCCCTTTTTATTCCTCGAACATTCCCTTTT
ACCCCTTAATAAACCCCTTTTTCTCTTCAAAATAAATATTTCTCCCTTTC
TCCTCTTCAATATATACCTTTTTTATTTTCTTCCTTGCTCTCTTCACATA
TTTCTCTTCTTTTTC
| CAATTATTTNNNNACTTGCAGTGAGGCGTGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAACACCTTGTCAGGCAACT
CTCATTTGTGGGTATCTCCAGATCTAGAAGCAACAAAGCTTTCCTTTGGC
TTCTGCAGACATCCACCCTCATGTGCACACTTCCATATATAAATTAAGTT
AATTAAAATTATATGTATATAAAGAAAACAACCATGTTCCAGGAGTGGAA
TGAGAAGCAGCATCCAAGAGTAGAATAGAATGAAATGAGCAAGGATTATG
AAGGGAAAACATTATTTCCCCAAATCTGTTAGATTTCCGAAATGATGAGC
AGAGAAAAGCTGTTCTTATAGTTCTTGTGTGTCTTTTAAAATTCTCTTGA
ATGTAATCAGTATCCTTGGAAGATGTGGCATTTCTTGGTTTCATGGGATG
GGACTTATTTTTAATAAACTCTGGCTTACAACATCTTCATATGTTCTCAT
AGCATATCATATGCAGAATCAATAAAAATGAGTTCACCCAAATTTTNAAT
GTTGTTCAGGCAATTTATTTGCTACTAAAATTGTAAAAGTCAATACAGAA
ACTGGAGAAATGGAGTCATGTTATCTTAATAACTCTTTCAGTATGAGGAG
AATACGTATAATGAAGAACACATGTTGACTGGATGGTATGACATAGAGTA
GTGCAGTTATAGATAAAGCAGAATGCAGGATTGATACCAGATGTTGACTC
ACTTCAGGATTCATAAGCAAGGGCAGATCCTTCAGGAAGTGCGCAGCAAG
GTAACCAGGCGCTGCTACCGGGAGCTCTCTACACAAGTGTTGTTACTTTC
TAACAAGAAATTGCCATGTGTTCTTAAGGTTTAAAACCCCCCACAGGTGA
AACATTTCAGGGGAAAAAAAAAGATTTAGAAGTTACGTTCCATTTACCCA
TAATTTTTTAAGTTAATAATTCCCCAAAGTGGTAAAAATTTGTACCAAAC
TTAACTTTTTCCGAAATCCCCTCCTTTGGAAAAAAAAAAAAAAGTCCAGT
TTAATCCTTGGCCCCCCATAAGGATCCCTTTAAGGGTCCAGAATGAAAAA
CCTGGGAAAAGGTTCTTTTCTCTCCCACGGAAAACCTTTATCTAAGGGTT
TTCTCTTGGCCAAAAATATTCTTAAAAAACC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 11 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 7 6 6 6 8 6 8 8 8 8 11 11 11 3 0 3 17 14 20 20 21
21 30 33 33 30 21 19 19 19 34 36 42 42 33 22 22 19 22 26 29 35 35 35 36 44 33 33 33 25 25 17 18 10 9 9 9 10 10 14 19 22 24 24 22 35 32 48 38 42 42
42 42 43 42 43 47 38 38 36 36 36 36 39 44 44 39 37 42 30 25 22 13 9 9 9 10 15 30 37 59 40 40 33 33 33 31 31 37 41 43 33 37 30 43 43 53 53 37 48 42
42 32 42 24 18 18 24 29 33 40 37 46 44 48 41 41 42 42 50 50 50 51 68 68 68 57 57 48 48 57 57 57 47 43 43 57 59 68 59 44 44 42 42 43 57 57 54 48 48 48
48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 50 50 43 43 57 57 59 68 68 68 68 59 59 59 54 54 54 59 59 59 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 43 44 44
43 37 43 57 57 57 57 57 57 38 57 35 43 43 38 38 38 38 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 57 44 43 35 35 44 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 57 44 42 31 31 44 44
57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 59 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 48 48 57 57 57 57 54 54 59 59 57 57 57 59 59
57 57 59 59 59 57 57 57 44 44 43 47 32 34 13 13 13 15 18 26 21 35 47 47 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 48 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 57
57 57 57 57 48 48 48 50 48 46 34 34 28 22 22 12 12 12 11 9 12 12 12 12 12 12 12 12 18 18 23 26 31 41 59 39 43 47 47 43 47 37 33 37 28 25 25 25 28 28
24 12 12 8 6 6 6 8 8 16 16 23 23 28 26 32 34 39 44 59 59 59 39 43 32 32 23 41 32 40 42 43 43 43 43 48 54 54 54 54 48 57 47 46 43 43 39 47 37 37
37 39 39 43 44 44 36 36 25 30 36 32 37 42 43 57 57 57 57 37 37 46 46 57 48 48 48 57 57 57 57 57 54 57 59 59 68 59 44 43 33 35 35 44 44 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 37 37 52 57 57 57 57 52 52 43 44 59 57 57 57 57 52 42 42 32 35 37 50 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 57 54 54 59
59 59 59 59 59 59 57 52 52 52 52 52 52 57 57 48 43 38 24 15 15 32 32 43 43 43 43 44 44 37 37 37 43 43 32 34 17 17 17 32 32 44 44 33 28 27 36 36 42 42
42 36 32 25 17 17 30 32 40 39 39 35 39 39 44 30 30 17 17 17 27 30 30 35 35 28 28 14 14 14 28 23 32 32 33 30 32 25 16 16 13 13 10 17 13 23 23 31 31 37
37 22 22 12 13 10 10 10 10 11 16 18 15 19 25 22 27 22 26 27 26 22 23 20 20 24 24 37 29 23 14 11 11 19 21 34 29 36 19 21 16 24 22 29 29 22 22 25 19 18
12 10 9 9 9 9 9 9 13 15 19 26 22 21 13 15 18 18 18 11 15 11 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 10 19 19 24 15 14 8 8 8 11 11 12 12 12 9 11 15 12
10 10 11 10 11 9 16 8 8 8 11 11 8 8 7 8 8 8 8 8 8 9 9 10 19 23 15 13 10 10 10 12 10 10 10 19 15 16 12 12 9 9 9 10 11 10 11 9 10 13
14 16 11 8 8 10 8 8 8 10 11 16 11 11 11 9 9 9 9 8 8 13 13 10 15 10 10 8 8 8 8 12 10 10 8 6 8 6 6 8 10 12 17 10 10 10 10 8 8 7
9 10 13 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 8 8 8 6 6 8 6 8 8 11 12 10 10 6 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 9 9 9 10 8 10 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 6 8 9 9 10 9 10 13 9 9
9 12 11 11 10 12 8 8 8 10 8 8 10 8 8 6 6 10 8 8 8 8 10 8 9 9 9 8 8 10 10 8 8 8 8 9 9 12 10 10 9 8 8 6 6 8 10 10 10 12
10 10 10 8 8 10 8 8 10 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 12 10 10 10 13 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 8
8 10 10 10 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 15 11 11 11 11 11 10 10 8 8 8 11 9 11 8 8 8 8 8 8 7 6 7 7 8 8 10 10 10 8 12
11 8 8 8 10 15 10 10 9 10 8 8 8 11 8 6 8 6 7 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 7 8 11 11 7 7 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 10 10 12 9 9 9 12 12 19 19 13 13 | Open.Hide. 7 8 10 8 10 9 9 11 3 0 0 0 0 3 7 7 9 7 6 6 6 7 6 7 7 7 10 6 6 6 7 9 9 11 8 8 8 6 6 7 8 10 10 15 8 8 10 21 17 17
12 12 12 15 8 8 8 24 24 37 35 35 35 35 36 36 53 44 44 39 50 42 41 21 17 11 11 11 12 12 12 11 10 10 14 19 18 13 13 10 22 26 30 43 40 40 40 44 44 50
50 50 50 50 36 35 35 31 31 31 29 31 30 19 19 10 10 10 10 9 9 9 9 10 15 16 21 26 30 30 32 41 59 59 59 59 50 57 57 47 47 47 47 47 47 53 53 50 68 68
50 48 48 42 34 32 23 23 27 32 42 50 50 50 68 50 50 51 50 50 50 50 48 48 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 62 62 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 57
57 57 52 52 38 28 26 16 14 12 12 11 11 12 27 38 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 44 43 43 43 43 43 44 47 59 42 42 33 33 33 35 32 37 37 42 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 54 54 48 59
48 37 37 23 28 32 39 39 43 43 43 39 34 40 34 43 48 48 57 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 50 57 43 43 43 43 48 48 40 47 47 59 59 27 27 3 0 3 27 23
41 41 47 47 47 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 47 48 48 48 57 48 54 54 59 57 57 54 54 54 54 54 57 59 48 48 48 48 48 47 48 43 43 43 46 46
54 54 57 48 48 48 57 57 57 57 57 54 57 57 43 43 43 57 48 47 47 47 48 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57
57 57 44 44 30 28 28 36 44 57 57 57 57 48 43 43 43 47 47 57 43 40 30 28 30 41 31 42 42 42 28 28 42 40 39 30 30 32 42 42 43 40 31 29 19 16 19 21 21 22
24 23 28 31 25 25 22 22 31 33 36 36 37 43 39 46 47 37 37 21 18 11 14 18 25 24 23 23 28 25 29 31 29 29 33 33 31 29 29 30 30 34 34 42 42 34 36 39 39 36
37 37 32 31 25 29 29 31 31 26 21 11 11 11 11 13 18 14 17 21 34 24 26 24 24 15 17 22 22 15 16 10 12 10 9 9 10 9 14 16 20 37 29 24 15 15 10 13 13 18
17 23 28 29 33 37 33 33 31 22 12 13 12 14 15 18 33 32 30 26 20 26 14 18 18 11 13 12 13 12 12 9 9 10 10 8 8 9 10 13 10 10 13 10 10 15 26 28 24 24
14 12 9 9 9 8 8 7 8 8 10 13 10 9 9 9 13 12 14 14 10 10 8 8 8 8 9 10 10 8 8 10 10 15 15 17 17 12 9 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8
8 8 8 8 10 13 13 11 11 13 14 9 10 10 8 8 8 15 16 17 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 12 8 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 8 12 11 11 8
8 8 8 8 10 19 19 19 12 8 8 8 8 14 8 8 10 8 8 10 10 13 11 14 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 9 9 9 10 10 10 10 10 11 12 14
18 18 12 12 14 16 22 21 12 10 12 10 10 9 10 12 14 10 13 8 8 6 6 10 10 15 10 10 11 16 16 20 20 23 25 21 13 11 11 11 12 18 14 12 11 11 10 12 11 15
12 10 10 10 9 9 9 12 10 10 10 10 9 13 15 15 11 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 18 15 15 12 18 9 9 9 10 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 8 8 8 15 10 9 6 8 8 8 8 8 7 8 6 6 6 6 10 9 9 9 10 10 12 19 24 25 12 12 10 10 9 9 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9
9 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 15 12 12 11 10 10 11 11 11 11 12 19 10 9 9 10 9 |