BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123C15.T7 (MSMg01no123_c15.b1) | MSMg01-123C15.TJ (MSMg01no123_c15.g1) |
ACC | AG332842 | AG332843 |
length | 1,256 | 1,267 |
length of high quality (start - end) | 327 (126 - 452) | 596 (123 - 718) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_c15.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_c15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_c15.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_c15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:30 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTTGNNCCCCAGTGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTTTGTTCAGCTCTGACCCTTTAAGTCTCCGGGGNTATTTGANTTT
CTGGAGTCCACCCTTTAAAGTTCCTTATATATATTGGATATTAGTCCCCT
ATCTGATTTAAGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCTTT
TTCTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAGTTTCATG
AGGTCCCATTTGTCAATCCTTGATCTTACAGCACAAGCAATTGAAGTTCT
ATTCAGGAATTTTTTTCCCAGTGCCCATATCTTCGAGACTTTTCCCCACT
TTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTCTGTGAAGTTCCTTGAT
CTTTTTTTATTTGACCTTAGTACAACGAGAGAGGAATGGGTCGATTCGCA
TTCTTTTTTTTGCCCCCCCCAGTTGTACCAGCACCATTTGTTGAAAATGC
TGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGA
CCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGCTCTTCAATTCTATTCCATTGGTC
TACTTGTCTGTCACTATACCAGTACCATGCAGTTTTTTTTTCCATTTTTT
TATTAGGTATTTAACTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCC
CATATCCACCCACCCTCACTCCCCTGCCCACCCACTCCCCCTTTTTTGGC
CTGGTGTTCCCCTATACTGGGTCATATTTTGTTTTGCCGTCCTATGTGCC
CTCTCTTTTCTGTGATGGTCTACTATGTCACCTTTTTGATATTTTGCAGT
TATTTGTAAGAGCTTCGGGGTATTGGTTATTTTATAATGGTGTTCCCTTC
TTTACTTTTTGCTAATCTCTTTTATTCCTCTGGTCTTACTTTTCTTTATC
TCCCCCATTTGGTTCCCCTATTTTTCCATTTCATTTTTTGCATTGCCCCT
TTTTTAATTCTTGTTTTTTGTTTGTTCTTTTCTTTATTCTCCTTTGTTAC
TTTTCTCTCTTTGGTTTCTTTTCCTTACNTATCTTTGTTTATTTTATGTT
TACTTTTTTTCTCTCTTTTCTATCTCTCCTTTCTCTTGTAATCAAATCCT
TTCCTATCTTATCTATCTTTCTATTATCTCTCTTCTTTCCTTCGCTTTCT
CTATAATATTAGGTCTTTGCATACTCTCTTTCTTTCTTGAGTATATATTA
TTACTC
| NNNCCAACGAAGTGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTAAGAGCTCAACAATGGGTTTGATGCAGA
AATTCTCTCCGTACTTAGAACCATGAAGTGAATGAAATCAAAAGAAATAA
GAGGAAGCTGGAATCTATATATCTGGGAGGCTACAAACAACCCATAGCAT
GGAAACATTTGATGCAATAATAGAAGGAGATTAAAGAGTCTGAAATGGCT
TAGTGTGCTATTCAGAGGTCTACTTCATATAGGTACAACCTTCGAAGCTT
AGTTTTCTCATCACAAAAAACCCACAAAGCATTCACACACACACACTCAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACACTTGTGT
GTGTGTCTTAGTGCCTTTGGAAAAGTTATTTCTGTCCATGTTCCCACTGA
CTTTTTTTCTATACCCTACGATAAAAAAATGTGTAAAGTATACTCACACT
TTATTTACTTATTTTCTTATTTATTTTTAATATTATAATTGTTTCGTTCT
GAAACTCATAAAACTGAGTCCTAGATCTTAGTTTCAGGTCCCACCATAGA
CACAGGCCCTATCTTCATCTGGCATGGTGATGACCAAAACCTGTTTGTCA
ATTGCTAGAGAAAGCCGAGGGGGAACTTGTTTACAAAGAGATCGACGAAG
TCACCCAGCTCCTCGGGGAAGCAAGTCTAGAAAATGGTTGATGGTAAAAC
CGTCTCTATGGCCATAGAAAAGGAAGCAAAGCAAGAACCATGCTGTGCTG
TTTCCTAAACCTACCGTGAGTCCAACTCCTGCATCTAGAGGTGAGACTGC
AACTAAGATCTGACTTCTAAAGCTTTGTACGGAACTACTTGGAACCTTAA
AAGTATGATGCTTATAGGAGGAAGAAGTTGTACCCTAAATGTTAGAGACA
GTTGAACTTTCTGAAGTGTTGTGTGCTAACCTTGTGACAAAGGAAAGTGA
CTCCTGGGGGCCATCCTGCGAAGAAGTTTAGCCTGCGAATTTACCAGGCA
AAACTTTTTTATTCCAAGAAACCTCCCCCCAGAACCTGAAAAATCTCAAC
TCCCCTGAATTGTGTATGGTCGTAAAAAAATATTCCCCCGCAAAATTTAT
TTCTAAAGCCCTCCTTAATCCCTTTTTCCGGGCTTTTGGGGGTCTCCTGC
AATCTGATCAGGCTCAGGGCCACAACATTGTCGGAAAACAAAGCATCTTT
TCGCCATTTTCCTCCAC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 9 8 3 0 0 3 9 9 9 7 6 6 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 15 19 24 20 15 15 15 21 21 28 28 37 33 36 36 36 37 37 37 37 37 42 42 47 47 47
53 50 50 57 50 53 36 36 36 35 35 31 31 31 31 33 28 22 18 13 8 8 8 9 13 12 10 9 6 8 6 6 6 7 11 12 23 3 0 3 25 25 39 27 27 3 0 3 21 21
33 33 33 33 31 31 30 29 29 23 18 11 12 18 12 12 12 12 11 10 10 13 10 11 11 18 21 29 31 31 31 33 41 53 53 59 50 50 53 53 53 43 43 47 47 57 47 48 42 42
37 37 39 48 48 57 48 68 68 68 68 42 50 50 47 47 50 50 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 54 54 57 57 57 68 59 68 59 59 54 54 57 59 50 52 50 50 39 43 43 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 54 54 59 57 68 68
68 57 57 59 59 59 43 46 46 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 47 54 57 57 57 54 44 44 42 42 32 34 32 43 46 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 48 48 48 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 43 43 43 36 36 43 44 43 42 37 26 25 14
14 10 15 20 23 15 12 12 16 12 30 30 47 50 50 50 48 53 48 43 44 43 43 43 48 43 43 39 39 39 39 39 43 43 43 43 43 57 48 48 59 48 57 57 59 59 34 34 23 23
23 18 18 14 17 13 12 14 13 9 9 8 8 8 8 10 10 11 16 25 25 37 42 33 33 33 33 31 31 28 28 21 26 16 24 24 30 34 30 22 20 17 17 19 30 28 19 19 13 19
19 32 41 47 59 59 59 59 59 59 47 43 43 44 44 54 54 48 57 57 54 54 59 59 57 54 38 41 27 41 42 47 47 57 44 43 35 35 33 33 35 42 42 37 35 35 35 37 39 43
43 37 32 33 36 33 33 42 44 44 44 43 43 43 32 38 28 24 28 36 32 32 22 12 19 12 15 15 30 36 52 37 43 42 50 43 43 43 44 50 59 59 59 59 50 50 35 35 35 42
42 42 57 43 44 43 57 44 42 35 35 42 42 54 57 43 42 37 37 35 28 28 25 28 31 23 23 23 32 23 41 32 32 41 41 48 54 57 44 44 21 19 13 21 24 42 42 48 42 42
47 48 40 40 32 25 24 12 12 19 27 24 29 19 27 14 14 15 19 30 25 29 16 16 16 30 19 16 9 9 9 16 15 19 19 26 26 15 15 10 17 24 15 15 15 27 17 19 18 21
14 14 14 18 18 28 24 28 23 23 23 23 23 23 28 30 33 25 25 18 18 17 18 17 19 19 10 8 10 10 12 15 26 23 19 16 17 14 16 10 10 10 10 10 19 13 9 9 10 10
26 22 25 25 30 24 21 18 10 9 9 10 12 10 9 9 19 17 8 6 8 8 8 10 8 10 10 13 10 8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 7 7 8 7 7
8 10 10 10 10 10 22 15 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 17 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 10 10 12
12 10 8 8 8 8 8 6 9 18 8 8 6 6 13 8 10 8 10 8 8 8 8 11 12 12 8 8 8 15 8 8 9 10 17 9 8 10 9 9 12 12 10 10 8 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 15 12 9 9 10 9 9 10 8 11 10 15 15 18 19 16 11 9 9 14 12 13 6 6 8 6 10 8 8 6
6 8 8 11 10 11 16 11 19 12 10 8 8 10 10 10 10 11 13 16 13 11 11 11 10 8 6 6 6 8 8 8 8 6 8 10 13 20 11 11 11 11 9 9 9 8 8 8 12 10
10 11 11 11 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 12 8 7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 11 8 8 6 6 10 10 8 8 6 6 8 6 3 0 3 8 10 8 8 10 8 8 8 8 9 19 16 10 10 8 7 8 6 6 8
8 6 6 8 10 15 16 19 12 8 8 8 12 12 13 10 9 13 10 10 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 11 8 8 8 6 6 6 6 9 9 9 12 12 10 8 6 6 10 10 8
9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 13 10 10 9 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 8 8 13 13 12 8 8 8 8 8 8 9 10 10 6 8 7 8
14 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 10 10 9 8 8 12 10 12 12 9 8 8 8 10 10 11 15 13 17 14 11 10 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 8 6 6
8 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 10 10 10 6 6 6 7 10 13 14 9 9 9 8 19 17 19 10 10 8 9 10 15 19 29 19 29 28 35 35 35 30 30 30 32 37
34 34 36 50 57 53 53 50 50 50 50 42 27 27 12 11 12 10 10 10 8 8 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 28 34 47 36 50 50 50 50 50 50 53 53 53 57 50 59 59
59 59 50 47 37 23 23 10 10 10 10 10 13 13 13 13 11 15 12 13 13 15 21 23 32 30 44 50 50 50 50 50 57 57 57 53 48 48 48 48 48 59 48 48 48 48 48 54 34 32
22 27 41 41 41 47 47 43 47 47 57 57 57 41 41 41 41 50 50 50 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 57 57 50 50 50 50 50 48 48 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 54 52 52 52 52 52 57 52 52 52 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 20 20 35 43 44 44 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 39
39 24 24 13 13 12 13 12 39 12 12 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 44 44 29 29 17 23 23 23 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 43 43 43 39 62 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 38 33 12 11 11 33 33 62 52 62 52 52 52 62 62 62
57 33 32 12 12 12 33 38 59 57 52 52 52 57 57 57 43 39 24 39 38 38 38 52 52 57 57 44 44 35 35 35 43 43 52 52 45 45 52 57 57 57 57 57 52 43 44 32 32 23
38 38 43 43 52 52 52 52 57 57 59 54 52 52 52 43 37 52 52 43 43 52 52 52 57 44 57 43 43 46 57 50 50 50 50 41 43 43 44 44 44 42 35 35 44 42 43 43 47 46
46 46 44 44 42 44 35 37 37 37 32 27 22 25 30 36 36 43 37 32 30 30 32 28 41 41 30 32 16 15 11 21 21 29 29 29 36 43 42 42 37 42 37 33 39 30 30 42 28 28
14 15 15 20 30 28 23 23 23 32 34 39 37 26 24 24 24 24 28 24 23 23 14 9 10 10 10 15 19 24 31 31 24 26 37 35 36 37 39 37 32 32 28 28 28 28 31 29 29 29
24 22 28 37 37 40 46 43 43 35 31 24 24 31 31 37 19 13 8 8 8 12 14 20 15 15 15 19 15 19 28 28 30 28 28 30 21 16 14 16 11 14 14 21 21 28 23 23 16 16
16 23 26 28 30 22 22 14 12 12 15 12 19 19 16 9 9 9 11 9 9 13 15 17 20 20 30 32 25 18 8 8 8 10 11 10 9 12 12 24 31 37 29 21 15 15 19 19 19 14
14 14 14 16 13 10 9 9 12 12 13 18 18 22 20 19 24 24 14 15 14 10 10 8 8 8 8 11 10 10 11 13 18 14 18 20 24 24 15 17 11 9 8 10 9 9 8 8 8 8
8 8 8 11 12 15 19 23 17 15 10 10 10 9 10 9 9 9 10 10 10 10 10 12 9 9 9 9 13 10 11 13 11 17 19 21 15 8 8 8 8 11 11 9 9 9 12 12 18 18
24 32 32 23 13 16 18 20 14 13 10 10 10 9 9 12 12 12 11 9 9 10 10 13 10 10 8 8 8 8 9 7 7 7 7 8 6 6 8 10 13 15 18 16 14 12 12 8 8 8
8 8 10 12 12 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 8 8 6 6 6 6 10 10 9 10 9 10 10 8 8 10 10 10 8 7 7 7 8 8 19 15 16 10 8 8 8 8 8 10 18
14 18 10 10 10 12 22 12 10 8 8 8 8 9 9 11 11 12 11 12 9 8 8 8 8 8 9 17 18 8 8 8 8 13 15 10 10 10 13 10 11 8 6 6 8 10 10 10 8 8
10 9 8 11 10 10 14 10 9 9 8 10 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 14 14 9 8 8 8 8 8 9 11 11 8 8 8 8 8 8 12 12 15 10 10 10 12 8
8 7 7 8 8 8 7 9 9 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 10 11 9 9 10 12 12 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
9 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 19 10 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 10 10 15 7 7 6 6 8 6 8 8 8 10 19 14 13 11
9 9 9 9 11 10 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 |