BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-141K16.T7 (MSMg01no141_k16.b1) | MSMg01-141K16.TJ (MSMg01no141_k16.g1) |
ACC | AG346482 | AG346483 |
length | 1,289 | 1,262 |
length of high quality (start - end) | 687 (88 - 774) | 645 (92 - 736) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_k16.b1 PHD_FILE: MSMg01no141_k16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:00:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_k16.g1 PHD_FILE: MSMg01no141_k16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:00:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCTTATCNTTNNNNNGGCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTTCAAAACTAAGTAAATATTTTATTTCCTCTATATAT
AACAAAGATGAATGCAACAGACCATAAATATGTGAGGCTTCTCCATAACT
AATTCAATAGGATGATCCACATGATCTAATGTTAGAGACTGGGACTGGGG
AGCATTTCAGGGGCAAGATAAAAGTATAGCACAATGGATATGCCAACAAA
TATATGAGGATGACCATAGAGAAGACTCCTAGCAATGAATATGGATACAC
TAACCCAGCCAAAAAAAAAAAATCTTCTACCTACAGTTTGTCCTGTCTGC
AAGATATGCTGGGGTAAATGTGGCACAAAACTTGTAACAATGACCAACCA
ATTAGTCTTCCAAATTGACATCCATGCTAGGGGAGGAAGTCCAGGAACCA
GAGACTTGATAGCCCAGAGAGCTAAGGTAGAACCTAACATGAGTGGGAAA
AAAAAGTCAATGAGATGATTTTTAATGATACTCTGCTACATTCCTGATAA
GGCCAACTGCAAAGACCCACGAGCAGACATCAGGTGGATGTCAGGGAATC
CTGTTGTTGTAGTCAGAGGATCTAAGGACTCAAACAGAACACAGCCCACA
GGATCAGCTAATCAGGGCTCATATGAGCTCACAGAGACTGAATCTAACAT
CAGGGAGCCTGTAGAGTTTTGACTTAGGTCTTCTACCCATGTGTTAGGTT
GTGTAGCTTGATGTTCTTGTGGTACTCCTAACAGTGGGAGCAGGGGCTGC
CTCTGACTCTTTTGCCTGCTTTGAGGTCTTTTTCCTTCTATTTGGTTGCC
TTGAATAGCCATTTTATTAAGGGAAATTCCTCTTCTTACTCTAACTTTGC
AAGCCAATGTTGGGTTGATATATCTGGAAAGGCCTGTTTATTTTTCTGAA
TTGAAAATGGAATAGGAATGGTTTCTGGTAAATAAATAAAGGTTTCTTTT
TATCTTTTCTCCTTAGTTATTTTTTCCCTTTCTTTCCTTTTATTTTCTTT
TTTCCTTCTTCTTTTTTCCTATTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTCTATCTTT
TCTTATCCTCAGTTTCCTGCCATTGTCTTTTCTTCCTATTTTCTCTTTTT
TTCNCTGTTTATTTTCTCCCCTCTCTTTTCTTTTCTTATTTCTTTCCTTA
TCATCCTTTCCTTATTTGTCCTCTTTATCTTACATCTCTACCTTTCTTCA
TCTTCATTCTCTCTTTTTACTTATACTCATTTTTGCTTG
| NCCGATTCTTTTTNTAAGATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTTAAAACTACAGTCCCAGT
GAAATGCCGCTTTTCTTTACCCATATTTTCTTTTCCCTTTTTTTTTTCAT
TTAAAAAATTCATTTTTCCTGGTGTATTTTAGGGTTGCTTTTTTTTTTGA
CTGTTTCGTGACTCAGTGTTTGAAAATAAGTTATTAACTAAGCTGAGTTA
ATGTTTACCAGAGGCCAGATGCTCCTCCCATTCCATCACGCTGTTGGAGA
AAATCCCATTGTAAATGAATGCTCCAAGTAGACTCAAGTTGCTCAGTTTA
CTAAGTATTCTTGTCACTTTGTGGAATTGATATTAAGAATTATATTCTCC
CGATGATTTTACTAGCACTGCAGCCTTGTTTGTATTAGAGTGAGCCGTAG
AACAAAAATCATCCACTGCTGTTTGGCTAGGGCTGATTCACTTTCCAGAC
ATGCAGGAAGAAAACCTGGTTTGGGAAGGAGTTTTTGCTTGAGTACTATA
CTCATTTACAAAAAGTATTTTTGATATGTTACTGATTTGTGTTTGTTAAG
ACAATAGCAATGGTATTGGTAAAGATGATATTGCAGTAGAATTGTCTTTA
AAGAAAGATTTTTGTCTAAGTAAAATCCATACCAGATAATTTTCTGTCTG
CTTGTTTATTTTTATTTGGCTGTAGATATATGATTGATTAGGCAATATTA
ATGATGTTTTAACGCTATCATTTATTTCATTCACTTACTTATCCTAGTTA
AAAAGGAGGCATTAAAGCATGAAAAATTTATTGTTCGGAGTTCTTAAAAT
AAATGACAGTGAAGTTAATTTTAAAATTTGTCTAATTTTTCCCATTTTTT
TGGTTAACTTTAAAAATAATTTTCTTGAATGTAATTGTATTATCTTGAAG
GAAATGCCTTATACTTTGTTCCGGACCATATATTTAGTTTTAATGTATTC
TTGCAAATCCTTAAAAATTTTGTTGTTTTTCCTTACAATAACTATATCTT
TTCTTTTTTTTTATTAAATTTCTCTCCATGTAAGTTTTTATATTTCACTC
CTTTATTATTTTCTTATATATACTTCTCTCTACCATATACCATTCATTTA
TGTTTATCTTTATCTACCTACCTACCTTCTCAATTTATAATCTTTCCTCA
ATATATTTATTTTCTCTTTTATTAAATTCTTTTCTTTTCTTTTCTCTTNT
TACTATCTCTTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 6 6 6 3 0 3 3 0 0 0 0 0 3 9 3 6 8 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 15 19 8 8 8 10 12 14 22 23 37 37 34 37 34 37 37
42 42 42 47 48 50 50 50 50 47 42 53 43 22 15 10 10 26 26 36 33 33 31 29 28 25 21 10 9 9 9 9 12 14 14 11 12 12 24 27 33 30 31 31 35 36 53 53 53 53
53 53 53 59 57 57 53 53 53 53 53 53 44 50 50 50 59 27 27 11 11 16 15 21 19 25 30 37 37 33 33 33 48 48 57 57 57 47 32 32 23 23 23 32 32 43 47 47 47 47
47 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 59 59 59 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 39 39 39 27 16 14 16 27 43 59 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68
68 68 68 57 57 52 54 57 57 52 54 54 57 57 57 57 57 59 57 52 57 47 57 57 57 68 68 57 57 57 59 54 57 59 59 57 57 57 57 57 54 54 43 48 44 57 57 68 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 48 48 47 47 48 50 50 68 68 68 68 54 54 48 48 43 47 43 43 43 43 43 48 57 59 48 43 43 43 43 43 43 43 43
43 43 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 47 59 44 41 41 44 59 59 59 47 59 59 59 48 48 48 59 48 48 48 48 48 50 57 57 59 59 44 39 39 39 39 39 41 39 37 37 37
37 39 41 37 37 39 39 31 31 39 31 34 34 39 39 39 34 37 39 39 39 41 41 34 35 34 37 34 39 35 34 34 39 39 44 37 37 44 41 44 39 39 39 36 29 32 36 36 37 37
40 40 41 39 37 35 24 21 13 14 14 16 14 12 18 23 20 20 35 32 18 21 11 11 18 23 32 28 22 14 12 12 19 8 8 8 9 8 12 16 24 29 24 26 23 28 28 28 31 31
31 35 37 31 34 22 22 22 30 30 32 27 27 14 14 14 19 23 28 28 33 30 37 21 15 11 12 10 14 14 24 18 17 15 20 19 19 14 19 23 23 19 19 25 25 23 10 11 9 9
9 9 24 21 13 17 10 10 10 10 13 13 26 19 19 14 12 9 9 8 8 8 10 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 10 10 14 9 9 9 11 11 9 10 8
8 8 8 9 8 10 10 10 9 9 11 11 11 11 11 11 13 9 9 9 9 10 11 11 11 11 11 12 13 13 9 9 8 8 8 8 9 8 8 10 12 19 17 10 8 6 6 8 6 8
8 8 8 8 10 12 12 10 12 9 8 8 10 10 8 8 13 13 10 8 8 8 8 10 11 10 10 10 9 10 10 11 11 12 11 15 11 11 11 11 9 9 9 8 8 6 6 8 8 13
13 10 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 10 13 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 11 13 17
12 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 12 12 11 11 8 8 8 8 8 8 9 12 12 15 19 15 11 11 11 12 12 11 11 10 15 12 12 13 8 8 6 6 8 8 10 10 13
10 11 11 9 10 9 9 9 10 10 10 11 9 15 12 12 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 8 9 9 9 9 8 10 10 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 10 10 9
7 7 3 0 3 9 9 9 15 11 9 9 12 15 11 10 10 9 9 8 10 7 6 8 6 11 8 8 6 7 9 9 10 9 9 12 12 7 7 8 8 6 6 10 8 8 8 8 6 6
8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 7 6 8 8 13 9 8 8 8 8 10 13 10 17 10 12 8 8 8 8 8 6 6 13 13 21 10 10 10 11
11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 10 9 7 7 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 13 11 10 8 7 7 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 8 7 10 8 8 8 8 19 19 27 3 0 3 11 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 9 9 9 8 6 8 6 8 10 10 15 19 17 8 9 10 23 19 24
10 16 19 28 28 35 35 37 37 37 37 34 35 36 38 38 36 53 41 50 50 50 47 27 21 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 7 11 10 23 23 37 37 33 33 33 33
36 36 53 57 59 59 59 53 53 53 50 31 31 31 31 30 29 23 21 15 8 9 9 9 8 12 13 28 34 37 37 37 41 48 53 44 39 39 35 35 35 37 59 59 57 57 53 53 53 50
50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 68 54 54 48 42 39 42 42 47 50 50 48 57 46 46 39 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 48
48 48 48 57 48 57 50 57 48 48 50 57 57 57 57 43 43 43 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 50 43 43 50 43 57 57 57 57
52 52 52 57 57 68 68 44 44 27 27 27 44 44 59 59 35 35 35 44 44 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 54 54 52 52 52 52 52 52 52
59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 52 57 57 57 57 52 57 54 57 57 57 54 50 57 57 57 57 44 44 29 29 29 44 44 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 54 57 57
57 57 46 59 43 43 44 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 48 48 43 43 43 48 48 57 54 54 54 54 54 54 57 47 47 35 35 35 59 59 59 59 59 59 57 57 48 57 57 57
48 48 48 48 48 48 59 41 41 26 18 15 12 11 11 12 16 25 34 37 59 59 59 59 59 59 59 48 59 48 57 48 48 48 43 43 30 30 30 42 42 48 48 48 48 48 37 37 28 28
32 43 43 57 57 47 47 43 43 43 48 47 57 59 54 48 48 48 48 48 59 59 57 59 57 57 57 57 59 59 59 44 44 32 42 42 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 37 37 37 50
50 57 57 59 57 54 46 57 43 43 52 57 50 59 52 43 50 43 50 57 52 50 43 38 38 38 44 43 52 52 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 59 68
59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 44 59 52 52 52 59 59 59 57 57 57 59 57 57
57 44 44 43 43 29 43 43 59 43 52 52 57 43 43 50 50 43 57 57 57 57 46 48 48 48 48 48 48 48 50 50 43 44 44 41 42 41 36 28 38 38 57 47 54 54 59 59 59 57
57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 44 42 32 32 31 36 36 41 43 48 47 47 48 50 48 48 54 54 57 59 57 48 48 48 48 48 53 53 57 57 57 40 40 28 28 32 39 34
59 43 43 40 43 43 48 46 59 59 59 37 37 35 36 32 37 30 30 21 21 11 11 11 11 11 21 21 28 28 24 28 27 20 20 23 23 20 23 21 13 12 11 11 10 13 19 28 26 16
18 22 24 28 31 31 15 12 19 19 12 11 13 12 10 15 10 10 8 8 8 8 8 8 23 9 9 9 10 10 26 21 17 17 12 16 11 16 13 13 12 10 21 12 12 8 8 8 8 9
8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 17 18 18 14 17 13 10 11 13 16 11 14 11 9 10 9 12 9 9 17 15 9 9 9 9 9 9 10 10 14 14 15 19 20 14 16 15 15
10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 9 9 9 14 14 19 14 15 19 23 15 10 10 10 10 10 12 12 14 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8
9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 12 16 9 9 8 8 10 8 12 10 10 10 10 10 8 9 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 10 10 8 8 8 8
8 8 8 10 11 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 9 11 10 10 10 7 6 8 8 9 9 9 9 11 11
11 9 10 10 12 8 8 8 8 8 8 11 11 15 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 9 11 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8
8 8 6 6 8 13 18 10 10 11 13 11 10 12 9 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 8 9 9 9 12 15 11 11 10 12 9 9 13 9 9 11 11 11 9
9 8 8 6 6 8 7 7 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 13 10 8 6 6 8 8 9 13 10
8 6 6 7 7 9 10 10 9 9 9 12 12 8 8 6 6 8 8 11 8 9 8 8 8 8 10 12 16 10 10 9 9 8 8 9 9 6 8 8 8 10 8 10 10 11 8 10 8 10
10 10 10 8 6 8 8 8 11 15 13 8 8 6 6 10 12 18 8 8 6 7 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 12 10 8 8 8 8 14 10 10 10 8 10 10 3 0 3
8 8 9 6 6 6 6 6 6 8 6 6 |