BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-264N13.T7 (MSMg01no264_n13.b1) | MSMg01-264N13.TJ (MSMg01no264_n13.g1) |
ACC | AG406280 | AG406281 |
length | 726 | 816 |
length of high quality (start - end) | 317 (46 - 362) | 167 (130 - 296) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no264_n13.b1 PHD_FILE: MSMg01no264_n13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:02:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no264_n13.g1 PHD_FILE: MSMg01no264_n13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:02:09 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTCTTTTATTTACATTTGAAAGATAGAAGCTGTACAAACAGCTTGC
TATTCTCTTTCTTTTGGGTTCAGAATAGTGAATGGGAACATTGTAAATGC
CTTGCATGTGGAGGAGACTATATAGGATGTGGTACATGTTTGCTTTATGA
AACTATTATTCTAATGCTAAAGTATGTTGTATTAGCCATGCTTTAGACAT
GACTTTATTGAAAGATCTGATGGCTAAGCAGCTTGTATTCATCCTAGGAC
GCCATCAAATGCCTCTCTAGTATAACAGTATACTATTATAGTTTAATATA
TATAATATTCTATTATAATGCCACCCCCCCCACTCTACTAGTATATTCAA
ATGGATAATAATAAAATTTCCTGTAAGATTAAAATAATTAACAAACTAGA
AAATGTAAGTCTTAAGGAAATCTTATTTTTAAGTTGAAATGGCTTCTACT
AATCTGATTTAGCAGTATATTATAGCAAAAACAATCTAAAGGACATTAGA
TTGGCCCTGCTTTACTTTACTAAAAGGCTCAGTGGTCTGTAAATTATATT
ATATCTATTTTAATATATTTTGTGAATGATGACAGTCACTGTCTCATGCA
TAGTCCTTGTTAATAGTGTCCACTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTA
AGATTTATTTATTGTTAATTGAAATN
| ACGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTTTTCCAGGAATTCAATATCCTTAGCCACCAAGGGAAG
GCAAATTAATACTCTTTGAAATTTTCTCTCACCAAAGTCAGAATGACTGT
TTAAAAAGGAAAAAGAATGTTGGCATGTATGTGTGGGGGGAGGGGTGCAC
CTATTCACTGCTGGTGAAAGTATAACTTATGCAGCCAAAGTAGAATATGT
ATGAAATTTCCTCAAAATTTTCAAAGTATATCTACCATTTGATTGATCTA
TACCACTCTTGGGAATGAACCTCTTTTTTTCTGTATACTACTATAGGCAT
ATATAGGATCATCTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCTGTATTTT
TCCTATATGTTTATTATCTCCCCCCCTGAATAATGAAAATAAGGTTTTAA
TTAGAGACAGTATCTTAATCGCTACTGTATAATTACTTAAATAAATCACA
TAAATTTTAAACTAATTCTTTATAATTATTGATAAATTTATTTATACTAA
ATAAATCATTTATTTTTTCTTACAATTCATAATATATAACTAAAAATAAT
TATAATACACACTACTACTATTGTAATTGCTTATTTTAACTCCTCATTAT
TCACTCACTTTCATCTTCTTACTTTTAATTATCTACTTAAATTAACGCTA
CCATCGATCAATGAAAAATTCTAATTCATATCTATTTATTATACTCATAA
CCATTATTTGTCCACAGCTCAACTTACTCTTTCATCTATACAAATTCACA
CCTCAACTTATTAGTC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 13 18 33 34 29 28 28 22 22 32 37 33 33 33 37 33 33 43 48 35 30 30 32 32 36 48 48 44 43 36 43 43 43 40 29 22 18 22 22 42 34 68 68 42
42 41 41 48 50 59 59 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 57 68 68 68 51 51 50 50 47 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 43 43 43 37 37 37 50 50 51 50 68 50 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 39 32 31 20 20 21 30 41 47 43 54 54 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 35 23 23 10 10 9 9 9 11 12 11 12 8 8 6 6 7 8 8 8 15 28 12 9 9 8 8 8 14 16 34 34 43 43 50 50 59 59 53 57 53 50 50 50 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 28 13 10 8 8 8 10 15 23 41 41 47 48 48 59 59 59 57 57 43 43 37 36 39 39 35 35 37
39 43 43 48 48 48 59 59 59 47 59 59 43 41 41 44 59 44 47 47 50 50 50 50 53 53 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 57 57
57 57 57 59 57 68 68 68 54 54 54 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 43 43 46 43 43
59 43 41 41 43 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 57 57 59 57 57 57 48 48 48 48 48 47 47 47 47 41 37 43 36 37 41 37 59 39 46 41 41 48 48 48 50 59 59 59 59
48 48 48 59 47 47 47 59 41 44 44 39 37 41 43 47 47 47 47 46 46 48 48 48 59 47 39 34 34 34 34 34 39 39 40 40 42 48 39 47 39 39 39 39 39 43 39 39 39 39
34 32 30 30 37 37 59 59 41 41 37 36 28 32 30 34 34 37 37 37 37 37 40 39 39 43 41 37 37 39 36 35 31 29 31 32 33 33 33 33 29 23 19 19 21 23 30 23 17 19
18 18 18 18 15 17 18 30 34 19 19 9 12 12 10 8 8 9 8 10 11 11 9 9 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 13 14 9 10 9 9 25 17 31 32 37 37 37 41 41 41 50 50 53 53 48 48 41 41 41 41 25 25 11 9 9 9 9 9 9 9 9 10 14 13 20 15 15 30 30 33
36 36 33 33 41 50 42 41 30 25 16 9 9 14 8 8 8 7 7 7 10 10 16 16 18 16 18 21 29 37 44 53 53 57 59 57 47 47 50 57 57 57 57 57 47 48 48 48 57 42
48 39 39 39 44 57 57 48 48 48 53 53 57 53 53 48 41 32 16 16 13 17 10 8 6 6 6 6 11 12 24 26 37 37 37 37 48 48 48 48 33 34 34 34 37 36 47 47 50 50
57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 57 41 41 41 41 41 41 47 43 43 47 48 48 57 54 54 54 54 54 57 46 43 43 43 43 48 48 48 48 43 48 32 32 19 19 19 28
32 39 43 37 39 39 36 39 43 43 39 43 39 39 43 28 28 17 17 12 20 9 11 11 21 21 33 37 35 33 30 28 25 23 31 28 20 20 28 30 25 17 15 13 23 18 20 31 28 32
37 32 32 13 13 11 13 13 28 32 43 40 37 28 28 28 37 37 39 37 28 25 23 12 15 14 15 15 18 21 32 39 32 35 35 31 31 23 23 23 23 34 34 28 27 13 12 12 23 23
28 20 20 20 20 20 32 28 31 26 15 13 15 15 19 19 18 21 18 14 14 8 8 8 9 17 15 8 9 9 11 11 12 10 8 8 8 15 28 37 28 28 23 28 22 23 14 11 10 10
9 16 15 28 15 13 11 17 13 17 18 18 15 13 14 14 19 23 32 26 29 23 25 22 18 14 12 12 13 19 22 11 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 7 10 12 10 13
10 12 12 28 28 15 15 10 12 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 8 10 11 11 16 11 16 15 10 14 12 11 14 11 10 11 11 17 18 11 11 11 11 9 11 10 8 10 8 8 8
8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 7 7 9 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6
8 8 10 11 12 8 8 6 6 8 8 10 8 8 7 7 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 11 11 10 10 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 10 10 8 10 8 8 8 12 16 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 14 12 12 9 8
8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 10 9 8 7 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 13 12 13 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 6 6
6 6 6 6 8 8 10 10 8 10 8 6 6 6 6 8 8 12 14 17 11 8 8 9 9 11 12 9 11 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8
9 9 9 9 9 9 6 8 6 6 11 8 6 6 8 8 10 11 15 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 11 12 19 19
15 15 11 15 12 12 11 11 9 10 9 11 11 11 11 12 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 7 7 9 9 8 8 9 8 8 8 6 6 8
8 8 9 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |