BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-280C02.T7 (MSMg01no280_c02.b1) | MSMg01-280C02.TJ (MSMg01no280_c02.g1) |
ACC | AG417300 | AG417301 |
length | 721 | 754 |
length of high quality (start - end) | 293 (74 - 366) | 234 (132 - 365) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no280_c02.b1 PHD_FILE: MSMg01no280_c02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:20:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no280_c02.g1 PHD_FILE: MSMg01no280_c02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:20:54 2005 |
singlet/doublet | singlet | singlet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (31,551,977 - 31,552,266) | (32,930,664 - 32,930,897) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTCCCTGGTGTCTCCACATCTGAGACGCCCAGCTTACTTCTGTTTTG
ACACAATCAGTCTCCTTCCTTTACCCCTGACTCTAGTTCCTATAGTGAAT
GGAGGGCTGTGGCCTCTACTTGACCTCTAACCCCTCACATCTGCAACCCA
CTCCGGTTTTCTTTGATTTTGTACTGGAAGGGAGACCAGGCTGGAACTGT
GAGCAGCCAGCTCTTCTTTGGCAGCCTCTAAAGCCAGGACCAGTCATCAG
ACAGCAGGCCCTGGGGCTTGAGAGGTGCTCATGTTACAAGGGTAAACAAA
ATGAGCCCATTCGTATTTTTTAGTTCCCATCCCCTCTCCTATATTTTCCC
TGAAGGTGGGGGAGGAGAGAGCAGCCATGTCATGCCAGTGGCCCATGGGA
ATTGTGCCCGTTCTTGGCACCTGAGAAACCCTTTCTTCTGCTCTGGCACT
GTATTGGCCTGGGAATGACCACTACGGTAGTTTAATTCTGACAGCTGTAC
AATAGTTTCTTCCCTTGTAGAGCCACCGTGTTCCTTCACAGCCTGCAAGT
CTCCTGGGTTGTCAGTATGCTAAATGAATCACCTGAGTAGATTTTTCTCA
CTAGGTGTTCTGGGTTATGGCGCCCTTTCCCCTGCTTCCGTCTGCTTCTG
CGATATAGAGTAGCCTCCAAG
| CGAATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTTAAACTAAATGAAACTCATGC
AATTATTATCAAATTGTATGTTTCACCACCAACATAGAAATCCTTCATTA
TTTTGTAAGGACCTTACAACTGTGCCAGGCTCAGAAACTGTTACATGGCT
ACTGGCTTATTTGGGGTATAACTACTTACCTATGACCTCACTTAAAGGTC
TGGGTGTCTGTCTGTCCTACACCAAAGGCAAGCAGAGTCATTAGTAGTAT
TCTCAAGGATGTTCTGATTAAACGTTACACTAAACTTAGTAACAAAGAAG
TCAGCCTTTAGTCCTATTTATTTATCACCCCCACCCCGCGCACAGGAGAT
CTCTGTGAGCTCTAGGCCAGCCTGCTCTACAGAGAGAATTCCAGAACAAC
CAGAGTTACATACACAGAAAAACTATGTCTTGGGGAAGAAATTAAAAATA
GAAAGCAGCAGCAGCGGGGGGTGGGTGGTGGGGGATATTTCCACCTCATC
TCCCCTCTCACCCTTTTAATTTCCCTTTATCCTTTTTTCCTCCTTTTTTT
CTAACCTCTCCTTATTTTTTTCCTCTTTTTTTACCTCCTTTTTCTATTTC
CATTCTCCCCGCCTTTTCCCACTTATCTTCTCCCCCTCTCTCCTTTTCTC
CTCTCCCCACTCTTCTTCTCCCCCCCTCTTCCTATCTCACTTTTTATATT
CTTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 13 13 15 24 37 59 47 37 37 37 31 31 30 23 23 25 28 28 28 47 48 30 30 31 31 30 23 21 8 6 6 6 6 8 11 12 11 15 15 26 30 33 39 41 47 36 36
36 36 44 44 59 50 47 34 34 16 10 7 8 8 8 8 11 21 18 24 22 23 22 19 21 21 28 39 57 57 57 47 50 47 50 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50
50 50 50 50 42 42 37 50 50 53 53 59 59 59 59 41 25 18 12 12 12 22 22 19 10 10 10 11 17 19 41 41 50 47 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 50 53 53
53 53 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 57 57 59 59 52 52 52 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 54 54 47 59 57 57
57 57 57 57 59 59 57 48 48 48 57 57 57 57 57 59 57 57 46 44 37 32 28 29 29 30 30 30 33 42 43 57 57 48 48 48 57 48 43 43 46 57 43 43 47 43 48 57 48 57
48 48 48 48 59 59 47 59 31 27 17 8 8 8 8 8 9 8 7 6 6 6 8 8 11 11 11 11 11 11 11 12 12 22 28 28 36 34 50 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59
59 50 50 50 43 40 35 35 35 39 39 43 43 48 48 57 48 39 47 39 37 37 37 37 24 24 19 18 12 10 10 10 10 9 11 12 15 18 16 26 26 37 33 33 37 47 47 47 36 42
34 34 39 36 37 35 35 35 39 42 43 43 43 39 43 30 28 28 28 37 43 43 43 21 21 14 28 24 39 43 43 34 40 37 30 30 37 37 40 40 43 43 39 30 28 17 24 24 37 37
43 37 37 28 28 20 24 24 28 23 16 16 19 26 31 30 37 26 26 12 19 12 16 16 15 13 11 11 11 11 18 24 37 37 40 37 37 36 36 22 23 12 11 11 12 21 24 22 19 15
14 11 11 11 11 11 19 23 36 59 59 36 34 20 18 18 19 16 12 12 13 16 11 11 9 9 9 10 11 7 6 8 6 14 15 25 21 24 15 19 12 14 14 24 21 15 15 11 11 11
16 13 13 11 11 10 10 10 11 10 8 8 8 8 10 11 11 12 11 11 11 16 13 17 19 22 24 25 22 20 16 16 11 15 15 10 10 10 11 12 12 16 13 20 20 18 18 14 14 14
10 10 8 8 8 8 9 19 19 16 14 10 10 9 10 10 10 11 12 12 14 15 12 20 23 21 21 9 8 8 11 8 8 8 16 16 34 23 23 18 18 12 13 11 11 17 19 10 10 9
6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 7 7 6 6 8 8 8 10 13 11 11 | Open.Hide. 7 7 7 7 6 8 6 6 8 15 17 36 37 37 37 34 37 41 39 39 37 37 37 39 50 50 50 50 57 44 32 22 15 11 11 15 15 10 13 9 13 13 29 21 32 26 32 36 44 44
47 47 47 47 47 39 39 48 48 34 25 16 10 15 10 10 13 12 12 11 10 10 16 16 33 33 43 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 57 53 53 53 53 53 53 53 53
53 53 57 57 57 57 57 42 38 38 36 36 41 50 50 50 41 34 22 17 9 9 8 10 10 7 6 6 6 6 8 17 22 29 37 37 47 37 41 47 47 50 38 42 42 42 43 43 53 59
59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 44 44 44 44 48 57 57
57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 37 42 30 30 30 37 33 37 43 59 43 59 48 57 57 57 48 48 48 59 48 48 48 48 59
59 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 31 23 19 13 14 10 11 11 12 12 17 10 8 8 8 8 8 10 18 13 10 12 10 17 12 8 9 9 10 10 22 30 41 42 50 50 50 50 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 35 35 37 59 47 47 47 43 43 46 46 46 39 43 28 28 12 12 11 11 11 10 10 10 10 10 13 21 24 34 39 41 39 37 31 24
15 15 13 21 18 28 23 34 32 35 35 39 35 39 39 47 48 48 57 38 47 47 44 44 37 47 46 47 47 43 41 37 36 41 41 34 34 25 24 29 29 33 33 33 37 39 43 36 37 28
28 20 32 32 32 32 20 20 24 24 28 23 23 23 23 28 23 23 23 26 30 28 7 7 6 6 6 13 19 21 15 18 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 7
10 12 17 16 15 9 8 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 8 9 9 10 10 13 10 8 8 8 8 12 18 18 12 11 11 12 15 15 15 12 9 9 9 11 14 15 9 9 9
9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 16 16 11 11 11 11 11 19 22 26 10 10 10 10 10 10 10 16 18 16 12 9 9 9 10 10 15 19 12 14 14 9 8 8 8 8 10 10 13 10
10 8 8 8 10 10 10 12 8 8 8 8 8 9 15 15 20 18 18 13 11 8 7 6 6 8 7 7 8 8 11 12 17 15 10 10 7 7 7 10 10 10 10 12 14 14 21 18 19 21
19 13 14 12 10 10 12 13 8 8 8 10 10 9 9 10 10 12 10 10 13 16 30 28 10 10 6 6 8 8 12 8 8 6 6 10 10 8 10 10 10 10 11 11 11 14 11 11 8 8
8 8 8 8 |