BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323K12.T7 (MSMg01no323_k12.b1) | MSMg01-323K12.TJ (MSMg01no323_k12.g1) |
ACC | AG442017 | AG442018 |
length | 1,174 | 1,281 |
length of high quality (start - end) | 587 (129 - 715) | 647 (128 - 774) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_k12.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_k12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_k12.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_k12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:27 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCAATTTNNNNNNNNGTCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTTGTGGTCCTGTCACCTTTAGATCTTGAGGTCACCATT
GTCACTTAGATTTTATCTTTGTGGGCACAACTGCTTACAGAGAATATGAT
TCTGCCTCATGCTGCTGTGCCTTAGTGACTTTTTGGAACTCCCTTGTAAT
TCTTGCATTTTGCATGCATGCTTGAAAAATAATCACACCATGTAGATTAT
AATGCCAAGTTCTAGTGCCAACTTGAGATGTTGTCTGGATTCCTTCTACT
ATAGCTGTCATGGTCTTTGGGAATGTTGGCAGCTGTTGTGAGAAAATACT
TGTCTAGTTAGTTATTTTGGTGTAAGGATTGCTTTCAACATTTATAGTTT
TTTGTCTCTCAATTCAAATAAGTTTGTGTTTTCAGAAATTGAACTTTAAT
AGGTTGAGTCTAAGTCTATGGGTACTTTTTCTTTAGTTCCAGTATTAGGT
GAGAGGTTTCACTTTATGTGTGCTCAACTCTTTAATAGCCTCACTAATGC
CCTCTTTTTCTATATCTTAAAGCTTGCCTGTATTTCTGGCCTATATATCC
TTCATCTCTCTACTCTACTTGCTGCTGTTTTTCACTGTAAATCTGGCTAA
GGACACTGAGCAATAATCATGCCACATGTTGAACATTATGCTGTCCTGAA
TTGGATTTCTTCAAACACATTAGTCCTTTACTTTTAAACTGAGCATCATT
CACACTCACAGGGCACAGGCNCCATATACAATATACAGAATATAACAGGA
GCATGAAATACCTGTAGCCCAGTTCTCAAAAGAGTCTTTATTTCCCGCTG
AAACCATGTGAGCTCGGTCTCCACTGTCTGTGTATCTCTCAGNATTCGGA
TGTCTTAATATGTTAACAAAATGCCTAATTTACCCCCAAATTAAAACTAT
TCCTAGCCCACGTAATCAAAACTCCTTTCAAATTCCTTTCGGAAAACAAC
TTGTAAAAGCCCCATGAAATCCTTTTGGGTTAACTTAATTTTTTATCACA
AGCCCTCTTCTTTTTGTTTTAAAAAACCCACTCTTTTTAACACCTTATAT
CTTTTTTTTTTTAAAAAAATTTTTCTTTTATTTAATAACTTACAAAGAGT
ATATCCTCTCTCTCCACAAACTCC
| NCCATTTCNNNNNNNTTTCACGGCAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTTAACCTTCTCTAATTCT
GTCCTCTTGATGTATTGAGCGTTAATAATGTTGCCATAGCATTATTATTT
GATTTACAATTAGTAAAAATTCAATTAAAGTTCTATAATCTCATAGATGG
TGATGGATATTGTCATGTCAGAAATAGTAATACCCCACGCTGGACCTAAG
TTCTCAATGAAGATATAAAGTCTCCTTCGACTCAGAGTCTCTAAGTAAAC
TGAATAACTTGTATATATATTTTCACAGTGTATGATAGCAAACTCCTGAT
AGAGTCAATCTTTGCATATTCTAGCCCATTATCTATTGCTGTTGAATTCA
TTCTATACAGGTTTGAACAGTTAGCTCTAGCCGTAAGTCCTCATCCAAAT
ACCAGCATTGAATGGGCACTCTCTTCTCCCAAGCCCTGGTTCCAGGATTT
AGGTTGACACAAATTACTAATAGCAGTGGTGGGTGTTGGCATTCAGTCCA
GCACTGGTGGGAATGGACATCTATGTTTGGTAAACTCAAAGTATAAATTA
TTGAGCGACTAAAACATTAAAATCTAACTCACCTTTTGAACATTAGACAC
ATCCCATAGATAATTTCCTGACAACTCATTCATTTGGCTTTTCAGTTGCA
CTCATATGAAACCTCTGGGATCACAAGAAAATGAATACCAAATCAGTTAG
GAAGTCTGAACTAAGGTAAAATACAAAGACTTTGCAGTCGTAAGGTTTGT
GCATGTGTATATGCATAAATTATCACACATGTACAGAAATTGTTTCTCAA
TCAAATTGACCAACTGAATTGTAATCTCTTGCCTTAANCGAACTAATGAT
TCACAATTGGAAGTTCTATCAACACTCTAAAAACTCTATTGTCAAAATTC
TTTCTAAGCTAAATGTCCAATATGGTCAGGAAATCAGCTTAAAAATTTTC
CCATAATCCACCTAAAACATGGTTTGTGGAAATTCAGGGCTATAGCAATT
TATGGGAAAATTTTATCCATTAACCTAAAATTTTTTTGCCAAAAAATTTC
CCTGGAATTGGGGAAATTTTATTGGTTTTTTTAACCCCTTTTAAAAACTC
ACCCGCGGGAAAAAATTTTTCTCAGTATAAGATTTTAAACACCGCCTGGT
TTTATTTATTAAAAAATTTATAAATTTCCCCGACAATGTACAAAAAGATA
TTCTTTTTTCTTTGTGACATAACTCTTAAAG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 7 7 8 7 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 9 7 7 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 12 17 9 8 8 15 15 17 24 32 36 36 33 33 33 33 33 33
37 37 37 37 37 37 37 32 28 32 37 37 30 31 31 31 31 31 37 50 33 33 29 19 13 9 9 9 9 10 7 6 6 6 11 11 21 17 20 18 30 37 41 47 47 53 53 53 38 38
36 38 36 36 36 36 33 33 39 37 47 25 23 23 10 10 10 10 10 11 16 16 19 19 24 26 30 19 20 20 23 32 36 36 36 42 42 53 53 57 57 57 53 53 53 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 25 21 11 11
11 11 17 26 30 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 43 43 36 36 28 28 31
40 43 57 59 57 57 54 46 46 43 37 37 28 28 33 42 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 59 59 57 48 48 48 47 47 59 59 68 68
68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 47 47 59 59 59 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 48 48 57 48 59 59 68 68 68
43 43 37 37 40 43 43 44 47 47 47 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 39 39 36 47 59 59 44 41 41 44 44 44 47 47 41 59 48 48 48 48 39 37 37 37 37 39 39 34 37
39 44 31 31 25 34 34 41 46 46 23 23 12 12 12 23 28 18 18 15 21 11 13 13 25 30 59 59 59 44 44 37 28 32 32 28 28 32 32 37 32 25 15 16 18 19 20 26 33 40
39 39 35 32 28 24 14 14 18 28 32 24 26 30 37 37 37 19 21 3 0 3 21 27 20 24 15 23 13 9 9 13 15 13 15 11 15 22 12 12 12 14 12 10 10 14 14 20 25 30
27 22 22 15 17 9 9 8 10 8 8 8 13 10 10 10 10 10 19 21 22 22 9 9 10 12 11 14 19 17 9 9 10 10 10 13 11 15 18 22 15 9 9 10 8 8 8 10 12 9
9 10 9 9 13 10 10 9 10 10 13 16 14 11 14 13 9 9 8 13 8 8 8 10 15 15 10 10 16 11 10 10 10 10 15 9 10 10 8 8 7 3 0 3 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 14 12 11 11 10 13 13 17 16 19 17 9 9 9 9 12 13 14 12 8 10 10 10 10 12 9 9 13 9 11 10 15 15 10 10 10 9 9 14 14
9 8 8 8 8 8 7 9 9 9 8 8 10 15 15 15 18 16 12 9 8 10 8 9 9 12 15 20 10 10 10 10 10 9 12 12 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
11 11 9 9 11 17 10 8 8 8 10 11 9 9 10 10 10 7 7 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 11 10 10 10 19 22 19 12 10 9 10 10 11 10 10
9 9 9 7 6 6 6 8 6 9 9 16 10 8 6 6 6 6 8 10 13 15 23 19 25 30 18 13 9 7 7 7 8 10 10 21 21 21 12 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 10 15 15 24 28 16 16 10 10 9 9 12 12 28 11 10 8 15 16 8 13 10 10 12 13 15 17 12 13 12 16 9 9 9 10 10 10 10 10 10 11 14 8 8 8 8 8 8
9 8 8 7 6 6 6 9 9 9 12 9 10 13 11 11 11 11 6 8 6 6 8 6 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 0 3 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 10 10 12 13 8 7 9 8 12 10 15 17 15 8 9 9 19 15 15
8 10 19 26 35 35 35 33 36 37 35 35 36 38 38 36 36 41 41 50 50 47 41 33 27 11 9 9 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9 13 10 22 23 31 31 44 53 53
50 53 42 38 38 36 36 35 35 31 31 31 30 28 27 21 21 9 9 9 6 6 6 6 8 8 9 25 21 28 28 25 19 21 25 21 26 30 30 42 43 43 43 47 47 47 47 53 53 57
57 59 68 68 68 68 51 51 51 51 51 47 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 47 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 59 59 57 68 68 57 57 57 59
59 59 57 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 31 27 12 10 10 10 11 10 13 11 15 23 28 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 44 57 43 47 48 48 48 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 43 43 43 47 57 59 59 48 48 48 48 48 43 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 59
68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 57 57 59
59 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44 44 39 39 39 44 44 47 39 41 41 37 41 44 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 59 59 59 57 53 53 50 50 50 57 59 59 48 48 48
48 41 41 47 59 59 59 44 37 37 39 37 34 41 43 39 32 39 37 36 40 37 41 35 31 31 41 37 39 43 59 43 37 31 29 37 37 37 30 37 37 37 37 39 41 41 35 27 27 25
22 22 18 25 22 22 34 19 13 13 17 19 20 37 36 32 35 37 39 39 39 37 25 14 9 9 9 10 10 24 28 41 19 12 12 15 15 24 28 28 28 24 24 25 24 26 26 26 27 36
36 39 28 28 12 12 12 28 15 25 25 34 32 36 40 39 41 37 31 30 25 24 24 15 21 14 17 17 21 21 24 22 22 24 28 39 30 30 27 28 28 27 30 25 32 28 12 10 9 11
17 19 21 10 8 9 9 12 8 8 10 16 19 28 23 24 19 19 14 16 12 24 16 21 10 11 12 16 15 15 19 15 16 10 10 10 3 0 3 13 10 11 17 11 9 9 10 13 12 9
8 10 9 9 9 9 13 28 17 25 14 13 8 8 8 10 15 15 14 8 8 8 10 13 15 8 8 8 8 8 17 17 13 13 13 15 15 19 11 16 11 11 6 6 6 7 8 25 19 20
16 18 16 13 13 9 8 8 10 10 12 12 10 6 6 6 6 8 8 9 9 8 10 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 8 6 6 8 8 10 21 19 17 25 12 10 9 11 11 8 8
8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 16 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 9 9 10 12 11 8 6 6 6 8 10 9 10 10 13
10 8 8 8 8 8 10 8 13 9 9 9 9 10 10 9 9 9 8 8 6 6 9 9 9 10 9 9 9 8 8 10 10 10 11 10 10 8 8 8 6 6 9 7 12 12 10 8 8 6
6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 14 9 9 9 9 8 9 9 9 11 11 13 14 12 11 11 9 11 13 10 10 10 11 11 12 12 16 8 10 6 6 8
8 8 11 8 8 8 8 8 10 11 11 17 11 10 10 11 17 17 14 12 12 12 12 9 8 8 6 6 6 7 10 10 10 15 13 10 10 8 7 9 9 11 11 11 8 8 8 8 10 10
10 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 15 8 8 8 8 8 12 15 18 11 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8
13 9 9 9 13 23 23 21 9 9 9 12 11 12 11 11 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 11 8 6 6 |