BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332M03.T7 (MSMg01no332_m03.b1) | MSMg01-332M03.TJ (MSMg01no332_m03.g1) |
ACC | AG448703 | AG448704 |
length | 1,234 | 1,270 |
length of high quality (start - end) | 548 (130 - 677) | 274 (136 - 409) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_m03.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_m03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:19:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_m03.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_m03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:19:33 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (67,516,227 - 67,516,774) | (67,621,110 - 67,621,383) |
---|
sequence | NNNCCCCGTATCATTTNNNNTCATTGGCGCTAAGACTACTAAGGGAGAGG
ATCCGCGGAATAAATGATCTCAAACTACCTCCTAATGAGTCCTCACCCTG
AAAACTTCCACTTATAAAACTCCTCATATCATTTGAGAAACAGCTCTAAT
TTCTATATGGAGTTTCCTTGTAAACTTTTCAAAAGAATCATTTCCCCAAT
ATTATTAAGTTACTGAAACACTTCCCTTTTCCCGGATAACATTCTGATGT
TTGAAGACTACAGTCTCATTCCTCATCAGTTTTAGCTTTCCCTAACTCAA
TCACAGTTAATTTTTCTGATCCAGTTTCTTCAGTGAAAGTGTTTTACAGT
TCATTGAAATGATTTTTAAAGTATTCAGATAGCAGAAGGGCGTCAGACAG
AGCAAAGCAGAGATCAGTCTTATTCAGTTTCATAAAAAGATAATACATTT
CTAGTCATCTTAGGTCACTATTTTGTTGTTAAGGTCTTATGATGAAGTTT
ACTGTTGTCATCTAATAATCTCACATTTTAAGTACAGCTCTAAAAATGTA
GCTGGAGTTAAATGCAGAAAATAAGTTCTCCCCTAGGTTGACAAATAATT
GTTATACATAGCTATGGTTAACTGGTTATGCTATTTCACTAGAAACCCCT
TCATACTGGTGGTTATCTTTGGGTGCCAGTCTTTTCATACTAAGGAAAAG
GTTGTTATTATTATTATTATTCAGAACCAAAGGAGCTATTCTAAGTTGTG
CCAAGGACGCTTACTGTGGCTATTTATTGAAATTAGAACAAACAAGAAAA
ATTGTCACCGCTTTTAATACAGAACTAATTCATTTTTTATGTCTGAAAAA
ATAATTAAATGGTTTCAGTAATATAAAAGACATGGCTGCGTATACTTAAC
GAAAACATTTTGCAATCTAAACTAATTGAATACATGGTTAAAAGAGGAAA
GGCTTTTAATTACACCTTTGCGAATAAAAATTCAGAAAAAGATGGAAAAC
CCTATTGTTTATTTCAGGCGAAAGGGCTTACTTTAAAAAAAAAATACAGT
GGTTCAGGTAAAATTGATTTCCATTGAAAAAAGAACAAACGGAAAGGTCT
AAAAATAGTAATCCCTAGTGAACCCTGAAACGAGGGGAAAATTTAAGAAA
AAACTGAAGGTAAAAAAACCTCCGAAAAATGGAAATCGGTAATTCTCAAA
TTTAAACCCGTAGTAAACAAATTTAAAAAAGTAA
| CCCGCCCTCTTNNNNAATCATGTGAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTGAAGCAGGGCTCAGCACC
TGTTCCTGAACAGGGCTGCCTTCCATGCAAGTTACCACGTGGCCACCTTT
AAGGAGGTGACACCAGTCCTGAGTGCGTGAAAGGGGGCTTCAGAGCTTCC
TGCCCGAAGGGTCCTTGAGAAGCCTGTTTGTTTTTCCCGGCGCTTGTCTC
CTCCCACCCTTCTCTGTCATTGGCCCGGTGTGGTGGGTGGGTGTGTTCCT
ATTGGTCAGGGGGTGGAGCCTATCCCTGGCCAGGGTAGGGGCGGGGCCTT
CGCGGCGCTGAGCTTGCCCTTGTGTCTGGTGCTCGCTAGAGCTGCTGCTG
CCGCCGCTGTTTTTGCCGCCGCCTCCGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCC
GCCGCCACTGCTGCTGCTGCAGCCGGAGCATCCGGGAGCCGCCGCCGCCG
CTGCTGCCACCGCTACCAAGCGCTGCTACCACTGCTGCCCACCTCTTCTC
CCAGGACTCTGACACCCGAGCGCGAGCGGCGGTGCTGCCAGCTTGCTGCC
CCTGTCCCCCACCCCTCCCTTCCGTGACCTACCCACTCCTTGCAGCCCTC
GCCTGCACCTTCCCCGACACCCCGGCATCTCCGCATCACCTGCCTGAACA
ACCTCCGGTTGATCTCTGGTACTTGCCTCGAGCTCCCAAAGGAAGGCAAG
GTCCTAACCGGTGCCCGTCAAATCAGTTTTCTCTCTTGTATTTTTACTAC
CTAACGTACTACAATCTATTTATCCTCACGAAATCCTTTTCTGTTTGTGA
TTTGCCCCTGCCGTTTTTGTGTTCCGTTATTCTCCTTCCCCTCGGTCTCA
TATAAGACTCGTCTCTTTCTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTATCTCACTATA
CTTTATTCTACCTTTAAATGCATACTTTTTTTATTCTTCTCTTCTTATTC
TCTTTCTCTCTCTTATTGACTCCTTTCCATATCTCATATCTCTCCTTTAT
CTTATCTTTTATTCATATACTCCCCTTTCCTATTTTTCCTATCCCTCTTT
TTCCATTTACCATACTACTTACTTTCTACCTAATTCTAATTTCTTTATCT
TATCCTTCCTCTTCTTCCTTCCCCTCTGTTCTTTTGTTATTCTTTCTACA
TTTCATCGCTTCCTTTACCTCCCTTCTTTATCTAGATCATAATACCCTAT
CATCTATATACTATTTCTAC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 3 3 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 15 22 20 17 19 14 17 17
26 32 33 37 33 30 30 30 19 19 10 10 9 22 25 33 33 33 33 33 33 33 30 25 15 15 8 6 6 6 6 6 8 8 8 7 7 8 8 8 11 19 23 33 33 33 31 31 35 35
35 36 53 53 50 50 50 50 36 36 31 31 28 28 28 25 23 19 15 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 11 19 37 37 41 50 50 50 50 53 57 59 53 50 53 37 37 37 40 40 47
57 43 43 43 43 43 43 43 51 57 57 57 54 54 54 57 50 50 50 41 41 50 50 50 68 68 57 54 57 54 54 54 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 48 59 48 54 54 57
57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 44 44 41 38 39 50 50 57 57 52 52 52 57 57 57 54 52 52 52 57 44 44 43 43 43 57 43 52 52 52
52 57 57 59 43 44 29 32 32 43 38 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 44 44 37 37 37 57 57 52 54 54 57 57 57 52 57 43 52 52 52
57 52 52 52 52 52 52 52 57 52 54 54 59 59 52 44 43 43 29 27 27 38 32 43 50 50 57 50 50 44 42 42 36 36 29 40 40 47 42 42 31 31 31 44 44 43 36 36 36 41
41 43 43 57 57 48 47 47 57 44 43 37 37 43 48 48 57 57 47 47 39 37 30 37 37 42 32 32 20 24 19 28 28 39 39 39 39 39 43 43 43 43 43 43 32 32 20 20 23 30
25 28 28 37 36 41 39 37 25 23 11 12 12 19 18 18 26 28 35 30 30 35 35 32 30 28 35 37 39 43 39 48 48 57 59 59 59 40 40 25 25 25 34 34 41 41 41 47 59 48
43 34 28 23 23 32 34 34 37 28 28 13 13 13 28 28 39 34 39 39 39 43 41 41 30 30 30 25 25 25 43 28 28 20 23 23 28 28 37 33 32 25 25 25 30 28 28 34 32 32
24 23 23 14 13 13 19 19 28 36 36 46 43 43 41 41 41 43 43 48 48 48 48 48 48 48 57 59 48 47 39 35 35 37 39 43 33 41 30 39 39 46 48 59 59 41 41 21 21 14
30 30 39 40 42 39 35 35 39 47 47 32 32 15 15 12 25 32 34 34 30 30 30 31 31 37 35 42 42 48 47 59 32 31 15 15 14 21 21 32 24 30 32 40 33 43 43 39 31 31
20 20 20 32 32 39 43 37 47 35 35 30 39 39 25 25 11 11 11 27 18 25 16 27 11 11 11 23 25 35 35 35 35 37 37 32 30 30 28 28 13 13 13 28 26 37 33 36 33 33
33 31 31 33 30 30 20 24 11 11 11 12 16 26 21 23 28 34 34 39 30 29 12 12 11 11 11 22 15 21 17 24 18 29 19 12 12 18 25 32 34 34 32 29 20 34 30 43 21 16
11 11 11 11 11 11 19 25 34 41 47 47 47 48 48 48 48 48 43 34 28 18 14 22 24 19 15 22 28 28 34 31 19 31 20 20 20 28 25 23 23 15 16 11 11 15 24 24 26 12
12 11 12 14 28 28 30 30 30 37 34 34 28 23 23 18 10 9 9 9 9 17 23 23 12 8 8 11 8 10 14 24 27 18 17 17 27 24 22 36 22 15 10 10 10 13 17 34 23 27
12 12 12 12 12 11 11 11 9 9 9 9 9 9 9 9 10 11 11 9 8 8 8 8 10 11 10 11 12 12 22 30 25 27 25 17 12 10 10 10 12 11 11 11 12 12 10 12 12 10
9 9 9 7 7 8 8 8 8 10 11 10 10 9 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 9 11 11 9 9 9 9 9 10 10 9 9 7 8 9 11 9 9 15 10 11 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 10 14 10 12 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 18 17 14 10 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 11 8
8 7 9 9 12 12 16 32 32 16 11 11 10 8 8 8 8 9 11 10 8 8 6 7 10 12 12 11 12 13 10 8 9 8 8 8 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 15 10 9
9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 7 10 9 8 8 8 11 11 11 10 10 9 9 9 9 16 16 8 8 10 10 9 9 9 10 9 9 7 7
7 8 8 8 11 11 11 11 12 12 10 10 10 10 9 9 11 8 9 8 8 8 10 9 9 10 12 14 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 9 9
8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 10 8 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 9 11 9 10 10 8 8 8 12 16 14 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 13 11
17 23 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 12 12 10 10 10 10 15 11 14 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 7 8 8 7 7 7 7 8 6 8
8 8 8 9 9 10 9 10 12 11 10 9 8 8 8 8 7 9 9 11 17 19 24 20 29 15 14 11 10 8 8 11 9 9 | Open.Hide. 8 8 6 6 6 8 9 9 9 9 3 0 0 0 0 3 9 9 9 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 8 10 13 10 8 9 9 16 12 19 23 15 15 8 10 10 19 19
15 15 24 26 35 35 35 37 37 37 35 35 35 35 35 36 36 50 50 50 50 47 47 27 23 9 9 11 15 11 8 7 7 7 8 8 9 11 11 10 10 15 21 21 31 47 50 47 36 35
35 35 36 36 36 53 50 47 47 44 44 50 37 37 22 21 11 13 12 10 13 9 10 9 10 10 10 16 19 28 22 17 17 11 15 14 27 27 36 42 42 42 53 57 53 50 50 47 47 47
53 68 68 68 68 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 50 50 50 50 50 47 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 54 48 48 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 52 52 52 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 54 48 57 48 54 54 48 57 57 57 59 57 59 59 59
59 57 57 54 59 59 57 57 57 50 47 47 47 54 59 59 59 54 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 30 25 10 12 9 11 10 10 11 11 11 12 20 28 47 59 59 59 50 53 53 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 43 59 47 54 54 57 57
57 59 59 59 59 37 37 28 36 29 36 44 42 59 43 43 43 43 44 44 48 44 44 46 39 39 37 46 46 57 57 57 57 57 35 35 35 36 36 57 48 54 48 59 42 42 35 35 35 59
59 59 43 43 43 59 59 59 59 54 57 57 57 57 47 47 43 57 57 48 48 48 59 59 59 57 48 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59
59 59 37 44 26 30 31 42 44 57 57 48 42 37 30 37 29 40 40 30 30 32 43 33 35 28 31 28 23 23 23 31 28 37 37 43 36 36 33 33 25 25 28 37 28 35 39 39 43 46
47 46 39 37 36 32 29 29 32 37 37 47 40 46 46 48 48 48 59 59 39 31 23 14 14 18 24 23 30 33 43 43 48 48 48 43 36 28 30 24 34 15 16 15 23 19 17 18 16 13
14 26 23 32 17 17 17 24 29 25 31 25 22 25 28 30 37 43 43 43 43 39 33 20 20 11 11 12 23 19 22 17 24 24 37 19 19 9 9 8 15 15 10 10 12 15 11 9 10 10
11 10 14 15 15 10 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 10 9 9 9 9 10 19 21 11 11 6 6 8 8 9 13 10 8 8 8 10 10 15 15 17 17 30 24 15 10 9 10 9 10
10 10 11 12 12 15 24 21 10 8 8 15 15 13 9 9 8 8 10 10 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 9 9 9 9 10 10 11 11 11 13 13 10 10
10 10 17 10 11 11 14 14 9 9 9 17 12 12 10 9 9 17 14 13 11 21 12 13 8 8 7 8 8 11 12 12 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8
11 15 11 17 12 13 13 15 15 10 8 10 8 8 10 15 15 8 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 16 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 9 9 10 11 10 9 10 10 12 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 10 10 10 11 15 16 11 9 12 9 12 10 9 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 10 8
10 10 10 10 11 11 11 15 10 12 12 12 9 9 9 9 9 7 9 13 15 13 12 13 13 12 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 16 16 22 14 12 17 13 10 10 11 10 10 11 11
12 13 8 8 6 6 6 10 10 10 9 7 8 6 9 9 15 9 9 9 12 9 10 9 8 8 8 8 11 10 14 14 9 10 13 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 17 17
10 10 10 18 13 16 19 17 14 14 14 8 10 8 8 8 11 13 15 13 8 8 8 8 10 13 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 10 11 15 17 10 10 8 12 7 7 8 8 9 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 7 8 10 10 9 10 8 10 7 7 6 6 10 10 10 10 8 8
8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 13 18 17 18 16 21 11 11 11 10 10 10 11 8 8 8 8 10 8 11 11 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 10 10
9 8 8 10 8 6 6 8 8 10 10 11 7 6 8 8 13 11 11 11 |