BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332P02.T7 (MSMg01no332_p02.b1) | MSMg01-332P02.TJ (MSMg01no332_p02.g1) |
ACC | AG448835 | AG448836 |
length | 1,232 | 1,292 |
length of high quality (start - end) | --- | 569 (133 - 701) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_p02.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_p02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:19:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_p02.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_p02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:19:56 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCAACCTCCNNNNTCACTCTCGGCCTAATACTCCTATGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCTCATTAGGAAACATCCTTTACGCCCCCAGNAAGNNGNGNGG
NCNGAGNGNAACCTTTTAAAGTCTCATCCAGGATTCCGGGNTCTTGACTG
TATGCCCGTCCAGTACACTGTGCACCAAGGTGGTGGTTGTTGTTGTTGCT
GCTGCTGCTTTTGTTCCTCTTCCTTCCCCCGCCTCCTCACCATTCTCCTC
ATCTTCTTCTCCTCCTTTTTCTCCTATTCCTTCTCCCCCTTTCCTCTTCC
TCTTCTTCCTTCTCTTCCTCCTCCTCTTCTTCTTCCTTCTTCCTGCATGT
CCCCTTATGACTTATCCTGAGTCAACCACCTGCCCACCCAGATCTCAAAA
TACTTTTGGACAAACTAGCCTGAGATAGTTATAACCAATCTGGCAGCGTC
GTAAATGACTAACACTCTTTCTTCCGTCTGTAGCCCAGCCCCATGTTAAC
CTTAATCCTCACTGCTCAACCAAGCCTTTCTGCAGGCGCTTCTTTCTGGG
CTACTGTGTCTACTTGTCTCAGATCATCCGGCCACGTACGTGCGACCCCT
AGGCCTGGACTTCTGGATCTCCTCACACGCCCAACTTGTTTGGCTTTTGC
CTCTCCAAATATGTTCTCTACTGAGCTTCTGGATGACGCCTGCGCTATGT
CCTGGACATTTCTTCCCCTGTACTCTAAGATGGTCAAAATTCCTACTTGA
GATAGTTCTCCATCCCTCTTTGCTCCTGGAACTCTCCGGTCCCTATATCA
TATGTCTTACATTCTTTGCTGCACATCCTGAACTACTTCTGGAACTTCCT
CAGATTGTAAATTTTAAAGACATTTTAGGCGATTTGCGCATGTATGCATA
CTAAAAAATTATTTTCTGGCTTAACTATTGAAGTATTTTAAAGCGAGATT
TTGGTTTGGTTTAACAACGGGCCCCTCCCCTTAACCCTAAATTTTGGTTG
TCCTGGAAACTCCCTATGTATACCCACCCCCCAACTCCCTAAAATCCACT
TGTTTTCGTCTTCCTAAAAACTGGGATTAAAAGTGTGTCCCCCTTCTTTC
CCAGTTTTTAAAAAATTTTAAAAACTTTCTACATCTCCCCCCTCTCATGG
AGAAGGGTTTTCAATTGATGCATATTCCAAACCTCCACGGGGCGTTCTCC
CTTCAAAAAAAACCTAACTATCTGCTGTTCTG
| CCGCCCCTNTNNAAACACATGCGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGCCCCCCCGAAATCC
CAGCCAGAGTACCAGGAGCCTTAACTGACCGTGCCAAGGGAAGGAGGGAA
GGAGGGCAGAATAGCTCTCTGACTGGAGGGAAGATAGGAACACACACACA
CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCTGTC
TCTATGTGCTTTCACTTTATTGGGCATGCTCCACCCTTCTCCCCTAGGAA
GAGGGAGGCAATGGGTGCCACTTCTCTCTGCATTTTCTTGGATGCCGCAG
GTCAGAGGCTAGTTGCTTCCATGTTCATATCCTTCTTCCTGGGATTTTCG
TGTTCCTCTTGTACCTTCTTCCTCTGGATCCCATTTCCATCCTACATCCA
CCTGCCCTCTACACCCTCTTTCTGTGTGCCTTGCTTCTTGTTCCCACCAC
AACTATCTCCCATGGTGTTGCTGTGTGTGCATGTGTGTTTGAGTGTGTGT
ATGTGTATGCACACATGTGTATGTTTTTAAGTGTATGTGTATGCATGCAA
GGGCGTGAGTTTGTGTTTTTGAATGTGTGTGCATGCTTGTGTGTGTGAGT
GTGTGTGAGAGTGTGTGCGTGAGTGTATGTGTGTGCGAATGTGTGTGTAT
ATGTGCGCGTGTGCCCCCCCCCCCCTCCCACTTCCCAACTCTCCCCCCCT
CCTTCTCCCCCTCCTCCTCCCTCCTCCCCTCCCTCTTCTCTCTCTTCTCT
CCCTCCCCCTCTTCCCTCCCCTCCTTTCCACCCACCCCTCCCTCCTCCTT
CTCTCCCCTCTCCCCTCCCTCTCCCCCTTCCCCCCCCTCACCTCCCCATC
CCCTCATCCTCTACTCCCTCCCCCCTCTCCTCATCCCCCACCCCACATCT
CTCTTTCCTCCTCCCTCCTCCCCCTCCACCCATCTCCCCACCCCCTTCAA
CCCCCTCCCTCACACATCTCCCTTCTCTTCCTCCTCTCCCCTTCTCCCCT
CTCTCTCTCTCCCTCCCCCTCCTACTCCCCCTCTTTACCACTCCCCTTCC
ACCTTCCTCCTCACCTCCCTCCTCTCTCTCTCTTACCCATCTCCCTTTCT
ACTCTCTCCTCTCTCTCCCTCCTCACTCTCTTTACCTCCCTATCTTCCTC
CCCCTCCCTCCATCATCCTTCCCACCTCCTCTTCCTCTCCCTCTCCTCTA
TAATCTATCCCTCCACTGCATGTCATCACCTCTCTCCTTATC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 6 7 7 8 9 9 3 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 9 9 11 11 8 8 6 7 8 8 8 10 8 8 8 10 10 9 9 9 12 12 15 16 12 16 16 32 29 30
19 16 11 12 9 12 10 19 19 25 28 28 30 30 18 28 28 16 12 9 9 10 9 10 11 10 12 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 3 0 3 13 3 0 0 3 0 3 0 3 3
0 3 0 3 10 3 0 3 0 3 12 9 10 9 12 11 8 9 9 10 10 10 10 10 12 15 15 18 22 15 20 22 34 34 19 14 9 7 7 3 0 3 23 19 22 12 9 9 13 15
25 25 28 36 31 32 23 23 23 19 18 19 19 21 21 21 28 22 28 28 19 14 10 12 12 12 15 13 13 10 10 10 10 11 13 15 14 15 19 20 24 24 20 16 15 15 23 19 19 19
19 19 16 18 22 23 12 12 13 26 26 36 36 32 32 30 40 32 39 39 32 31 30 30 24 23 15 15 13 10 10 10 15 18 19 21 21 15 15 11 11 11 11 19 19 28 13 13 11 13
13 17 18 18 14 12 12 19 19 25 28 18 20 22 24 24 37 37 36 33 33 28 22 28 28 28 28 20 20 20 32 23 23 23 19 26 32 25 25 25 32 28 30 37 30 41 24 24 14 21
21 33 32 28 26 17 17 17 14 17 15 12 13 13 12 12 18 18 18 14 14 14 20 20 14 15 15 32 32 30 30 15 15 13 18 18 21 32 24 24 21 32 25 15 11 11 15 17 23 18
16 12 16 31 35 26 28 19 16 13 13 13 21 28 20 23 17 23 12 9 9 9 9 9 9 11 10 8 8 8 10 12 13 27 14 14 13 15 12 12 12 12 24 22 21 15 15 21 22 26
21 18 15 17 30 28 21 13 15 19 17 15 15 18 24 18 12 10 9 9 11 21 11 11 11 18 12 12 15 15 30 30 24 24 11 11 12 25 15 16 16 10 10 15 12 9 9 10 9 9
10 12 14 19 14 15 23 30 30 31 23 17 17 18 19 11 18 18 30 23 22 22 17 14 16 23 23 20 18 16 11 11 9 12 12 24 15 15 15 19 26 23 22 10 12 12 16 14 21 11
14 16 12 10 14 14 18 29 34 33 30 22 12 12 6 6 8 12 12 9 10 10 17 17 11 10 11 18 26 30 34 30 23 15 11 11 11 11 12 22 26 30 30 33 37 28 24 15 12 12
12 18 30 34 37 26 19 17 17 30 30 28 28 24 29 16 16 16 21 18 11 11 13 17 11 11 12 20 20 17 13 13 12 10 10 9 9 15 13 21 20 14 9 9 10 9 9 15 23 23
14 17 15 10 10 15 10 12 11 15 15 21 18 15 12 12 22 12 12 14 28 23 32 18 18 13 12 10 15 11 13 9 9 11 13 10 17 17 14 12 13 10 10 10 10 17 19 22 22 22
22 16 14 18 16 16 16 12 11 11 11 12 12 14 24 28 20 19 19 19 17 19 11 10 9 9 9 15 17 32 20 20 28 28 27 25 18 17 11 12 16 12 12 11 11 9 15 11 12 11
15 15 16 9 9 9 11 15 13 20 21 23 17 14 11 11 14 12 15 9 9 9 11 6 6 6 10 10 10 13 13 8 9 12 12 12 11 11 11 21 19 17 7 6 8 6 11 10 11 7
8 8 10 13 11 11 13 13 22 22 11 10 9 10 10 10 15 22 21 23 18 12 12 12 19 21 12 9 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 21 11 11 11 18 18 25 28
33 27 34 21 16 12 17 19 17 11 11 10 11 12 14 11 9 10 10 8 8 9 9 10 8 8 9 10 14 12 9 9 8 8 10 10 10 9 9 9 9 11 10 15 15 18 29 17 17 14
14 9 9 8 11 15 16 24 11 10 8 7 8 9 17 13 12 10 10 10 13 9 9 9 9 12 9 11 12 12 8 11 8 8 8 8 11 12 21 19 21 18 11 10 10 10 10 13 10 8
8 8 8 8 10 15 10 11 11 25 25 33 33 33 30 23 13 12 10 9 9 13 9 9 10 8 6 6 8 8 12 11 8 8 6 6 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 7 8 8 8
8 10 8 8 8 15 9 10 10 13 16 9 9 9 11 9 11 11 11 11 13 15 11 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 11 12 9 9 9 9 10 16 14 8 8 8 8 8
11 11 10 10 9 8 13 9 8 6 6 6 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 11 16 11 11 11 11 10 10 12 10 10 13 11 10 10 10 26 26 28 18 15 9 9 9 10
8 16 12 18 12 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10 11 11 11 11 11 10 11 9 10 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 22 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 6 6 8 8 19 8 8 9 9 12 18 11 11 11 13 11 11 12 12 12 11 11 9 9 9 8 10 10 6 6 8 8 6 7 10 9 12 19 20 18 12 11 8 8 8 6 6 8 8
8 6 6 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 12 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10
8 8 8 8 10 9 9 12 8 8 9 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 0 0 3 9 7 8 7 7 8 8 7 6 6 6 6 6 10 6 6 6 7 12 9 10 10 8 8 9 9 13 12 18 19 20 22 20 24 21 19 20
20 16 18 16 14 11 10 10 10 22 21 28 30 30 31 36 31 33 33 37 37 41 29 32 15 11 8 8 8 8 8 8 11 11 13 13 14 13 12 12 11 11 15 27 30 37 37 37 37 41
33 53 53 53 57 47 36 35 35 30 31 30 33 31 21 17 11 11 11 13 15 15 10 10 10 19 18 13 12 10 10 10 10 22 28 32 48 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 57 57 57 57 54 54 54 54 57 48 42 42 21 26 24 28 32 39 37 57 43 44 37 57 44 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 57 57 43 43 43 47 47 54 54 57 57 57
57 57 50 50 48 48 48 57 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 57 57 57 57 44 44 35 35 35 44 44 57 57 57 57 57 59 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
43 43 43 43 43 47 62 43 62 39 43 29 23 23 35 35 43 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 52 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 31 44 38 44 23 27 27 43 43 43 43 43 35 39 39 43 43 52 52 52 43 43 20 20 20 43 43 45
52 62 52 43 43 39 35 43 43 26 26 26 35 27 31 31 31 31 27 24 19 32 23 31 43 43 43 43 43 41 41 41 42 42 45 57 57 57 52 43 43 43 43 27 23 23 38 36 33 28
39 33 38 41 27 23 23 43 44 57 43 36 28 28 28 36 32 37 42 50 43 43 38 36 24 17 17 16 21 17 17 17 19 18 32 28 21 21 28 28 38 38 27 27 23 23 16 23 10 11
11 16 24 32 32 24 24 12 12 12 18 24 41 42 26 22 13 13 13 18 26 30 28 28 23 27 25 32 25 30 21 24 13 15 12 12 12 21 32 29 30 28 25 30 30 30 22 15 12 20
16 12 9 9 9 9 9 10 10 10 10 9 10 12 13 13 10 17 21 18 10 11 11 10 15 10 13 10 10 10 10 10 10 13 10 9 8 8 7 6 8 8 15 18 28 21 18 17 13 10
11 11 10 10 8 8 8 8 8 15 15 12 12 13 13 10 11 9 9 10 8 8 6 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 6 8 6 8 8 10 9 10 10 8 10 6 7
8 10 10 11 11 13 12 10 8 8 8 10 14 16 19 8 8 8 8 8 9 13 9 10 10 10 10 8 8 8 10 10 10 10 8 10 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 8
8 10 8 9 9 9 10 8 6 6 6 8 10 10 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 11 12 11 12 13 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8
13 8 10 6 6 8 8 13 12 12 12 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 8 10 8 8 6 7 8 10 10 9 9 10 10 12 12 11 11 11 10 9 9 9 10
9 11 11 10 10 8 8 7 7 8 8 10 8 8 11 8 10 10 10 10 14 14 13 12 8 8 10 11 8 9 9 10 8 8 9 9 10 9 8 8 8 11 12 12 10 10 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 15 18 13 8 8 6 6 8 8 9 8 12 13 13 10 8 8 8 8 10 8 9 9 13 18 16 15 12 12 12 12 10 10 12 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10
8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 6 7 8 8 10 11 11 11 11 12 16 16 19 26 19 17 9 9 9 9 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 17 12 15 15 13 8 8
8 8 8 8 10 11 13 13 10 10 13 10 10 10 6 6 8 12 14 16 16 15 14 7 7 6 11 8 8 9 9 10 12 9 11 11 11 10 10 11 12 12 12 15 18 17 9 8 8 8
8 8 10 7 7 8 8 8 8 8 19 19 10 10 10 10 10 8 9 9 9 8 10 13 10 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 9 9 8 8 7 7 6
6 8 9 9 9 9 12 8 8 8 10 7 6 8 8 10 12 13 8 8 8 12 8 8 8 15 10 11 8 13 13 15 10 8 6 6 6 6 8 10 15 9 9 10 16 15 28 22 10 10
6 6 6 6 7 6 11 9 9 11 12 16 13 10 8 8 8 8 8 10 8 9 7 8 8 6 6 8 12 15 20 20 17 17 17 15 13 13 8 8 8 8 |