Query= MSMg01no335_m15.b1 MSMg01no335_m15.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no335_m15.b1 PHD_FILE: MSMg01no335_m15.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 22:23:40 2005
(432 letters)
>mm_chr16_81775421_81776252
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Sbjct: 381 tggaatctctaagagtctcttaatgtcaatcagacatatatatgtgtgattgtacacatt 440
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Sbjct: 501 taaaatacataataaaaaacttgttaactctgaactattgataatgctttaaataaaaat 560
Query: 361 tatttactgatacaacaagtgattatatatatatat-------at---atatat-at--- 406
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Sbjct: 561 tatttactgatacaacaagtgattatatatatatatggtggctattttatatattatttt 620
Query: 407 atatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 621 atatatatatatatatatatatata 645
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 667 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 620
Score = 93.5 bits (48), Expect = 2e-23
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 669 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 622
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 671 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 624
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Score = 93.5 bits (48), Expect = 2e-23
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 675 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 628
Score = 93.5 bits (48), Expect = 2e-23
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 677 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 630
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Sbjct: 679 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 632
Score = 91.6 bits (47), Expect = 9e-23
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Query: 385 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
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Sbjct: 680 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 634
Score = 70.3 bits (36), Expect = 2e-16
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Query: 384 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 431
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||
Sbjct: 653 tatatatatatatatatatatatatatatatataaa-ata-atatata 608
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
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Number of successful extensions: 55
Number of sequences better than 10.0: 1
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Length adjustment: 9
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Effective length of database: 823
Effective search space: 348129
Effective search space used: 348129
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X3: 517 (999.5 bits)
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S2: 8 (16.2 bits)
| Query= MSMg01no335_m15.g1 MSMg01no335_m15.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no335_m15.g1 PHD_FILE: MSMg01no335_m15.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 22:23:40 2005
(464 letters)
>mm_chr16_81913062_81913925
Length = 864
Score = 725 bits (375), Expect = 0.0
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Strand = Plus / Minus
Query: 1 tcttcaagattatttaatcagaagagtactaggcttttaattgttttacttttgtggtaa 60
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Query: 121 ataggttttctgtactattgaacctaggtccaatattagagaaggtatttgtgtgtaaac 180
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Sbjct: 200 --------------tttatttatttatttatttatttatttattataagctactgatggt 155
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
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Effective search space used: 387716
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
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