BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-341N06.T7 (MSMg01no341_n06.b1) | MSMg01-341N06.TJ (MSMg01no341_n06.g1) |
ACC | AG455527 | AG455528 |
length | 766 | 770 |
length of high quality (start - end) | 471 (44 - 514) | 370 (75 - 444) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no341_n06.b1 PHD_FILE: MSMg01no341_n06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:31:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no341_n06.g1 PHD_FILE: MSMg01no341_n06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:31:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTTTGTTTACCTCTGTACCCCAATTTTAATAGGGTTACTCAGTTCTCT
ATTAGTCCAAACAGAAGGTTCTTAGTTACTTCATAAAAGTCATGCATGAA
AGGACTGCACTAGTGGTTTCATGCTAACTGGCAAGTTGGTGTTGTAGCAC
TTAGGGTCCACTTCTGGCTCAGACCTGTGCTGACTTTCTCCTACTGGGTC
CCAAATAACACCTTTTGAGCCTATGATAGGTAACTAGTAGTGAAGAAGTT
ACCATGTCAATTGCAACCTATTTTTCTATATTCTACAATAAAAATTTAAT
AAAGGCTCAACATTTGGTTATATTGGGCAACTAACAATAATGGTAATAAC
CTACATAGTTTGAAGAAGAGTCTTCAGTCAGTGCTCTGTAACTAAGAATT
TATAGGAAATACAGCTTGGTGACATGGATATTTTCCTTTCGAAAATGCAT
GCCTTCTGGAAGCAATATTTTTTTCCTGTTTCTTTTGCCACTTGAATATC
ATTGCTAGGATGCATTAATACTTTCATTAAAACAGCTGTATGGACCAACT
TCCATGGTTTTAAAAAATTTACTAATTTTCTAATTTGTTCTTTCCTGCCT
GGCTTTTGCCCCTTATTTAATAATAATTAACCATTTTTGCGCCCCTTTTT
AATTTTTTCCGGTTTTATCAACCCTACTTGTTTTTATCCCACAAATTTCT
TTCTTTTAATTTCTCC
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGTGGAATATGTAACAATGAAGAAA
TTTTGGTGCCTAGTAATGTCTAGTGTAATTGAATGTTTTCCTAAATATTT
AAAACAAGATCCATGTCCTGATGTAATTTACTAATCTAGCATTTCTTGAA
ATAATGACAACTTTATTTATCACAAGGGTATTCTATGTACACAAACTGAA
GGAATTTTTACTTATTGCTTTGTGTTGGATTATTTTGGTTGGATAATACA
CTTGGATATTTATTATTTATCCTGTCATGAAATGTGAATATTAAAATAAC
ATGCATTAATTAGCAAACTATAAGGACATTGCATAGAAACAGATGCCAAA
TGGTTTTGTTTCTTAAGCCATCATGTTGGAGTGTTTTGTATTAATTTTAC
ATTTGCCCGATCCCTTTTTATCTAAGGTGGAGAATTTCTAATTCAATACC
CGTTTGACCCGAAATCCACCATCCTTTTTTTTTTTCCCACTCCCCCTTCT
CTTTACTCCTCCCCTCTCTACTCTCTTATTCGATACCTTCATTAATTTTC
CTTTTTTCCCCCTCTTTTTTTTCCCCCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
CCCTTTTTTTTTTTTCCTCTTTTCCCCCCTTTCCCCCTCTTACCTCCCAT
TCTTCATCCTCCTAACTATATACCTATTTTTCACCTTTCCCCTCCCCCCT
TCACCTCTCTCTCCTCTTCT
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 21 19 24 39 39 37 37 32 27 27 32 19 23 25 28 28 33 59 28 19 16 13 11 17 13 16 10 8 8 8 9 14 23 37 23 23 14 19 19 25 25 39 39 23 21 17
19 29 29 59 59 59 59 47 27 27 14 14 14 23 27 59 47 59 59 59 48 48 48 47 47 47 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 43 44 42 42 42 33 28 42 42 37 40 42 48 48
48 34 68 44 44 20 31 31 41 48 47 47 47 57 57 57 57 44 44 28 39 37 44 44 57 59 59 59 57 57 57 48 48 57 57 68 68 57 57 41 47 47 57 57 54 54 57 57 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 54 52 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 52 52 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 43 43 57 57
44 44 44 68 59 59 43 52 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 52 57 52 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 43 43 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 48 50 48 48 48 57 59 59 59 48 48 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 48 43
43 39 44 39 43 43 46 46 57 48 57 48 59 43 59 59 37 37 23 32 32 43 43 39 39 32 32 33 37 39 43 43 39 43 43 47 47 43 43 41 47 47 34 34 25 21 19 14 17 18
22 37 37 39 37 41 34 37 39 34 32 23 23 23 34 23 17 10 10 10 17 22 32 31 39 31 36 35 35 30 32 32 43 34 37 28 22 17 17 11 11 15 23 25 24 23 23 23 23 33
24 19 15 19 18 24 24 32 23 23 13 13 10 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 23 12 12 14 25 15 15 17 18 18 19 12 12 12 14 26 26 15 12 12 15 21 24 16
9 10 9 9 8 10 11 11 11 12 12 12 24 19 11 11 8 8 8 9 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 8 8 10 13 13 10 10 9 8 12 8 8 8
8 8 8 8 8 8 15 18 14 15 8 8 8 11 10 12 11 8 8 7 6 8 8 10 10 10 12 10 8 10 10 11 13 23 10 10 11 21 15 15 9 8 8 12 8 8 9 10 10 10
10 12 12 12 8 10 8 9 6 7 9 8 10 8 8 11 11 12 12 14 12 8 8 8 8 13 11 12 10 10 10 10 8 10 16 20 15 17 12 9 9 8 8 12 12 15 11 13 14 9
9 9 8 8 12 11 10 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 17 10 8 10 8 8 8 8 9 9 9 12 10 12 10 8 8 8 8 7 8 7 7 8 8 10 14 10 11 11
18 15 22 18 16 12 10 9 9 9 9 15 9 9 9 9 | Open.Hide.12 12 10 10 10 9 9 16 16 25 24 24 28 20 24 22 22 32 39 39 37 37 37 29 25 27 22 20 25 19 11 11 12 15 22 18 22 29 29 31 30 28 39 39 39 39 34 28 30 30
28 28 33 30 30 53 48 37 37 15 15 12 17 24 24 28 34 31 42 42 29 29 34 28 35 43 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 50 54 54 54 50 50 59 59 59 59 50 57 50
50 50 51 68 57 57 44 40 36 41 41 41 41 57 57 57 57 57 47 44 46 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 50 54 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68
68 59 57 54 52 52 50 50 50 50 50 50 54 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 54 57 57 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 68 68 68 59 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 44 44 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 52 52
57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 54 52 52 50 43 43 43 57 57 54 54 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 54 54
54 50 50 50 57 57 59 54 54 50 59 39 39 43 44 44 48 48 48 59 59 59 43 40 40 57 57 48 43 47 43 43 30 34 22 24 20 30 30 37 37 37 39 42 40 44 30 30 30 37
40 43 47 59 59 59 59 54 34 34 24 22 23 25 27 32 23 23 24 23 23 23 19 30 30 43 43 37 28 28 28 28 28 28 28 25 34 34 30 22 21 21 14 15 15 30 22 22 10 10
10 16 17 15 11 11 16 10 10 8 8 8 8 9 9 8 9 8 11 8 10 10 9 8 8 8 8 13 16 17 12 10 10 8 8 8 8 8 9 11 15 13 13 10 10 10 11 13 16 10
10 10 10 11 10 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7 10 8 8 8 8 13 10 8 8 8 9 8 12 9 9 10 8 8 8 8 15 15 19 16 21 10 10 10 21 19
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 10 10 8 10 10 11 9 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 12 12 16 15
15 11 10 15 13 13 9 10 9 14 14 13 14 11 11 11 14 12 10 10 8 10 8 12 15 18 24 18 20 19 18 18 18 18 19 13 12 14 12 12 12 10 11 20 22 22 22 25 23 25
22 15 11 11 11 11 11 11 15 18 21 19 20 28 15 10 9 9 9 10 9 12 14 16 15 19 13 16 16 8 12 10 13 13 16 12 13 7 7 7 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8
15 11 10 9 10 11 10 10 10 13 8 8 8 10 10 9 11 11 11 11 11 12 10 10 10 10 10 18 17 23 11 9 9 9 10 7 14 13 23 8 10 7 7 10 8 11 10 11 15 13
13 11 10 10 19 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 |