BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-353E06.T7 (MSMg01no353_e06.b1) | MSMg01-353E06.TJ (MSMg01no353_e06.g1) |
ACC | AG464185 | AG464186 |
length | 752 | 782 |
length of high quality (start - end) | 450 (51 - 500) | 243 (82 - 324) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no353_e06.b1 PHD_FILE: MSMg01no353_e06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:46:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no353_e06.g1 PHD_FILE: MSMg01no353_e06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:46:05 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGAACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCAAGTCATCTCGCTTGGCAGAAAGCACCCTTATTCACTGAA
CCATTTTATCAGACCTGTGAGGTACACACCTATAATCCCTGTATTTGGAA
GGAGGAGGCAGGAGGGTCAAGCTACATAGGGAGTGCAAGGCCAGCCTGGG
TTTCATGAGACCCTGTATAAAAACAAAGAAAGCCCCCCAAGAGGCCAGTG
TTAAAGCTCAGTAGGTAAAGGCATTTGCCTCATAATATTGGCAATTTGTA
ATTGATCCCTGGAACCCATACAAAGGTTTAGAATAGACTTCACAAAGATG
ACCTCTGACCTTACATGCATGTGGTGGTATCTTGTGTTGTCTCTTTCTCT
CCCAGCCCATGAACACACACACACACACACACACACTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATACAAACAAAAACAAAC
TACAATATGATTGTAATAAAGAGGAGCTTGGTTAGCTAAATATGGTCATA
TATACCTGTGATTCTAGCGCTTGGAAGACGAAGGCTGGATGAGGATTGGG
AGCTAAAGGCCTGTGCTCTAATTATTAAGTTCACAGTCTGCTTTTGTTCT
TTTTATGACCTTGTGAGTGTCGTTGATTTACATGTCCCATCCTTTCTGAT
ATTATGTTTAAACATCTCTTAATCTTACATTTCTATTGGAAAAACTGGTT
GG
| TTCTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACGCACCGGGGTGGATGTG
TCCCTACATCGCCCCCAGGATCTCGAGGCCCACCTTAACCCCAAGGCGCG
CTCCAGACGCACGTGTCTCTAAACTGCACCTTGACCCACTGCTACCCGCC
TTGGCTTAGCGTTGCTGTCCGGAGACCACGCCTCCGGCGGTGTTCTCCGT
CTCCCCGGAATCCAGCACCGGCCATTGGCTGCTCTCAGCTCTCCGCCCCG
ACGCGTGCCCCAGTGCATCCCGCCCATTTCTCAGTTTCCCGGCTGGCACG
GGGCGTGGCGTGGGCTGTTCTCATCTCACGCCACGCGGCGCGGAGTCCGT
TAGCTGACGTGATCACCCCGCCTCCCGGATCATAATTGTCCGTGTTCTCA
CTAAACTTCGCCTCTCCCGTTCCTTATTACCCCTTTTCGCAATCTCGTAC
TACCATATCAGTCCGTTCGTATCTTCCTTCCGCTTTTCTTGCTTCGCCTT
CTCTCCCTCCTCCCCCTTTCATTCCCTTCCCCCTACCCTTCCCCTTCCCT
ATTTCCATTCCCTTTTTTTTCCTCTCCCATCCCTTATTTTTTCCCCCTTC
TCTCCTAATCTTATCCTTCCCCTTCCATCTCTTTTTTCCCCCTTTTTCCC
CTTTTTTTCTTTCCTTCCCCTTACCCCTTTCCCCTTTCCCCTATCTAACC
ATACCTATCTCCTTTCCCTTTATATCCCCTCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 8 10 9 9 10 16 37 37 30 30 29 25 25 32 39 37 31 31 41 37 37 41 41 26 24 21 21 20 21 21 12 12 11 10 11 12 19 19 14 14 20 20 28
29 59 48 50 35 36 35 35 33 33 33 33 33 41 23 23 10 8 8 8 8 8 19 27 39 40 40 40 48 48 59 59 57 57 57 53 53 53 57 57 57 47 47 40 42 42 47 57 57 43
47 54 54 54 68 68 68 68 51 50 47 47 50 57 59 68 68 50 50 50 48 57 54 54 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 57 57 59 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
68 68 68 68 68 59 59 48 59 48 44 47 46 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59
68 59 57 57 57 57 50 53 57 57 57 50 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 39 41 34 33 24 12 12 12 24 28 30 34 46 59 59 59 50 50 57 57 57 57 59 59 57 57
57 57 57 57 59 50 50 50 53 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 54 48 48 48 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 54 57 57 57 48 48 47 47 44 44 43 43 37 43 42 44 43 46 46 47 37 37 32 32 33 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 59 59 59 59 59 57 54 54 57 59 59 68 57 57 57 57 48 33 33 33 37 33 36 43 41 28 28 28 37 37 34 34 19 19 17 15
15 11 8 8 8 8 8 13 14 30 22 22 15 10 8 7 8 8 10 18 19 12 12 12 15 15 17 30 24 17 13 22 12 11 11 19 15 25 22 28 28 33 33 28 28 22 23 18 24 18
19 15 15 10 10 10 15 15 10 10 9 15 9 9 9 11 8 8 10 12 15 23 14 13 19 15 12 11 11 11 11 9 10 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 10 19 21 19 17 14
10 13 13 15 11 13 14 14 15 12 12 12 16 12 11 11 16 12 11 8 9 10 17 10 15 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 10 9 9 10 8 8 6 6 8 12 10 12
8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 9 10 10 12 10 10 13 13 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 10 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 12 11 11 9 9
9 9 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 8 11 9 9 9 17 18 22 25 34 31 39 39 37 37 37 37 32 32 44 44 30 27 15 9 9 9 9 9 9 10 9 12 12 30 21 39 37
43 44 47 47 47 47 47 53 44 59 50 50 35 25 18 8 8 8 8 8 17 10 12 12 20 15 22 29 29 36 36 47 50 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 43 50 50 50 54 68
68 68 59 59 54 54 50 50 50 50 57 57 57 53 68 54 50 43 43 43 48 48 42 40 40 44 46 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 54 54 46 46 43 43 44 57 57
59 59 59 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 57 54 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 68 68 57 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 59 59 52 52 52 59 57 57 50 50 50 50 50 47 52 52 57 59 59 59 59 57 48 27 27 11 11 11 27 34 59 59 59 57 43 43
59 59 59 59 57 57 37 33 24 28 28 32 32 41 42 42 44 57 57 57 57 57 43 47 47 44 43 43 47 43 48 48 48 59 44 39 30 30 42 43 57 44 59 48 48 48 48 48 43 48
43 43 43 43 43 43 39 36 37 43 43 43 32 34 23 23 23 34 41 59 41 41 21 10 10 9 9 9 9 11 11 11 9 11 12 23 30 59 59 43 39 39 59 30 34 32 23 21 28 21
14 14 15 18 20 19 15 15 12 15 13 15 12 8 8 6 6 8 8 14 14 19 10 10 10 10 10 10 10 10 11 15 17 17 21 22 18 12 12 11 12 12 15 13 15 11 9 9 12 9
9 13 18 12 16 15 18 10 16 13 10 10 11 11 11 11 15 12 12 12 12 21 29 37 28 21 11 11 11 9 8 8 8 8 8 6 9 8 9 13 8 9 10 10 10 11 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 14 14 9 9 9 10 13 14 16 14 10 11 9 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 6 6 9 10 18 14 13 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 15 10 12
6 6 8 10 10 8 8 10 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 10 10 8 8 8 8 11 8 9 9 12 8 10
10 9 9 12 12 8 8 8 8 9 10 19 19 20 20 12 11 8 8 8 8 8 12 12 25 17 18 18 15 15 18 15 15 10 10 11 11 11 13 13 13 14 11 9 12 11 9 8 10 9
9 8 8 10 15 8 8 11 10 10 10 12 12 13 10 13 10 10 8 10 8 13 8 8 8 8 19 12 10 8 8 8 8 8 8 12 9 8 8 10 10 10 9 10 12 16 21 12 9 9
9 9 9 6 6 6 6 6 6 16 10 11 11 11 14 9 9 15 16 11 16 13 14 13 12 8 8 8 8 8 12 12 9 11 11 13 19 13 13 8 13 15 12 12 15 19 18 18 22 28
22 14 14 14 16 19 13 13 14 11 14 13 12 12 12 19 19 23 19 13 11 8 8 9 8 10 12 12 12 13 16 24 25 25 20 18 18 14 14 9 9 9 8 9 10 8 8 8 10 9
8 8 8 8 15 10 8 8 6 6 8 8 10 15 15 11 9 10 10 9 9 13 10 10 10 13 14 18 19 22 22 22 |