BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-369G17.T7 (MSMg01no369_g17.b1) | MSMg01-369G17.TJ (MSMg01no369_g17.g1) |
ACC | AG476412 | AG476413 |
length | 705 | 736 |
length of high quality (start - end) | 487 (46 - 532) | 532 (69 - 600) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no369_g17.b1 PHD_FILE: MSMg01no369_g17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:07:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no369_g17.g1 PHD_FILE: MSMg01no369_g17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:07:08 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTATCTGATCAGAGAAGACCTTATACCAATGCTCTTCAAACAATTT
TCCAAAATAGAAACAGAAGGAACACTACCCAATGAATTCTGTGAAACCAC
ATTTATGCTCATACCTAAATGAAACACCCTACAAAGTAAGAGATCTTCAG
ACTAATTTCCCTTATGAATGTCAATGCAAAAATAAACAATAAAATTCTTG
CAAACTGAATCCAAGAACACTTCAAAATGATAATCCTGAATAAGTAGCCT
TCATCCCAGTGATGCTGGTATAATTCAATACACAGATATCAAGCAACGTG
ATCCACTATGTAAACAAACTCAAAGAACAAAACCACATGATCATCTCATT
ATATTCTGAGAAAGTATTTGACAAAATTCAACACCCCTTCATGGTAAAAG
TCTTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGTCCAAACCTAACCATAGTANAAGCA
ATATACAGCATACCAGTATCCAACATCAAACTGAATGGGGATAAACTTGA
AGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTATAAAAAGCTACCCACTCTCTTCCT
ACCTAATCCATAATGTACCTTAATTTCCTATCTATATCTATTAGGTTTTC
TAATATAAGTTTTAAGACATACTTTATTGTACTTTGAAAAAACTTCCAAT
AACTN
| AATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTGGCAACATGAGCTCTGTTAATTTCTTCAC
CACTCCTTACTATTGTTATTCAAAGTAAATGTAGCAATATGTTTATGCTT
TTGATTTATTGTCATTTTTAAAATAGCATTAAGCATTAAAGTATCTATAT
AGTAAAGGTTAATATAAACGTGGTCTCTATTTTTAAAATCAAAATAAGAC
ATTACCAGCAGTTTAAGAGAAACTAGCCTTATAAGATTTAAACACCACAT
AAATACATTTGTTACGATTAAACGAAATATATCTAAAAGATTACTTTTTT
AAAGAAATAGGAATTATTTACTGGAAAGTTTGGAAGCTAATGACCCAAAC
GCTGATGAGCCTAGGGCTCTGGCATCTGGTGACAACACTGTTGGTTATGA
TATCATGTTGACAATAATTTTTACAAAAAAAGAATACAGATGGCCATACA
GGAAATGTAAATCTGAGGTAGAGGTTAGATATGTTCTCTCATGAGATCTC
ACCCCCAAGAATTAATATTTACTCCAGAGCCTGGCACCTTACATCATCCT
GGGATCGTCCATAAAATTCATCAGTTAATATCTTCCAAAAAATATATCTA
TTCCCGGGGACCAAATGCCAAACACATGAGTCTCTTAAGACCACAGAGCA
TACCCAAGGCAAAGCAGCAACATTAAACTATATATT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 8 8 8 12 15 24 26 28 23 23 18 16 16 22 29 22 22 11 13 11 30 41 28 27 21 13 13 9 11 9 11 11 14 27 35 44 43 20 20 24 22 22 29 34 47 44 29
23 23 32 32 33 37 23 17 10 10 10 14 15 24 27 33 33 48 59 47 47 48 47 47 47 59 59 59 42 38 38 36 36 33 59 59 59 59 37 37 37 37 32 32 32 32 33 33 47 50
30 29 26 26 26 35 43 57 57 57 57 37 37 40 40 40 40 48 50 50 53 50 68 68 68 68 68 54 54 54 54 53 53 68 68 68 68 50 50 50 53 53 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 57 54 54 54 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 48 48 43 47 43 47 48 47 59 41 41 39 44 41 39 39 41 41 41 41 47 46
59 59 59 59 59 43 43 43 59 57 57 57 48 48 48 42 36 36 36 33 33 48 59 59 59 47 37 37 31 31 28 24 24 28 25 23 29 29 32 43 47 23 27 3 0 3 27 15 20 20
24 24 59 41 41 18 17 12 13 9 9 9 12 11 30 30 33 37 33 30 31 31 31 30 30 37 32 31 18 18 20 24 32 30 11 9 9 9 7 10 8 11 10 13 13 17 17 18 15 13
12 13 10 20 20 22 18 18 32 34 30 28 15 15 15 15 12 11 8 8 8 8 8 10 10 13 12 14 8 8 8 8 8 8 13 11 8 8 8 8 10 15 24 19 10 9 8 8 10 10
16 13 12 11 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 10 12 10 12 14 9 9 12 10 8 12 11 13 11 11 10 11 11 12 13 11 11 11 12 12 9 9 9 9
9 9 11 10 8 8 8 8 9 8 8 9 10 13 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 7 9 15 8 12 12 9 9 9 10 10 9 9 10 9 8 6 8 6 6 8 8 10 10 13 8
8 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 8 7 7 6 6 8 11 14 24 30 37 39 39 39 39 39 37 37 34 34 19 17 17 11 11 11 12 12 23 19 10 13 12 21 21 32 32 17 21 11 11 10 19 21 41 33 28
15 12 12 11 12 18 19 24 28 27 47 39 29 24 28 28 35 35 57 57 57 47 47 50 50 57 50 50 50 53 57 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 50 50 47 47 47
50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59
59 59 57 57 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 59 54 59 57 57 48 54 48 57 48 48 48 48 48 54 54 54 57 48 59 59 57 48 48 48 57 57 48 48 48 48 39 39 35 39 30 37 32 47 36
36 36 41 37 37 28 24 22 30 29 35 41 41 37 32 41 41 41 41 41 59 47 47 47 47 34 34 28 28 24 31 39 31 36 35 35 37 37 43 39 37 39 40 39 37 41 41 37 11 9
9 9 9 12 12 19 14 19 18 25 34 41 25 28 27 30 15 15 11 11 10 17 15 19 25 18 18 14 22 22 25 33 28 15 16 10 10 10 19 26 19 20 20 20 20 20 28 32 37 35
31 31 31 31 25 18 18 19 19 18 19 14 14 14 15 16 19 15 12 12 12 18 21 24 18 17 15 28 12 12 12 15 18 10 8 6 6 7 13 19 16 23 24 12 11 11 11 10 12 10
11 11 15 17 22 15 12 9 8 8 8 8 8 12 13 13 13 10 11 17 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 7 7 |