| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-392I04.T7 (MSMg01no392_i04.b1) | MSMg01-392I04.TJ (MSMg01no392_i04.g1) |
|---|
| ACC | AG494028 | AG494029 |
|---|
| length | 777 | 786 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 271 (48 - 318) | 243 (78 - 320) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_i04.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_i04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_i04.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_i04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:03 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCTTTGTTTACCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGAT
TTTCTGAAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCC
CCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTC
TTTTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCTTTGCAGAAACTTTGGAGTTTC
ATTAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACTGCACAAGCCATTGCTGT
TCTGTTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCA
CTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCTTTG
ATCCATTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATGGATCGATTCG
CATTCTTCTACATGATAACAACCAGTTGTGCCAGCACCAATTGTTGACAA
TGCTGTCTTTCTTCCACTGCATGGCTTTAGCTCCCTTGTCCAAGATCACG
TGACCCTACGCGTGTGGGCTTATTTCTGGGTCCTCCACCCCTATTCCCTT
GCCCCCACCCGGTTGTCCTCTATATTCCCCCCCCAGCAACCTTTTACCCC
CCCTGGTCCAGCACCACAGCCTTTCCCCCTCTCTTTGTCCGCTCCCCCCC
CAACCTCCCCTTATCCCCCCTCTTACCCCCCCTTCTCCCCTCGCCTTTTT
CCTCTCTCCCCCCTATCCTCCCCCCCC
| TGCAGTGCGTAGGCCTGGNGGCCGCCTGGCTTCAATACCAGAGGNNGAAC
NANAGAAGGTTTCGAGACAACATCCAATTCATGCAGAATCAAACCAAAAA
AAAATATTAGCTAACAAAATAAAAACGCTAACTTAGGCATACTAAGAATT
ATGTAAATTAAAAGCGCAGGAACACAGTTTATTTTTACCATACTGAGATG
TGGTTTTTTGGAGAATACTTTTAATCGCTGAATTAAAAATTTTAAAATAA
ATACTCTGTGATTTACCCAAAGTTTATATATCATACATCTATAATATTTC
AAATAATATATACTCATGTGCATCATTTAGGAAAACACATCTGGGTCAAC
TTTTTCTAAAATTTGCATATTCTTTCTCTAGGTGAGGCTCAAACAAGTTG
CAGTAGATAAGAGACCGCAGGAATTTAAAATCTTACTCTGGCAGTAATCT
CAGACTCCATGTTGGAGGGTCCCAATGCACTGTCTGAATACTCGCTTTCC
ATCTACAGCCACCGCTATTGACTGATGTTCTCCTATACAGACACTACGAT
CCTGCATGCGTCTTTATCCATATACAACTTCCCTTCTCCATCGCTCATTT
TATCTTATCCCGCCCTCCTGCCATCTTTCCCCCGTGTTTTGTTTGCTGAT
CTCTCGCTCTGTATTCTTCTTTTTCTTTCCCCTTCATACCCAACACCCCC
CGCCCCCTTTTTATTTGCCAGATCCCTCCGTTCATATTCCCCCCCTCTCC
CCCCCCCCTTTCTACCTCCCTCTTTTTATTCCTTTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 12 12 13 17 11 11 15 22 37 37 28 28 23 18 18 24 28 31 31 33 37 33 28 36 36 26 22 18 15 13 8 10 8 9 8 8 8 10 25 25 20 19 22 22 22 24 32 32
32 28 33 33 33 33 33 47 47 44 34 18 11 9 6 6 7 13 15 20 31 25 33 37 47 47 40 40 40 44 59 57 59 57 43 43 43 43 40 43 43 43 43 48 48 50 50 50 48 50
54 54 53 50 48 48 47 47 48 43 44 37 37 37 46 46 57 57 57 57 59 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 47 47 47 57 57 43 43 36 37 37 43 34
44 43 44 47 57 57 57 57 57 57 57 57 52 37 37 50 50 50 50 54 54 54 57 50 50 50 50 50 50 59 59 59 57 57 52 52 52 57 59 59 57 57 59 59 57 57 52 52 52 54
57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 57 44 44 32 32 32 44 44 57 57 57 57 43 40 40 40 40 46 57 47
48 43 44 43 43 46 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 59 59 48 48 43 43 43 57 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59
59 59 47 48 48 43 43 43 37 37 43 43 41 41 37 30 24 19 11 11 11 11 16 12 11 11 15 24 30 41 41 50 50 44 44 36 36 32 33 39 42 47 47 57 59 59 57 57 48 48
48 57 59 59 59 59 59 59 54 54 47 46 43 39 35 35 35 35 42 37 33 30 32 41 43 59 59 59 59 57 43 43 47 59 43 59 39 33 30 30 28 28 25 25 28 34 37 46 41 37
39 35 31 31 35 39 34 34 36 36 37 27 23 23 14 15 15 12 12 12 9 12 18 26 14 12 12 15 19 19 28 28 34 34 35 39 39 43 40 37 40 40 43 42 43 48 32 32 17 17
17 32 30 48 48 34 34 25 19 18 18 18 17 30 24 27 18 18 11 11 11 24 25 37 33 30 28 23 23 22 28 11 8 8 8 10 10 10 10 11 12 28 30 32 24 28 14 14 14 23
24 26 24 16 14 19 17 20 20 36 33 33 21 18 11 10 10 10 10 11 11 11 12 12 15 16 27 22 11 11 11 15 13 19 28 19 19 11 11 12 15 14 9 9 9 13 12 12 11 11
11 11 13 13 12 12 9 9 9 10 9 9 10 9 9 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 10 17 17 11 11 8 8 10 13 22 11 11 11 23 23 29 16 13 11 11 11 24 21 11 10
8 8 8 10 7 9 9 9 10 10 9 9 8 10 10 10 10 10 13 13 12 8 8 8 8 10 13 13 12 10 10 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 17 25 34
27 20 18 16 12 11 8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 12 12 20 19 20 16 13 12 7 7 7 10 10 11 10 10 9 6 11 6 6 8 8 9 8 13 9 11 15 15
19 13 8 8 8 13 13 10 10 10 13 8 8 8 8 17 15 9 8 8 8 8 8 9 9 9 14 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 10 10 15 8 9 9
10 8 8 6 7 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 11 11 15 30 31 27 24 22 22 22 19 | Open.Hide. 9 10 9 9 9 15 9 9 9 18 23 37 36 40 36 23 23 3 0 3 23 23 39 27 27 11 12 10 7 7 7 8 7 7 9 9 9 8 8 9 9 9 9 3 0 0 3 17 17 3
0 3 0 3 18 18 10 9 9 7 8 8 6 6 6 6 8 8 11 10 9 9 9 9 9 11 13 17 27 29 31 31 31 44 44 37 37 39 39 42 42 48 47 47 47 47 47 50 59 59
59 57 57 57 68 68 47 50 48 57 57 57 50 50 42 36 26 25 32 32 44 44 36 30 30 32 47 47 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 50
50 57 57 57 47 47 47 57 32 32 20 20 20 32 36 43 43 43 50 37 32 32 32 32 27 28 20 28 27 44 44 57 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 44
36 36 28 28 30 44 59 57 57 54 54 57 54 54 54 54 54 54 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 59 47 42 42 39 39 33 34 25 25 32 37 37 37 47 39 36 39 35 32 28 16
16 9 11 11 12 16 16 25 25 41 41 41 48 48 48 37 39 39 39 39 39 35 35 35 39 39 48 48 48 48 48 48 48 47 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 57 59 47 47 47
47 47 48 39 39 39 39 40 47 47 48 46 39 39 22 23 9 12 9 9 9 9 9 9 9 9 18 20 11 11 20 27 37 48 48 48 43 43 37 39 43 47 47 46 37 40 28 28 28 42
33 33 43 42 43 57 34 30 11 11 11 11 11 18 22 12 12 11 12 12 15 15 19 27 30 47 34 34 21 19 12 12 11 12 12 21 26 22 26 19 15 17 14 18 18 32 32 39 37 37
28 28 20 24 17 17 17 25 25 15 23 14 10 8 10 8 8 8 8 10 10 16 26 32 33 26 21 15 13 13 13 15 28 32 43 43 47 48 48 39 39 33 33 36 43 39 40 43 43 34
30 18 12 12 18 18 15 8 8 8 8 13 17 47 59 46 19 17 8 8 8 11 11 11 11 12 20 11 11 11 24 21 18 14 13 12 12 19 18 22 12 12 10 10 10 10 10 11 15 11
12 12 22 13 12 8 8 8 9 8 8 10 13 14 10 10 10 13 21 12 12 12 24 24 15 10 8 8 8 13 15 15 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 11 11 11 12 12 13
16 10 10 10 10 10 10 11 11 16 18 23 12 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 10 10 8 9 9 9 10 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13
8 8 8 8 11 9 9 9 10 10 10 10 10 8 17 11 10 8 12 11 11 7 6 8 8 8 8 8 10 13 11 12 13 8 8 6 6 6 10 16 13 8 7 7 6 8 8 11 9 9
9 16 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 8 6 8 6 6 6 6 10 16 21 8 8 6 6 6 7 14 16 15 11 8 8 6 6 8 12 12 10 8 8 6 6 6 6 13 27 8 8
6 6 6 17 13 18 19 23 20 15 15 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 7 6 6 10 8 10 10 13 9 8 8 8 8 8 8 13 17 21 15 9 8 8 8 8 8 11
11 14 14 16 19 18 18 19 22 19 19 12 12 12 9 12 12 15 8 8 9 10 8 8 8 7 6 6 6 8 6 9 10 10 10 10 |
|---|
