| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-415D16.T7 (MSMg01no415_d16.b1) | MSMg01-415D16.TJ (MSMg01no415_d16.g1) |
|---|
| ACC | AG511337 | AG511338 |
|---|
| length | 726 | 1,201 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 244 (64 - 307) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no415_d16.b1 PHD_FILE: MSMg01no415_d16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:33:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no415_d16.g1 PHD_FILE: MSMg01no415_d16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:33:33 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | plural | no hit data |
|---|
| sequence | TGCGGCCGCTAAACGACTCCTATTGCGNAAGGATGCCGCGGAATCATGGG
ATACCCGTGACCGTGCTTGTAAGTGCACAAGAAATATCACTGGAATCCCT
TCTACTTTCCTAGAGTTGAAGAAGGAAGAGATAAAGCAGAGACAAATTGA
ACGAGAAAAATTGGCATCTCTGAAAAAACAAGACGAAGATAAAGATAAGA
GGGATAAGGAAGAAAAGGAAAGCAGCAGAGAGAAGAGGGAGTGGTCTCGC
AGCTCAAGAAGATGCAGATCCAGATCTCCTACTCCTAGAAGATGATCTTC
CCCTGTCTTTTTTAGAGAGAAAGCGCAGTCACTCTTGATCTCCCCATCAC
AGAACCAAGAGCCGGAGCCCTTTCCCTGCCCCAGAAAAGAAGGAGAAATC
TCCAGAGCTCCCAGAGCCATCCTAGAGGATGAAGGACTCCTCAGTACAGG
AGGCCACCTCGACAAGTAACATCTTGAAAGCTCCCAAGCCTGAGCCTGTA
CCAGAGCCCAAAGAACCATCTCCCGAACAAAACTCCAAAAAGGAAAAGGA
ATAGACTCCATCAAGACCTCGGTCAAGTTCCTGCCGTATACCGGACCGCG
GCCTACTTGAAACAGGTACACCTGGGACGTAGGCTGGTTTCCGAACCAGA
CCTATACTGCGAGCGAGATTATGGAGCCCATATCACTCGCCCGATCCATG
CCCCCACATTTTCCTCCCTATCTGTG
| GGGCGTATTCGTTTAAAGCCGTTATCTCTTCGTACTTATCACCGTGCAAC
ATTAGTACTTTACATAATTTTCGCTAATATACTACGTTTGATATACATAT
TACACACATGTTACAGACGGGGCGGCTGTGCTGGTTTTCTTCCCCTCAAA
AAAAAAAGGTGTTGAAGTGCCTGTCAACGTTAGTAGATGAGGCAATTATT
TGTTCCCCCCCGAACGAGGGAAATACTTTGTCTGCTACGATTGTTATAAT
ACTCTTAATCTATAACAAATAAGAATATCAGGTTGTGCTTGTCGTCTTAA
CGTTCAGTACATATGAAACATTTAGTTTGGTCGCAATAAACGGGCGGATT
TAAGTCTAATGGGTCGTGCGTCATGTGCTTTAACCCCTATTTTATTGGGT
TTTCATCGTTCGAGGGGGTACTTGCAGAAAAGCTACGTATAGTGCGTGTG
TTGCGTCGCGTGCAGAGCTCAAACGAAAATGGGCGGCATCTACGATGTTT
TTTGCGATAATCGTTCACGCGGGAGGTATATACGTGGTGGGTTATGTGAG
AGGGCTCGAATAAAGCGTTTTGCTTGTGGGCGGTTCGGTTGTAGCGGAGG
CGATAATGGAAGAGGATCGATGGAGTTTGTACGCTCCGTCAGAGAAGCGG
GTAAAGTGTCGCAGCACGATAAGAAGATGCTGGTGGGGGTATACACCATC
GTTAGGTGCGGGTTGGTGTAGAGGTCATCGGGATGGTGATGATGAGAATT
CACCGCCNATGGGGAGAGGGGTGCGGCTTTTACACGCTGAGTCGAGTGCA
GGTTATATGCGCGGTAGATTGTGCGATTACGCGCGCATCATATCCCGTGT
AGCGTACCATATAGAGACGGTTGCCTGCACGCGTGGTTCGCGCAAAGTGT
GACCGCAGATTAGATAATCGAGCAGTTTATATACGACGGAGGATATGGGT
GGTAAAAGTGTACAGGATACCGCGCGGATCGATAGAGCGGGAANCGAGAG
AGTGCCCATTTGGCGCAACTTGTGGTGACACTCTCCGTTTTACGCGCCCA
TTATCCCTCCGTACCAAGCTCCCACGTATACCTCCAACGATACTTCCGGA
GTATACTAGCAGGATGATACCGTCGCTGAGGTTNCGANGCGCGTGTGAGT
GACATATGTATAGGCCATATGCGATGATGTACAAGATGGCAGATGGCTGG
G
|
|---|
| quality values | Open.Hide.22 24 25 25 19 16 12 21 21 19 10 9 9 22 23 28 23 11 12 12 9 6 6 6 6 6 3 0 3 10 8 8 8 8 8 8 8 10 27 27 26 14 10 11 22 22 21 16 9 9
9 9 9 9 15 12 8 8 8 8 8 8 13 15 29 29 37 37 50 50 50 53 53 31 31 29 29 18 18 12 24 19 16 9 9 9 21 23 40 37 39 47 33 33 33 37 37 28 32 37
37 37 37 41 40 40 48 37 37 30 28 24 21 26 24 25 29 37 39 39 28 24 24 24 24 28 34 25 22 24 29 25 30 30 43 48 59 59 34 34 19 19 10 20 20 34 34 36 36 48
48 48 48 41 46 46 30 22 19 19 12 16 19 37 37 37 37 37 39 48 43 43 37 39 25 28 12 12 11 22 22 39 59 46 43 43 36 36 39 43 43 43 34 33 33 33 33 28 37 37
47 33 31 30 27 27 24 34 35 44 44 43 43 41 31 31 41 59 41 41 41 40 40 43 43 43 46 48 48 48 48 48 57 59 59 59 37 34 32 30 33 31 31 28 31 43 43 57 57 59
59 59 57 57 57 54 54 57 59 68 68 68 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 43 48 42 39 47 47 47 44 59 59
59 59 59 30 19 10 9 8 8 8 17 12 12 12 12 23 30 41 59 59 59 59 59 59 48 43 43 59 43 46 46 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 48 39 39 30 30 35
37 37 43 43 41 41 39 39 37 37 37 31 32 41 41 41 47 46 46 59 48 48 53 48 50 48 48 48 48 48 47 47 47 47 43 43 43 43 47 39 35 35 39 59 48 54 48 48 46 48
46 46 40 43 43 57 59 59 54 47 42 39 37 37 36 37 37 30 30 18 26 11 11 11 16 24 30 26 29 29 26 26 32 30 30 37 44 44 43 37 37 32 30 28 28 28 23 23 23 28
23 28 31 34 37 43 42 59 42 40 33 36 28 32 39 28 30 25 30 30 47 47 48 48 48 48 48 48 39 39 39 39 37 34 24 24 20 20 18 23 25 30 23 18 19 15 15 13 19 19
28 32 24 10 10 13 15 17 17 19 31 23 24 17 19 19 15 15 19 26 22 15 15 10 10 10 10 11 13 18 19 23 17 17 17 11 11 11 12 23 30 39 34 34 21 21 14 18 16 11
10 10 10 10 11 12 19 10 10 10 10 14 11 12 13 13 13 10 10 11 24 21 23 34 29 28 22 22 17 17 11 11 11 12 12 12 15 15 17 30 30 30 23 20 19 20 16 18 15 11
11 11 18 18 13 13 18 19 15 8 8 8 8 12 8 8 8 8 11 11 9 9 12 8 9 13 9 9 9 9 9 9 10 15 13 12 13 13 10 8 8 8 8 8 8 11 11 9 10 9
9 8 10 10 8 8 7 6 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 21 19 16 13 15 12 11 11 11 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 8 9 10 8 10
8 8 8 17 8 8 6 6 8 10 14 15 10 10 13 12 9 8 8 8 8 9 8 8 8 8 | Open.Hide.11 11 11 11 8 8 6 6 6 8 12 6 7 6 6 6 6 6 6 7 10 12 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 10 7
9 7 7 10 6 8 6 6 8 8 12 11 8 9 9 9 9 9 17 11 8 8 10 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 7
6 6 6 8 6 6 6 8 8 10 11 10 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8 10 9 9 11 9 9 9 10 10 11 9 10 9 10 10 16 12 11 11 11 11 11 16
16 17 19 15 13 10 9 8 6 6 6 7 7 11 10 9 12 9 9 9 9 9 6 6 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 10 13 8 8 8 8 9 7 7 6 6 6 6 8 7
6 6 6 6 10 12 12 12 13 7 7 6 6 6 6 6 7 6 8 8 9 13 11 13 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 8 6 7 8 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8
7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 7 7 9 7 13 8 8 8 9 10 12 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10
10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 10 8 8 10 15 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 10 13 13 11 11
11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 7 9 7 6 6 10 8 8 10 10 10 10 10 11 12 13 12 12 8 8 9 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 9 9 9 9 9 10 10 9 9 9 9 10 10 13 10 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 6 7 10 11
19 18 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 12 6 8 8 8 10 9 12 8 8 8 8 8 6 6 7 8 7 11 9 9 9 8 8 8 10 10 10 10
10 8 8 9 9 9 11 11 8 10 7 6 8 6 8 8 8 9 9 12 10 11 8 8 6 6 8 10 10 6 6 8 6 8 14 16 11 11 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8
6 8 6 6 6 6 10 8 7 6 8 8 8 8 8 8 12 8 8 12 12 8 8 9 9 9 9 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 9 15 11 12 10 10 10 13
10 11 6 6 7 7 10 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 8 6 8 8 8 10 8 9 11 11 9 9 11 11 11 9 9 9
10 9 9 9 8 8 8 10 8 6 8 6 6 7 7 8 8 8 6 8 9 9 7 6 8 6 6 6 8 8 10 10 12 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 8 8 11
9 8 8 8 8 8 3 0 3 8 6 8 8 9 6 6 6 6 10 12 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 6 6 7 7 6 6 11 10 8 6 6 6 8 8 10 10 10 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 6 6
6 6 6 7 7 8 8 10 9 6 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 13 10 9 8 8 6 6 6 8 10 9 9 9 9 9 10 10 11 9 8
8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 7 8 8 9 10 8 10 9 7 10 6 6 8 8 8 8 8 11 11
8 8 7 8 8 8 10 10 8 10 6 6 8 8 11 9 9 7 8 8 8 8 8 10 9 9 12 12 8 8 8 6 8 6 6 8 7 8 7 12 6 6 3 0 3 11 9 9 6 6
8 6 6 6 6 8 8 6 7 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 12 12 11 11 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 8 6 9 9 6 6 6 6 10 8 8 7 7 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 8 8 8 8 8 7 6 6 6
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 10 13 9 9 9 9 10 10 10 8 9 8 8 8 8 7 3 0 3 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
8 8 11 10 8 6 6 6 8 13 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 11 10 12 8 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 6 8 8 8 8
8 |
|---|
