BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-436M20.T7 (MSMg01no436_m20.b1) | MSMg01-436M20.TJ (MSMg01no436_m20.g1) |
ACC | AG527783 | AG527784 |
length | 792 | 773 |
length of high quality (start - end) | 42 (121 - 162) | 337 (142 - 478) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no436_m20.b1 PHD_FILE: MSMg01no436_m20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:01:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no436_m20.g1 PHD_FILE: MSMg01no436_m20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:01:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCAGGATCCGCG
GAATTCTAATACCATTTCCGTACCGGATTACTCAGTCCACCTCTGTGTGG
GCCTGGCCAGGGCCTAAGAAAGCTCTAGAAGCAAAGCGGTAGGAAGTTGT
TAGCTTTCTCAGAGGACAAGGGAAACCCCAGGACACCTGCCACGCCTCCC
GACCCCGGTGGAGCTGCCCAGGCTAGCCTCTCTAACCTGCCCGCTCTCCT
CACTGCCCTGAGCGTCCGCCCAGTCCTGCGCCATTCGAAAGCCCGCCCGA
CCCCTCAGTCGCCGAGTCTACTGTTTTGCCCGACCCCCTCCGCCGCGGCG
CCGCTCGGCCAGTCCTCCAAGGCTCGTACCGGGTCTGAGAGCCCCGCACA
CGCTTCCCGTCTCACCTCGAGCCTCCCGGGTAACACTGGCGGCTCCCTCA
CCTTCTCCCAGCCGCACACCCGGTCCCGTGCTGCAGTGTAGACTGCGGTA
GAGGTGGACCGACCGTCCCGTGCCTCATAACTAACAGGTCCCGTTTTAGT
CCGTCGCGCGAGCGTGTCTCTCGCTACGATTCCTTACCTTGTCGCTCGGC
TCTTGTTCCTGAATTGGTTTTAACGAATGCCCCAATCCCCGCCCCTTTTT
CCCATAATTTTATTATTTTATTTGTTATAATTTTTCTTTTCGTTTTTTAC
ACCCTTTTTTCTTCCCCCCCCCTAATGTTTATCTTTTCTCTGTATATTTG
CGTTGCTTCCCTCCTATTATCTTCACCTTACTTATTTTTTTG
| CCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGGACAGATAAGGTGGTAGACAGGTG
TGCAATGATGGATGCATGCAAAATGACTTGATGGAAATATCATGATAATT
CTAGCCTTTCTCTTTATTCAGCTCCTCAACAGGCCACTGCTTGTTAAAAA
CTAATTTTACACTACTGCAAAGTTAACAAACCGCTCTTCCAAACACATAA
GACCATCAGATTTCATTTCCAGTATGTACAAGAGTATTGACTCTTTGCTT
CATCCCCCTACATTAATCATTATCTCTTTAAAAACTCATTTCCAATTTGA
TAAGAAAATTAATTCCATGCTTTCATTCGGGCTTCCAAGTGCCCACTCTC
GGCAAAGCACATAATTCTGAGAATAAAGCACCTGCTCTTTCACGTCGTTG
TTTGATGGCCTACGTACAAAGAAGCAGCCAGGAGTGAGTAGTAAAGGTTT
CAATCCGAGCATGAATGAAGATAATTAAACTGCAGCCGTTACTTCAGGGA
ATAAGTGCTTCCGCATGTGAATGCGCTGGACATTGTAAAGAAGCTTTGCA
TTGGACAAAGAGAGAGACCAATCCACATGTTTTTAAAAAAACTATTGTGC
CCTAAGTTTGTCACACTCTCACAATCTAAATGAAGTTTGCTAAACTCCTC
ATGTGCCCTTTCCTGCCTGCCCCATAATCATATTAACCCCCTTACTTAAT
AAGTATACATTCCTCTCCTGCGA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 6 8 8 8 9 21 21 29 23 9 3 0 3 8 9 23 23 37 37 37 37 37 37 48 29 26 28 26 25 25 27 16 9 9 9 12 10 13 13 8 8 12 16 16 18 28 34 32
19 19 17 19 29 29 37 37 37 33 26 17 11 9 9 11 11 11 12 10 11 15 16 23 24 24 28 28 37 33 37 33 24 24 20 20 24 29 24 30 30 37 19 17 8 9 8 10 15 19
20 23 32 32 30 15 15 13 18 13 15 14 14 14 23 12 12 12 13 16 20 29 25 25 33 42 43 40 37 23 22 18 18 18 19 27 30 32 32 37 44 43 41 37 37 28 28 28 32 25
28 32 44 30 22 30 24 20 16 19 12 12 16 24 15 15 11 19 12 12 12 11 11 11 11 15 16 30 32 42 36 42 41 41 28 32 17 23 17 32 32 32 21 16 14 14 21 32 43 32
23 17 17 23 32 32 24 14 8 8 8 8 8 19 28 43 38 28 28 18 18 13 14 14 38 20 24 24 24 21 29 38 18 15 13 19 24 32 27 29 33 43 31 31 33 42 42 46 46 44
44 42 41 24 15 12 12 20 32 13 14 13 24 15 21 24 41 32 35 35 32 25 11 11 11 21 26 32 37 28 28 28 36 41 28 21 11 11 12 12 18 21 17 26 13 13 13 21 27 37
39 39 39 43 28 26 14 14 10 10 9 9 9 12 14 10 10 10 10 20 23 15 15 12 12 14 13 13 14 18 21 21 29 19 19 23 28 37 32 25 25 17 20 20 21 20 12 11 11 16
15 15 20 21 18 19 12 15 15 13 15 11 11 10 10 10 10 13 18 22 29 15 15 15 21 18 11 11 11 16 13 11 13 13 19 24 32 17 8 8 8 8 12 17 28 32 30 23 19 11
15 15 23 19 28 28 34 34 43 43 39 33 32 28 28 32 33 35 28 32 20 20 20 28 28 36 32 28 18 12 9 9 10 9 15 16 15 21 12 11 11 11 12 11 18 18 25 25 34 34
43 36 36 35 30 30 21 21 14 14 14 21 16 12 12 12 12 12 12 12 12 14 13 14 14 14 21 24 22 13 13 12 12 11 12 12 18 11 11 10 10 9 10 9 9 9 10 15 11 12
12 11 11 12 13 10 8 6 6 8 10 16 15 15 15 15 15 11 12 11 11 13 17 11 13 11 18 11 11 10 10 17 17 17 17 19 15 15 18 13 13 14 12 11 8 6 6 6 8 8
10 9 10 10 10 8 8 12 22 24 15 11 11 11 11 11 10 9 9 9 9 9 6 6 8 8 8 8 8 8 12 9 10 10 10 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 10 10 9
10 10 10 10 10 15 13 11 11 14 13 9 9 9 9 8 8 8 13 13 12 18 10 9 9 7 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 18 10 14 6 6 6 9 15 10 14 18 16 13 15
12 10 8 8 8 8 8 8 10 15 8 6 6 7 7 12 10 13 10 10 8 6 6 8 8 8 9 13 12 8 10 10 10 11 19 15 14 10 12 12 8 8 8 14 11 15 10 8 8 8
8 8 8 8 17 12 12 10 8 8 8 10 10 10 10 10 15 11 10 14 11 10 9 10 10 11 8 8 8 8 8 9 10 10 15 13 10 10 12 15 11 11 6 6 6 6 6 10 8 6
6 6 11 8 8 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 15 12 12 9 9 8 9 13 15 14 7 7 6 6 9 9 16 19 33 15 17 8 8 | Open.Hide. 6 6 7 6 8 12 11 9 8 3 0 3 8 8 9 9 30 30 37 44 44 39 39 39 37 37 39 39 39 43 27 23 9 9 13 12 9 9 9 9 17 19 27 24 23 18 23 11 11 11
21 21 42 42 41 37 37 23 12 10 13 13 15 10 12 12 12 9 17 19 19 25 18 20 20 21 16 24 24 23 28 18 28 18 18 12 12 12 11 11 12 22 19 19 24 21 12 12 12 12
12 18 18 23 25 30 28 25 22 12 12 11 16 13 14 12 17 11 11 12 16 16 16 18 11 11 12 11 16 16 24 24 18 16 14 10 12 12 13 15 13 13 22 30 39 42 57 57 57 68
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 62 62 68 62 62 62 68 68 68 62 43 35
16 16 32 32 52 38 38 32 35 39 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 39 32 32 18 24 17 18 18 26 26 41 41 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 57 68 68 68 57 57 59 57 59 59 57 57 68 68 59 59 59
47 59 41 43 43 47 47 48 48 57 59 59 57 57 57 57 57 44 44 30 28 28 43 43 57 57 46 48 43 46 46 57 57 59 54 54 59 59 59 57 57 57 48 43 39 23 21 9 9 9
23 25 57 48 48 48 43 43 36 43 43 59 47 57 39 39 36 36 33 30 28 28 23 18 15 12 12 12 16 21 18 12 12 12 12 18 12 12 10 9 9 9 9 9 16 20 20 23 32 34
43 43 43 37 30 24 17 17 18 30 30 34 36 25 25 31 29 18 11 11 11 12 10 11 17 17 18 17 32 30 33 25 15 10 10 10 10 15 20 33 33 37 37 29 28 20 18 10 10 8
9 10 11 10 11 10 10 16 19 17 17 11 11 11 18 21 12 12 11 16 19 15 8 8 8 8 9 11 15 11 15 15 18 10 9 8 15 12 10 15 16 11 12 11 13 15 16 19 14 12
13 19 10 10 11 12 12 13 11 10 10 10 11 11 8 8 8 8 10 10 15 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 12 13 11 10 12 12 21 18 18 18 12 13 9 9 8 8 8 9
10 13 18 8 8 6 6 8 8 6 9 6 6 7 6 8 8 8 8 8 11 11 11 10 10 10 10 13 11 11 10 12 10 11 11 11 12 14 9 9 9 13 10 10 10 12 12 8 9 8
8 8 6 6 6 8 6 10 11 15 8 8 6 6 8 8 10 9 10 10 17 16 12 12 11 8 8 8 15 8 8 11 11 11 11 11 13 13 12 11 13 6 6 6 7 8 10 8 8 8
8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 11 12 13 10 8 10 8 8 8 6 6 6 |