BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-465N06.T7 (MSMg01no465_n06.b1) | MSMg01-465N06.TJ (MSMg01no465_n06.g1) |
ACC | AG549917 | AG549918 |
length | 781 | 1,067 |
length of high quality (start - end) | 350 (41 - 390) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no465_n06.b1 PHD_FILE: MSMg01no465_n06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no465_n06.g1 PHD_FILE: MSMg01no465_n06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:05 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
TGTAATATTAATAATTTTTAGTTCCTGAGGGGGTTTTTATATTTGTTATT
ATTATTATTTGGTTTTTCAAGACAGGGTTTATCTGTATAGCCCTGGCTGT
CCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGCC
TGCCTCTGCCTCCGGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACACCCG
TCTATTATTATTATTATTATTATCATTATTATTATTAAAAACTACAAGGC
ATATTGACAACTTATTGTGTAATTAAACCCTTACACACAAAGTATAACTT
TGTAGTTCCTATTAGGCATCCTAATTATAAGCATTTAAGCATAAATAAAA
ACCTATAAACTGATTTATATAGCTTTTCAACATAACAGGGCCTACGCCTA
ATATTTGTACATATTTATAGAACATATTGCAGTCTTTATAAAAACCATAT
TTGGTCAATACCTCTTTCTTACCAGTTCTGTCCACATCTTTGCCAGTGTT
TCTTTCCTTGCATTAACTTCTCTTAGTCTGTCACTTTATCGATCCCCCCC
CCATTTTCTTTTTTTCCTTCCCCCCGCCCCCTTTCTTTTTTTTGTCCACT
TCCTATTATTTGGTTATCTTTCCCTCTCCCCCCGTTCTCCCCCCATCACC
ACCTCTTTCTCTCTATACCCTCCCTGTTCTCTCCATCTTCCTTTCTCCCT
CTTTCCTCCCCCGCCCTTTTCCCTTTTTCTT
| ATATCTCTTATNCAGACACCTGCGCCGCCACCGCGCAGTGTTATGAAANT
ACTCCTCCTTATTATTATTATTACGCGACGGCTCGTGAACAGCGACCAAA
CAATATCACATGCACCGCCACTTTGCATGTAAAGAACAACGCCCGCGCCG
CCTCGCGGTGGCAGTGTTGTGTCTATGAATGAGTGCGTCATATACACATC
GTGCTCGGTCGTCGTGGCTAGTGCCAACTTTCGTTATAGATTAACCACAA
CGAGACGGGTCGCTTAATCAACGACTGTCGCCGCCAGTCCATTTTTCCTC
CGCCCCACACTCTAGTTTCTGCACGTTATAGTGACCGAGGCGTAGAGTGA
ACTAAAACGGAGATACGACACAACTACCAAAAGATACACGATGCTTCGTT
CATTCGTTTCGCGGCGGTCACGAGATAGTCGTTACTCCAATGACTATAAT
CGAATCTCATATGCCCGATTTAATGCGATGCTGGGCCTCTCCCCACCGAT
ATCCGCGGCGCTCCCCCCGCAACACCTGCCTGCTGTATCTATATTATACA
TGTATAGACGTCGGCTTCGCCGGGATTTCGACCGACGACGCGTGTTCCGC
GCTCGCCCTATAAGTGCCGCGGCACACCTATTATCGGTATGTACTCGTAT
AATTACGAAGCCCGCGCGCCGCCGCGCTTATCACCATACTCATAGATACA
ACTACTGACCCCTGCCTTCATTGTCGCGCTATAACACGCGCATCGACCAC
GGCGTCTGTANACTTTATTATTTGCCATCGTTGGCTCGCTAGACATCGAT
GTATAAAAGTGACGACCCGCACATATCGTATTTATTACGCTTACATGTCC
GGCGTAGCGTTGTTTATATATCGTTGACCTCGCCCTCATATTTGCGCGGC
TTTCGTATATATTCACATATAGGGCCACCGCCGTTCCTGTCCGCGTTATG
CCTCGGTAGCCAAGCGAAATAGCTGGATCTGGCGATGTATATATAGCGCA
ATACAGATATCCCGCTGTCTGTATTACGCAAATGCCCCATACACAGATGA
GCTGTGCGTGTATACCG
|
quality values | Open.Hide.11 11 23 23 39 39 39 37 32 26 16 19 9 10 10 15 15 47 47 41 25 20 20 15 13 6 7 6 6 6 6 15 14 25 25 29 29 31 31 31 32 59 48 48 33 33 33 33 33 33
34 23 16 10 11 11 12 12 12 11 12 23 26 37 37 37 41 50 36 36 38 38 42 42 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 48 50 54 54 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 48 48 42 42 37 37 41 41 47 48 44 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 57 50 43 50 57 57 68 68
57 50 50 37 36 36 50 50 57 52 54 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 44 50 37 37 41 43 43 52 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 37 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57
59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 39 43 62 62 52
62 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 52 52 52 62 52 52 52 52 52 43 43 35 35 35 43 35 35 23 23 23 31 35 38 38 14 14 12 21 8 8 8
10 22 38 52 52 43 43 24 24 19 24 24 18 17 13 26 26 38 44 43 52 52 57 57 57 52 52 43 43 43 52 43 43 43 37 37 43 43 23 19 16 11 11 15 27 38 52 52 52 59
44 43 38 23 18 18 13 13 14 30 30 28 24 17 24 19 32 32 35 43 36 43 32 24 27 21 18 20 18 18 14 14 14 32 34 32 24 15 13 13 18 24 24 20 18 18 25 17 19 24
29 32 35 35 41 32 18 18 14 14 14 21 23 25 25 22 24 22 21 15 12 12 11 11 12 18 11 11 11 12 12 13 15 12 12 12 11 11 12 12 13 10 11 10 8 8 8 13 21 15
11 11 11 13 18 11 11 11 12 11 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 11 11 11 19 10 8 8 8 8 8
8 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 19 15 11 9 9 9 9 10 10 11 12 18 13 13 12 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 13 9 8 8 8 6 6 6
6 8 8 8 11 14 10 8 6 6 8 8 9 9 10 9 10 9 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 11 10 10 17 16 12 8 8 8 8 11 13 20 20 30 30 15
13 9 8 8 10 9 13 18 24 27 24 22 18 13 13 13 13 9 9 10 13 15 13 7 6 6 6 10 10 11 15 16 19 19 15 14 15 15 12 12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10
10 12 12 8 8 8 6 6 8 8 10 9 6 8 7 7 10 10 16 17 13 10 8 8 8 8 8 12 12 12 8 7 6 6 8 10 11 7 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 21 16 22 18 22 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 16 26 32 16 12 10 8 8 8 8 9 9 11 11 11 10 10 12 10 12 12 11 13 10 10 10 10 12 12 6 6
8 8 9 12 12 10 10 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 9 15 15 10 8 8 10 10 8 11 11 11 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 3 0 3 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 8 8 3 0 3
10 6 6 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 6 6 8 6 6 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 11 11 9 8 8 8 8 7 7 9 10 8 10 8 8 8 8 8
6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10 10 9 9 9 8 8 6 6 8 10 8 8 7 8 8 8
10 10 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8
8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 10 17 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 9 8 8 8
8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 13 10 8 10 8 10 8 8 8 8 10 12 9 8 8 7 6 6 6 8 8 12 10 8 9 9 12
8 9 9 13 12 11 10 9 9 9 8 10 8 8 10 10 14 16 16 10 10 10 13 10 10 10 10 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8
8 8 6 6 8 7 8 10 10 10 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 12 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 9 9 11 11 11 8 8
6 6 6 6 18 13 16 10 13 9 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 10 11 16 8 10 10 8 8 10 8 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9
10 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 10 9 9 6 8 6 6 10
8 9 12 11 9 8 8 6 6 8 8 8 8 11 12 14 8 8 8 8 7 8 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 6 8 9 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8
8 8 8 6 6 6 8 10 10 9 9 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 7 7 8 8 12 10 9 9 9 9 9 9 11 10 11 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 12 12 10 10 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 9 6
6 6 6 8 11 15 11 9 9 9 8 8 7 7 6 6 8 8 8 8 8 10 9 9 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10
11 8 8 6 6 8 7 6 8 6 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 11 6 8 8 8 8 8 6 6 7 8 8 7 6 8 6 9 10 17 11
8 8 8 8 8 10 11 9 11 3 0 3 6 8 8 8 7 7 7 9 10 10 6 6 8 8 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 9 9 9 11 11 6
6 6 6 6 6 9 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 10 9 9 12 11 11 8 8 8 8 10 7 7 6 6 6 10 11 10 13 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 8 8 10 10 13 10 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 10 13
14 17 16 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 11 12 10 9 12 7 6 8 8 8 8 9
9 9 9 9 12 12 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 13 8 8 6 6 6 6 6 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 8 6 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |