BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-466C04.T7 (MSMg01no466_c04.b1) | MSMg01-466C04.TJ (MSMg01no466_c04.g1) |
ACC | AG550152 | AG550153 |
length | 754 | 753 |
length of high quality (start - end) | 572 (74 - 645) | 492 (74 - 565) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_c04.b1 PHD_FILE: MSMg01no466_c04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_c04.g1 PHD_FILE: MSMg01no466_c04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:30 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | ACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGCGCG
GAATTCTTTCCTTACCATGACAACCACATTATTAAAACATTATCAATTAT
TTGGGTCAATTTCATTTTTAAACTGTCTTAACTGATCACCTATGCAGAAT
TATTGGACCTGAGTTATGAACTATTTGAATCATCATGATTATATTTTCTT
ATGCAATGTGAATGGCTGCTCTGACTTGGTGACTTGGTGGGAATAAGTGA
GACACTTGAAATCTTCCCTTCTATGTGATGCTAAGTAGTAAGTAGGTCAC
ATCTCACAAGGAATATTTTTTGCAGGCCCTACTAGGAGGAAAGAATAGTA
ACAGCATGCACTGATTGTTGTATCACTGATACCCTATGTAGCTTAAGAAT
GTAGTATTAAGCAAAAAGTGAAAATCATTATCATTTTGCCGAAGAAACAA
AATACAGAATGAAGGCAAATGAGCTTGTTATGGGTCCCAGAGATCCCACT
CTGATTCTGAAGCAAATTTTAATACAAAGGCATCTACATACAACTTCTAT
GACTATTTATATTAGAAAGATTCAGAGCAGATGAGGCCAATGTGGCCTAT
CTTGTCAAAGATAAATATCTGCTTAATGAAATTCTCCACTGCTAAAATGC
CTCAACTTCCTGCTGCTGGAGGTCCCTAAGAAGTGGTGGTCACTTAACCT
GACTTATTCACTGTTTGCATTTAGAGGCGATTGGCACATGAAAGTCCTTT
CAAN
| GCGATGTAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAGCCCAAGGTCTTGCTCAAGGACATT
CTAGGGCTGTTGGAACACTGGCAGAAGGCTTTAGAGAGCACGTGGATCCA
TACACTAGACTAACGCGGGAATGGAGAATTAATGTATGGGTTAGAGAGAA
CGTCAGACTCCAGGAGGAGAGCTTCCTTGAAACTCTTTTTGCCTCATGAG
CAGCTTTTAGGCATCCCTACCTGACAAGCTGACTCGACCAGAGTGCCATG
GTAAGGCAGGATTATTTCTTGGCTTTCAAGGAATGCCAAGTGCTCTGCTG
CAGTCTGGGCCTTGTTCAGCTCTTCTATATCTAGCTCCAACTGGTAATAC
TGTGGCCTCTCCTGACCTTCCTACTACTGCTCAGTCCCTACAGCTGTGCC
AAAACTTGCACCTCTTGCTACAGTTGCTGCCACTGCTCCCAGGGCTGTGG
CTCCATACAAGTATGCCTCCAGTGTCTGAAGCCCTCACCCTACCATTCAT
CTGCTGCAGGACACCTAGTCTGCAGCCCATGCCCAGGGTCAGAAGCACAT
GATTGCCTCCTTGTTGGCTGTAGCGGCCCTTCCCCCCCCCATCTCCCAGG
AGCAGAAGCAGATGTTGGGGGAGCATCTGTTTTCCACTTATCCCAAAATA
TGATTTCCCACTTGGGCTGGTACCACCTCCTGATATGCTCGCTTGTATCT
CCG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 10 21 17 22 34 28 28 35 30 29 16 17 8 8 8 8 19 25 32 32 12 12 12 22 17 7 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 9 9 13 11 11 11 15 18
24 25 25 16 28 33 37 34 23 13 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 10 13 17 24 28 24 37 37 37 48 48 57 48 48 48 48 47 47 47 47 47 47 43 43 43 47 57 57 57
57 57 54 57 48 47 48 48 50 50 50 50 47 47 50 50 68 44 44 30 25 24 24 40 33 44 57 57 57 57 57 47 47 47 50 50 47 57 48 57 57 57 57 57 57 57 47 47 50 50
50 50 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 50 68 57 57 57 52 54 54 59 59 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 52 52 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57
57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 57 52 52 57 59 54 57 57 57 57 57 57 57 43 57 47 50 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 32 44 32 33 26 36 28
28 40 40 57 57 57 57 68 68 57 57 47 47 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 57 59 59 57 43 43 43 47 47 59 59 59 43 32 32 21 32 32 35 35
59 47 48 48 48 48 48 48 50 42 42 41 30 28 27 14 16 14 18 16 16 11 11 11 17 28 34 40 46 46 48 43 59 48 57 57 59 59 59 59 43 48 48 57 43 53 50 50 57 57
48 57 57 57 57 57 59 47 43 39 36 43 44 57 46 46 43 59 48 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 54 54 57 57 57 43 43 43 57 57
57 57 48 48 48 59 59 59 44 44 31 31 33 44 43 57 57 57 57 57 57 57 59 59 44 44 48 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 47 47 43 36 44 35 35 35 42 42 43 43 43
57 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 43 43 43 41 41 43 59 47 59 43 46 46 57 57 57 68 68 68 68 57 43 42 35 39 43 40 35 40 39 39 39 43 39 48 48 47 47 46
43 37 39 37 37 37 41 43 36 36 37 41 41 41 39 41 41 50 50 50 50 43 34 33 25 25 34 43 43 48 32 32 20 28 29 30 25 35 39 43 46 54 54 41 41 39 43 43 43 40
48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 41 59 39 39 59 59 21 25 18 17 14 9 14 21 24 34 37 28 28 13 24 24 21 28 32 22 19 30 30 37 37 41 32 34 20 20 34 34 37
35 31 31 34 30 23 20 20 26 34 39 37 37 31 31 37 37 39 47 46 33 21 19 19 14 14 30 30 30 22 22 18 25 28 28 28 28 28 28 36 36 39 23 19 12 12 14 15 19 11
11 16 16 16 23 23 28 30 32 30 30 30 28 21 22 16 16 12 12 10 10 12 19 12 15 19 17 13 11 11 9 8 8 8 8 10 12 16 16 23 23 28 28 25 20 20 15 9 9 10
26 24 28 22 19 20 18 21 18 21 22 23 13 15 16 21 24 24 24 22 17 23 11 11 11 12 12 12 12 11 18 12 8 8 8 8 14 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17 8
6 6 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 14 10 10 10 28 32 41 39 28 23 18 14 12 15 11 11 12 25 19 21 9 6 6 7 7 6 6 8 8 10 18 11 12 11 12 25 21 10 10 10
23 17 19 13 29 27 9 9 9 9 12 16 15 14 20 11 11 11 19 24 24 22 16 18 21 30 33 36 36 36 38 38 59 39 39 39 39 43 34 31 24 22 29 29 43 43 42 43 48 48
54 57 54 59 59 59 54 57 54 46 46 43 37 37 39 43 39 37 42 28 28 40 40 47 47 47 48 57 57 57 59 57 57 57 68 57 57 59 59 54 54 48 57 48 50 42 48 42 47 48
50 57 44 43 42 50 50 43 36 50 43 57 43 52 52 50 43 50 37 37 50 50 50 50 57 50 50 50 50 50 50 54 54 57 57 57 57 52 52 52 52 59 57 68 57 57 57 57 57 57
57 52 52 52 52 57 50 50 52 50 43 43 43 52 52 52 50 54 57 57 68 57 59 54 54 54 59 50 57 43 40 44 44 37 43 48 57 57 57 57 46 29 28 24 14 14 24 32 35 44
44 59 59 57 59 57 57 57 48 48 48 59 44 47 47 47 54 57 59 57 57 57 46 46 43 43 43 43 43 48 57 43 43 43 36 36 43 42 43 43 43 43 48 39 37 39 30 30 30 30
43 43 48 59 59 59 59 30 15 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 34 34 59 47 50 50 48 48 48 39 39 39 42 39 39 39 39 47 47 47 43 46 46 48 48 48 57 48 48
43 48 48 43 43 47 42 32 30 30 36 44 47 43 48 43 46 43 48 57 48 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 59 54 54 54 57 57 43 43 47 46 57 47 43 44 59 59 47 57 59
59 59 59 41 41 20 20 32 38 43 43 47 57 57 57 43 43 52 52 52 52 59 59 59 59 54 57 57 52 57 57 59 52 50 48 48 57 57 57 57 47 47 57 50 50 54 50 44 37 32
32 42 44 57 57 57 44 42 31 27 18 32 32 43 42 44 42 48 42 42 42 42 39 35 35 39 43 57 39 39 40 43 43 47 47 48 48 41 33 33 22 29 29 36 35 35 39 37 39 32
24 24 28 15 18 25 27 18 18 14 23 23 39 37 37 33 36 28 28 16 19 15 16 16 16 19 28 30 22 22 27 22 23 25 22 14 14 22 26 37 43 37 39 30 30 30 43 36 37 28
29 33 39 40 28 23 20 24 24 30 27 21 14 14 22 23 12 13 16 20 26 28 14 11 8 8 8 8 11 21 23 28 28 19 12 12 12 13 10 12 12 15 15 17 16 16 24 21 34 26
30 15 18 15 15 14 10 10 11 10 9 9 10 10 10 15 16 12 13 6 6 6 6 8 9 9 11 17 8 9 8 11 8 8 10 11 11 10 12 8 8 10 8 8 8 10 9 11 11 9
9 9 9 9 9 14 12 12 11 8 8 8 8 8 8 13 12 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 19 12 12 9 9 11 9 10 8 6 8 6 6
10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 10 11 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 8 8 8 10 8
8 7 7 |