BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-470L03.T7 (MSMg01no470_l03.b1) | MSMg01-470L03.TJ (MSMg01no470_l03.g1) |
ACC | AG553638 | AG553639 |
length | 1,320 | 756 |
length of high quality (start - end) | --- | 568 (79 - 646) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no470_l03.b1 PHD_FILE: MSMg01no470_l03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:47:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no470_l03.g1 PHD_FILE: MSMg01no470_l03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:47:41 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCGGATGGGGACCGTGCGCCGGCCGCTCCAATAATAATATGTGGGCGGG
GCGTCGCGCAAAGAACGCTCCCCCCTATATGTTTGTGGTTTGCAGAAGAA
AAGAGGGGGCGGGAGCGCCNCCTCCCGCGCCCGCCTTGTTTTTGCTCGCC
CGCCCCAACCAAACCATACGCCGCCCAACAGACGACCGNTGCCCCCTCAC
AACAGGAAGCGGCGGGGCTCTTTCCCCTCCACTCACAAACCACACAAAGA
GCGGACNNCCCNAGGTGNTCGCCAAATAACACCTATTCTTACACACGACA
TCAGTGCGTCGTTCGCTTACATCGCACCGCCAGCATCTATATACTTTCAC
ATATACCCTGTCTGCCCCCGCACCGCGAGTGTAGCGACAAGCGCATACGT
CACACCGTGCCCGTCCCCATGAATAGCGATACATAACACGTACTCGGATG
CCCCTATACACAAGAACACCCCTCTATGTCTCCCTCCTGTTCAAATTACT
TCTCCGCCCGCCTCATCTCCGCCCCGCCCGCGGGACGGCGCAGAACACGC
CACTGCCGCGCCTTTTATCTGCATTAACGCAATCCCTGTATCAGTTATAC
TACAACACCNTTNTCACTACACTGCTCTTTCTACGCGGTATGGAAATAAA
CATCCGCCTGCCACCGCTCTTATACACGCCGCAATCAGTTCCCGCGTGGA
CGTATCGCCCACGCGCTACACACGAGACGCGTCAGACTGCACCNACTCTG
CCCGTCCGCCGCACATGACGCCCGCCCACTGATACATCGCGACTCCGTTC
ACTCTGTACTAATCTTGTACCATCTCGCCCCCGCTACACGACGCATTACC
TGCTCCGCGCTTAGGAATGTCTCTCTATATCGCGCGTACTATCCACAGCG
GCTCACACCCGTTAGCGACCGACTCTAATAATCGATTTGTANTAGCAATA
AGGAACGACGGACACCGACGGGGCGGATGTAGATACTCCACGGNACTTCC
ATATAATACGCCCACTGTCCGCAACGCGCGCTCCCCTCGACGCGGCGCCG
CCGCCCGCACACTCACGATGATAGCTTCATGTGTATTCCTGTACGTGCGC
CCGTCTGATAGTACACGTTTACTGTCTAACGACACGTCCTCCCNCTCCTA
TGTCTACTCGTACCCTCCCTATTCTCCGCTCACTCTATGGCACGTTTACT
CTCTCCGCGTGCCTCCTNCGTGATAGAACACGCCATCATACGCTTCCTGA
CAGCGCCTACGCGAGATCGAACATCACGTCTCGTACGCTGTTCGACAAGG
CANTACCGCACACGTCAGCN
| NCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTAATTTTATTTCAAATTATTA
ATTTCGTAAGAGATGTTAAACAATTAAGTCATACTTTGTTGATAACTTTG
CTCAAAATATAATCAGAAGTCAATCTAAATAATTGGCAGTGTCTACAATG
TATACATTATATATCAAGAGGTATTCACTAAAGCAGCTTATTCTACATCA
CTATCTCCAGCTATATATTATACATATTATACAACTGAGCTACTGAACTA
GAGCTAGTTCGAACTGGGACATAACGTATGGTGTTTAAAATGTTCCAAAT
CACTGTCTCATTTCTAATATATAAAATCCAATAATAATAGCAAAATCCAC
CAACCTCTTTCTAAATCGATGCTTATATATTTATATAGACATACTTGGCT
GATTATCCGTAAATATAAGAAATAACTGTAGTAAGGCATATAATTAATAC
CACTCCAAAGAAAATGCATCCATAGTATTAATGTGCAGCTGCTGGAAAGA
GGTGCACGGTTGCTAGAGAGCACAGGTGGAAGACCATTTTCACTATAGAA
ACTATTATTAACAGATTTGATCATTTTGCAATTTAAAAAAAGCTCTCAAA
AGATAAGTGAAATTTTGCTCTCATTCCTGCCACTGACCTTTATTTGTACA
ATTCTCCTTCTAAATAAGAATGTACATCCGTGCTACAATAGCTTTTAGTT
CACCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 6 8 6 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 10 9 12 9 10 10 10 12 12 7 7 7 7 9 10 8 8 8 8 7 7 9 9 8 6 6 6 6 6 7 6 6 6 11 14
10 10 8 8 8 6 8 8 6 6 6 13 8 8 6 6 8 6 8 8 9 10 7 7 6 6 8 8 10 10 10 10 12 12 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7
6 8 7 7 12 14 17 13 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 7
6 7 7 8 11 9 10 9 14 12 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 8 6 6 11 12 10 10 9 9 10 9 9 13 8 8 8 8 3 0 3 11 11 16 27 20 13 13 8 10 10
10 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 8 8 9 9 8
8 10 10 10 10 3 0 0 3 14 3 0 3 10 8 8 3 0 3 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 13 8 6 6 10 7 8 7 7 7 8 10 11 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 13 8 11 10 15 10 9 9 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 9 9 8 8
8 8 8 8 13 13 12 10 10 8 10 6 9 10 8 10 8 6 7 8 8 9 9 7 8 8 8 6 6 6 6 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 11 12 21 14 14 14 16 8 8 6 6 8 8 10 10 10 16 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 9 8
8 8 10 8 8 10 10 11 12 10 9 9 8 8 8 8 10 12 13 10 14 14 9 13 13 9 9 10 15 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 10 9 9
9 9 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 6 9 10 15 11 9 9 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
12 11 8 8 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 11 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 17 11 6 8 6 6 8 6 7 7 7 7 6 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8
8 11 7 7 10 10 14 8 8 7 8 8 8 6 9 7 6 8 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 13 18 9 9 10 8 7 7 7 7 7 6
8 6 6 8 8 8 12 8 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 7 6 6 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 8 8 10 10
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 7 8 7 9 8 7 7 7 10 12 12 11 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 7 7 7 8 8 8 8 6 7 9 9
10 10 10 10 11 10 10 7 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 9 9 9 7 7 7 7 7 8 8 11 12 10 8 8 8 6 6 8 8 13 10 10 10 13 10 9 9 9 8
8 8 8 10 8 10 10 11 12 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 8 8 8 8 10 8 8
8 10 10 8 8 8 7 7 8 8 10 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 9 9 8 8 3 0 3 8 10 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 9 9 8 8 10 10 8 13 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 7 6 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 10 10 10
13 9 9 6 6 6 6 8 6 8 7 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 8 6 8 9 10 9 9 9 9 9 8 8 10 11 15 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 9 8
6 6 6 6 8 6 8 11 15 12 11 9 8 8 8 8 10 10 13 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 12 7 6 8 8 10 10 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 10 12 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 6 6 7 6 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 6 6 8
6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 6 10 6 10 10 13 7 9 9 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 10 10 10 13 16 9 9 9 6 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6
6 6 10 11 11 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 6 6 6 9 11 11 11 11 12 10 10 10 10 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 13 10 10 9 6 6 6
8 3 0 3 6 6 6 6 6 7 10 8 6 6 6 6 6 6 3 0 | Open.Hide. 0 3 3 6 6 11 10 10 8 8 8 15 19 30 32 37 32 29 31 39 34 39 39 39 41 36 37 37 37 37 37 37 32 25 15 9 9 12 13 12 11 18 23 27 33 27 48 48 50 53
47 47 50 47 47 50 53 53 50 50 50 30 25 13 8 10 10 8 8 9 17 18 19 29 29 30 33 33 48 47 53 53 53 53 53 53 53 53 50 47 43 43 48 48 59 57 57 68 68 68
68 57 57 57 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
57 57 57 48 50 50 50 51 51 51 50 50 50 50 35 50 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 59 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 68 68
68 68 68 57 57 57 50 50 43 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 48 57 57 59 57 57 54 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
54 54 54 42 44 35 35 35 59 59 59 59 59 59 59 47 43 43 43 43 43 40 40 43 59 59 48 59 59 57 57 57 48 39 34 32 25 18 26 21 24 28 32 24 37 43 43 37 39 35
35 35 47 43 47 39 34 33 28 24 24 36 34 34 32 33 24 30 22 32 32 35 37 30 20 24 27 25 24 28 22 23 18 20 20 32 39 39 29 29 20 20 19 32 23 34 28 28 28 22
22 35 37 37 39 39 47 43 41 31 31 28 28 28 34 32 34 43 43 34 34 28 28 28 35 34 37 28 27 29 29 25 25 28 22 25 37 37 43 43 39 34 28 23 21 21 12 12 12 21
12 12 11 11 11 12 12 12 12 14 15 9 10 10 21 30 34 23 23 28 28 28 28 24 16 14 13 16 9 9 12 12 12 15 18 19 10 9 9 9 9 9 12 21 19 21 16 12 13 12
13 16 19 19 15 15 14 14 12 12 12 10 10 8 8 8 7 9 9 11 15 11 12 12 11 12 11 10 8 8 7 7 11 10 12 8 8 8 8 11 9 8 8 12 17 17 8 8 8 8
7 9 10 12 12 12 |