BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-474M14.T7 (MSMg01no474_m14.b1) | MSMg01-474M14.TJ (MSMg01no474_m14.g1) |
ACC | AG556765 | AG556766 |
length | 1,912 | 728 |
length of high quality (start - end) | --- | 500 (73 - 572) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_m14.b1 PHD_FILE: MSMg01no474_m14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_m14.g1 PHD_FILE: MSMg01no474_m14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GGCATGGTGATGAGCTGGTAGACTGGCGAAGGGGGTCGCTATTGTGNGGT
GCGTGCTGGTCTCATTTATCTCTTCCTTCCCTCAGCNGCNCTGCCTCTCT
TCTTGGTGCAACATCCNATTAAATTTGTATGCCTTACGTCTCTACTACAG
CGATGACACAACATATAAATCATCACCATCGTGCCTGTATCAATAGATAC
TGAGGACATAGTACTTCACGCTACCACNAACATTCTGACCATGAGCGTAT
AGCTACTCTACTTGCGTCAGCGCCTTTCTNATCGCATCTCGCGGTCCGGC
GTCCATGCGCGCTGCGTGCTCTGCCTTGTACTGTGTCGTTGCGATGCTAA
CACTAGCACTCTCGTANCGAGCGCATGAGACCCATCACATAGAGTGAATG
AGGGAGACGGGGTNGCAAGAGAGGTATGCATACACGATAGTCGTAGGTGA
GCACGAGTTAGTGACGCCTCGGCGGAACTGATGTCTCGTGCGGATGTAAT
GATCACGACGGACTGTTATCTGTGCGTGACTTAGTTGGTCGCTACGCGAC
GTTGTATGCATGACAGAGGGACGAGCGCATATACTCGGACATCGAAAAGA
TAAGGTACGTGANAGTATGGAGTAGAGATAGTTATGTAGNATGACTAGAC
GATGCACCTATTCACGAGGACCTATGAACGTACTATTATACACTAGAGTA
TAACACAGCAGTGTATGACGTCTGACTAGTCTGCTCCGGCTCTCACGTAT
CGATGCGCTGCGCGCATCTCTCTATCATAGTTAATACTACTCTACATACA
TAGTATACAAGCNCGTATCTTATAGATGCTACCATAATATCATTGAGTCA
CACCTACTCATTAATATATCTACACTATCTCNTCTTCACACCCTACGCTA
CAGCCATATGTGCGCACTCACACATGACGACGCACTCTACTAGTGCACGA
GTAGTGAGCAACTATCGCTACGTCTCGATCANTAATATCGTTAGCGATAC
CACGCGCGACAACCTACTATCCTATGCTACCACATATACAGCGCGAGTAC
GTCGCACTACTAATACGTCTAGTGATATATGTGCTGACACTGTNTCACGT
AGCGCGATGATTTGTGCGATGTCGCTGAGGACTGCGACCAGAGCTATTCG
TCGAGTNGCCTACTAGGTANTGCATTGCGNTNCTACTNGATCGATCGCNG
TCTTAGTGACGCTGGCTACTAGCGCTATGCGACGTTCGATCTCTGGCTAT
GAGCGGCTGTGTAGCACGTCGTACGTAGATATAAGAGAGTTACGCTAGTA
AGCAAGCGCGTCTACGCAGCGCGACGACGCGCGCGTANTATNATGCTACG
TGCGCGTGCTGTGCCGCTCAGTAGCAGTAGCGTATACCGCACATATAGTA
CGNTNGTCNATGATCGTTTACTGCTCTCGTGATATTATTCAGAGTCGCGN
GCTGATGAGTGATCGCTGAGACAGACAGGCGCGCGGTGAGNCGNATTCGG
CACTCTAGCGAGTAGCGTAATTATTGATACTAACGTCGCTGTGTAGCAGT
CGTGACGTGNGCGTGTCACNCGAGTGTTGATANGTAGCGCGAGAGACGGC
TCACGNGGAAGTGACGCGATACTANATCGCCATCGCCTATGATAGCATAC
GTANGCTAGCACAGTCATCTTTGCTATCTGATGCTAANTCNGNTCGCGAG
TTATATAAACAAGTGATGACCANTNCTGACAATATCACANCGCCGTAGTG
ACTATATCGCTNTAGCCCGTAGNATGACTAGTAGTCGTATAGAACTCACA
GCNTGTGTCATGCTCCTATGTACGACTGCGCGTCGACGTCGTGATCATCA
TAGTGTCGCCGTGTANCTATATCGTCNTACTGCTGATGCGACATGTACGC
TCNCNATGANTN
| NCGATGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTTTCGCGGACTTCAACTATCAGATGGACAGAAACAGGCAT
GGGAGATAGAAGACCAATCCTTTATCCTCTGAAGGCACCCCAGAATATAA
GGGGGGTCACAGACTACTCTAAGCCAGTAACCCATTTACAAAAGAAATGA
GGGTGAAAAAAAAATAATAAAACTGTAAACTTCAGACTTTGGGTATCGAA
TATGTTACAAGCAGTGAAAGCAGGAAAATTAAATTATGATAGGAGAATAA
ACACAATGCTTTGTCTCGTACTAATCAAATGGACACCGTTAAGTCTGGAC
ATCTTATGAAGGCCACACATTCAGCCTTAGGCATCAATTATGGTTGCTTC
ACTGATGGAGTCCAGAGGAAGCCATTCAGCCTGCTTCGTCGTGGGGGACA
GAGAGCATCTACAAGTTCACAGAATAATTAATAATATCCATGTTATTGTC
CAGCAGAGTTAACACTGAGTTTCCTTAAATGAACTGGCCAAGTCTGACAC
TCTGGTCTGTTTCTTCACCCGCCATCTNAAATGCATTATACACTCTGAGA
AATGTCCCTCTCATATCCTTTCCAAGAGCCAAGTTCCAACCTGGGTTTAT
TATTCACCCGGCCTGGGTTTCAGCACTTGGTTAAGCGTCCCGGATTCTTT
TTTATTTTTTCCCCATTTATATTTTTGG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 9 7 7 8 6 6 6 6 8 6 8 8 6 8 6 6 8 3 0 3 8 10
8 8 8 6 6 6 6 6 8 7 6 8 6 8 6 7 6 6 6 10 13 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 3 6 8 8 10 17 8 8 6 6
8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 6 6 7 6 8 3 0 3 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 7 9 9 9 11 11 11 10 10 8 8 8 6 6
6 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 15 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10
8 8 8 8 8 10 10 8 10 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 10 10 10 8 8
8 8 11 8 12 7 6 8 8 8 6 7 7 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 8 3 0 3 9 11 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8
12 9 8 8 8 8 10 10 14 14 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 15 12 3 0 3 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8
6 6 6 7 6 9 7 10 10 10 8 8 3 0 3 8 8 7 7 9 9 9 10 14 10 9 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 6 8
6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 10 10 10 10 13 10 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6
8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 10 13 10 10 9 12 12 13 11 10 10 6 6 6 6 8 8 8 13 8 6 6 6 10 10 11 13 12 9 10 9 9 9 8
8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 11 8 6 6 6 10 6 6 6 6 10 7 7 6 6 6 6 6 7 7 8 8 8 8
6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 3 0 3 7 7 7 8 8 6 6 6 6 6 6 9 11 9 10 12 10 8 8 10 10 11 11 10 3 0 3 6 8 6 9 7 8 8 7 8
7 7 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 8 6 8 8 6 8 6 6 6 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 13 10 9 9 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 10 10 6 6 6 6 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 8 12 7 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 9 10 14 18 16 12 9 9
9 9 9 9 10 10 9 10 11 12 8 8 6 6 6 6 8 8 9 10 10 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 7 6 6 6 6 8 10 10 11 6 6 6 6 6 6
10 17 18 16 10 6 8 6 6 8 6 3 0 3 8 8 10 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 11 11 12 11 9 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12
11 8 6 6 6 6 6 8 8 10 17 15 18 18 24 22 11 8 8 8 8 8 8 13 11 13 10 8 9 9 3 0 3 10 10 6 7 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 7 9 9 10 10 9 9 9 11 12 12 12 11 10 10 10 10 9 6 6 6 6 8 6 8 8 8 7 8 10 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 9 9 8
8 8 8 7 7 7 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 7 6 6 8 8 10 8 3 0 3 10 10 11 8 6 6 6 7 8 8 9 9 9 9 9 9 8
8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 15 13 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 11 10 10 10 10 10 8 9 8 8 8
7 9 9 9 10 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 8 8 11 11 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 6 6 6 6
6 6 10 11 10 8 8 8 8 8 10 10 7 7 7 8 8 6 6 6 7 6 8 8 10 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 13 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 8 8 13 10 3 0 3 0 3 13 8 8 3 0 3 6 6 6 9 8 11 8 8 3 0 3
7 7 8 8 11 13 12 10 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 9 10 10 10 10 10 9 10 10 11 13 14 9 9 9 9 10 9 8 6 8 6
6 8 8 8 8 8 9 11 11 11 13 11 11 11 11 11 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 13 8 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 10 8 8 6 8 6 6 6
6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 7 7 10 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 18 19 23 18 6 7 6 3 0 3 12 3 0 3 6 8 8 10 6 6 6
6 7 7 8 8 11 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 7 7 8 9 9 9 9 9 6 7 7 8 8 8
10 3 0 3 0 3 6 3 0 3 8 10 11 18 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 7 6 10 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 8 10 3 0
3 10 10 10 13 8 8 8 8 12 7 10 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 7 6 9 7 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6
6 8 8 10 7 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 7 7 6 6 6 8 8 8 8 7 6 10 6 8 8 8 8 8 8 12 10 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 9 9 3 0 3 6 6 6 6 8 6 6 3 0 3 9 9 7 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6
6 6 6 7 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 14 12 8 8 8 8 10 9 10 3 0 3 8 8 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 9 12 12 13 13 12 10 10 10 6 6 3 0 3 3 0 3 0 3 8 8 10 10 10 8
8 8 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 8 6 8 6 6 6 6 3 0 3 0 3 8 10 9 8 8 8 8 8 8 7 7 7 3 0 3 10 10 10 10 13 11 9 6 8
8 8 8 6 10 14 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 7 7 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6
6 3 0 3 9 11 6 8 6 7 7 7 7 7 8 8 6 8 6 6 6 6 9 8 8 7 9 7 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 6 8 6 6 6
6 6 6 9 10 10 10 6 6 6 6 8 8 7 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 6 8 8 8 8 8 7 7 7 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6
6 3 0 3 0 3 9 9 3 0 3 0 | Open.Hide. 0 3 8 10 13 11 10 10 9 15 9 9 9 19 28 41 39 32 37 37 32 29 31 37 31 32 26 26 16 27 9 9 7 6 6 6 6 6 6 9 10 15 13 22 15 19 28 27 12 11
11 27 26 50 42 35 25 18 9 9 8 9 9 8 8 10 8 9 9 9 9 18 17 21 22 31 36 31 31 31 36 36 36 53 53 53 53 53 53 57 57 43 42 36 42 42 42 48 50 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 30 30 25 28 29 44 36 43 48 48 48 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 53 53 47 47 47 42 42 42 53 53
59 59 59 59 48 48 48 46 46 40 39 28 22 10 9 9 14 22 59 47 47 59 59 48 48 48 59 57 57 57 48 57 50 57 57 57 53 53 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 32 32 26 24 17
17 17 29 32 44 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57
59 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 28 30 10 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 18 27 30 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 68 59 59 59 59 57 57 54 48 48 48 48 48 48 48 59 59 57 48 48 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 59 59 59 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 54 54 54 59 57 44 44 37 37 43 46 46 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 53 53 50 50 50 50 57 57 57 57 59 48 48 48
48 41 41 41 59 59 44 41 37 37 41 41 41 41 42 47 59 59 43 37 37 41 41 39 41 41 41 41 41 59 41 37 37 44 39 36 29 31 24 32 32 39 59 47 41 41 39 36 36 39
43 39 34 25 30 32 21 17 8 8 8 10 15 24 24 30 30 26 21 18 11 11 11 17 17 10 3 0 3 6 8 19 12 17 17 29 30 32 32 34 25 25 19 25 15 15 15 11 11 13
24 23 27 19 22 17 27 23 30 24 30 18 18 17 25 25 26 24 26 32 25 22 20 32 31 22 21 20 18 19 20 28 20 18 13 23 12 9 9 14 9 9 8 10 10 8 14 8 9 9
10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 31 26 25 18 14 11 10 10 10 13 10 9 9 9 9 9 11 11 21 12 10 8 8 8 10 13 18 11 9 9 9 13 13 16 16 18
30 25 27 30 35 37 37 15 10 10 9 9 10 10 11 12 10 10 10 9 9 9 15 15 11 11 11 11 |