BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-546F21.T7 (MSMg01no546_f21.b1) | MSMg01-546F21.TJ (MSMg01no546_f21.g1) |
ACC | AG611209 | AG611210 |
length | 761 | 739 |
length of high quality (start - end) | 664 (30 - 693) | 675 (65 - 739) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no546_f21.b1 PHD_FILE: MSMg01no546_f21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:27:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no546_f21.g1 PHD_FILE: MSMg01no546_f21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:27:38 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GCCGCTATACGACTCCTATAGTTCGAGGATCCGCGGAATTCACTCATTAG
TCTGAGATGGCCTGGAGCTAACAGTGTTCTCTCTACCTCAGCCTCCTGCA
TGCTGGGTCACAGCAATACCTCTCCATGCTGTGCTGAGGTTTATTGAGTT
AACTGTTTGGGAGACAATGTGGGATAAGCCTTTAGAATCTAAGGGGTATA
CCTACTTTTGGTCCAATTGCTGACCTTTCAGAGATCTGACCTATGGAAAT
TAACAATACAAAACCTTATCTTTAAATATTTAATTCCCCTTTAAGCACTT
AACACAAAAAAGAAACTAGATAAGTATCCAGACATGTCTTGGAACATTCT
CATTAAAATATTATTTGTGAACACATTAAATAGAAGCTTGAAGTAATTTA
AGTAGTCTTCAAACTCCTTTAAATGAATTATGATTTAATCATAAATGAGA
TACAATGCAGACATCAGAATTTTGAGACAGACTTGGGATGAAGCTCAGGA
TGGAGCACTCGTCTTTCATCTGAAAGACCCTGTGTTTGCTGCCCAGAATC
ATCAAATACAAAGCTGAATACAGGTTAATATAGTTAAATGTAGTAGAACT
AAAGCCATAGTCTCTTGATACACAAAGAGAATTTAAATAATATGCACAAT
CCCCTACTTTTAAGTTAAATCAGAAAAAAGAAAAGGCTGATACACATAGA
TGGTTATGTCCAGTNAAATATCCAAAAACACAGAGAAAGTTATTCATATT
GATTATCTCTG
| GGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXAATGAAAATGAAGGCACAACATACCCAAATCAATGG
TACACAATGAAAGCAGTGATAAGAGGAAAATTTAGAATGCTAAGTGCTTT
CATAAAGAAATTAGAAATACCAGCAACTTAAAATTTTCAGTACACCTGAA
AGCTCTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAATCAAGCACACCAAAGAGGA
GTAAAAGACAGGAAATAACCAAAATCTGGGCTACTTTGTTAAATATCAAG
TGATAATATGTGTGTGTGTGTTAATTTTTGGGTCTTCAATTCTATTCCAT
TGATCTTCCTGCCTGTCTCTGTACCAATAACATACAGTTTTTATCACTAT
TGCTCTGTAATACAGCTTGAAGTCAGCTATGGTGATTCCACCAGAAATTC
TTTTATTGTTGAGAATAGTTTTTGCTATTCTGTTTTTTTGTTTTTGTTTT
TCCAAATGAATTTGCAAATTGCTCTTTATAACTCTACGAAGAATTAATTT
GGAATTTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTTGGCAAGAT
AGCCATTTTTGCTATACTAATCCTGCCAATCCATCAGCATGGGAGACCTT
TCCATCTGAGATCTTCGATTTCTTTCTTCAGAAACTTGAAGTTCTTGTCA
TACAGATCTTTCACTTGCTTGGTTAGAGTCACACCAAGA
|
quality values | Open.Hide.15 15 15 19 13 10 10 15 15 29 30 27 21 12 12 12 24 21 25 11 10 8 8 8 8 8 19 22 17 17 17 25 36 59 59 22 19 18 28 29 29 33 33 33 37 41 37 37 28 28
19 32 32 39 33 34 43 47 50 53 53 53 53 57 57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57
57 57 54 54 54 57 57 47 43 47 57 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 48 48 48 41 59 59 59 59 43 37 26 29 34
34 41 41 47 41 40 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 59 30 30 23 18 18 30 34 41 41 46 47 47 48 48 48 48 48 43 37 33 28 28 43 43 59 40
39 39 35 35 35 39 39 39 35 39 39 59 47 47 41 37 31 31 32 37 36 32 28 28 35 36 39 39 41 47 47 41 35 31 31 31 31 34 34 21 21 14 30 30 48 34 34 34 34 36
36 36 40 37 31 28 32 32 32 32 34 34 34 37 37 34 37 37 31 32 23 23 23 28 28 35 34 41 39 37 37 36 36 35 36 36 41 39 47 47 39 39 37 39 35 35 31 28 28 43
59 59 59 47 47 43 41 37 34 40 35 28 25 39 32 32 32 32 36 31 24 10 9 9 9 9 9 21 31 30 25 30 30 22 22 22 25 25 34 28 24 24 18 18 18 19 19 23 23 25
23 18 14 14 14 23 23 32 22 19 12 11 8 3 0 3 8 8 24 28 21 16 9 9 9 11 17 14 12 12 11 11 11 21 24 24 30 20 18 18 18 18 12 21 11 11 11 17 20 25
22 23 18 18 21 22 20 20 20 23 19 | Open.Hide.11 11 11 11 17 25 34 41 44 39 37 37 37 37 32 32 44 44 37 37 23 23 9 9 12 11 10 10 10 10 21 21 39 38 34 34 39 30 30 30 33 33 33 50 47 47 39 39 39 26
20 23 19 27 28 30 34 34 26 29 28 28 32 32 34 36 36 47 53 42 42 36 37 37 42 57 57 57 53 53 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 68 68
51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 57 57 68 68 68 68 48 50 41 41 30 42 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 59 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 57 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 54 54 57 57 68 68 68
68 68 68 59 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 52 50 52 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 68 57 57 48 48 48 59 59 59 47 47 47 59 59
57 57 47 47 47 47 47 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 59 59 57 57 54 54 57 54 54 54 48 48 43 37 37 30 28 28 37 37 39 48 48 57 57 59
59 57 57 48 48 48 57 43 43 33 33 30 39 37 43 39 39 39 36 39 39 47 59 48 47 47 42 39 39 36 35 31 36 39 39 39 36 36 36 40 43 39 36 32 35 31 24 28 23 23
23 34 34 41 43 43 43 44 43 43 36 36 36 43 39 48 48 48 42 42 40 39 34 34 25 22 20 30 30 41 59 41 41 39 47 35 36 37 37 34 31 30 30 17 17 14 16 16 34 36
43 36 31 35 36 39 25 22 12 12 12 22 26 32 32 31 31 20 24 24 39 37 37 37 41 41 31 28 31 20 18 18 28 28 41 36 35 39 36 32 34 29 25 33 26 32 23 23 23 25
25 24 23 20 28 23 34 33 31 34 34 28 28 28 31 31 35 35 31 20 20 18 13 13 15 18 25 32 32 23 28 23 30 24 24 24 22 28 22 |