| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | B6Ng01-015C05.b | B6Ng01-015C05.g |
|---|
| ACC | DH849480 | DH849481 |
|---|
| length | 1,051 | 1,128 |
|---|
| definition | DH849480|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015C05, 5' end. | DH849481|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015C05, 3' end. |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (88,759,986 - 88,761,042) | (88,895,155 - 88,896,301) |
|---|
| sequence | gaattcattgctgtctgtatgttggcgtgctcttgcaggcctgggttact
tgtgtactttccttataatcctttcaagtcatccaagagttgtcatgtga
ctaagacaatgcccaagtgacaatttcaggtgtcagcttggtttttgttt
gtttgtttttttgttttgttttgttttgttttgggccctggctgtcttcc
agcaatttccagtatcaatatcgtcccttcaagaccgactttgtcgaagc
cctcttcggaaatatctgtggctgacatccatggaaaggagagagaataa
aatagcgtggggggtgtgagggccaaatttacattttaagtttgaattat
tgtgtctaagagacccataaaacaaaaggcctctaacctgtaaccccctt
gcccaaaagagcgacacttctgagatgctggaggctaccctttaagggag
ataacaagccatgtgtttctcctctaaacaaactccctgaccaactatac
tgaatgtgtttgctcacattaagcagatggtacctgggcaggaaacacat
caggatgtttctgggcgccaattggatgtaggtgggaggtacaaaggctg
gaaattcatcaggcaatatgcttgcctctgattggacttgataggaaata
tgggtttgcctttttaagcctctgcaaaatgtggccattttctggaaacc
caggaacagacctggccagagtccatcatcctggccagtatttattaaag
cttgcttcaaatctgactcagaattgtggcaattctcttactctctccca
gccagatgaacaggcgaagatagaaacttgccttccaaaagcttctaacc
tatcaaaaaagggacatttatgaacaataacagcagcttgataaaaaaaa
gttcacagtaaagggtaggtgacatggctcagcagtgagacttctgctca
gtcccagggaactgctcgctggggcttgattgtcccttgaataccattgt
tgcagtattagaaggtggacttaaaaaatttatgaactgtgtgttgaagt
g
| gaattccctcaacagaaaagatgtggatatgcatctgagtaagaattttc
atcagttcagtgcatagaccactgattggtacctcattactggtaacgat
agcaggcaaagaggcctttccaatctctaaacacaacgtttagtttagaa
aattccaaataaaggagaataatgttctttcagttattaagataacacca
ttttaaaaatagccacaaataagccaagtttgtgacaaactattttggtt
gtgaatattaataaatcccctggatttcccaaggttttgttataagaaat
gaatattttaattatattaaacaaaagtctctggggaagatggaaatcca
tagagaactctgaggcctgtggctcagaaacagaaaatcaaatgatgtct
ttctttttacttcccctatccctaggaaagagcccaaaaagggaagagaa
aagcttgttccattggcttgatgaaagcaggcattaacgaacacagggaa
actcgtgtagctgtggttacctacctaggtagtcattcatttagttcttt
acctacccatccatttgccagcctaccaacctacctcccaacctacctac
caacctgcctacctcccaacctacctatcaacctaccaacctacctacct
acctaccaacctgcctacctacctacttatcaacctcccaacctgcctac
cttcctaccaacctacctaactaccaaccaacctaccaacctatgtaaat
ctttttgaggtttttattttccagaatctatgtggctcacttgagtcaat
catagggtctgtgtatttctggcctggttatgagtttcagtgttcaacta
cattaagacaaatttaatgaccctagatgaaacagtgggcaaagtaaaga
agcaatcgctgaactccatgttgactgtcacccgcatcaattcctgcacc
ggctgttacagagaaacttgcctacacttttaatgaactgggggactaat
tcaggctgagttcctagctgcgaaacaggtgtgtgagaagacatccgtgg
agggcccgaaacgttctcatgaagttttttatggttgtgtgttttttttt
ttgagaggagcctactatacagccaggt
|
|---|
| quality values | Open.Hide.61 41 16 30 53 27 17 61 61 61 61 61 47 61 61 61 47 61 49 47 47 61 61 55 47 12 12 10 15 15 16 19 21 18 41 41 36 43 55 59 61 61 61 59 61 61 61 59 59 59
61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 59 59 59 49 49 35 49 52 40 30 35 49 59 59 59 61 59 61 59 59 59 59 59 61 61 61 59 61 59 61 61 59 61 59
59 59 59 59 41 59 61 59 61 61 61 59 61 61 59 61 59 61 61 59 61 59 59 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59
61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 59 55 59 61 61 61 61 61 61 59 61 59 59 61 61 59 61 59 59 61 61
59 52 61 59 59 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 59 59 59 59 61 61 61 59 61 61 61 61 59 59 59 52 59 59 61 59 61 59 61 61 61 59 61 59 59 59 52 61 61 52 61
61 61 59 59 59 61 61 52 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 59 61 61 61 59 52 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 44 55 61 59 59 61 61 59 61
61 59 52 59 31 52 49 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 59 59 59 59 59 59 61 59 59 59 59 61 61 61 59 59 59 59 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61
59 61 61 61 61 61 61 61 61 52 61 59 61 61 61 61 55 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 55 55 55 55 55 55 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 55 55 52 61 52 52 49 55 52 49 55 55 55 61 61 61 61 47 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 50 61 61 61 61 55 55 55 55 50 61 55 61 55
61 43 55 61 55 47 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 55 55 50 50 50 61 61 61 61 53 61 61 61 52 61 53 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 53 61 61 47 61 52 61 53 45 61 50 53 47 39 52 53 61 53 61 50 61 53 50 47 61 61 53 53 53 50 53 50 61
53 53 33 47 47 37 61 61 61 61 61 61 53 61 47 53 45 53 61 45 61 61 61 61 53 42 27 47 33 53 47 47 39 53 47 46 57 34 53 32 30 47 34 53 57 28 47 27 53 53
47 47 47 34 28 57 57 40 39 57 53 27 47 32 47 53 38 45 40 47 53 45 50 50 45 53 50 57 50 45 47 28 53 57 31 45 36 23 24 57 36 24 42 31 28 38 57 41 33 38
30 52 57 47 42 57 25 37 47 47 45 57 57 57 52 27 52 28 52 57 45 53 42 50 50 38 47 47 30 45 32 17 30 53 34 37 27 33 57 57 42 42 50 36 25 27 46 16 14 33
43 31 37 45 52 43 45 36 30 50 28 38 38 40 46 23 37 30 19 50 15 39 38 24 15 32 33 16 42 23 53 32 41 21 10 46 24 36 25 40 27 57 18 41 18 50 20 57 50 24
25 30 10 32 33 32 26 37 24 57 34 36 33 13 31 48 24 31 36 16 8 57 47 32 31 38 25 53 53 21 36 23 15 33 38 29 33 29 22 24 29 35 32 25 28 37 31 57 33 28
18 33 40 27 24 37 22 37 40 25 31 13 8 29 37 22 40 25 8 13 17 36 31 53 57 21 37 30 23 27 30 44 25 38 31 30 28 36 34 26 13 37 12 33 23 15 20 31 33 38
33 23 33 33 15 29 30 30 29 30 26 48 31 30 18 14 29 51 29 32 30 23 31 29 30 26 26 24 15 28 30 22 18 29 15 16 6 12 12 18 38 31 30 47 47 46 48 51 51 29
13 29 25 28 15 12 27 22 21 16 21 20 18 45 32 20 27 8 25 18 24 21 14 12 12 19 19 25 28 20 16 12 25 10 22 8 11 43 10 11 14 12 6 24 25 28 17 16 10 7
11 14 16 37 9 7 11 33 14 25 29 27 23 7 12 29 43 13 14 11 13 29 29 22 12 18 21 21 41 9 8 13 14 39 43 29 25 23 19 26 29 7 29 20 14 16 31 16 29 9
14 10 22 8 16 20 14 12 12 18 6 40 35 20 25 5 24 6 21 13 25 29 17 26 9 12 27 29 14 15 17 9 15 14 24 6 9 24 29 10 19 11 7 12 29 14 10 7 5 6
5 | Open.Hide.61 47 52 49 61 28 28 17 13 19 9 11 12 7 12 19 18 27 59 49 59 35 59 59 61 61 59 61 61 59 61 61 59 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
59 43 43 23 23 28 35 52 43 39 59 61 61 59 61 61 61 55 55 61 61 61 59 59 59 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 59 59 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 59 55 44 55 59 61 59 43 55 59 59 59 52 59 59 61 61 61 59 59 61 59 59 59 59 59 59 59 59 59 61 59 59 61 61 61 61 61 61 59 61 59 59 61 59 61
61 59 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 52 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 59 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 59 61 59 55 59 61 43 59 59 52 59 59 59 39 61 61 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 43
59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 59 61 59 61 61 61 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
55 55 52 52 55 52 61 55 55 55 55 52 55 55 61 55 52 55 55 61 55 55 55 61 61 61 61 61 61 52 61 52 52 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 55 55 61 61 61 55 61 61 61 55 61 47 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 47 61 55 61 55 55 61 34 55 61 61 55 61 50 50 50 43 47 50 61 53 61 61
53 61 61 53 61 61 61 61 41 61 52 47 31 61 61 61 61 61 61 61 37 61 61 61 50 39 47 50 53 53 50 50 47 43 50 52 50 52 43 43 50 50 50 50 52 50 50 50 43 61
43 39 61 61 61 46 61 53 61 61 39 42 61 61 45 47 39 31 35 35 38 34 45 42 61 53 53 45 39 39 35 26 42 45 50 53 53 45 53 53 52 50 52 47 42 39 47 47 47 53
45 53 50 50 52 53 32 22 52 53 53 53 57 38 50 45 45 32 42 40 42 45 50 52 42 50 52 39 45 29 43 35 47 57 57 47 45 57 52 27 53 29 47 53 57 50 53 50 38 42
19 20 16 8 19 24 38 37 39 38 43 45 52 50 53 52 45 50 52 53 38 50 32 42 43 27 37 19 47 30 47 23 50 34 45 39 45 37 37 31 53 43 42 42 52 28 47 53 36 34
48 52 57 57 57 46 38 42 12 53 20 57 57 53 30 34 32 57 45 45 30 18 12 19 42 36 39 53 33 37 50 52 42 38 17 15 50 37 37 28 50 30 42 53 27 32 38 30 38 28
42 29 42 30 7 33 50 20 21 8 8 12 33 24 37 27 53 33 34 29 32 57 16 29 29 42 53 11 40 22 23 30 40 16 27 57 28 37 34 31 35 52 15 33 40 29 33 17 15 26
37 12 25 20 31 29 37 32 18 28 57 19 27 57 37 48 29 21 30 28 20 53 19 15 10 8 13 19 35 31 53 31 30 25 27 28 43 44 30 18 14 47 25 18 27 17 45 29 21 41
44 9 13 29 31 27 29 30 30 28 13 29 28 11 9 20 18 13 20 22 6 29 22 18 17 15 31 16 29 13 26 45 33 18 26 31 28 29 9 21 11 7 7 7 14 25 31 17 26 36
24 14 7 15 11 5 10 8 10 7 7 12 14 27 41 9 16 13 29 34 21 35 10 13 30 11 28 9 51 41 36 15 25 13 31 25 13 10 7 7 29 46 46 10 11 21 21 10 8 9
7 7 8 15 23 7 9 10 7 7 29 29 17 21 5 19 15 29 25 15 13 6 27 29 28 11 7 6 7 5 7 5 15 8 5 17 19 31 10 5 9 10 17 6 24 15 6 5 27 9
28 14 27 5 6 7 5 8 8 10 5 5 7 5 5 6 12 26 17 23 13 12 12 14 17 10 32 28 38 38 6 17 5 5 10 5 5 7 4 6 10 28 7 6 24 32 32 35 24 42
17 16 5 11 5 15 12 21 7 9 15 13 8 4 4 4 5 20 6 5 8 4 6 15 8 13 18 11 |
|---|
