BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067J22
Chromosome17 (Build37)
Map Location 44,660,133 - 44,761,858
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRunx2
Upstream geneLOC100043332, Pla2g7, Tdrd6, Slc25a27, Cyp39a1, Dscr1l1, Enpp5, Enpp4, Clic5
Downstream geneSupt3h, 4930564C03Rik, EG210562, EG668314, Cdc5l, Spats1, EG668319, Aars2, Tcte1, Gm323, Nfkbie, Slc35b2, Hsp90ab1, Slc29a1, EG653016
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067J22.bB6Ng01-067J22.g
ACCDH886448DH886449
length1,076965
definitionDH886448|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067J22, 5' end.DH886449|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067J22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,660,133 - 44,661,228)(44,760,891 - 44,761,858)
sequence
gaattcaacctccctggcaatggtcccaaaatctatttactcctctcggt
ggctctcagccccacccgaatgtctgtcttcttgcctgcttccaagtatc
tctacctgtaggctcggctctctcctatgttgactgacagggcctctctg
gctacttgaaatatttgtcttcccctgtctctttgtcatcttaccataac
caagccaaaatcctaagggaagggtgcacagagagatgctatctaccagc
atacgccagtcacaatctgttgcccttgagacctacttcaaagatacgga
accaagaaagagagaagcattcaggcagaaaagaataaaccagcagtgtt
ttcagagggacagcacggaccaatcatttcttgtcatttaaaagaggaaa
agaaagggctcaggagatggcctaacccttaaagcaagcctgaggacctg
ggtttgaacctctaaaaacacccataaaacaccaggcatggtggtgtaca
cttgtactcccagagctgggaaggcagacacaggcagagtccctagagcc
agcaagctccaggccaatgagagactttgtttagaaacacaagatggacg
atttgatgcctgtggaacaacacccaagattgacttctggtccttgtaga
acttgatcttggattccagtatccagaaatctggatatgtgtgcatatac
caccaccacaccaccaccacaaccatcaccaccatcaccaccaccaccac
caccaccatcacacatccaaatgaagtatttatcacaatgacaaaggtgg
ccaacatctttgacatcctgtccacctattcagaaatgggtgtgaaggga
aatagattggaaaggtgtgtcaagtctgctggctttgtcctgagagaaag
cagatgactaaataatttcttttggctcacactagctgaagagaaaggag
aactggaaatgatggctgcaagagaaaattttgcagcaccatagactgtc
tgttttgttttttggttttttatttttatttttccccctttgaatgagct
gtttacagttgacagcaatattagaa
gaattctcacctttccttgctgaggagtctgcgtggccagggcgcaggga
cttcttcattctgatactttgcttagacaggactaggaccagagcccaca
ttccgtcctgggcattcttcccattactgaacacagccatggtgaccagt
tgaagagagagacctccccacctagagttaacccatccttctttttgctt
cttgccttctcccatcttgacgtgaagttaggtgaaggcataaaatatgc
atatagtctatgaatacatgcgtgtgaatgtgtgcacttgcaggggccca
aagagaacactgagtgtcctgctctgtcactctctgccttgttccattga
ggcagggtctctcactgaacctagagctgtggtaactggcagccaacaaa
tctcaggagtcctctggtctctgctttcccacagcactggaactataggt
ctgtatatggccatagctgtccatttacccagggtttgcatctgagctca
gctcctcacacataggaggcaagcactcttaccctctgagctgtcctggt
agccccaggcatagattttttttttttgccctgtggcttcgcagcatctt
ccctctggaactatctgggtctatagctagtgtgggctctatattctgac
tcagagaaataaaacttgggttttgatcttagcagacagagagtgcccat
tagttgaagagctacactagcatactctgcacttgcctcatgttccacag
ccccttgggaagatagcaaggcacttttttctcctaatgaaaacaagtag
caccttactatacagttaggtgtgtctatttatccttgggaaacagaggg
ttccgtgtctcaagacacacaaggggtcaggggcagccacaaactaatgc
tgcaagtggtccattgctggtgagtttattgctatagcaccagaataact
ctggaggggtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_44660133_44661228
seq2: B6Ng01-067J22.b_49_1124

seq1  GAATTCAACCTCCCTGGCAATGGTCCCAAAATCTATTTACTCCTCTCGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCTCCCTGGCAATGGTCCCAAAATCTATTTACTCCTCTCGGT  50

seq1  GGCTCTCAGCCCCACCCGAATGTCTGTCTTCTTGCCTGCTTCCAAGTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTCAGCCCCACCCGAATGTCTGTCTTCTTGCCTGCTTCCAAGTATC  100

seq1  TCTACCTGTAGGCTCGGCTCTCTCCTATGTTGACTGACAGGGCCTCTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCTGTAGGCTCGGCTCTCTCCTATGTTGACTGACAGGGCCTCTCTG  150

seq1  GCTACTTGAAATATTTGTCTTCCCCTGTCTCTTTGTCATCTTACCATAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTGAAATATTTGTCTTCCCCTGTCTCTTTGTCATCTTACCATAAC  200

seq1  CAAGCCAAAATCCTAAGGGAAGGGTGCACAGAGAGATGCTATCTACCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCAAAATCCTAAGGGAAGGGTGCACAGAGAGATGCTATCTACCAGC  250

seq1  ATACGCCAGTCACAATCTGTTGCCCTTGAGACCTACTTCAAAGATACGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGCCAGTCACAATCTGTTGCCCTTGAGACCTACTTCAAAGATACGGA  300

seq1  ACCAAGAAAGAGAGAAGCATTCAGGCAGAAAAGAATAAACCAGCAGTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGAAAGAGAGAAGCATTCAGGCAGAAAAGAATAAACCAGCAGTGTT  350

seq1  TTCAGAGGGACAGCACGGACCAATCATTTCTTGTCATTTAAAAGAGGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGGGACAGCACGGACCAATCATTTCTTGTCATTTAAAAGAGGAAA  400

seq1  AGAAAGGGCTCAGGAGATGGCCTAACCCTTAAAGCAAGCCTGAGGACCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGGCTCAGGAGATGGCCTAACCCTTAAAGCAAGCCTGAGGACCTG  450

seq1  GGTTTGAACCTCTAAAAACACCCATAAAACACCAGGCATGGTGGTGTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGAACCTCTAAAAACACCCATAAAACACCAGGCATGGTGGTGTACA  500

seq1  CTTGTACTCCCAGAGCTGGGAAGGCAGACACAGGCAGAGTCCCTAGAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTACTCCCAGAGCTGGGAAGGCAGACACAGGCAGAGTCCCTAGAGCC  550

seq1  AGCAAGCTCCAGGCCAATGAGAGACTTTGTTTAGAAACACAAGATGGACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCTCCAGGCCAATGAGAGACTTTGTTTAGAAACACAAGATGGACG  600

seq1  ATTTGATGCCTGTGGAACAACACCCAAGATTGACTTCTGGTCCTTGTAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGATGCCTGTGGAACAACACCCAAGATTGACTTCTGGTCCTTGTAGA  650

seq1  ACTTGATCTTGGATTCCAGTATCCAGAAATCTGGATATGTGTGCATATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATCTTGGATTCCAGTATCCAGAAATCTGGATATGTGTGCATATAC  700

seq1  CACCACCACACCACCACCACAACCATCACCACCATCACCACCACCACCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACCACACCACCACCACAACCATCACCACCATCACCACCACCACCAC  750

seq1  CACCACCATCACACATCCAAATGAAGTATTTATCACAATGACAAAGGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACCATCACACATCCAAATGAAGTATTTATCACAATGACAAAGGTGG  800

seq1  CCAACATCTTTGACATCCTGTCCACCTATTCAGAAATGGGTGTGAAGGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACATCTTTGACATCCTGTCCACCTATTCAGAAATGGGTGTGAAGGGA  850

seq1  AATAGATTGGAAAGGTGTGTCAAGTCTGCTGGCTTTGTCCTGAGAGAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGATTGGAAAGGTGTGTCAAGTCTGCTGGCTTTGTCCTGAGAGAAAG  900

seq1  CAGATGACTAAATAAATCTCTTTTGGCTCACACTAGCTGAAGAGAAAGGA  950
      ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGACTAAAT-AATTTCTTTTGGCTCACACTAGCTGAAGAGAAAGGA  949

seq1  GAACTGGAAATGATGGCTGCAAAGAGAAAAATTTTGCAAGCACCAATAGA  1000
      |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||
seq2  GAACTGGAAATGATGGCTGC-AAGAG-AAAATTTTGC-AGCACC-ATAGA  995

seq1  CTGTCTGGTTTTTTGTTTTTTTTGGGTTTTTTTATTTTTTATTTTTCCCC  1050
      |||||||   |||||||||||   ||||||||   |||||||||||||||
seq2  CTGTCTG---TTTTGTTTTTT---GGTTTTTT--ATTTTTATTTTTCCCC  1037

seq1  CCTTTGGAATGAGCTTGTTTACAGTTGACAAGCAAAATATTTAGAA  1096
      |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |   ||||||
seq2  C--TTTGAATGAGC-TGTTTACAGTTGAC-AGCAATA---TTAGAA  1076

seq1: chr17_44760891_44761858
seq2: B6Ng01-067J22.g_68_1032 (reverse)

seq1  CACACACCCCTCCAGAGTTTATTCTTGGTGCTATAGCAATAAACTCACCA  50
      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACCCCTCCAGAG-TTATTC-TGGTGCTATAGCAATAAACTCACCA  48

seq1  GCAATGGACCACTTGCAGCATTAGTTTGTGGCTGCCCCTGACCCCTTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGGACCACTTGCAGCATTAGTTTGTGGCTGCCCCTGACCCCTTGTG  98

seq1  TGTCTTTGAGACACGGAACCCTCTGTTTCCCAAGGATAAATAGACACACC  150
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTC-TTGAGACACGGAACCCTCTGTTTCCCAAGGATAAATAGACACACC  147

seq1  TAACTGTATAGTAAGGTGCTACTTGTTTTCATTAGGAGAAAAAAGTGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGTATAGTAAGGTGCTACTTGTTTTCATTAGGAGAAAAAAGTGCCT  197

seq1  TGCTATCTTCCCAAGGGGCTGTGGAACATGAGGCAAGTGCAGAGTATGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCTTCCCAAGGGGCTGTGGAACATGAGGCAAGTGCAGAGTATGCT  247

seq1  AGTGTAGCTCTTCAACTAATGGGCACTCTCTGTCTGCTAAGATCAAAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAGCTCTTCAACTAATGGGCACTCTCTGTCTGCTAAGATCAAAACC  297

seq1  CAAGTTTTATTTCTCTGAGTCAGAATATAGAGCCCACACTAGCTATAGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTTTATTTCTCTGAGTCAGAATATAGAGCCCACACTAGCTATAGAC  347

seq1  CCAGATAGTTCCAGAGGGAAGATGCTGCGAAGCCACAGGGCAAAAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAGTTCCAGAGGGAAGATGCTGCGAAGCCACAGGGCAAAAAAAAA  397

seq1  AAATCTATGCCTGGGGCTACCAGGACAGCTCAGAGGGTAAGAGTGCTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTATGCCTGGGGCTACCAGGACAGCTCAGAGGGTAAGAGTGCTTGC  447

seq1  CTCCTATGTGTGAGGAGCTGAGCTCAGATGCAAACCCTGGGTAAATGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTATGTGTGAGGAGCTGAGCTCAGATGCAAACCCTGGGTAAATGGAC  497

seq1  AGCTATGGCCATATACAGACCTATAGTTCCAGTGCTGTGGGAAAGCAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGGCCATATACAGACCTATAGTTCCAGTGCTGTGGGAAAGCAGAG  547

seq1  ACCAGAGGACTCCTGAGATTTGTTGGCTGCCAGTTACCACAGCTCTAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGGACTCCTGAGATTTGTTGGCTGCCAGTTACCACAGCTCTAGGT  597

seq1  TCAGTGAGAGACCCTGCCTCAATGGAACAAGGCAGAGAGTGACAGAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGAGAGACCCTGCCTCAATGGAACAAGGCAGAGAGTGACAGAGCAG  647

seq1  GACACTCAGTGTTCTCTTTGGGCCCCTGCAAGTGCACACATTCACACGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTCAGTGTTCTCTTTGGGCCCCTGCAAGTGCACACATTCACACGCA  697

seq1  TGTATTCATAGACTATATGCATATTTTATGCCTTCACCTAACTTCACGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCATAGACTATATGCATATTTTATGCCTTCACCTAACTTCACGTC  747

seq1  AAGATGGGAGAAGGCAAGAAGCAAAAAGAAGGATGGGTTAACTCTAGGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGGGAGAAGGCAAGAAGCAAAAAGAAGGATGGGTTAACTCTAGGTG  797

seq1  GGGAGGTCTCTCTCTTCAACTGGTCACCATGGCTGTGTTCAGTAATGGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGTCTCTCTCTTCAACTGGTCACCATGGCTGTGTTCAGTAATGGGA  847

seq1  AGAATGCCCAGGACGGAATGTGGGCTCTGGTCCTAGTCCTGTCTAAGCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGCCCAGGACGGAATGTGGGCTCTGGTCCTAGTCCTGTCTAAGCAA  897

seq1  AGTATCAGAATGAAGAAGTCCCTGCGCCCTGGCCACGCAGACTCCTCAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCAGAATGAAGAAGTCCCTGCGCCCTGGCCACGCAGACTCCTCAGC  947

seq1  AAGGAAAGGTGAGAATTC  968
      ||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAAGGTGAGAATTC  965