BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-077B04
Chromosome17 (Build37)
Map Location 67,175,849 - 67,324,513
singlet/doubletdoublet
Overlap genePtprm
Upstream genePpp4r1, Ralbp1, LOC100043873, LOC100043592, Twsg1, Ankrd12, 5430411C19Rik, Ndufv2, ORF19, Ddx11, LOC100043599, LOC100043875, 1110012J17Rik, LOC100043876, Rab12, 9130404H23Rik
Downstream geneLrrc30, Lama1, Arhgap28
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-077B04.bB6Ng01-077B04.g
ACCDH893143DH893144
length1,0301,104
definitionDH893143|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077B04, 5' end.DH893144|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077B04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,323,801 - 67,324,513)(67,175,849 - 67,176,980)
sequence
gaattctttctccctttgctgagttggcattagagaaaagttggtatgca
ctataaattgtggggtgttttaagttatgctatttaagggcaatgttttg
agtgttctttttctctttacacgtgttgagaggaatgtttctcctatact
taggcatctacacaaagtcaggtctcccacccaaccttgcctcccatccc
taggtgtctactgagataaactgagccaaacataaatgtgatagagatac
attctaaccagcaataactgcaatggggaattttctatagaggtcactgg
gcatttaaaaaaagaatggaggtgttaagagagaaagcaaggatccagga
gggtcagagaagtggaggctgacaaaagttaagaggccaggctggtccat
gggaagtttgtcctttactaatgctctcatcaacggaccctccccctttt
tcagactgggagatagcaaagccatggtacttgatatgaccatcagcaaa
cactggatggccttcagtttttccaaatagggcactaaaggaggttggga
tcatgtaggaaagatggccgcaagccattaggaaccgagtcagcacttgc
tctagtctttacaggtcaagacagacaccagtctagggcccagtagtgtg
tggtaaatgagggtgtcttcctcatctccctttccaatagaaaaacagtg
gttctcagctgatgttttctgagagatgaatggaaagtgatttattaacc
tctggtactgcaggaaagatacaaatgcataaaagatacaaatgcatgaa
agatacaaatgcatgaaagatacaaatgcaggaaagatacaaatgcagga
aagatacaaatgcaggaaagatacaaatgcaggaaagatacaaatgcttt
tttgtatgcttcacgcatgttggcctacctgaagtagaagtagagattga
tcagctttcccagtcaatcagagtgtgagtatttaactcaagaatggagt
cactgtataaatgcagtaatcactatttct
gaattcaactgacattgttaggatattttacacattaacagttgaatatt
ttcaaactgataggtcttagccacaggtgtagaatgtatctgggaccata
aaaacacaccttttatatatcttttaaaggaaagaaaacgcacaatgaat
attctcagatgaaaggggaattaagctaaaactcaacaaagatggctgaa
aatttccaaacactggaagataaggaacatgtgtttaaggctttatctgt
aacatggcaccactggaaggtagagaaacctctaggaagtggagccttgt
gagagactgtaggtcactggaagctatcctctaaggagactatgagatgg
tatctcctctttcccctcaacccccgcctctcatgaaccatcaggaggat
ggatggctttgctccatgatgctctccccattgtgatgtgctgcctcact
gtaggccccagagcagtgagcccatctggctgctgggctaaaataaacat
ctgagactgagactaactgaaagtgtcccttttctatggtaattttgtag
gtggtttgtcacagtgcaggataactgctcaaagattgtagtactgtcga
ggggggcattagagggaagaaaaaatggtcatagctctgaaagttcagcc
aggaatgaaagtgagagaggagaatgatggtaaggcaggtacttagacgg
aaaatagttgctgtaatctattattgcacatgagggaacaggaaatgaga
aaaaaaatttcctgccatattattattcacatgataggtgtcaatcatcc
acatgacacgtgtcaatcacaaccaatagagaaaacccagcaaagaatga
actgttgggaaaagtcctctggaagagctggggaacaaatggtagcccac
ttagggacatgcagaaggaacagcccctccccacctttttttctgaacca
tgctgggtggtttgtgacatgcattgacatttactacagtgtgtggctca
ggggagactcataatgctgctgtcactgtccctcagatgaagggaggatg
cacagccctctctaatacagaccttgccaagatgtgctagaaagactgta
cctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_67323801_67324513
seq2: B6Ng01-077B04.b_47_759 (reverse)

seq1  ATCAGCTGAGAACCACTGTTTTTCTATTGGAAAGGGAGATGAGGAAGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCTGAGAACCACTGTTTTTCTATTGGAAAGGGAGATGAGGAAGACA  50

seq1  CCCTCATTTACCACACACTACTGGGCCCTAGACTGGTGTCTGTCTTGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATTTACCACACACTACTGGGCCCTAGACTGGTGTCTGTCTTGACC  100

seq1  TGTAAAGACTAGAGCAAGTGCTGACTCGGTTCCTAATGGCTTGCGGCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAGACTAGAGCAAGTGCTGACTCGGTTCCTAATGGCTTGCGGCCAT  150

seq1  CTTTCCTACATGATCCCAACCTCCTTTAGTGCCCTATTTGGAAAAACTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTACATGATCCCAACCTCCTTTAGTGCCCTATTTGGAAAAACTGA  200

seq1  AGGCCATCCAGTGTTTGCTGATGGTCATATCAAGTACCATGGCTTTGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATCCAGTGTTTGCTGATGGTCATATCAAGTACCATGGCTTTGCTA  250

seq1  TCTCCCAGTCTGAAAAAGGGGGAGGGTCCGTTGATGAGAGCATTAGTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCAGTCTGAAAAAGGGGGAGGGTCCGTTGATGAGAGCATTAGTAAA  300

seq1  GGACAAACTTCCCATGGACCAGCCTGGCCTCTTAACTTTTGTCAGCCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAAACTTCCCATGGACCAGCCTGGCCTCTTAACTTTTGTCAGCCTCC  350

seq1  ACTTCTCTGACCCTCCTGGATCCTTGCTTTCTCTCTTAACACCTCCATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCTGACCCTCCTGGATCCTTGCTTTCTCTCTTAACACCTCCATTC  400

seq1  TTTTTTTAAATGCCCAGTGACCTCTATAGAAAATTCCCCATTGCAGTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTAAATGCCCAGTGACCTCTATAGAAAATTCCCCATTGCAGTTAT  450

seq1  TGCTGGTTAGAATGTATCTCTATCACATTTATGTTTGGCTCAGTTTATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGTTAGAATGTATCTCTATCACATTTATGTTTGGCTCAGTTTATCT  500

seq1  CAGTAGACACCTAGGGATGGGAGGCAAGGTTGGGTGGGAGACCTGACTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGACACCTAGGGATGGGAGGCAAGGTTGGGTGGGAGACCTGACTTT  550

seq1  GTGTAGATGCCTAAGTATAGGAGAAACATTCCTCTCAACACGTGTAAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGATGCCTAAGTATAGGAGAAACATTCCTCTCAACACGTGTAAAGA  600

seq1  GAAAAAGAACACTCAAAACATTGCCCTTAAATAGCATAACTTAAAACACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGAACACTCAAAACATTGCCCTTAAATAGCATAACTTAAAACACC  650

seq1  CCACAATTTATAGTGCATACCAACTTTTCTCTAATGCCAACTCAGCAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAATTTATAGTGCATACCAACTTTTCTCTAATGCCAACTCAGCAAAG  700

seq1  GGAGAAAGAATTC  713
      |||||||||||||
seq2  GGAGAAAGAATTC  713

seq1: chr17_67175849_67176980
seq2: B6Ng01-077B04.g_68_1171

seq1  GAATTCAACTGACATTGTTAGGATATTTTACACATTAACAGTTGAATATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTGACATTGTTAGGATATTTTACACATTAACAGTTGAATATT  50

seq1  TTCAAACTGATAGGTCTTAGCCACAGGTGTAGAATGTATCTGGGACCATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACTGATAGGTCTTAGCCACAGGTGTAGAATGTATCTGGGACCATA  100

seq1  AAAACACACCTTTTATATATCTTTTAAAGGAAAGAAAACGCACAATGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACACCTTTTATATATCTTTTAAAGGAAAGAAAACGCACAATGAAT  150

seq1  ATTCTCAGATGAAAGGGGAATTAAGCTAAAACTCAACAAAGATGGCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCAGATGAAAGGGGAATTAAGCTAAAACTCAACAAAGATGGCTGAA  200

seq1  AATTTCCAAACACTGGAAGATAAGGAACATGTGTTTAAGGCTTTATCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCAAACACTGGAAGATAAGGAACATGTGTTTAAGGCTTTATCTGT  250

seq1  AACATGGCACCACTGGAAGGTAGAGAAACCTCTAGGAAGTGGAGCCTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGCACCACTGGAAGGTAGAGAAACCTCTAGGAAGTGGAGCCTTGT  300

seq1  GAGAGACTGTAGGTCACTGGAAGCTATCCTCTAAGGAGACTATGAGATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACTGTAGGTCACTGGAAGCTATCCTCTAAGGAGACTATGAGATGG  350

seq1  TATCTCCTCTTTCCCCTCAACCCCCGCCTCTCATGAACCATCAGGAGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCCTCTTTCCCCTCAACCCCCGCCTCTCATGAACCATCAGGAGGAT  400

seq1  GGATGGCTTTGCTCCATGATGCTCTCCCCATTGTGATGTGCTGCCTCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGCTTTGCTCCATGATGCTCTCCCCATTGTGATGTGCTGCCTCACT  450

seq1  GTAGGCCCCAGAGCAGTGAGCCCATCTGGCTGCTGGGCTAAAATAAACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCCCCAGAGCAGTGAGCCCATCTGGCTGCTGGGCTAAAATAAACAT  500

seq1  CTGAGACTGAGACTAACTGAAAGTGTCCCTTTTCTATGGTAATTTTGTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACTGAGACTAACTGAAAGTGTCCCTTTTCTATGGTAATTTTGTAG  550

seq1  GTGGTTTGTCACAGTGCAGGATAACTGCTCAAAGATTGTAGTACTGTCGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTTGTCACAGTGCAGGATAACTGCTCAAAGATTGTAGTACTGTCGA  600

seq1  GGGGGGCATTAGAGGGAAGAAAAAATGGTCATAGCTCTGAAAGTTCAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGCATTAGAGGGAAGAAAAAATGGTCATAGCTCTGAAAGTTCAGCC  650

seq1  AGGAATGAAAGTGAGAGAGGAGAATGATGGTAAGGCAGGTACTTAGACGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATGAAAGTGAGAGAGGAGAATGATGGTAAGGCAGGTACTTAGACGG  700

seq1  AAAATAGTTGCTGTAATCTATTATTGCACATGAGGGAACAGGAAATGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAGTTGCTGTAATCTATTATTGCACATGAGGGAACAGGAAATGAGA  750

seq1  AAAAAAATTTCCTGCCATATTATTATTCACATGATAGGTGTCAATCATCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATTTCCTGCCATATTATTATTCACATGATAGGTGTCAATCATCC  800

seq1  ACATGACAGGTGTCAATCACAACCAATAGAGAAAACCCAGCAAAGAATGA  850
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGACACGTGTCAATCACAACCAATAGAGAAAACCCAGCAAAGAATGA  850

seq1  ACTTGTTGGGAAAAGTCCTCTGGAAGAGCTGGGGAACAAATGGTAGCCCA  900
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AC-TGTTGGGAAAAGTCCTCTGGAAGAGCTGGGGAACAAATGGTAGCCCA  899

seq1  CTTAGGGACAATGCAGAAGGAAACAGCCCCTCCCCACCTTTTTTTTCTGA  950
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  CTTAGGGAC-ATGCAGAAGG-AACAGCCCCTCCCCACC-TTTTTTTCTG-  945

seq1  AACCATGCTGGGTGGTTTGTGACATGCATTGACATTTACTACAGGTGTGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
seq2  AACCATGCTGGGTGGTTTGTGACATGCATTGACATTTACTACA-GTGTG-  993

seq1  TGGGCTCAAGGGGGAAGAACTCCATAATGCTGCTGTCCAACTGTCACTCA  1050
        |||||| ||| |    ||| |||||||||||||||  |||||| ||||
seq2  -TGGCTCAGGGGAG----ACT-CATAATGCTGCTGTC--ACTGTCCCTCA  1035

seq1  GGATGAAGGGAGGGATTGCCACCAAGCCCCTCTCTAATACAGACCCTGCC  1100
       |||||||||| ||||   |||  || |||||||||||||||||| ||||
seq2  -GATGAAGGGA-GGAT--GCAC--AG-CCCTCTCTAATACAGACCTTGCC  1078

seq1  ACAAAGATAGTGCCTAGAAAAGACTGTACCTC  1132
         ||||| ||| |||| ||||||||||||||
seq2  ---AAGAT-GTG-CTAG-AAAGACTGTACCTC  1104