BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-092M03
Chromosome17 (Build37)
Map Location 61,167,597 - 61,355,495
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043549
Downstream geneLOC433129, EG620725, LOC100043560
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-092M03.bB6Ng01-092M03.g
ACCDH904429DH904430
length1,0441,062
definitionDH904429|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092M03, 5' end.DH904430|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092M03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,354,456 - 61,355,495)(61,167,597 - 61,168,663)
sequence
gaattcactgactatgcctggtagttctctttgactgctctttggtaaaa
tatactcagtaattagtaacattagaggcaaaaacaattggatggtggaa
gcatgcactggcaggaatttagtccagtctggactttgctacattgtgct
ttggagtttcactacggctttttaataagagacctagaagatgaacttgt
tttagtaactgcaaatctctaattaaactggccaatatttatcataaatg
taagtgaatttcagttattcgcctatttatacctgtataagtgacatact
agaaatttgcttaaaagtaaagatttttccagtgcaagcacacttttctt
gctttctgaaggctacgcataagaagtaaaatttcggggtaaaggtatga
tccataccttctgtaaattcttctcatatctctcccagagccgaggcttc
cccgtgcttccacaaccccagtgaagaaataacaaagacgagtaaacaca
aacataggagttggtttttgaaggatcaaggaattaaggattgttaaaaa
cttaatttctgcatcttgtggatatatgtgtttgtaagaaaaaaccacca
aaaccaaaaacatccgtttaatatgttaaaatgttacttcagtctaactg
agaaaagaactattcacgagaccaaaatacagaataattttccctattga
taaaatagagaagagtctgttagaatctggataaggaaatcagtcagcat
tctagaatggagtgggttaggcttcatgtgttcctgcaccaaattgagac
gctgtggaattttgatgccttctaagaaaggaaaggcaactcatttctcc
agtgagtgggctacacacccaggagattacagagagcttatatatgtata
ttacatatacatcatatacacacacacatatactcatacaataatacata
tacatgtgtgtatgtgtgcatgtatgtatgtgtatgtatgtatatatagc
agattaaccttatagtgtaagactatatagtattatttatatat
gaattctttctaggttctgagaattttattcaaagaactgacataatggc
ttgcacagaatggcaaaagtagcaaagtgaatttatgtaaagtgatgcaa
cttagaggggcatactgtcaagactgacactgcaatctgaggaccttatg
ttccctccttcattgactcagtgtctttgaattgcagggatggctttcta
ccttgattgacagattaggttatatgttcatttgtctcactgtgttgtcc
tttccaagattgactctgattttagccacatggatatcaaattatgctca
gtgataagatgatgaaagggatggggttctcccaaaaggttatttggaag
gcttagtctgggttattgggtatgcctgccccaaaccagctcaggaaaac
taagtctttgtattcttcagagtgctattctttgagaatttatgtgaaca
gaaactgttcatagttaaaagttgttagaggtggaggaagatttgctgtt
gttatgagatgtggattctgatgtagaggagtaacacagagagttgcatt
gaggttgcattggttgtagaggggtgcacgtagacacagtgtgtgcagac
aaagacttaggcttctaaggaaagagagaagtatctagaactcaaaccaa
gtaaaggcccaggtaactaaattattccctatgcttgcctgtctcaggac
ttactatcctaccttttctgagatctgtctgcctctgcctcctgagttag
ccactatatgcctgactaccattttgctcctgaaagagaacggatttttt
ttcggagatattaaacacgctttagatagtagaggctttagatgtcttgt
ttcatatctcttccagtgttattgaaatatttaacgtattttctttcaat
aataaaataatatttcatagttataaaagtatgttttactaatatttaag
tgggaggaaagatgtacttccatatctagacagagcctgaggaatattac
cctacaacccaagacctagaagttatgttttcataggagccttcactgaa
ttctgttttagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_61354456_61355495
seq2: B6Ng01-092M03.b_45_1088 (reverse)

seq1  --ATATATAT-ATACTATATATGTCTTTACACTATATGTGTATTATGCTA  47
        ||||| || |||||||||| ||| |||||||||| |  || | |||||
seq2  ATATATAAATAATACTATATA-GTC-TTACACTATAAGGTTAATCTGCTA  48

seq1  TATATACATACATACACATACATACATGCACACATACACACATGTATATG  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATACATACATACACATACATACATGCACACATACACACATGTATATG  98

seq1  TATATGTGTATGAGTATATGTGTGTGTGTATATGATGTATATGT-ATATA  146
      |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TATTATTGTATGAGTATATGTGTGTGTGTATATGATGTATATGTAATATA  148

seq1  CATATATAAGCTCTCTGTAATCTCCTGGGTGTGTAG-CCACTCACTGGAG  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CATATATAAGCTCTCTGTAATCTCCTGGGTGTGTAGCCCACTCACTGGAG  198

seq1  -AATGAGTTGCCTTTCCTTTCTTAGAAGGCATCAAATTTCCACAGCGTCT  244
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAATGAGTTGCCTTTCCTTTCTTAGAAGGCATCAAAATTCCACAGCGTCT  248

seq1  CAATTTGGTGCAGGAACACATGAAGCCTAACCCACTCCATTCTAGAATGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTGGTGCAGGAACACATGAAGCCTAACCCACTCCATTCTAGAATGC  298

seq1  TGACTGATTTCCTTATCCAGATTCTAACAGACTCTTCTCTATTTTATCAA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGATTTCCTTATCCAGATTCTAACAGACTCTTCTCTATTTTATCAA  348

seq1  TAGGGAAAATTATTCTGTATTTTGGTCTCGTGAATAGTTCTTTTCTCAGT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGAAAATTATTCTGTATTTTGGTCTCGTGAATAGTTCTTTTCTCAGT  398

seq1  TAGACTGAAGTAACATTTTAACATATTAAACGGATGTTTTTGGTTTTGGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTGAAGTAACATTTTAACATATTAAACGGATGTTTTTGGTTTTGGT  448

seq1  GGTTTTTTCTTACAAACACATATATCCACAAGATGCAGAAATTAAGTTTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTTCTTACAAACACATATATCCACAAGATGCAGAAATTAAGTTTT  498

seq1  TAACAATCCTTAATTCCTTGATCCTTCAAAAACCAACTCCTATGTTTGTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAATCCTTAATTCCTTGATCCTTCAAAAACCAACTCCTATGTTTGTG  548

seq1  TTTACTCGTCTTTGTTATTTCTTCACTGGGGTTGTGGAAGCACGGGGAAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCGTCTTTGTTATTTCTTCACTGGGGTTGTGGAAGCACGGGGAAG  598

seq1  CCTCGGCTCTGGGAGAGATATGAGAAGAATTTACAGAAGGTATGGATCAT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGGCTCTGGGAGAGATATGAGAAGAATTTACAGAAGGTATGGATCAT  648

seq1  ACCTTTACCCCGAAATTTTACTTCTTATGCGTAGCCTTCAGAAAGCAAGA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTACCCCGAAATTTTACTTCTTATGCGTAGCCTTCAGAAAGCAAGA  698

seq1  AAAGTGTGCTTGCACTGGAAAAATCTTTACTTTTAAGCAAATTTCTAGTA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTGCTTGCACTGGAAAAATCTTTACTTTTAAGCAAATTTCTAGTA  748

seq1  TGTCACTTATACAGGTATAAATAGGCGAATAACTGAAATTCACTTACATT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTTATACAGGTATAAATAGGCGAATAACTGAAATTCACTTACATT  798

seq1  TATGATAAATATTGGCCAGTTTAATTAGAGATTTGCAGTTACTAAAACAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATAAATATTGGCCAGTTTAATTAGAGATTTGCAGTTACTAAAACAA  848

seq1  GTTCATCTTCTAGGTCTCTTATTAAAAAGCCGTAGTGAAACTCCAAAGCA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATCTTCTAGGTCTCTTATTAAAAAGCCGTAGTGAAACTCCAAAGCA  898

seq1  CAATGTAGCAAAGTCCAGACTGGACTAAATTCCTGCCAGTGCATGCTTCC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTAGCAAAGTCCAGACTGGACTAAATTCCTGCCAGTGCATGCTTCC  948

seq1  ACCATCCAATTGTTTTTGCCTCTAATGTTACTAATTACTGAGTATATTTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCCAATTGTTTTTGCCTCTAATGTTACTAATTACTGAGTATATTTT  998

seq1  ACCAAAGAGCAGTCAAAGAGAACTACCAGGCATAGTCAGTGAATTC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAGAGCAGTCAAAGAGAACTACCAGGCATAGTCAGTGAATTC  1044

seq1: chr17_61167597_61168663
seq2: B6Ng01-092M03.g_72_1133

seq1  GAATTCTTTCTAGGTTCTGAGAATTTTATTCAAAGAACTGACATAATGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTAGGTTCTGAGAATTTTATTCAAAGAACTGACATAATGGC  50

seq1  TTGCACAGAATGGCAAAAGTAGCAAAGTGAATTTATGTAAAGTGATGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACAGAATGGCAAAAGTAGCAAAGTGAATTTATGTAAAGTGATGCAA  100

seq1  CTTAGAGGGGCATACTGTCAAGACTGACACTGCAATCTGAGGACCTTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGGGGCATACTGTCAAGACTGACACTGCAATCTGAGGACCTTATG  150

seq1  TTCCCTCCTTCATTGACTCAGTGTCTTTGAATTGCAGGGATGGCTTTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCCTTCATTGACTCAGTGTCTTTGAATTGCAGGGATGGCTTTCTA  200

seq1  CCTTGATTGACAGATTAGGTTATATGTTCATTTGTCTCACTGTGTTGTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGATTGACAGATTAGGTTATATGTTCATTTGTCTCACTGTGTTGTCC  250

seq1  TTTCCAAGATTGACTCTGATTTTAGCCACATGGATATCAAATTATGCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAAGATTGACTCTGATTTTAGCCACATGGATATCAAATTATGCTCA  300

seq1  GTGATAAGATGATGAAAGGGATGGGGTTCTCCCAAAAGGTTATTTGGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAAGATGATGAAAGGGATGGGGTTCTCCCAAAAGGTTATTTGGAAG  350

seq1  GCTTAGTCTGGGTTATTGGGTATGCCTGCCCCAAACCAGCTCAGGAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGTCTGGGTTATTGGGTATGCCTGCCCCAAACCAGCTCAGGAAAAC  400

seq1  TAAGTCTTTGTATTCTTCAGAGTGCTATTCTTTGAGAATTTATGTGAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCTTTGTATTCTTCAGAGTGCTATTCTTTGAGAATTTATGTGAACA  450

seq1  GAAACTGTTCATAGTTAAAAGTTGTTAGAGGTGGAGGAAGATTTGCTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGTTCATAGTTAAAAGTTGTTAGAGGTGGAGGAAGATTTGCTGTT  500

seq1  GTTATGAGATGTGGATTCTGATGTAGAGGAGTAACACAGAGAGTTGCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGAGATGTGGATTCTGATGTAGAGGAGTAACACAGAGAGTTGCATT  550

seq1  GAGGTTGCATTGGTTGTAGAGGGGTGCACGTAGACACAGTGTGTGCAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTGCATTGGTTGTAGAGGGGTGCACGTAGACACAGTGTGTGCAGAC  600

seq1  AAAGACTTAGGCTTCTAAGGAAAGAGAGAAGTATCTAGAACTCAAACCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACTTAGGCTTCTAAGGAAAGAGAGAAGTATCTAGAACTCAAACCAA  650

seq1  GTAAAGGCCCAGGTAACTAAATTATTCCCTATGCTTGCCTGTCTCAGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGGCCCAGGTAACTAAATTATTCCCTATGCTTGCCTGTCTCAGGAC  700

seq1  TTACTATCCTACCTTTTCTGAGATCTGTCTGCCTCTGCCTCCTGAGTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTATCCTACCTTTTCTGAGATCTGTCTGCCTCTGCCTCCTGAGTTAG  750

seq1  CCACTATATGCCTGACTACCA-TTTGCTCCTGAAAGAGAACGGATTTTTT  799
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTATATGCCTGACTACCATTTTGCTCCTGAAAGAGAACGGATTTTTT  800

seq1  TTCGGAGATATTAAACACGCTTTAGATAGTAGAGGCTTTAGATGTCTTGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGAGATATTAAACACGCTTTAGATAGTAGAGGCTTTAGATGTCTTGT  850

seq1  TTCATATCTCTTCCAGTGTTATTGAAATATTTAACGTATTTTCTTTCAAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATATCTCTTCCAGTGTTATTGAAATATTTAACGTATTTTCTTTCAAT  900

seq1  AATAAAATAATATTTCATAGTTATAAAAGTATGTTTTACTAATATTTAAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAATAATATTTCATAGTTATAAAAGTATGTTTTACTAATATTTAAG  950

seq1  T-GGAGGAAAGATGTACATCCATATCTAGACAGAGGCCTGAGGACATATT  998
      | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||
seq2  TGGGAGGAAAGATGTACTTCCATATCTAGACAGA-GCCTGAGGA-ATATT  998

seq1  TACCTACAACGCAAAGACCTAGAGTTTAATGTTTTCATAGGGAGCCATTC  1048
        |||||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||
seq2  ACCCTACAAC-CCAAGACCTAGAAGTT-ATGTTTTCATA-GGAGCC-TTC  1044

seq1  ACTGATATTCTGTTTTAGG  1067
      ||||| |||||||||||||
seq2  ACTGA-ATTCTGTTTTAGG  1062