BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128J14
Chromosome17 (Build37)
Map Location 73,461,310 - 73,596,881
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLycat, LOC668709
Upstream geneAlk, Ypel5, Lbh
Downstream geneCapn13, LOC100043666, Galnt14, Ehd3, LOC240160, Xdh, Srd5a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128J14.bB6Ng01-128J14.g
ACCDH930407DH930408
length8421,008
definitionDH930407|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128J14, 5' end.DH930408|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128J14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,596,040 - 73,596,881)(73,461,310 - 73,462,321)
sequence
gaattcaaatcccagcaaccacatggtggctcacaaccatccgtaacgag
atctgactccctcttctggagtgtctgaagacagctacagtgtacttaca
tataatcaataaataaatctttaaaaaaaaacattaggattatagaggtt
tcgattttatattcctgtatcttttgtgctaaaatccccacagttcttgg
taacatcataactataacaaatataatactgtcagggaataagcttgtat
cattactaacaatatggcgataatacaatttcagtgttttttccccgcca
aggtagttcttttgtcttgaccaagtttactgttgggactttccacctgt
cactaagtacagctgctgtggtctgaatgttcatgtgcatgtccccaggg
tgatgatggcaggaagtggagccttttagaggttgtcagtttgcagaggt
ggaccaatggacagggttaatactattatataaaagaggcccctcctgaa
ggggacataggaagacatgaaacaagagaaaacatagcaacagtcaccta
ggaaaccaggccctcctcactagaccctgcccctccctgtaggtgtctct
tcaacttagggcttcccagcttcctgacctatgagaaataggggctcatc
acagtttgtggtggccttataaacaataaacagacagagacaatagtcat
tttatctttttgtattatttctaattttagcataaacatatgttctgtca
tgtttaaaaaagaatttgaaagcataccatgtgtacctgcacacacatgt
aagccaaggtgtgtggtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtg
gaattcttttgtgtatggtttgtagatatgttggggttcaggaatcacca
cacaagcccctcatactcgtgtgtctcagttaagcaagaatagtttattg
aacatacaccccaaggctgatccataagggtcacagcataggctcaggag
ctaagactggaccatggacatttttcaggccagtttataaagggaaaaac
caccgtgagctcatgtgcaggtacaggaaaagctgccccttctcagcgct
gactcaggctgttttggccagctagaaaggacagctctaaccgagctgta
ttctgatcggttctcagtggagcttatgcttgtgcaatctcttaagacta
acaaatctcagaatgtaacaggctatgtggtggatacgaccctgttctga
gtcaagctatttttctggtcagtgactggcaggcatggaatgtaatggct
acagctatactagggggcaggccttaacacgtgtgtatgcgtaagggcat
gcacagggaaaggcttcatcttttgagaaagggtcttactgagtctgatg
ctcactgaccgactagactgcatttatttatttatttatttatttttacc
gatttattgtttttaagccccctctctgggcatcctttaatttctatctc
ctggtgcttgaattacatacatacatgttgctggatatttgattacattg
tgagcccagagaatatgagctgtaacaactggtctctaatgtgtccttag
cctttgatcctcgagctttctgtctactgtaaacaagcacttgtgatgta
ggccaatcctagcactcgcctttaatccaagggcaaaataaaggtcaaga
ggccgggcaagtaagcagcagacaggactcgagcagactcagcagggagg
agggtccctgagatgaaggctatcagacattgtggaggagggaaagaagt
gtagccaggtcagctggttgccttctctgccgctctgagctggcagcttt
caccacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_73596040_73596881
seq2: B6Ng01-128J14.b_51_892 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACAAACACACACCACACACCTTGGCTTACATGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACAAACACACACCACACACCTTGGCTTACATGTGT  50

seq1  GTGCAGGTACACATGGTATGCTTTCAAATTCTTTTTTAAACATGACAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGGTACACATGGTATGCTTTCAAATTCTTTTTTAAACATGACAGAA  100

seq1  CATATGTTTATGCTAAAATTAGAAATAATACAAAAAGATAAAATGACTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTTTATGCTAAAATTAGAAATAATACAAAAAGATAAAATGACTAT  150

seq1  TGTCTCTGTCTGTTTATTGTTTATAAGGCCACCACAAACTGTGATGAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTGTCTGTTTATTGTTTATAAGGCCACCACAAACTGTGATGAGCC  200

seq1  CCTATTTCTCATAGGTCAGGAAGCTGGGAAGCCCTAAGTTGAAGAGACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTTCTCATAGGTCAGGAAGCTGGGAAGCCCTAAGTTGAAGAGACAC  250

seq1  CTACAGGGAGGGGCAGGGTCTAGTGAGGAGGGCCTGGTTTCCTAGGTGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGGGAGGGGCAGGGTCTAGTGAGGAGGGCCTGGTTTCCTAGGTGAC  300

seq1  TGTTGCTATGTTTTCTCTTGTTTCATGTCTTCCTATGTCCCCTTCAGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCTATGTTTTCTCTTGTTTCATGTCTTCCTATGTCCCCTTCAGGAG  350

seq1  GGGCCTCTTTTATATAATAGTATTAACCCTGTCCATTGGTCCACCTCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTCTTTTATATAATAGTATTAACCCTGTCCATTGGTCCACCTCTGC  400

seq1  AAACTGACAACCTCTAAAAGGCTCCACTTCCTGCCATCATCACCCTGGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGACAACCTCTAAAAGGCTCCACTTCCTGCCATCATCACCCTGGGG  450

seq1  ACATGCACATGAACATTCAGACCACAGCAGCTGTACTTAGTGACAGGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCACATGAACATTCAGACCACAGCAGCTGTACTTAGTGACAGGTGG  500

seq1  AAAGTCCCAACAGTAAACTTGGTCAAGACAAAAGAACTACCTTGGCGGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCCCAACAGTAAACTTGGTCAAGACAAAAGAACTACCTTGGCGGGG  550

seq1  AAAAAACACTGAAATTGTATTATCGCCATATTGTTAGTAATGATACAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACACTGAAATTGTATTATCGCCATATTGTTAGTAATGATACAAGC  600

seq1  TTATTCCCTGACAGTATTATATTTGTTATAGTTATGATGTTACCAAGAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCCCTGACAGTATTATATTTGTTATAGTTATGATGTTACCAAGAAC  650

seq1  TGTGGGGATTTTAGCACAAAAGATACAGGAATATAAAATCGAAACCTCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGATTTTAGCACAAAAGATACAGGAATATAAAATCGAAACCTCTA  700

seq1  TAATCCTAATGTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTGATTATATGTAAGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCTAATGTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTGATTATATGTAAGTA  750

seq1  CACTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGAGGGAGTCAGATCTCGTTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGAGGGAGTCAGATCTCGTTAC  800

seq1  GGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAATTC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAATTC  842

seq1: chr17_73461310_73462321
seq2: B6Ng01-128J14.g_66_1073

seq1  GAATTCTTTTGTGTATGGTTTGTAGATATGTTGGGGTTCAGGAATCACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGTGTATGGTTTGTAGATATGTTGGGGTTCAGGAATCACCA  50

seq1  CACAAGCCCCTCATACTCGTGTGTCTCAGTTAAGCAAGAATAGTTTATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGCCCCTCATACTCGTGTGTCTCAGTTAAGCAAGAATAGTTTATTG  100

seq1  AACATACACCCCAAGGCTGATCCATAAGGGTCACAGCATAGGCTCAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATACACCCCAAGGCTGATCCATAAGGGTCACAGCATAGGCTCAGGAG  150

seq1  CTAAGACTGGACCATGGACATTTTTCAGGCCAGTTTATAAAGGGAAAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGACTGGACCATGGACATTTTTCAGGCCAGTTTATAAAGGGAAAAAC  200

seq1  CACCGTGAGCTCATGTGCAGGTACAGGAAAAGCTGCCCCTTCTCAGCGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGTGAGCTCATGTGCAGGTACAGGAAAAGCTGCCCCTTCTCAGCGCT  250

seq1  GACTCAGGCTGTTTTGGCCAGCTAGAAAGGACAGCTCTAACCGAGCTGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCAGGCTGTTTTGGCCAGCTAGAAAGGACAGCTCTAACCGAGCTGTA  300

seq1  TTCTGATCGGTTCTCAGTGGAGCTTATGCTTGTGCAATCTCTTAAGACTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATCGGTTCTCAGTGGAGCTTATGCTTGTGCAATCTCTTAAGACTA  350

seq1  ACAAATCTCAGAATGTAACAGGCTATGTGGTGGATACGACCCTGTTCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATCTCAGAATGTAACAGGCTATGTGGTGGATACGACCCTGTTCTGA  400

seq1  GTCAAGCTATTTTTCTGGTCAGTGACTGGCAGGCATGGAATGTAATGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGCTATTTTTCTGGTCAGTGACTGGCAGGCATGGAATGTAATGGCT  450

seq1  ACAGCTATACTAGGGGGCAGGCCTTAACACGTGTGTATGCGTAAGGGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTATACTAGGGGGCAGGCCTTAACACGTGTGTATGCGTAAGGGCAT  500

seq1  GCACAGGGAAAGGCTTCATCTTTTGAGAAAGGGTCTTACTGAGTCTGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGGAAAGGCTTCATCTTTTGAGAAAGGGTCTTACTGAGTCTGATG  550

seq1  CTCACTGACCGACTAGACTGCATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGACCGACTAGACTGCATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTACC  600

seq1  GATTTATTGTTTTTAAGCCCCCTCTCTGGGCATCCTTTAATTTCTATCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATTGTTTTTAAGCCCCCTCTCTGGGCATCCTTTAATTTCTATCTC  650

seq1  CTGGTGCTTGAATTACATACATACATGTTGCTGGATATTTGATTACATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCTTGAATTACATACATACATGTTGCTGGATATTTGATTACATTG  700

seq1  TGAGCCCAGAGAATATGAGCTGTAACAACTGGTCTCTAATGTGTCCTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCCAGAGAATATGAGCTGTAACAACTGGTCTCTAATGTGTCCTTAG  750

seq1  CCTTTGATCCTCGAGCTTTCTGTCTACTGTAAACAAGCACTTGTGATGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGATCCTCGAGCTTTCTGTCTACTGTAAACAAGCACTTGTGATGTA  800

seq1  GGCCAATCCTAGCACTCGCCTTTAATCCAAGGGCAAAATAAAGGTCAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAATCCTAGCACTCGCCTTTAATCCAAGGGCAAAATAAAGGTCAAGA  850

seq1  GGCCGGGCAAGTAAGCAGCAGACAGGACTCGAGCAGAACTCAGCAGGGAG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGCCGGGCAAGTAAGCAGCAGACAGGACTCGAGCAG-ACTCAGCAGGGAG  899

seq1  GAGGGTCCCTGAGATGAAGGCTATTCAAGACATTGTGGAGAAGGGAAAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||
seq2  GAGGGTCCCTGAGATGAAGGCTAT--CAGACATTGTGGAGGAGGGAAAGA  947

seq1  AGTGTAGCCAGGTCAGCTGGGTGCCTTCTCTGCCGCTCTGAGCTGGCAGG  1000
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGTGTAGCCAGGTCAGCTGGTTGCCTTCTCTGCCGCTCTGAGCTGGCA-G  996

seq1  CTTTCACCACAG  1012
      ||||||||||||
seq2  CTTTCACCACAG  1008