BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130A04
Chromosome17 (Build37)
Map Location 38,411,114 - 38,472,139
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr138, Olfr137, Olfr762-ps1, Olfr136
Upstream geneH2-M3, Olfr755-ps1, Olfr99, Olfr756-ps1, Olfr101, Olfr102, Olfr103, Olfr104, GA_x5J8B7W5KGR-1115818-1115257, Olfr105, Olfr758-ps1, Olfr106, Olfr107, Olfr759-ps1, Olfr108, Olfr760-ps1, Olfr109, H2-M2, Olfr110, Olfr111, Olfr112, Olfr113, Olfr114, Olfr115, Olfr116, Olfr117, Olfr118, Olfr119, Scocp, Olfr120, Olfr1558-ps1, Olfr121, Olfr122, Olfr123, Olfr124, Olfr125, LOC672822, Olfr126, Olfr127, Olfr128, Ppia-ps17_697.1, Olfr761, Olfr1552-ps1, LOC100043265, Olfr129, Olfr130, Olfr131, Olfr132, Olfr133, Olfr134, Olfr135
Downstream geneLOC626985, LOC100043297
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130A04.bB6Ng01-130A04.g
ACCDH931435DH931436
length1,1311,101
definitionDH931435|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130A04, 5' end.DH931436|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130A04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(38,470,979 - 38,472,139)(38,411,114 - 38,412,226)
sequence
gaattcttttgggtggctttcattggttacagccattctcttgatttatt
ttatctacagtttagaagtgccatgttaacataaacaatagataaataaa
ataaagaaaaattatggaaaaccaagagaagtgcaagtcacatacaaaga
taaatccataaaataacagcagttggttgttgttgggatctggagagctt
acacagtgcttaaaagtacttattgtttttcttggaaaccaagtatgtat
tcccagtaccatgatgagtgtagcacaagtaccctcatctacagctccag
agaataaaatgcccatttctgtccttgtatggacacacccccacaagcac
atataggcataaataaataataagaaaaattaaaagtcaaaccctacctt
taataaaaaccctaaatgccaagagtatggcattctgtactttaattcct
taacaaaaaattttgccatattacattactgtgtccagactagataatta
ttttccataagtaaagtacaaaaaaaatccatgataaacactaaataaat
atctgatcatgaagccactgctacagaagattatttcaagaattctaccc
acagattaaaacaaacccactaatcaacaaacaaaaactaaatccccaag
actgtgaatgtacagaaaagaatgcagctcagtggtctggtaataaatac
tagtataaagactacagaagaaccaaacataaataattgaaaacataata
ggaagtcatacatacctttcagaattaagtaatagttaatagtctcaatc
ttcccattaaaagccagagactgccagactggaatgagatacaggaagga
attattcatagcaagcaaataacaaacaaacatttgcaaatgaataaaag
tgaaattacatgaaaaaatggattcaaaagcaatagtattagtaaaaaaa
aggtacctttgtactgataaagaactatccacagagcgccaaaatcatga
gatgatcatagaggaatgtagcatatcatttcagtaggagtactaaacaa
agtatgacattctaacataactttagatgactacgttatgataatagatg
actatcagcgacaaaaaaaacagaaactgca
gaattcttgaaagaatcttctgtagcagtggcttcatgatcagatatatc
tttagtgtttattatggattttttttgtactttacttatgaagaataact
agttattgtggacagagtaatgtaatatggaagaattttttgttaaggga
ttgaagtacagcatgccatactcttggcatctagggtttttcttagaggt
agagtttgacttttaatttttcttattattatatttatgcctatgtgtgc
ttgtgggggtgtgtccacacaaagatagaattgggcattttattttctgg
agctggagatattggtacttgtgttacactcatcatggtactggaaatac
atgcttagtttccaagaaaaacaataagtactcttaagcactgtgtaatc
tctccagatcccaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaaaaacaactactgttgttttatggatttatctttgtatgtga
cttgtacttctcttggttttcaataatttttctttgttttatgtatctat
tgttttaaattaacatggcacttctaaactgcagataaaataaatcaaag
gagaatggctgtaaccaatgaaagccacccaaaagaattcatcctactgg
gctttgctaaccatccttggctggaactccctctctttgttactcttctg
ataacatatcccatggctttgatggggaacatcgccatcattctggtgtc
caccttagaccctcgtctctacagccccatgtactttttcctcaagaatc
tctcctttctggacatgtgctacaccacaagcttgtgcctcagatgctgt
ttaacctgggaagctcagaaaaaccattacttacattggatgtgttgtca
ctttatgtcttcacataatggggaggcacagaatgtctacttttagctat
tatgtcctttgatcgatatgtggctactggcaaacctctccactacactc
tcattatgaccaagagtatgcattttgtcagtatctatatgtgctgactg
gagtgatcttggtttcgaaggcttaccttacattgcactgccattatgtg
g
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_38470979_38472139
seq2: B6Ng01-130A04.b_46_1176 (reverse)

seq1  TGCAGTTTCTTTGTTTTTTTTGTTTGGCTGAATAGTCATCTATTATTCAT  50
      |||||||||  |||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||
seq2  TGCAGTTTC--TGTTTTTTTTG--TCGCTG-ATAGTCATCTATTA-TCAT  44

seq1  AACGTAGTCATCTAAAGTTATGTTAGAATTTGTTCATTACTTTTGGTTTA  100
      |||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||  |||||
seq2  AACGTAGTCATCTAAAGTTATGTTAGAAT---GTCA-TACTTT--GTTTA  88

seq1  GTACTCCTTACTGAAATTGGATATGCTAACATTTCCTCTATGATTCATTC  150
      ||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||  
seq2  GTACTCC-TACTGAAAT--GATATGCT-ACA-TTCCTCTATGA-TCAT--  130

seq1  CTCATGAATTTTGGCGCTCCTGTTGGATAGTTTCTTTTATCAGTACAAAG  200
      |||||| ||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||
seq2  CTCATG-ATTTTGGCGCT-CTG-TGGATAGTT--CTTTATCAGTACAAAG  175

seq1  GTAACCTTTTTTTTTAACTAATACTATTTGCTTTTTGAATCCATTTTTTC  250
      || |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  GT-ACCTTTTTTTT--ACTAATACTA-TTGC-TTTTGAATCCATTTTTTC  220

seq1  ATGTAATTTCACTTTTATTCATTTGCAAATGTTTGTTTGTTATTTGCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATTTCACTTTTATTCATTTGCAAATGTTTGTTTGTTATTTGCTTG  270

seq1  CTATGAATAATTCCTTCCTGTATCTCATTCCAGTCTGGCAGTCTCTGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAATAATTCCTTCCTGTATCTCATTCCAGTCTGGCAGTCTCTGGCT  320

seq1  TTTAATGGGAAGATTGAGACTATTAACTATTACTTAATTCTGAAAGGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGGGAAGATTGAGACTATTAACTATTACTTAATTCTGAAAGGTAT  370

seq1  GTATGACTTCCTATTATGTTTTCAATTATTTATGTTTGGTTCTTCTGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGACTTCCTATTATGTTTTCAATTATTTATGTTTGGTTCTTCTGTAG  420

seq1  TCTTTATACTAGTATTTATTACCAGACCACTGAGCTGCATTCTTTTCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATACTAGTATTTATTACCAGACCACTGAGCTGCATTCTTTTCTGT  470

seq1  ACATTCACAGTCTTGGGGATTTAGTTTTTGTTTGTTGATTAGTGGGTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCACAGTCTTGGGGATTTAGTTTTTGTTTGTTGATTAGTGGGTTTG  520

seq1  TTTTAATCTGTGGGTAGAATTCTTGAAATAATCTTCTGTAGCAGTGGCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATCTGTGGGTAGAATTCTTGAAATAATCTTCTGTAGCAGTGGCTT  570

seq1  CATGATCAGATATTTATTTAGTGTTTATCATGGATTTTTTTTGTACTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATCAGATATTTATTTAGTGTTTATCATGGATTTTTTTTGTACTTTA  620

seq1  CTTATGGAAAATAATTATCTAGTCTGGACACAGTAATGTAATATGGCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGGAAAATAATTATCTAGTCTGGACACAGTAATGTAATATGGCAAA  670

seq1  ATTTTTTGTTAAGGAATTAAAGTACAGAATGCCATACTCTTGGCATTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTGTTAAGGAATTAAAGTACAGAATGCCATACTCTTGGCATTTAG  720

seq1  GGTTTTTATTAAAGGTAGGGTTTGACTTTTAATTTTTCTTATTATTTATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTATTAAAGGTAGGGTTTGACTTTTAATTTTTCTTATTATTTATT  770

seq1  TATGCCTATATGTGCTTGTGGGGGTGTGTCCATACAAGGACAGAAATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCTATATGTGCTTGTGGGGGTGTGTCCATACAAGGACAGAAATGGG  820

seq1  CATTTTATTCTCTGGAGCTGTAGATGAGGGTACTTGTGCTACACTCATCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTATTCTCTGGAGCTGTAGATGAGGGTACTTGTGCTACACTCATCA  870

seq1  TGGTACTGGGAATACATACTTGGTTTCCAAGAAAAACAATAAGTACTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACTGGGAATACATACTTGGTTTCCAAGAAAAACAATAAGTACTTTT  920

seq1  AAGCACTGTGTAAGCTCTCCAGATCCCAACAACAACCAACTGCTGTTATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACTGTGTAAGCTCTCCAGATCCCAACAACAACCAACTGCTGTTATT  970

seq1  TTATGGATTTATCTTTGTATGTGACTTGCACTTCTCTTGGTTTTCCATAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGATTTATCTTTGTATGTGACTTGCACTTCTCTTGGTTTTCCATAA  1020

seq1  TTTTTCTTTATTTTATTTATCTATTGTTTATGTTAACATGGCACTTCTAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTTTATTTTATTTATCTATTGTTTATGTTAACATGGCACTTCTAA  1070

seq1  ACTGTAGATAAAATAAATCAAGAGAATGGCTGTAACCAATGAAAGCCACC  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGATAAAATAAATCAAGAGAATGGCTGTAACCAATGAAAGCCACC  1120

seq1  CAAAAGAATTC  1161
      |||||||||||
seq2  CAAAAGAATTC  1131

seq1: chr17_38411114_38412226
seq2: B6Ng01-130A04.g_68_1168

seq1  GAATTCTTGAAAGAATCTTCTGTAGCAGTGGCTTCATGATCAGATATATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAAAGAATCTTCTGTAGCAGTGGCTTCATGATCAGATATATC  50

seq1  TTTAGTGTTTATTATGGATTTTTTTTGTACTTTACTTATGAAGAATAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGTTTATTATGGATTTTTTTTGTACTTTACTTATGAAGAATAACT  100

seq1  AGTTATTGTGGACAGAGTAATGTAATATGGAAGAATTTTTTGTTAAGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTGTGGACAGAGTAATGTAATATGGAAGAATTTTTTGTTAAGGGA  150

seq1  TTGAAGTACAGCATGCCATACTCTTGGCATCTAGGGTTTTTCTTAGAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGTACAGCATGCCATACTCTTGGCATCTAGGGTTTTTCTTAGAGGT  200

seq1  AGAGTTTGACTTTTAATTTTTCTTATTATTATATTTATGCCTATGTGTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTGACTTTTAATTTTTCTTATTATTATATTTATGCCTATGTGTGC  250

seq1  TTGTGGGGGTGTGTCCACACAAAGATAGAATTGGGCATTTTATTTTCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGGGGTGTGTCCACACAAAGATAGAATTGGGCATTTTATTTTCTGG  300

seq1  AGCTGGAGATATTGGTACTTGTGTTACACTCATCATGGTACTGGAAATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAGATATTGGTACTTGTGTTACACTCATCATGGTACTGGAAATAC  350

seq1  ATGCTTAGTTTCCAAGAAAAACAATAAGTACTCTTAAGCACTGTGTAATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTAGTTTCCAAGAAAAACAATAAGTACTCTTAAGCACTGTGTAATC  400

seq1  TCTCCAGATCCCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGATCCCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA  450

seq1  CAACAACAAAAACAACTACTGTTGTTTTATGGATTTATCTTTGTATGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAACAAAAACAACTACTGTTGTTTTATGGATTTATCTTTGTATGTGA  500

seq1  CTTGTACTTCTCTTGGTTTTCAATAATTTTTCTTTGTTTTATGTATCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTACTTCTCTTGGTTTTCAATAATTTTTCTTTGTTTTATGTATCTAT  550

seq1  TGTTTTAAATTAACATGGCACTTCTAAACTGCAGATAAAATAAATCAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTAAATTAACATGGCACTTCTAAACTGCAGATAAAATAAATCAAAG  600

seq1  GAGAATGGCTGTAACCAATGAAAGCCACCCAAAAGAATTCATCCTACTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGGCTGTAACCAATGAAAGCCACCCAAAAGAATTCATCCTACTGG  650

seq1  GCTTTGCTAACCATCCTTGGCTGGAACTCCCTCTCTTTGTTACTCTTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGCTAACCATCCTTGGCTGGAACTCCCTCTCTTTGTTACTCTTCTG  700

seq1  ATAACATATCCCATGGCTTTGATGGGGAACATCGCCATCATTCTGGTGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACATATCCCATGGCTTTGATGGGGAACATCGCCATCATTCTGGTGTC  750

seq1  CACCTTAGACCCTCGTCTCTACAGCCCCATGTACTTTTTCCTCAAGAATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTAGACCCTCGTCTCTACAGCCCCATGTACTTTTTCCTCAAGAATC  800

seq1  TCTCCTTTCTGGACATGTGCTACACCACAAGCATTGTGCCTCAGATGCTG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTTCTGGACATGTGCTACACCACAAGC-TTGTGCCTCAGATGCTG  849

seq1  TTTAACCTGGGAAGCTCCAGAAAAACCATTACTTACATTGGATGTGTTGT  900
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACCTGGGAAGCT-CAGAAAAACCATTACTTACATTGGATGTGTTGT  898

seq1  TCAACTTTATGTCTTCCACATAAT-GGGAGGCACAGAATGTCTACTTTTA  949
         |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  --CACTTTATGTCTT-CACATAATGGGGAGGCACAGAATGTCTACTTTTA  945

seq1  GCTATTATGTCCTTTGATCGATATGTGGCTATCTGCAAACCTCTCCACTA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  GCTATTATGTCCTTTGATCGATATGTGGCTACTGGCAAACCTCTCCACTA  995

seq1  CACTCTCATTATGAACCAAAGAGTATGCATTTTGTCAGTATCTATTATGT  1049
      ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CACTCTCATTATGA--CCAAGAGTATGCATTTTGTCAGTATCTA-TATGT  1042

seq1  GGCTGACTGGAGTGATCTTTGGTTTTTCAGAGGCTACACTTACATTGCAA  1099
       |||||||||||||||||| |   ||||  |||||   |||||||||| |
seq2  -GCTGACTGGAGTGATCTTGG---TTTCGAAGGCTTACCTTACATTGC-A  1087

seq1  CTGCCATTATGTGG  1113
      ||||||||||||||
seq2  CTGCCATTATGTGG  1101