BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132G07
Chromosome17 (Build37)
Map Location 67,925,621 - 68,116,483
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrrc30, Lama1
Upstream gene9130404H23Rik, Ptprm
Downstream geneArhgap28, D930040M24Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132G07.bB6Ng01-132G07.g
ACCDH933206DH933207
length1,1861,156
definitionDH933206|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132G07, 5' end.DH933207|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132G07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,115,280 - 68,116,483)(67,925,621 - 67,926,791)
sequence
gaattcaagtgcccgaggacgcaggctaagtgtcaattctaaacaccggc
aagtcactgaatatcatgcaatgcccagtcttaccaggcactggtcacac
tgctgtcctgtcacgtgaggtttgcagtcacacagtccagtctccagatg
gcagatgccagaaagggagccattctcgtggcagtcacaggctaggacac
acaagacccacaaaagggtttgatttatttacttagataatttgagtgga
agccgtttgatcccataaggagaaggctaacacattcacaaagctaacat
acttcacagacaatgagagccccgtcagggtgggaagcaacctccgaagc
aggggtgttgaccctggacctgaagacttgacagcctgagagggggcctg
ggatcagcttcctggctaatccacttttcctgagaacctggcttccttcc
agcttttggtttcccttggtatatgtggggtatattccctagctttgcct
gagatcctgagagacacaaccctgctgccctttagaaaggacttactctc
tcatcccatagcctgactctgaacatgactcctacctccccagcacgaag
cctgcaggccatcaacgcagagataactgctctctagctggaggtctccc
agctcgccttctctccttcccctccccgtctccctgcctcctcccttcct
ctccttccctccctctctttctccctccctgtctttttgacatacttaac
tgatgtttatctctgtggcaccccctctaccatgtccctctctttcccta
gtatgtccatcaacgtcacctctaattttctgtcctccgggtctcttatg
tgctgaggcagcacttttcaaagtctctgggacactgcaagtgctaaatt
cagtgaggagatttagtgatcatcatggaggatctttcttagaatttgac
ccatctaccacccacttccctgcatttgaaattaagtgtccatgatgctg
agttcaggttgacgagccaaagccaggcccttttcatctaatggtgtgcc
tacacttttattttctggttgattggcaccacctcttctcgtgctggaat
taagaccaacgttaccttgaatatcaaaaataaatggcatattatccggc
atccctccttggacagagttcaaactagactacaca
gaattctgtacatggataacttgtgactctctgggagaatcaccacagtg
aacagtgggttcgggtgtgccaaccacagccttttccttaggaaaactgc
ttttcctcagctcccattgttcctcctggggacactaaccacagctcctg
aacatctggctcgcctgcctgaaaaaccactaccccggctctgttcctga
tgacggatgggtcagcacagaagcaagtcagcacagttgactacagagag
attgtccccaggagctctacaatctgtggggcacatggaggagaaagagg
agcttgcttggctctgcagttgctcctcttgacataggcctggacagaaa
taatccaggccaaatacttaccatccatttgtctggatgagaagaaaaga
ggcaagctcatcaaaatatgaaaaaaacgggatggagactgagaagaaaa
cgctgtcagcaccactgctcagccttcttgaaagccagcccacccactgt
cctctcaattgaccttactttgttgatatacaccttatactcttgagtgg
aaggtggcagcactgggtttcagaggagcaggacacagacctgcagtgag
ttttgctttccttccctttaaaacctgtgtcactggccatgccaggcagg
ctggcacggggcttacatgttgtcttcagtcacataagctaggcttctag
gttgtctaaccacagcagtcatgcatggctctggattgtagcttctactc
ctcaatttcaaaatatccaagggagataagaggaagtacatagagtaata
gagaacactcccatcaccccaactgtgtcattccttctgcatgccacagg
agtggtgggctatgtagggcactataaagagtcaccgagggcttcctgga
ggtggcagaggtcttcatcttctttcagtttggaaggccggctagaatct
gtagtctgatgaaatcccccttaatagcaaatggcaaatcctcttgccac
tctcttgcccttagacttctagagagctggagctgtttactagtttacca
gcaggcctttctttgttccctcctatttaattgtccaacattacattagc
agctgaaggtgcaggcaaaggtgctgctgtggccttgctctgtctgttcc
tgcaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_68115280_68116483
seq2: B6Ng01-132G07.b_46_1231 (reverse)

seq1  TGTGTAGGTCTAGTTTTTGAACTCTGTCTCAAGGAAGGGATGCACGGATA  50
      |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||
seq2  TGTGTA-GTCTAG--TTTGAACTCTGTC-CAAGG-AGGGATGC-CGGATA  44

seq1  ATAATGCCACTTGTATATTTTGATAATTCAAGGTAAACGTTGGTCTTATA  100
      || |||||| || |   ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
seq2  AT-ATGCCATTTAT---TTTTGAT-ATTCAAGGT-AACGTTGGTCTTA-A  87

seq1  TCACAGCACGGAGAAGAGGTGGTGCCAATCATACAGAAAAATAAAAGTGT  150
      |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||
seq2  TTCCAGCAC-GAGAAGAGGTGGTGCCAATCAACCAG-AAAATAAAAGTGT  135

seq1  AGGCACA-CATTAGATGAAAAAGGGCCTGGCTTTGGCTCGTCAACCTGAA  199
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACACCATTAGATG-AAAAGGGCCTGGCTTTGGCTCGTCAACCTGAA  184

seq1  CTTCAGCATCATGGACACCTTAATTTCAAATGCAGGGAAGTGGGTGGTAG  249
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TCAGCATCATGGACA-CTTAATTTCAAATGCAGGGAAGTGGGTGGTAG  232

seq1  ATGGGTCAAATTCTAAAGAAAGATCCTCCATGATGATCACTAAATCTCCT  299
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTCAAATTCT-AAGAAAGATCCTCCATGATGATCACTAAATCTCCT  281

seq1  CACTGAATTTAGCACTTGCAGTGTCCCAGAGACTTTGAAAAGTGCTGCCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAATTTAGCACTTGCAGTGTCCCAGAGACTTTGAAAAGTGCTGCCT  331

seq1  CAGCACATAAGAGACCCGGAGGACAGAAAATTAGAGGTGACGTTGATGGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACATAAGAGACCCGGAGGACAGAAAATTAGAGGTGACGTTGATGGA  381

seq1  CATACTAGGGAAAGAGAGGGACATGGTAGAGGGGGTGCCACAGAGATAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTAGGGAAAGAGAGGGACATGGTAGAGGGGGTGCCACAGAGATAAA  431

seq1  CATCAGTTAAGTATGTCAAAAAGACAGGGAGGGAGAAAGAGAGGGAGGGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGTTAAGTATGTCAAAAAGACAGGGAGGGAGAAAGAGAGGGAGGGA  481

seq1  AGGAGAGGAAGGGAGGAGGCAGGGAGACGGGGAGGGGAAGGAGAGAAGGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAGGAAGGGAGGAGGCAGGGAGACGGGGAGGGGAAGGAGAGAAGGC  531

seq1  GAGCTGGGAGACCTCCAGCTAGAGAGCAGTTATCTCTGCGTTGATGGCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGGAGACCTCCAGCTAGAGAGCAGTTATCTCTGCGTTGATGGCCT  581

seq1  GCAGGCTTCGTGCTGGGGAGGTAGGAGTCATGTTCAGAGTCAGGCTATGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCTTCGTGCTGGGGAGGTAGGAGTCATGTTCAGAGTCAGGCTATGG  631

seq1  GATGAGAGAGTAAGTCCTTTCTAAAGGGCAGCAGGGTTGTGTCTCTCAGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGAGAGTAAGTCCTTTCTAAAGGGCAGCAGGGTTGTGTCTCTCAGG  681

seq1  ATCTCAGGCAAAGCTAGGGAATATACCCCACATATACCAAGGGAAACCAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGGCAAAGCTAGGGAATATACCCCACATATACCAAGGGAAACCAA  731

seq1  AAGCTGGAAGGAAGCCAGGTTCTCAGGAAAAGTGGATTAGCCAGGAAGCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGAAGGAAGCCAGGTTCTCAGGAAAAGTGGATTAGCCAGGAAGCT  781

seq1  GATCCCAGGCCCCCTCTCAGGCTGTCAAGTCTTCAGGTCCAGGGTCAACA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCAGGCCCCCTCTCAGGCTGTCAAGTCTTCAGGTCCAGGGTCAACA  831

seq1  CCCCTGCTTCGGAGGTTGCTTCCCACCCTGACGGGGCTCTCATTGTCTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGCTTCGGAGGTTGCTTCCCACCCTGACGGGGCTCTCATTGTCTGT  881

seq1  GAAGTATGTTAGCTTTGTGAATGTGTTAGCCTTCTCCTTATGGGATCAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTATGTTAGCTTTGTGAATGTGTTAGCCTTCTCCTTATGGGATCAAA  931

seq1  CGGCTTCCACTCAAATTATCTAAGTAAATAAATCAAACCCTTTTGTGGGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTTCCACTCAAATTATCTAAGTAAATAAATCAAACCCTTTTGTGGGT  981

seq1  CTTGTGTGTCCTAGCCTGTGACTGCCACGAGAATGGCTCCCTTTCTGGCA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGTGTCCTAGCCTGTGACTGCCACGAGAATGGCTCCCTTTCTGGCA  1031

seq1  TCTGCCATCTGGAGACTGGACTGTGTGACTGCAAACCTCACGTGACAGGA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCATCTGGAGACTGGACTGTGTGACTGCAAACCTCACGTGACAGGA  1081

seq1  CAGCAGTGTGACCAGTGCCTGGTAAGACTGGGCATTGCATGATATTCAGT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGTGTGACCAGTGCCTGGTAAGACTGGGCATTGCATGATATTCAGT  1131

seq1  GACTTGCCGGTGTTTAGAATTGACACTTAGCCTGCGTCCTCGGGCACTTG  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGCCGGTGTTTAGAATTGACACTTAGCCTGCGTCCTCGGGCACTTG  1181

seq1  AATTC  1204
      |||||
seq2  AATTC  1186

seq1: chr17_67925621_67926791
seq2: B6Ng01-132G07.g_66_1221

seq1  GAATTCTGTACATGGATAACTTGTGACTCTCTGGGAGAATCACCACAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTACATGGATAACTTGTGACTCTCTGGGAGAATCACCACAGTG  50

seq1  AACAGTGGGTTCGGGTGTGCCAACCACAGCCTTTTCCTTAGGAAAACTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTGGGTTCGGGTGTGCCAACCACAGCCTTTTCCTTAGGAAAACTGC  100

seq1  TTTTCCTCAGCTCCCATTGTTCCTCCTGGGGACACTAACCACAGCTCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTCAGCTCCCATTGTTCCTCCTGGGGACACTAACCACAGCTCCTG  150

seq1  AACATCTGGCTCGCCTGCCTGAAAAACCACTACCCCGGCTCTGTTCCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCTGGCTCGCCTGCCTGAAAAACCACTACCCCGGCTCTGTTCCTGA  200

seq1  TGACGGATGGGTCAGCACAGAAGCAAGTCAGCACAGTTGACTACAGAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGGATGGGTCAGCACAGAAGCAAGTCAGCACAGTTGACTACAGAGAG  250

seq1  ATTGTCCCCAGGAGCTCTACAATCTGTGGGGCACATGGAGGAGAAAGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCCCCAGGAGCTCTACAATCTGTGGGGCACATGGAGGAGAAAGAGG  300

seq1  AGCTTGCTTGGCTCTGCAGTTGCTCCTCTTGACATAGGCCTGGACAGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCTTGGCTCTGCAGTTGCTCCTCTTGACATAGGCCTGGACAGAAA  350

seq1  TAATCCAGGCCAAATACTTACCATCCATTTGTCTGGATGAGAAGAAAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCAGGCCAAATACTTACCATCCATTTGTCTGGATGAGAAGAAAAGA  400

seq1  GGCAAGCTCATCAAAATATGAAAAAAACGGGATGGAGACTGAGAAGAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGCTCATCAAAATATGAAAAAAACGGGATGGAGACTGAGAAGAAAA  450

seq1  CGCTGTCAGCACCACTGCTCAGCCTTCTTGAAAGCCAGCCCACCCACTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGTCAGCACCACTGCTCAGCCTTCTTGAAAGCCAGCCCACCCACTGT  500

seq1  CCTCTCAATTGACCTTACTTTGTTGATATACACCTTATACTCTTGAGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCAATTGACCTTACTTTGTTGATATACACCTTATACTCTTGAGTGG  550

seq1  AAGGTGGCAGCACTGGGTTTCAGAGGAGCAGGACACAGACCTGCAGTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGCAGCACTGGGTTTCAGAGGAGCAGGACACAGACCTGCAGTGAG  600

seq1  TTTTGCTTTCCTTCCCTTTAAAACCTGTGTCACTGGCCATGCCAGGCAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTTTCCTTCCCTTTAAAACCTGTGTCACTGGCCATGCCAGGCAGG  650

seq1  CTGGCACGGGGCTTACATGTTGTCTTCAGTCACATAAGCTAGGCTTCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCACGGGGCTTACATGTTGTCTTCAGTCACATAAGCTAGGCTTCTAG  700

seq1  GTTGTCTAACCACAGCAGTCATGCATGGCTCTGGATTGTAGCTTCTACTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCTAACCACAGCAGTCATGCATGGCTCTGGATTGTAGCTTCTACTC  750

seq1  CTCAATTTCAAAATATCCAAGGGAGATAAGAGGAAGTACATAGAGTAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATTTCAAAATATCCAAGGGAGATAAGAGGAAGTACATAGAGTAATA  800

seq1  GAGAACACTCCCATCACCCCAACTGTGTCATTCCTTCTGCATGCCACAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACACTCCCATCACCCCAACTGTGTCATTCCTTCTGCATGCCACAGG  850

seq1  AGTGGTGGGCTATGTAGGGCACTATAAAGAGTCACCGAGGGCTTCCTGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTGGGCTATGTAGGGCACTATAAAGAGTCACCGAGGGCTTCCTGGA  900

seq1  GGTGGCAGAGGTCTTCATCCTTCTTTCAGTTTGGAAGGCCGGCTAGAATC  950
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCAGAGGTCTTCAT-CTTCTTTCAGTTTGGAAGGCCGGCTAGAATC  949

seq1  TGTAGTCTGATGAAATCCCCCTTAATAGCAAATGGCAAATCCTCCTTGCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGTAGTCTGATGAAATCCCCCTTAATAGCAAATGGCAAATCCT-CTTGCC  998

seq1  ACTCTCTTGCCCCTTAGACTTCTAGAAGAGCTGGAGCTGTTTACTAGTTT  1050
      ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCTTG-CCCTTAGACTTCTAG-AGAGCTGGAGCTGTTTACTAGTTT  1046

seq1  ACCAGCAGGGCTTTTCTTTGTTTCTCTTCTATTTTAATTGTTCCAACATT  1100
      ||||||| ||| |||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |
seq2  ACCAGCA-GGCCTTTCTTTG-TTCCCTCCTA-TTTAATTG-TCCAACA-T  1091

seq1  TACATAAGCCAGGCTGAAAGTGCAGGCAAAGTGTGCTTGCTGTGGCCTTG  1150
      ||||| |||   |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| 
seq2  TACATTAGC--AGCTGAAGGTGCAGGCAAAG-GTGC-TGCTGTGGCCTT-  1136

seq1  GCTACTGTCTGTACCTGCAAT  1171
      ||| |||||||| ||||||||
seq2  GCT-CTGTCTGTTCCTGCAAT  1156