BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170E23
Chromosome17 (Build37)
Map Location 60,956,357 - 61,067,665
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043549
Downstream geneLOC433129, EG620725, LOC100043560
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170E23.bB6Ng01-170E23.g
ACCDH961055DH961056
length768957
definitionDH961055|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E23, 5' end.DH961056|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,956,357 - 60,957,123)(61,066,711 - 61,067,665)
sequence
gaattcattaaaacgagaattgtattgcctctgaggatttgtggtatggt
tcatatcttttagaatagtaacagtcgaatgagcatgcaaagtctattgt
aagctccttggctcccctgtcctaattcaggttgattcagggtgagatat
aattatactaaagggtaataattatctttacagtgatgcaatacccctgc
agcttttatgtatatttgcaacaatctcttatttgattgatgagagacat
cagtgcattgaatcagataaacaaatgtaacagatcaattttaaataaga
aataacttcaataaaaatcagtttatttcaacttgcctgcaaacccttct
acttataagattaattctgaatggaagagggtctctggtttcaggcagca
gtgtgaaaattgtgaaaatccagggatgtcctgggttggtaaatgcagat
ggtaccatcaacacttctcacatcttggtgatattttttttctaattctg
ctaattgtaacaataaactttgctgatagatatggcatgagctcacctct
gtcactttagaattatatttttctttaaaagaaaatactggactattacc
tgagactcagtgggtcctctgtccatgagaactgcatctctctactgtgg
tagcatcaggatgtgataccttttcaagataattgacattaaatgatgtc
cttagggtgaaataattgttaaaaggtcagtgtctttacagaagtcaggg
gcgggggggtgggggggg
gaattccctctgtgatagactctaagctgtaaaatgaaataaaccctctc
cttcctaggtggctttgggtcatggtgttttatcacagcaatagcaaccc
taactaagtatttgtcaagtcaccatattcatatcttcacctactccaca
gcctatttaaatattcttatcatttgtggtttcaatgaccttaaattctt
gttcaggcagtgagaaagattcacatgtaatactaatggcccaaaggtac
ttctgaagatcccatcagcatccctatcacagaaaggtgattaagttggt
atcagtgttccaggcaagtttatttctagaccaagggctcagaggtgacg
ttggatgaaatgcttttgcttgccttgttctgatgatttatattgcagaa
tttaattcactggaaagatacgtttttggtttgatttggataaaccatgt
gttttatgagccttatgaaaacacaaagatatcatttaggaattaaaaga
aacgatgtccatcttcaaagttacttacaggtaccgtctttcatagaatt
caaacagaaatgtatttctttttcattcacatattattgaccttacatcg
tctgtttttccccactgctctctcagcatttttagagtaaatgtagatca
aagataaaagtgactgaaggttattcaatcacaaatatgcatagaactac
aacagcgagggtcgggacctccaggtgggtctgtgcatccagacccatga
gagaggacagtgttgaatacttttgacagttttacccctgtgtgttctgt
cctatcccagacctcagacaccctttcttggcgagagtgactgcttccag
aaagtaattttggattgaattagagctttctgagagaggcaaaacatact
ttacagtaggcaaattgattttctctgggtcagtgccttgctggtgtcca
ccgtacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_60956357_60957123
seq2: B6Ng01-170E23.b_44_811

seq1  GAATTCATTAAAACGAGAATTGTATTGCCTCTGAGGATTTGTGGTATGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAAAACGAGAATTGTATTGCCTCTGAGGATTTGTGGTATGGT  50

seq1  TCATATCTTTTAGAATAGTAACAGTCGAATGAGCATGCAAAGTCTATTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCTTTTAGAATAGTAACAGTCGAATGAGCATGCAAAGTCTATTGT  100

seq1  AAGCTCCTTGGCTCCCCTGTCCTAATTCAGGTTGATTCAGGGTGAGATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCCTTGGCTCCCCTGTCCTAATTCAGGTTGATTCAGGGTGAGATAT  150

seq1  AATTATACTAAAGGGTAATAATTATCTTTACAGTGATGCAATACCCCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATACTAAAGGGTAATAATTATCTTTACAGTGATGCAATACCCCTGC  200

seq1  AGCTTTTATGTATATTTGCAACAATCTCTTATTTGATTGATGAGAGACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTTATGTATATTTGCAACAATCTCTTATTTGATTGATGAGAGACAT  250

seq1  CAGTGCATTGAATCAGATAAACAAATGTAACAGATCAATTTTAAATAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCATTGAATCAGATAAACAAATGTAACAGATCAATTTTAAATAAGA  300

seq1  AATAACTTCAATAAAAATCAGTTTATTTCAACTTGCCTGCAAACCCTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACTTCAATAAAAATCAGTTTATTTCAACTTGCCTGCAAACCCTTCT  350

seq1  ACTTATAAGATTAATTCTGAATGGAAGAGGGTCTCTGGTTTCAGGCAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATAAGATTAATTCTGAATGGAAGAGGGTCTCTGGTTTCAGGCAGCA  400

seq1  GTGTGAAAATTGTGAAAATCCAGGGATGTCCTGGGTTGGTAAATGCAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAAAATTGTGAAAATCCAGGGATGTCCTGGGTTGGTAAATGCAGAT  450

seq1  GGTACCATCAACACTTCTCACATCTTGGTGATATTTTTTTTCTAATTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCATCAACACTTCTCACATCTTGGTGATATTTTTTTTCTAATTCTG  500

seq1  CTAATTGTAACAATAAACTTTGCTGATAGATATGGCATGAGCTCACCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTGTAACAATAAACTTTGCTGATAGATATGGCATGAGCTCACCTCT  550

seq1  GTCACTTTAGAATTATATTTTTCTTTAAAAGAAAATACTGGACTATTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTTTAGAATTATATTTTTCTTTAAAAGAAAATACTGGACTATTACC  600

seq1  TGAGACTCAGTGGGTCCTCTGTCCATGAGAACTGCATCTCTCTACTGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTCAGTGGGTCCTCTGTCCATGAGAACTGCATCTCTCTACTGTGG  650

seq1  TAGCATCAGGATGTGATACCTTTTCAAGATAATTGACATTAAATGATGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATCAGGATGTGATACCTTTTCAAGATAATTGACATTAAATGATGTC  700

seq1  CTTAGGGTGAAATAATTGTTAAAAGGTCAGTGTCTTTACAGAAGTCA-GG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTTAGGGTGAAATAATTGTTAAAAGGTCAGTGTCTTTACAGAAGTCAGGG  750

seq1  GCGGGGGGGTGGGGGGGG  767
      ||||||||||||||||||
seq2  GCGGGGGGGTGGGGGGGG  768

seq1: chr17_61066711_61067665
seq2: B6Ng01-170E23.g_67_1023 (reverse)

seq1  GGTACGGTGG-CA-CAGCAAGGCACTGAACCAGAGAAATTCAATTTGCCT  48
      |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  GGTACGGTGGACACCAGCAAGGCACTGACCCAGAGAAAATCAATTTGCCT  50

seq1  ACTGTAAAGTATGTTTTGTCTCTCTCAGAAAGCTCTAATTCAATCCAAAA  98
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAAAGTATGTTTTGCCTCTCTCAGAAAGCTCTAATTCAATCCAAAA  100

seq1  TTACTTTCTGGAAGCAGTCACTCTCGCCAAGAAAGGGTGTCTGAGGTCTG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTTCTGGAAGCAGTCACTCTCGCCAAGAAAGGGTGTCTGAGGTCTG  150

seq1  GGATAGGACAGAACACACAGGGGTAAAACTGTCAAAAGTATTCAACACTG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAGGACAGAACACACAGGGGTAAAACTGTCAAAAGTATTCAACACTG  200

seq1  TCCTCTCTCATGGGTCTGGATGCACAGACCCACCTGGAGGTCCCGACCCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTCTCATGGGTCTGGATGCACAGACCCACCTGGAGGTCCCGACCCT  250

seq1  CGCTGTTGTAGTTCTATGCATATTTGTGATTGAATAACCTTCAGTCACTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGTTGTAGTTCTATGCATATTTGTGATTGAATAACCTTCAGTCACTT  300

seq1  TTATCTTTGATCTACATTTACTCTAAAAATGCTGAGAGAGCAGTGGGGAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTTGATCTACATTTACTCTAAAAATGCTGAGAGAGCAGTGGGGAA  350

seq1  AAACAGACGATGTAAGGTCAATAATATGTGAATGAAAAAGAAATACATTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGACGATGTAAGGTCAATAATATGTGAATGAAAAAGAAATACATTT  400

seq1  CTGTTTGAATTCTATGAAAGACGGTACCTGTAAGTAACTTTGAAGATGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTGAATTCTATGAAAGACGGTACCTGTAAGTAACTTTGAAGATGGA  450

seq1  CATCGTTTCTTTTAATTCCTAAATGATATCTTTGTGTTTTCATAAGGCTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCGTTTCTTTTAATTCCTAAATGATATCTTTGTGTTTTCATAAGGCTC  500

seq1  ATAAAACACATGGTTTATCCAAATCAAACCAAAAACGTATCTTTCCAGTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAACACATGGTTTATCCAAATCAAACCAAAAACGTATCTTTCCAGTG  550

seq1  AATTAAATTCTGCAATATAAATCATCAGAACAAGGCAAGCAAAAGCATTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAATTCTGCAATATAAATCATCAGAACAAGGCAAGCAAAAGCATTT  600

seq1  CATCCAACGTCACCTCTGAGCCCTTGGTCTAGAAATAAACTTGCCTGGAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAACGTCACCTCTGAGCCCTTGGTCTAGAAATAAACTTGCCTGGAA  650

seq1  CACTGATACCAACTTAATCACCTTTCTGTGATAGGGATGCTGATGGGATC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATACCAACTTAATCACCTTTCTGTGATAGGGATGCTGATGGGATC  700

seq1  TTCAGAAGTACCTTTGGGCCATTAGTATTACATGTGAATCTTTCTCACTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAGTACCTTTGGGCCATTAGTATTACATGTGAATCTTTCTCACTG  750

seq1  CCTGAACAAGAATTTAAGGTCATTGAAACCACAAATGATAAGAATATTTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAACAAGAATTTAAGGTCATTGAAACCACAAATGATAAGAATATTTA  800

seq1  AATAGGCTGTGGAGTAGGTGAAGATATGAATATGGTGACTTGACAAATAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGCTGTGGAGTAGGTGAAGATATGAATATGGTGACTTGACAAATAC  850

seq1  TTAGTTAGGGTTGCTATTGCTGTGATAAAACACCATGACCCAAAGCCACC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTAGGGTTGCTATTGCTGTGATAAAACACCATGACCCAAAGCCACC  900

seq1  TAGGAAGGAGAGGGTTTATTTCATTTTACAGCTTAGAGTCTATCACAGAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAGGAGAGGGTTTATTTCATTTTACAGCTTAGAGTCTATCACAGAG  950

seq1  GGAATTC  955
      |||||||
seq2  GGAATTC  957