BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185L23
Chromosome17 (Build37)
Map Location 56,832,669 - 56,975,377
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRanbp3, Ccpn-ps, AI662250, Ndufa11, Fut4-ps1, Nrtn, Dus3l, Gm546, Rfx2
Upstream genePot1b, Emr4, Zfp119, BC011426, EG433125, BC031441, Ebi3, Ccdc94, Shd, Fsd1, AW049765, Mpnd, Sh3gl1, Chaf1a, Ubxd1, Hdgfrp2, S3-12, 2310076L09Rik, Lrg1, Sema6b, Tnfaip8l1, D17Wsu104e, Dpp9, LOC668573, A230051N06Rik, Fem1a, Ticam1, M6prbp1, Arrdc5, Uhrf1, Jmjd2b, Ptprs, EG668592, Znrf4, Safb2, Safb, 2410015M20Rik, Rpl36, Lonp1, LOC619718, Tmem146
Downstream geneAcsbg2, 1700061G19Rik, Mllt1, Asah3, Clpp, Alkbh7, Pspn, Gtf2f1, Khsrp, Slc25a41, Slc25a23, Crb3, Dennd1c, Tubb4, Tnfsf9, Cd70, Tnfsf14, C3, Gpr108, Trip10, LOC668635, Vav1, Emr1, EG224916, Cntnap5c, LOC674419
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185L23.bB6Ng01-185L23.g
ACCGA010776GA010777
length893370
definitionB6Ng01-185L23.b B6Ng01-185L23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,832,669 - 56,833,560)(56,975,004 - 56,975,377)
sequence
gaattcaagttcccagcacctaacctacataaagagccagacatggtatg
tgttgatagcacagccaggctctgcctgcatcctctagacttgagtggtc
cctccctgcacaccagccccagttcccaacactgcgtcatgctaggagaa
gctctgcccagggtgaggctggggtcctgccctgtcatttggggattcag
gctttgaggggaaagaagcaagatttttatggtgtgccagggcctgtggg
agattcctcctctgtactgcagaagagtgggtgacagcagaagccacatg
aatcagggtgctctgtttttgctctggacagagaatccttgttaactgta
tccagatgcctcttgcctctgtgcagatgctctagctgagagaatagcct
ggttgagtgcaaggctctgcaggtgttggcttctaagctgagccacacgg
caagttcatgctagagctctcatgacagtagctgccctccagagccagtg
tcctgtgtggcaaactgggcccataaagcccagtgtcttgattctcatcg
gctgtaagcctgagcaatatagcccccagatcagccagggcaaggggcct
ccagataaggggagctggagatcatctctaccccctgcttcacagtggct
agagcagcactgtcatgccacttggtgacagcgctgagccaccaggccag
cgtagggctctcagtggggaagctgggctgtctgccaaaattagtcttgt
ggctggcgcgttgcatagatgtactataatttgggtgaattgggctgtaa
atcaagttgggtgtaatctgatcctggggacaccaggctgagctcaccag
tccctgtgctgcagagtgggcttttatcttgcctgtgccctaa
tactgggttttgttttgtttggtttggtttggttgtttgagttgggggtg
gtcttgctgtgtagccctgtctgtcctgaaactcactatgtagatcagga
tggccttgaactcacagatatccagctgcctctgcctcccaattataaaa
ccttatgctccaggattgacccacaatcccaatcagctgtcagtggagag
aggactgagcccaggacacagccatccatagctgcctagcacttggcttc
atattttgggctcatgtacacctacactcattgaattttaagatgaagca
gcctggctggcaccagaagatattgtgaagacatttgtggttggactgtt
tattttatttatgtattggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_56832669_56833560
seq2: B6Ng01-185L23.b_45_937

seq1  GAATTCAAGTTCCCAGCACCTAACCTACATAAAGAGCCAGACATGGTATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGTTCCCAGCACCTAACCTACATAAAGAGCCAGACATGGTATG  50

seq1  TGTTGATAGCACAGCCAGGCTCTGCCTGCATCCTCTAGACTTGAGTGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGATAGCACAGCCAGGCTCTGCCTGCATCCTCTAGACTTGAGTGGTC  100

seq1  CCTCCCTGCACACCAGCCCCAGTTCCCAACACTGCGTCATGCTAGGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTGCACACCAGCCCCAGTTCCCAACACTGCGTCATGCTAGGAGAA  150

seq1  GCTCTGCCCAGGGTGAGGCTGGGGTCCTGCCCTGTCATTTGGGGATTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCCCAGGGTGAGGCTGGGGTCCTGCCCTGTCATTTGGGGATTCAG  200

seq1  GCTTTGAGGGGAAAGAAGCAAGATTTTTATGGTGTGCCAGGGCCTGTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGAGGGGAAAGAAGCAAGATTTTTATGGTGTGCCAGGGCCTGTGGG  250

seq1  AGATTCCTCCTCTGTACTGCAGAAGAGTGGGTGACAGCAGAAGCCACATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCCTCCTCTGTACTGCAGAAGAGTGGGTGACAGCAGAAGCCACATG  300

seq1  AATCAGGGTGCTCTGTTTTTGCTCTGGACAGAGAATCCTTGTTAACTGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGGGTGCTCTGTTTTTGCTCTGGACAGAGAATCCTTGTTAACTGTA  350

seq1  TCCAGATGCCTCTTGCCTCTGTGCAGATGCTCTAGCTGAGAGAATAGCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGATGCCTCTTGCCTCTGTGCAGATGCTCTAGCTGAGAGAATAGCCT  400

seq1  GGTTGAGTGCAAGGCTCTGCAGGTGTTGGCTTCTAAGCTGAGCCACACGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAGTGCAAGGCTCTGCAGGTGTTGGCTTCTAAGCTGAGCCACACGG  450

seq1  CAAGTTCATGCTAGAGCTCTCATGACAGTAGCTGCCCTCCAGAGCCAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCATGCTAGAGCTCTCATGACAGTAGCTGCCCTCCAGAGCCAGTG  500

seq1  TCCTGTGTGGCAAACTGGGCCCATAAAGCCCAGTGTCTTGATTCTCATCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGTGGCAAACTGGGCCCATAAAGCCCAGTGTCTTGATTCTCATCG  550

seq1  GCTGTAAGCCTGAGCAATATAGCCCCCAGATCAGCCAGGGCAAGGGGCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAAGCCTGAGCAATATAGCCCCCAGATCAGCCAGGGCAAGGGGCCT  600

seq1  CCAGATAAGGGGAGCTGGAGATCATCTCTACCCCCTGCTTCACAGTGGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAAGGGGAGCTGGAGATCATCTCTACCCCCTGCTTCACAGTGGCT  650

seq1  AGAGCAGCACTGTCATGCCACTTGGTGACAGCGCTGAGCCACCAGGCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGCACTGTCATGCCACTTGGTGACAGCGCTGAGCCACCAGGCCAG  700

seq1  CGTAGGGCTCTCAGTGGGGAAGCTGGGCTGTCTGCCAAAATTAGTCTTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGGGCTCTCAGTGGGGAAGCTGGGCTGTCTGCCAAAATTAGTCTTGT  750

seq1  GGCTGGCGCGTTGCATAGATGTACTATAATTTGGGTGAATTGGGCTGTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGCGCGTTGCATAGATGTACTATAATTTGGGTGAATTGGGCTGTAA  800

seq1  ATCAAGTTGGGTGGAATCTGATCCTGGGGACACCAGGCTGAGCTCACCAG  850
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGTTGGGTGTAATCTGATCCTGGGGACACCAGGCTGAGCTCACCAG  850

seq1  TCCCTGTGCTGCAGAGTGGGCTTTTATCTTG-CTGTGCCCTAA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCCCTGTGCTGCAGAGTGGGCTTTTATCTTGCCTGTGCCCTAA  893

seq1: chr17_56975004_56975377
seq2: B6Ng01-185L23.g_68_443 (reverse)

seq1  CCCAATACATAAAT-AAATCATCAGTCCAACCACAAATGTCTTCACAATG  49
      |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCCAATACATAAATAAAATAAACAGTCCAACCACAAATGTCTTCACAATA  50

seq1  TCTTCTGGTGCCAGCCAGGCTGCTTCATCTTGAAATTCAATGAGTGTTGG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
seq2  TCTTCTGGTGCCAGCCAGGCTGCTTCATCTTAAAATTCAATGAGTGTAGG  100

seq1  TGTACATGAGCCC-AAATATGAAGCCAAGTGCTAGGCAGCTATGGATGGC  148
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACATGAGCCCAAAATATGAAGCCAAGTGCTAGGCAGCTATGGATGGC  150

seq1  TGTGTCCTGGGCTCAGTCCTCTCTCCACTGACAGCTGATTGGGATTGTGG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCCTGGGCTCAGTCCTCTCTCCACTGACAGCTGATTGGGATTGTGG  200

seq1  GTCAATCCTGGAGCATAAGGTTTTATAATTGGGAGGCAGAGGCAGCTGGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATCCTGGAGCATAAGGTTTTATAATTGGGAGGCAGAGGCAGCTGGA  250

seq1  TATCTGTGAGTTCAAGGCCATCCTGATCTACATAGTGAGTTTCAGGACAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGTGAGTTCAAGGCCATCCTGATCTACATAGTGAGTTTCAGGACAG  300

seq1  ACAGGGCTACACAGCAAGACCACCCCCAACTCAAACAACCAAACCAAACC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGCTACACAGCAAGACCACCCCCAACTCAAACAACCAAACCAAACC  350

seq1  AAACAAAACAAAACCCAGTAGAATTC  374
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAACAAAACCCAGTAGAATTC  376