BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-189I14
Chromosome17 (Build37)
Map Location 69,210,935 - 69,320,963
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneArhgap28, D930040M24Rik, EG622645
Downstream geneEpb4.1l3, 2410021H03Rik, Zfp161, C030034I22Rik, A930029G22Rik, A330050F15Rik, LOC100043623, LOC668720, LOC673535, LOC100043630
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-189I14.bB6Ng01-189I14.g
ACCGA013535GA013536
length1,2131,148
definitionB6Ng01-189I14.b B6Ng01-189I14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,210,935 - 69,212,133)(69,319,819 - 69,320,963)
sequence
gaattctactggctacattgtaacaggaactagaagtgatgggagatggt
ctaaaagtatactgaagaaggctcacaggtcacccgcagattccatgcca
ttgtatttgtatataaaggaatagcatgactttggaatttgcaatcctca
ggggtcctgaaagctgtcccttgtactaagagacattttgcattattatt
gattattagtcataaaatgaagctcttgtctgttgcagcatttaaggtta
tctccttactggttgtagctggtttcttcagcagcttcatttgaaaaaaa
attcatctcggcaagataccacagatgatcctctttagcctagcatctgc
ctctccttacttaaaatcagcacttgcgcaaagatgatcaggcctggcat
tagagaagtgaaatcattaatgctgtgttttcttgtcttccaatcccttc
caagactgatcctaaagctataagcccctggaccagggcaccaatgttag
ctgggggatgtattagaaaggtaatctcaggtcctattctatgtttacta
gcaatatgctggaaatggggccagaaacctgtgttttcaacaacttcaac
aaaactcgcaggcaactctggtatatgctcagtcactagccttggccagt
catcttttaaatatatgatgctttggagtccagaaggctccagcaaggaa
atgtatgttgtcaaggaacaggctgaaggtcctgagagattatcataaga
gcactcctcttttaaggctccttgaacccattacaaaacagagacctaca
tgaatggcaggatgctgagggacccattggtcacagggtcctgcagatca
agacaccctttacgtcacagtcctgtgggcggctctcttcccaacaatca
catcaccctgagcatgcagacacaaagtaatatgtttctatttgtgctta
gccttttcagcctgacacagcaaagcaaccaccacctattgttgccacag
aaattgtccttttctcattgcttccagaggtccagattgacaaagagcaa
tgattctaaacaaagtgattttcccaagcccctccatgtctctaggtggc
ctggtgtttcaagtgtctcaaaaggtctgcattgctacatgacccacacc
cagattcttcttgccttcctgtaagggtaaatgtggcttagtaggcccgg
tccaagaatctct

gaattccacttagttatgaggagatctcagacaaaagtgcagggaaaccc
ccagagtctgcatttataaagaagtcctaagccaaggtcaggatttatta
tttgtaaaataggacagatctacagttgaattatgtggacaaagcaaacc
cctggtttttaaaaggacagcactttaggactggtggacgatggctcctg
ggaatgtgtaggattgagagatcattgagtgagactcttgttgactggtt
gattgaagctgacgttgattggttgactttgataagggcagttaccgaaa
tgaattttcatagcttatttgatgggagtctgaaagtggttttggtaaat
ctttgtccaaggctttggaacaatcctggaagaagtctttacatttcaca
aattcaaaggacagaaacacgtgaccattattttgttgcgttgtctttga
gaaacatgcttttccactagttataaatatatcagtaacaatagatgaac
tagatccagctgacttgcctgtagtcaaggcctggtatttgaacacgagt
tccttctgggtatttgaccctaataatgtttatattaacatagcactgta
gagtaatgaaattaggtctcgtttacaaatgttagagtgatatttgttct
cttacaggtggaaaattgaagctcaaagaaatgtcaacatgatcatagac
ttttcacatcttcttatcatcccttggcaacaaactttaccaaatcattt
gatggttgtttggtaaataaatagaagatgaagctatacaaataattgct
cattcaaagtagcaatgtgaattaggtactagggatataaacccagctaa
acataaatataataattaacaattttttattagtctgtgctatcacatac
aatgtaacattagtttagcacaatgtgctggctgggttcttttattgttg
ttgttgcgtcttttttattaacctgactcaagctggagttatttgaaaag
aggaaggcgattgaaaaagaaaaaaagtcttcatcgtgttgcctgttagc
agtctgaagaacattttcttgatttgtgattgatgtaggagggcttcagc
tcacttgcatgtcctgacagtcttggattgtagagtagctagctgagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_69210935_69212133
seq2: B6Ng01-189I14.b_42_1254

seq1  GAATTCTACTGGCTACATTGTAACAGGAACTAGAAGTGATGGGAGATGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTGGCTACATTGTAACAGGAACTAGAAGTGATGGGAGATGGT  50

seq1  CTAAAAGTATACTGAAGAAGGCTCACAGGTCACCCGCAGATTCCATGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGTATACTGAAGAAGGCTCACAGGTCACCCGCAGATTCCATGCCA  100

seq1  TTGTATTTGTATATAAAGGAATAGCATGACTTTGGAATTTGCAATCCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTTGTATATAAAGGAATAGCATGACTTTGGAATTTGCAATCCTCA  150

seq1  GGGGTCCTGAAAGCTGTCCCTTGTACTAAGAGACATTTTGCATTATTATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTCCTGAAAGCTGTCCCTTGTACTAAGAGACATTTTGCATTATTATT  200

seq1  GATTATTAGTCATAAAATGAAGCTCTTGTCTGTTGCAGCATTTAAGGTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATTAGTCATAAAATGAAGCTCTTGTCTGTTGCAGCATTTAAGGTTA  250

seq1  TCTCCTTACTGGTTGTAGCTGGTTTCTTCAGCAGCTTCATTTGAAAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTACTGGTTGTAGCTGGTTTCTTCAGCAGCTTCATTTGAAAAAAA  300

seq1  ATTCATCTCGGCAAGATACCACAGATGATCCTCTTTAGCCTAGCATCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATCTCGGCAAGATACCACAGATGATCCTCTTTAGCCTAGCATCTGC  350

seq1  CTCTCCTTACTTAAAATCAGCACTTGCGCAAAGATGATCAGGCCTGGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCTTACTTAAAATCAGCACTTGCGCAAAGATGATCAGGCCTGGCAT  400

seq1  TAGAGAAGTGAAATCATTAATGCTGTGTTTTCTTGTCTTCCAATCCCTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAGTGAAATCATTAATGCTGTGTTTTCTTGTCTTCCAATCCCTTC  450

seq1  CAAGACTGATCCTAAAGCTATAAGCCCCTGGACCAGGGCACCAATGTTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACTGATCCTAAAGCTATAAGCCCCTGGACCAGGGCACCAATGTTAG  500

seq1  CTGGGGGATGTATTAGAAAGGTAATCTCAGGTCCTATTCTATGTTTACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGGATGTATTAGAAAGGTAATCTCAGGTCCTATTCTATGTTTACTA  550

seq1  GCAATATGCTGGAAATGGGGCCAGAAACCTGTGTTTTCAACAACTTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATATGCTGGAAATGGGGCCAGAAACCTGTGTTTTCAACAACTTCAAC  600

seq1  AAAACTCGCAGGCAACTCTGGTATATGCTCAGTCACTAGCCTTGGCCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTCGCAGGCAACTCTGGTATATGCTCAGTCACTAGCCTTGGCCAGT  650

seq1  CATCTTTTAAATATATGATGCTTTGGAGTCCAGAAGGCTCCAGCAAGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTTAAATATATGATGCTTTGGAGTCCAGAAGGCTCCAGCAAGGAA  700

seq1  ATGTATGTTGTCAAGGAACAGGCTGAAGGTCCTGAGAGATTATCATAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTTGTCAAGGAACAGGCTGAAGGTCCTGAGAGATTATCATAAGA  750

seq1  GCACTCCTCTTTTAAGGCTCCTTGAACCCATTACAAAACAGAGACCTACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCCTCTTTTAAGGCTCCTTGAACCCATTACAAAACAGAGACCTACA  800

seq1  TGAATGGCAGGATGCTGAGGGACCCATTGGTCACAGGGTCCTGCAGATCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGGCAGGATGCTGAGGGACCCATTGGTCACAGGGTCCTGCAGATCA  850

seq1  AGACACCCTTTACGTCACAGTCCTGTGGGCGGCTCTCTTCCCAACAATCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACCCTTTACGTCACAGTCCTGTGGGCGGCTCTCTTCCCAACAATCA  900

seq1  CATCACCCTGAGCATGCAGACACAAAGTAATATGTTTCTA-TTGTGC-TA  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  CATCACCCTGAGCATGCAGACACAAAGTAATATGTTTCTATTTGTGCTTA  950

seq1  GCCTTTTCAGCCTGACACAGCAAAGC-ACCACCACCTA-TGTTGCCACAG  996
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
seq2  GCCTTTTCAGCCTGACACAGCAAAGCAACCACCACCTATTGTTGCCACAG  1000

seq1  AAA-TGTCC-TTTCTCATTGC-TCCAGAGG-CCAGA-TGACAAAGGAGCA  1041
      ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||
seq2  AAATTGTCCTTTTCTCATTGCTTCCAGAGGTCCAGATTGACAAA-GAGCA  1049

seq1  ATGA-TCTAAACAAAGTGATTTCCCCAAGGCCCCTCCATGTCTCTTAGGT  1090
      |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  ATGATTCTAAACAAAGTGATTTTCCCAA-GCCCCTCCATGTCTC-TAGGT  1097

seq1  GG-CTGTGGTTTCAAGTGTCCTCAAAAGGTCTGCA-TGCTACATGA-CCA  1137
      || |||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||
seq2  GGCCTGGTGTTTCAAGTGT-CTCAAAAGGTCTGCATTGCTACATGACCCA  1146

seq1  CACCCAGA-TCT--CTGCCTT-CTGTAAAGGTGATAGTGGCTTAGGAGGC  1183
      |||||||| |||   |||||| |||||| ||| |  ||||||||| ||||
seq2  CACCCAGATTCTTCTTGCCTTCCTGTAAGGGTAAATGTGGCTTAGTAGGC  1196

seq1  CCCGTCCAAG-ATCTCT  1199
      || ||||||| ||||||
seq2  CCGGTCCAAGAATCTCT  1213


seq1: chr17_69319819_69320963
seq2: B6Ng01-189I14.g_66_1213 (reverse)

seq1  GCTCAGCTTGCTTTCTTCTACAA-CCAAGACTGCCA-GCCCTGC-AGTGA  47
      |||||||| ||  |  ||||||| ||||||||| || | | ||| |||||
seq2  GCTCAGCTAGC--TACTCTACAATCCAAGACTGTCAGGACATGCAAGTGA  48

seq1  GCTG-AGCCCTCCTACATCAATCACAAATCAAGAAAATG-TCTTCAGACT  95
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| 
seq2  GCTGAAGCCCTCCTACATCAATCACAAATCAAGAAAATGTTCTTCAGAC-  97

seq1  TGCCTACAGGCCAACACGATGAAGAC-TTTTTTCTTTTTCAATCGCCCTT  144
      |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |
seq2  TGCTAACAGG-CAACACGATGAAGACTTTTTTTCTTTTTCAATCGCC--T  144

seq1  CCCTCTTTTCAAATAACTCCAGCTTGAGTCAGGTTAAT-AAAAAGACGCA  193
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCCTCTTTTCAAATAACTCCAGCTTGAGTCAGGTTAATAAAAAAGACGCA  194

seq1  ACAACAACAAT-AAAGAACCCAGCCAGCACATTGTGCT-AACTAATGTTA  241
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACAACAACAATAAAAGAACCCAGCCAGCACATTGTGCTAAACTAATGTTA  244

seq1  CATTGTATGTGATAGCACAGACTAAT-AAAAATTGTTAATTATTATATTT  290
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  CATTGTATGTGATAGCACAGACTAATAAAAAATTGTTAATTATTATA-TT  293

seq1  TATGTTTAGCTGGGTTTATATCCCTAGTACCTAATTCACATTGCTACTTT  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTTAGCTGGGTTTATATCCCTAGTACCTAATTCACATTGCTACTTT  343

seq1  GAATGAGCAATTATTTGTATAGCTTCATCTTCTATTTATTTACCAAACAA  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGCAATTATTTGTATAGCTTCATCTTCTATTTATTTACCAAACAA  393

seq1  CCATCAAATGATTTGGTAAAGTTTGTTGCCAAGGGATGATAAGAAGATGT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCAAATGATTTGGTAAAGTTTGTTGCCAAGGGATGATAAGAAGATGT  443

seq1  GAAAAGTCTATGATCATGTTGACATTTCTTTGAGCTTCAATTTTCCACCT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGTCTATGATCATGTTGACATTTCTTTGAGCTTCAATTTTCCACCT  493

seq1  GTAAGAGAACAAATATCACTCTAACATTTGTAAACGAGACCTAATTTCAT  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAGAACAAATATCACTCTAACATTTGTAAACGAGACCTAATTTCAT  543

seq1  TACTCTACAGTGCTATGTTAATATAAACATTATTAGGGTCAAATACCCAG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTACAGTGCTATGTTAATATAAACATTATTAGGGTCAAATACCCAG  593

seq1  AAGGAACTCGTGTTCAAATACCAGGCCTTGACTACAGGCAAGTCAGCTGG  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACTCGTGTTCAAATACCAGGCCTTGACTACAGGCAAGTCAGCTGG  643

seq1  ATCTAGTTCATCTATTGTTACTGATATATTTATAACTAGTGGAAAAGCAT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGTTCATCTATTGTTACTGATATATTTATAACTAGTGGAAAAGCAT  693

seq1  GTTTCTCAAAGACAACGCAACAAAATAATGGTCACGTGTTTCTGTCCTTT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCAAAGACAACGCAACAAAATAATGGTCACGTGTTTCTGTCCTTT  743

seq1  GAATTTGTGAAATGTAAAGACTTCTTCCAGGATTGTTCCAAAGCCTTGGA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTGTGAAATGTAAAGACTTCTTCCAGGATTGTTCCAAAGCCTTGGA  793

seq1  CAAAGATTTACCAAAACCACTTTCAGACTCCCATCAAATAAGCTATGAAA  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATTTACCAAAACCACTTTCAGACTCCCATCAAATAAGCTATGAAA  843

seq1  ATTCATTTCGGTAACTGCCCTTATCAAAGTCAACCAATCAACGTCAGCTT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTCGGTAACTGCCCTTATCAAAGTCAACCAATCAACGTCAGCTT  893

seq1  CAATCAACCAGTCAACAAGAGTCTCACTCAATGATCTCTCAATCCTACAC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCAACCAGTCAACAAGAGTCTCACTCAATGATCTCTCAATCCTACAC  943

seq1  ATTCCCAGGAGCCATCGTCCACCAGTCCTAAAGTGCTGTCCTTTTAAAAA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCAGGAGCCATCGTCCACCAGTCCTAAAGTGCTGTCCTTTTAAAAA  993

seq1  CCAGGGGTTTGCTTTGTCCACATAATTCAACTGTAGATCTGTCCTATTTT  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGTTTGCTTTGTCCACATAATTCAACTGTAGATCTGTCCTATTTT  1043

seq1  ACAAATAATAAATCCTGACCTTGGCTTAGGACTTCTTTATAAATGCAGAC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATAATAAATCCTGACCTTGGCTTAGGACTTCTTTATAAATGCAGAC  1093

seq1  TCTGGGGGTTTCCCTGCACTTTTGTCTGAGATCTCCTCATAACTAAGTGG  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGGTTTCCCTGCACTTTTGTCTGAGATCTCCTCATAACTAAGTGG  1143

seq1  AATTC  1145
      |||||
seq2  AATTC  1148


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |