BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-217G07
Chromosome17 (Build37)
Map Location 81,063,085 - 81,198,053
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMap4k3, LOC100043697
Upstream geneAW061290, Cyp1b1, EG668821, Arl6ip2, LOC625074, Hnrpll, Gpx4-ps, Galm, Sfrs7, 4930560E09Rik, Gemin6, Dhx57, Morn2, Sos1, Cdkl4, F420015M19Rik
Downstream geneC230072F16Rik, LOC675572, EG668830, Tmem178, Thumpd2, LOC100043700, LOC100043704, Slc8a1, EG668832
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-217G07.bB6Ng01-217G07.g
ACCGA033816GA033817
length1,0451,130
definitionB6Ng01-217G07.b B6Ng01-217G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,197,008 - 81,198,053)(81,063,085 - 81,064,220)
sequence
gaattctccaatgtgagagagagagacatttcccactccctagtaggaag
aatgaacaaagaagaaagaccattttgaaggtgttttcaatgacctgtcc
acccccaacttcctgacccccagctgatttcctctttcaggcttctcctg
gttcttagagtgattcattcttcccacaatgactgggccttttgcctcat
aaagcactccctgtcttttcagatataatgaactaaaattaagcagaagg
cagcctggagcactaagaaaaactccctatggcaagagcttgcagcccca
caatagccttataaggcaagccaaggaagccctggctactggggcaaaac
aatagagggtagaaagttattttggggagtacggaggatgaggagtgtcc
atttcccagatttatattaaatgtgtcatacctctgctaaggcggaataa
atacccaacatttacccatttgtaataaacataggaaaactatcccagtg
agagagccaccgttcacaggcactgtataaatgtgggctgctctgaacaa
ctgagtatttctctcctctctttaagaccaccatcaaggcctgtatgaca
ggtgagcctttgtatgtgctagtcaataaggcattttttaaaagtaactg
cagtacatcaagcttcaggattgtacgcacttttaacatacacacacatc
tagcatagtcccttaatcaaagatcttaaaagacagcaagggtctggatg
tgtagctcattgatagagggtttgcccaatgtatccaaagccctgtttta
atctcatcatcagaaaagaggagtgggggagccagggagagtatctgtgt
ttgcatgtgtacattaagaaaccacctatactccagcattcaggaggcag
aggcaggtggaactctgagctcaaggccagcctggtccacagagcaagtt
ccaggacagccaggaatacacagaaaaacctgtctggaaaatgagccatg
gggaaagtgaaggagaagaagggaggaagaatggggagggaaatg
gaattcttttaagcctaagagaaaggggcagcagctggtgtatgtagagg
cagcttcctcaatgaaaccacacccagaattcccaagtcacatgctgatg
acactgttacagaattaccataataggtcacgtgtgaaagattctgtctt
ctaagcaagaatcaggaatcactgcatggcgcgagtcaattttattgtta
ggtgctggaaccactactgtttttcaaaagggaaatgaacagtgtacctg
agatagcttccaaaataagcaacaatgtttgggtgtttgcagtctttcat
cataatgatttcttgctgtacaaccgcaaagtcttctcctaggacacaaa
gcaagcatgttggatagtcaataggtaaaatgctcatttactttaaaaca
cgtgaaagtaattatacttacaattaactatggcacagctaatgaacttt
atatccagcacaaccaatgccttaatggtattacttctaacaaccatttc
agccccggcttgaggagccctgtaccttggtgagaaagaagtacagatgc
gactcctgggccctgagtctgttctcacaaagtacttagcgctgtgctaa
tgtcctgctcagtaaaataacctcacagggatgaatgggttactaccttc
aaaatggcgggcagggtaatttccatacgaacacttcctgctaatacagc
acaccttagggcattgttataggaaatatgtattacaaaaatggtcttca
ctaggaatacccattgcttccccctgttactaaacaacatttggctggtt
gtggtggcacacaccctgtgtatagctggaaaggaagaggcaagagaatc
atttaaatagaaattcaccataaagacgtgatcctttttaaagttagaga
aagaccattggccagcaagtgtgtgagctctgcagcactgggaaggccca
cacagcgtgagttaaagtgagtcctgtacggtagcatcttcacttggctt
tcccaacggtgtcaggctaggaaaagacatttcatctacaccggcaggct
attggtcagtcatctgccttaccctcttgctggccaattctcaaaataaa
cctggcacttaggtgtcattcacaggtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_81197008_81198053
seq2: B6Ng01-217G07.b_45_1089 (reverse)

seq1  CTTTTCCCTCCCC-TTCTTCCTCCCTTCTTCTCCTTCACTTTCCCCATTG  49
      | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATTTCCCTCCCCATTCTTCCTCCCTTCTTCTCCTTCACTTTCCCCA-TG  49

seq1  CCTCATTTTCCAGACAGGGTTTTTCTGTGTATTCCTGGCTGTCCTGGAAC  99
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATTTTCCAGACA-GGTTTTTCTGTGTATTCCTGGCTGTCCTGGAAC  98

seq1  TTGCTCTGTGGACCAGGCTGGCCTTGAGCTCAGAGTTCCACCTGCCTCTG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCTGTGGACCAGGCTGGCCTTGAGCTCAGAGTTCCACCTGCCTCTG  148

seq1  CCTCCTGAATGCTGGAGTATAGGTGGTTTCTTAATGTACACATGCAAACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGAATGCTGGAGTATAGGTGGTTTCTTAATGTACACATGCAAACA  198

seq1  CAGATACTCTCCCTGGCTCCCCCACTCCTCTTTTCTGATGATGAGATTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACTCTCCCTGGCTCCCCCACTCCTCTTTTCTGATGATGAGATTAA  248

seq1  AACAGGGCTTTGGATACATTGGGCAAACCCTCTATCAATGAGCTACACAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGGCTTTGGATACATTGGGCAAACCCTCTATCAATGAGCTACACAT  298

seq1  CCAGACCCTTGCTGTCTTTTAAGATCTTTGATTAAGGGACTATGCTAGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACCCTTGCTGTCTTTTAAGATCTTTGATTAAGGGACTATGCTAGAT  348

seq1  GTGTGTGTATGTTAAAAGTGCGTACAATCCTGAAGCTTGATGTACTGCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTATGTTAAAAGTGCGTACAATCCTGAAGCTTGATGTACTGCAG  398

seq1  TTACTTTTAAAAAATGCCTTATTGACTAGCACATACAAAGGCTCACCTGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTTTAAAAAATGCCTTATTGACTAGCACATACAAAGGCTCACCTGT  448

seq1  CATACAGGCCTTGATGGTGGTCTTAAAGAGAGGAGAGAAATACTCAGTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAGGCCTTGATGGTGGTCTTAAAGAGAGGAGAGAAATACTCAGTTG  498

seq1  TTCAGAGCAGCCCACATTTATACAGTGCCTGTGAACGGTGGCTCTCTCAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGCAGCCCACATTTATACAGTGCCTGTGAACGGTGGCTCTCTCAC  548

seq1  TGGGATAGTTTTCCTATGTTTATTACAAATGGGTAAATGTTGGGTATTTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATAGTTTTCCTATGTTTATTACAAATGGGTAAATGTTGGGTATTTA  598

seq1  TTCCGCCTTAGCAGAGGTATGACACATTTAATATAAATCTGGGAAATGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGCCTTAGCAGAGGTATGACACATTTAATATAAATCTGGGAAATGGA  648

seq1  CACTCCTCATCCTCCGTACTCCCCAAAATAACTTTCTACCCTCTATTGTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTCATCCTCCGTACTCCCCAAAATAACTTTCTACCCTCTATTGTT  698

seq1  TTGCCCCAGTAGCCAGGGCTTCCTTGGCTTGCCTTATAAGGCTATTGTGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCCAGTAGCCAGGGCTTCCTTGGCTTGCCTTATAAGGCTATTGTGG  748

seq1  GGCTGCAAGCTCTTGCCATAGGGAGTTTTTCTTAGTGCTCCAGGCTGCCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCAAGCTCTTGCCATAGGGAGTTTTTCTTAGTGCTCCAGGCTGCCT  798

seq1  TCTGCTTAATTTTAGTTCATTATATCTGAAAAGACAGGGAGTGCTTTATG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTAATTTTAGTTCATTATATCTGAAAAGACAGGGAGTGCTTTATG  848

seq1  AGGCAAAAGGCCCAGTCATTGTGGGAAGAATGAATCACTCTAAGAACCAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAAAGGCCCAGTCATTGTGGGAAGAATGAATCACTCTAAGAACCAG  898

seq1  GAGAAGCCTGAAAGAGGAAATCAGCTGGGGGTCAGGAAGTTGGGGGTGGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGCCTGAAAGAGGAAATCAGCTGGGGGTCAGGAAGTTGGGGGTGGA  948

seq1  CAGGTCATTGAAAACACCTTCAAAATGGTCTTTCTTCTTTGTTCATTCTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCATTGAAAACACCTTCAAAATGGTCTTTCTTCTTTGTTCATTCTT  998

seq1  CCTACTAGGGAGTGGGAAATGTCTCTCTCTCTCACATTGGAGAATTC  1046
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTAGGGAGTGGGAAATGTCTCTCTCTCTCACATTGGAGAATTC  1045

seq1: chr17_81063085_81064220
seq2: B6Ng01-217G07.g_67_1196

seq1  GAATTCTTTTAAGCCTAAGAGAAAGGGGCAGCAGCTGGTGTATGTAGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTAAGCCTAAGAGAAAGGGGCAGCAGCTGGTGTATGTAGAGG  50

seq1  CAGCTTCCTCAATGAAACCACACCCAGAATTCCCAAGTCACATGCTGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCCTCAATGAAACCACACCCAGAATTCCCAAGTCACATGCTGATG  100

seq1  ACACTGTTACAGAATTACCATAATAGGTCACGTGTGAAAGATTCTGTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGTTACAGAATTACCATAATAGGTCACGTGTGAAAGATTCTGTCTT  150

seq1  CTAAGCAAGAATCAGGAATCACTGCATGGCGCGAGTCAATTTTATTGTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCAAGAATCAGGAATCACTGCATGGCGCGAGTCAATTTTATTGTTA  200

seq1  GGTGCTGGAACCACTACTGTTTTTCAAAAGGGAAATGAACAGTGTACCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGGAACCACTACTGTTTTTCAAAAGGGAAATGAACAGTGTACCTG  250

seq1  AGATAGCTTCCAAAATAAGCAACAATGTTTGGGTGTTTGCAGTCTTTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGCTTCCAAAATAAGCAACAATGTTTGGGTGTTTGCAGTCTTTCAT  300

seq1  CATAATGATTTCTTGCTGTACAACCGCAAAGTCTTCTCCTAGGACACAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATGATTTCTTGCTGTACAACCGCAAAGTCTTCTCCTAGGACACAAA  350

seq1  GCAAGCATGTTGGATAGTCAATAGGTAAAATGCTCATTTACTTTAAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCATGTTGGATAGTCAATAGGTAAAATGCTCATTTACTTTAAAACA  400

seq1  CGTGAAAGTAATTATACTTACAATTAACTATGGCACAGCTAATGAACTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAAAGTAATTATACTTACAATTAACTATGGCACAGCTAATGAACTTT  450

seq1  ATATCCAGCACAACCAATGCCTTAATGGTATTACTTCTAACAACCATTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCAGCACAACCAATGCCTTAATGGTATTACTTCTAACAACCATTTC  500

seq1  AGCCCCGGCTTGAGGAGCCCTGTACCTTGGTGAGAAAGAAGTACAGATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCGGCTTGAGGAGCCCTGTACCTTGGTGAGAAAGAAGTACAGATGC  550

seq1  GACTCCTGGGCCCTGAGTCTGTTCTCACAAAGTACTTAGCGCTGTGCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCTGGGCCCTGAGTCTGTTCTCACAAAGTACTTAGCGCTGTGCTAA  600

seq1  TGTCCTGCTCAGTAAAATAACCTCACAGGGATGAATGGGTTACTACCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGCTCAGTAAAATAACCTCACAGGGATGAATGGGTTACTACCTTC  650

seq1  AAAATGGCGGGCAGGGTAATTTCCATACGAACACTTCCTGCTAATACAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGCGGGCAGGGTAATTTCCATACGAACACTTCCTGCTAATACAGC  700

seq1  ACACCTTAGGGCATTGTTATAGGAAATATGTATTACAAAAATGGTCTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTAGGGCATTGTTATAGGAAATATGTATTACAAAAATGGTCTTCA  750

seq1  CTAGGAATACCCATTGCTTCCCCCTGTTACTAAACAACATTTGGCTGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGAATACCCATTGCTTCCCCCTGTTACTAAACAACATTTGGCTGGTT  800

seq1  GTGGTGGCACACA-CCTGTGTATAGCTGGAAAGGAAGAGGCAAGAGAATC  849
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGCACACACCCTGTGTATAGCTGGAAAGGAAGAGGCAAGAGAATC  850

seq1  ATTAAAATAGAAATTCACCATAAAGACGTGATCCTTTTTAAAGTTAGAGA  899
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAATAGAAATTCACCATAAAGACGTGATCCTTTTTAAAGTTAGAGA  900

seq1  AAGACCATTGGCCAGCAAGTGTGTGAGCTCTGCAGCACT-GGAAGGCCCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AAGACCATTGGCCAGCAAGTGTGTGAGCTCTGCAGCACTGGGAAGGCCCA  950

seq1  CACAGCGTGAGTTAAGGTGAGTCCTGTACGTAAGCATCTCCACTTGGCCT  998
      ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||
seq2  CACAGCGTGAGTTAAAGTGAGTCCTGTACGGTAGCATCTTCACTTGG-CT  999

seq1  TTCCCAACGGTGTCAGGCTAGG-AAAGACATTCCATCTACACCCGGCCAG  1047
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||
seq2  TTCCCAACGGTGTCAGGCTAGGAAAAGACATTTCATCTACACC--GGCAG  1047

seq1  GCTATTGGTCAGTCATCTGCCCTACCCTCTGCTTGGCCAAATTCTTCAAA  1097
      ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||| |||||
seq2  GCTATTGGTCAGTCATCTGCCTTACCCTCTTGCTGGCC-AATTC-TCAAA  1095

seq1  ATAAAACCTGGCAACCTTAGGGTGCCA-TCACAGGGTGGG  1136
      || ||||||||||  |||| |||| || ||||| ||||||
seq2  AT-AAACCTGGCA--CTTA-GGTGTCATTCACA-GGTGGG  1130