seq1: chr17_29069974_29070477
seq2: B6Ng01-217O13.b_53_178 (reverse)
seq1 TATG--TATATATGTATATGTATATATGTATATGTGTGTGTGTATATATA 48
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seq2 TATGTATATATATATATATGTATATATATATATACATATATATATACATA 50
seq1 TATATATACATACATATATATATATATATATATTTGAGGGGACACGATGA 98
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seq2 TATATATGTATATATATATGTATATATATAGGTTTTTCGAGACAGGGT-- 98
seq1 AAAATAACGGTTTCATTCTAATTCTCCT--ATTATTTTAATTTTGAAACC 146
| | || | || | |||| |
seq2 ---TTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGA------------------- 126
seq1 ACACAAATACCTATTCAAAGGATATATATACATATATATATATGATTTAA 196
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 TCATTTATTTTATGTGTATGAGTACATGCTGTAGCTGTATAGATGGTTGT 246
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 GAGCCTTCATCTGCTTGTTGGGAATTGAATTTAGGACTTCTGCTCACTTT 296
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 GACCCCATTACGGGCAGCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCAT 346
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 GTGGTTGTTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCGGAAGAGCAGTCAGTGCCC 396
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 TTACCTACTGAGCCATCTCTCCAACCCCCTCAAAAAATTATATATATATA 446
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 TTTGTTTGTTTTTGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCT 496
seq2 -------------------------------------------------- 126
seq1 GTCCTGGA 504
seq2 -------- 126
| seq1: chr4_4787454_4788598
seq2: B6Ng01-217O13.g_67_1239 (reverse)
seq1 TCTG-TAGGAGATTATTTTG--ATCAGGCTAATTGAGGT--AGAAAGAGG 45
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seq2 TCTGTTAGGAGGATATTTTGGATTCAGGCTAATTGAAGTTAAGAAAGAGG 50
seq1 TGCACACTG-TTGGTG-ACA-CAATTCCCTAGG-CAGGGAAT-CCTAGAC 90
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seq2 TGCACACTGTTTGGTGAACACCAATTCCCTAGGCCAGGGAATCCCTAGAC 100
seq1 GT-ATAAGA--GTGAA-GACAGTCAACTAA-GTGCTA-GGTTGCATGCAT 134
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seq2 GTAATAAGAAGGTGAAGGACAGTCAACTAAGGTGCTAGGGTGGCATGCAT 150
seq1 T-CATTACTGA-TTCCTG-ATTGTGGAGA-TGA-TGTGA-CCAGCTGCTT 178
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seq2 TCCATTACTGATTTCCTGAATTGTGGAGATTGATTGTGACCCAGCTGCTT 200
seq1 CAAGCTTCTGC-TGTGT-GGACT-CCCATAA--TCACTGCACATGAGAAT 223
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seq2 CAAGCTTCTGCTTGTGTGGGACTCCCCATAAATCCACTGCACATGAGAAT 250
seq1 TGTGAGTCAGGATTAAACCC-TTCCTCCCTTCAGTTTCTTTTGTCAGAGT 272
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seq2 TGTGAGTCAGGATTAAACCCTTTCCTCCCTTCAGTTTCTTTTGTCAGAGT 300
seq1 GTTTTATCATAGCAATGGAAAAAGAAAATGAAACAATTCTTTCTGTAGTA 322
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seq2 GTTTTATCATAGCAATGGAAAAAGAAAATGAAACAATTCTTTCTGTAGTA 350
seq1 GATGTTCAACATATCTAATCTAAAACTATACTTGGTATAGATATCTTTAC 372
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seq2 GATGTTCAACATATCTAATCTAAAACTATACTTGGTATAGATATCTTTAC 400
seq1 TCTCAAAGATTTGATTTAGTAGCATAACTAGAAATAAATAATCACTTGAA 422
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seq2 TCTCAAAGATTTGATTTAGTAGCATAACTAGAAATAAATAATCACTTGAA 450
seq1 TACCATTATTAACAAATATTTCCTGCATGGATTTCCATCAATGTTTTTGC 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACCATTATTAACAAATATTTCCTGCATGGATTTCCATCAATGTTTTTGC 500
seq1 ATACTTTGTTAGAGGAGAAAACCCTTTGTTAGATGAATATTTTATTTCAT 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATACTTTGTTAGAGGAGAAAACCCTTTGTTAGATGAATATTTTATTTCAT 550
seq1 TTTTTGAGTCACATCAGATTTTGTAGTAAGAATGCTGACATACTGATAAA 572
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seq2 TTTTTGAGTCACATCAGATTTTGTAGTAAGAATGCTGACATACTGATAAA 600
seq1 AAGCATATATTAGATTGCAAAATATATAAACTAGAAGTATTTGATGAAGT 622
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seq2 AAGCATATATTAGATTGCAAAATATATAAACTAGAAGTATTTGATGAAGT 650
seq1 CTGCTGGACACCTATAAGAGATTGGGTAATTTCAGGTAAAGTATAACAAG 672
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seq2 CTGCTGGACACCTATAAGAGATTGGGTAATTTCAGGTAAAGTATAACAAG 700
seq1 TGGGCACAGAACACAATTGTTCTAAAGTTGGTTCTAAAGTCTGGTTAGTT 722
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seq2 TGGGCACAGAACACAATTGTTCTAAAGTTGGTTCTAAAGTCTGGTTAGTT 750
seq1 TTAGTGTGTGATGTTTTCATTTATTTTCAAAATTTTTACAATAAAATATA 772
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seq2 TTAGTGTGTGATGTTTTCATTTATTTTCAAAATTTTTACAATAAAATATA 800
seq1 AAATAGAATATGATTGTTATCGAGTTGAAGGGTAAGTCTATGATTGAAAA 822
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seq2 AAATAGAATATGATTGTTATCGAGTTGAAGGGTAAGTCTATGATTGAAAA 850
seq1 GCTATTTCAAATTTGTTTTAAATTTATATAGGAGAATTGAAAATAAACTT 872
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seq2 GCTATTTCAAATTTGTTTTAAATTTATATAGGAGAATTGAAAATAAACTT 900
seq1 AGTACTTTTCATAGAGAACAACAGTTTTTGTTCTGTAATCTGTGATGAGT 922
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seq2 AGTACTTTTCATAGAGAACAACAGTTTTTGTTCTGTAATCTGTGATGAGT 950
seq1 GTTTGACTAATTTACCTCATTAACTTGAGATTATTTATTCAGTAAAAGTA 972
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seq2 GTTTGACTAATTTACCTCATTAACTTGAGATTATTTATTCAGTAAAAGTA 1000
seq1 TCTCCAGAAATGTTACAAAATATCAAGCTAGAACTTGGATTCTAATTTAT 1022
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seq2 TCTCCAGAAATGTTACAAAATATCAAGCTAGAACTTGGATTCTAATTTAT 1050
seq1 GCAATATTGTTACTAATTTTTAAACCAAAACTTGTAATGTTTAAGTATAG 1072
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seq2 GCAATATTGTTACTAATTTTTAAACCAAAACTTGTAATGTTTAAGTATAG 1100
seq1 AATATAAATATATTAATTCCAGGATGGTTTTAAAAGCTGGATGTTATATA 1122
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seq2 AATATAAATATATTAATTCCAGGATGGTTTTAAAAGCTGGATGTTATATA 1150
seq1 TTGCTGTTCATTTTAAGGAATTC 1145
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seq2 TTGCTGTTCATTTTAAGGAATTC 1173
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