BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-245G21
Chromosome17 (Build37)
Map Location 22,065,845 - 22,184,994
singlet/doubletdoublet
Overlap gene3110048L19Rik, 4930432O21Rik, LOC665820, LOC665825, LOC674332, LOC631010
Upstream geneLOC627884, Ppp2r1a, V1rf5, Zfp160, LOC627912, LOC435509, EG627924, 4933430A09, EG665654, EG665662, LOC665666, EG665669, V1rf1, V1rf2, V1rf4, V1rf3, A830058L05Rik, Zfp54, Zfp51, Zfp53, LOC100042508, Zfp52, BC049807, Zfp760, BC043476, 4930515G13Rik, 2610036F08Rik, LOC624960
Downstream geneEG665844, EG210853, LOC671007, EG240038, EG631624, 6330416L07Rik, Zfp758, 1300003B13Rik, EG210876, LOC100042656, EG628185, ENSMUSG00000046088, EG383218, EG433078, LOC100042679, A630033E08Rik, LOC671128, LOC665961, EG434701, LOC665976
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-245G21.bB6Ng01-245G21.g
ACCGA054315GA054316
length1,1621,121
definitionB6Ng01-245G21.b B6Ng01-245G21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,183,838 - 22,184,994)(22,065,845 - 22,066,960)
sequence
gaattcatcagtggatccaggcacagtcaacattgtaagattgtgacctg
acatcatcatctgcaaatttcacactcaagaactggacaatcaggtcatt
ttcaggaagtttcttattttctggatcccatttatagccatctttagccc
aaggtgccctgggctataccagatagatatgcctggaataactgataaag
tcatcactcttatgatctaggctctggaaatacccccacccccaatacag
gcccagagttgcattgctctagtttcctaggctgttcttcatctatccat
gccaacagtcagcagtagttgttgtactggctgatcttcataaacaggca
actccttctccccagagggctacaggcacaccacctacctatacctgcac
ttgtgatacacagcagacttcagtcattatgaactgctgggtgagcatgc
atagcatgggacagaaatcctaatgtagtaaggccaaggacactcccacg
ttcagtacccattggctgacctcattgtgatgtccagtggccactggcta
gagaatgttattgtccagtatcactggctgacctcatccaggtgttcagt
agccaggggctgactgcaccttgatgtccagggtttgttgctttcttctt
tgtagaaatatccctttgcatttctctctcatttttgtcccatcatccct
gtagactgctatatcaagggtgtatttagtgttaactgttttataaaccc
ttcttgctcgtctgatgtgtgtgtgtttgatttttacttgcctgggtata
cttctacttgtaataatatttataataataaatattaatgaccctccctt
ttgtttgcttagggattctgttcatgtgttcactattcaaaatcattcat
gttttctagtatttcttggttttactgctaaaagttaacctgttgtccat
ctggtcttattgcaacatggcataagctgagactgaattaaaatctgtca
atggctttcccatattctttggaattataagaagaaagaataggatgatt
ttatgatagggaagaggagttaagaagacggagaacgagccttgccttga
gagtacatgacactataggaggaagattgcctgttttgctatctgtatga
tattttctatag
gaattctaagaacacttttaaaggtaaagcatttgtcacattcactacat
ttgtaaagtttctcactagtatgaaatctctgatgaatactaagactgta
tttgtaaaaaaagcatttgtcacattcactacatttgtaaggtttctctc
cagtatgaattgtctgatgttgtctaagcttacatttcttggtgaagcat
ctggaacattcactacatctgtaaggtttctttccactattggtttgttt
cagcccaagtatttgtttagagtcaaaaaccttattaagcactgtcccat
tgtgttctttctttcctatgtggagtccttgatttagaccaatggtagaa
cacaaatttaaacagtttacacaatttttatatttgcaaggttctctggt
gtttccagtttcatgtctgtttacgtttgatgactcaacatgtgtatccc
tgaagttatcttggtaaagtacactttgggtgtattcctggatgattttg
ccatgctcataatatttataagacttcttttggatagttacatgcttgtg
aacaatatgctgtgtgtcttgatccaagccattctcatatttaggaaaaa
tgcaaagattctctgaaaaaaaaaagtacaattaaagaccatagggacta
atggataagtaagacaatatcccatgtttcctgacatttttctaatgtaa
tttaatgattctcaagaatacagctctcaaaagtggtctttttcacaatc
attacatggatgcttagaacaaccttaaatctttataacaaataacagga
aatgatagtagactcaaaacccttatttaaacagtgtattttggagaagg
tggaaaaaatagcttgagcagtaaactttgaaaaaggagcaaactaaaat
atcatatcaaattgtttctctatttgttgtttatgctttatgacagtgac
actatgtagctttggtcagctacaaactcattatatatccacattggtgt
ggaattcacattcaaagaccatgctggtgccagtaccaacatagaagacc
aacatataaaagtgaaagaaggtaacaacaaacttctcacacagctcttt
tcctcattaacctgtccattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_22183838_22184994
seq2: B6Ng01-245G21.b_44_1205 (reverse)

seq1  CTATAGAAAAATACACTACAG-TAGC-AAACAGGC-ATCTTTCCCTCCTA  47
      |||||| ||||||   ||||| |||| |||||||| |||||  |||||||
seq2  CTATAG-AAAATATCATACAGATAGCAAAACAGGCAATCTT--CCTCCTA  47

seq1  ---TGTCATGTCCTCTCAA-GCAA-GCTCTTTCTCCTTCTTCTT-ACTCC  91
         |||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||
seq2  TAGTGTCATGTACTCTCAAGGCAAGGCTCGTTCTCCGTCTTCTTAACTCC  97

seq1  TCTTCCCTATCAT-ACATCATTCCTATTCTTTCTTCTTTATAATTCCAAA  140
      ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TCTTCCCTATCATAAAATCA-TCCTATTCTTTCTTC-TTATAATTCCAAA  145

seq1  G-ATATGGG-AAGCCATTGACAGATTTTAATTCAGTCTCAGCTTATGCCA  188
      | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATGGGAAAGCCATTGACAGATTTTAATTCAGTCTCAGCTTATGCCA  195

seq1  TTGTTTGCAATAAGACCAGATGGACAACAGGTTAACTTTTAGCAGTAAAA  238
      |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T--GTTGCAATAAGACCAGATGGACAACAGGTTAACTTTTAGCAGTAAAA  243

seq1  CCAAGAAATACTAGAAAACATGAATGATTTTGAATAGTGAACACATGAAC  288
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAATACTAGAAAACATGAATGATTTTGAATAGTGAACACATGAAC  293

seq1  AGAATCCCTAAGCAAACAAAAGGGAGGGTCATTAATATTTATTATTATAA  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCCCTAAGCAAACAAAAGGGAGGGTCATTAATATTTATTATTATAA  343

seq1  ATATTATTACAAGTAGAAGTATACCCAGGCAAGTAAAAATCAAACACACA  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTATTACAAGTAGAAGTATACCCAGGCAAGTAAAAATCAAACACACA  393

seq1  CACATCAGACGAGCAAGAAGGGTTTATAAAACAGTTAACACTAAATACAC  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCAGACGAGCAAGAAGGGTTTATAAAACAGTTAACACTAAATACAC  443

seq1  CCTTGATATAGCAGTCTACAGGGATGATGGGACAAAAATGAGAGAGAAAT  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGATATAGCAGTCTACAGGGATGATGGGACAAAAATGAGAGAGAAAT  493

seq1  GCAAAGGGATATTTCTACAAAGAAGAAAGCAACAAACCCTGGACATCAAG  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGGATATTTCTACAAAGAAGAAAGCAACAAACCCTGGACATCAAG  543

seq1  GTGCAGTCAGCCCCTGGCTACTGAACACCTGGATGAGGTCAGCCAGTGAT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGTCAGCCCCTGGCTACTGAACACCTGGATGAGGTCAGCCAGTGAT  593

seq1  ACTGGACAATAACATTCTCTAGCCAGTGGCCACTGGACATCACAATGAGG  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGACAATAACATTCTCTAGCCAGTGGCCACTGGACATCACAATGAGG  643

seq1  TCAGCCAATGGGTACTGAACGTGGGAGTGTCCTTGGCCTTACTACATTAG  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCAATGGGTACTGAACGTGGGAGTGTCCTTGGCCTTACTACATTAG  693

seq1  GATTTCTGTCCCATGCTATGCATGCTCACCCAGCAGTTCATAATGACTGA  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTGTCCCATGCTATGCATGCTCACCCAGCAGTTCATAATGACTGA  743

seq1  AGTCTGCTGTGTATCACAAGTGCAGGTATAGGTAGGTGGTGTGCCTGTAG  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGCTGTGTATCACAAGTGCAGGTATAGGTAGGTGGTGTGCCTGTAG  793

seq1  CCCTCTGGGGAGAAGGAGTTGCCTGTTTATGAAGATCAGCCAGTACAACA  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGGGGAGAAGGAGTTGCCTGTTTATGAAGATCAGCCAGTACAACA  843

seq1  ACTACTGCTGACTGTTGGCATGGATAGATGAAGAACAGCCTAGGAAACTA  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTGCTGACTGTTGGCATGGATAGATGAAGAACAGCCTAGGAAACTA  893

seq1  GAGCAATGCAACTCTGGGCCTGTATTGGGGGTGGGGGTATTTCCAGAGCC  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAATGCAACTCTGGGCCTGTATTGGGGGTGGGGGTATTTCCAGAGCC  943

seq1  TAGATCATAAGAGTGATGACTTTATCAGTTATTCCAGGCATATCTATCTG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCATAAGAGTGATGACTTTATCAGTTATTCCAGGCATATCTATCTG  993

seq1  GTATAGCCCAGGGCACCTTGGGCTAAAGATGGCTATAAATGGGATCCAGA  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGCCCAGGGCACCTTGGGCTAAAGATGGCTATAAATGGGATCCAGA  1043

seq1  AAATAAGAAACTTCCTGAAAATGACCTGATTGTCCAGTTCTTGAGTGTGA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGAAACTTCCTGAAAATGACCTGATTGTCCAGTTCTTGAGTGTGA  1093

seq1  AATTTGCAGATGATGATGTCAGGTCACAATCTTACAATGTTGACTGTGCC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGCAGATGATGATGTCAGGTCACAATCTTACAATGTTGACTGTGCC  1143

seq1  TGGATCCACTGATGAATTC  1157
      |||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCACTGATGAATTC  1162

seq1: chr17_22065845_22066960
seq2: B6Ng01-245G21.g_69_1189

seq1  GAATTCTAAGAACACTTTTAAAGGTAAAGCATTTGTCACATTCACTACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGAACACTTTTAAAGGTAAAGCATTTGTCACATTCACTACAT  50

seq1  TTGTAAAGTTTCTCACTAGTATGAAATCTCTGATGAATACTAAGACTGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAAGTTTCTCACTAGTATGAAATCTCTGATGAATACTAAGACTGTA  100

seq1  TTTGTAAAAAAAGCATTTGTCACATTCACTACATTTGTAAGGTTTCTCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAAAAAAAGCATTTGTCACATTCACTACATTTGTAAGGTTTCTCTC  150

seq1  CAGTATGAATTGTCTGATGTTGTCTAAGCTTACATTTCTTGGTGAAGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGAATTGTCTGATGTTGTCTAAGCTTACATTTCTTGGTGAAGCAT  200

seq1  CTGGAACATTCACTACATCTGTAAGGTTTCTTTCCACTATTGGTTTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACATTCACTACATCTGTAAGGTTTCTTTCCACTATTGGTTTGTTT  250

seq1  CAGCCCAAGTATTTGTTTAGAGTCAAAAACCTTATTAAGCACTGTCCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAAGTATTTGTTTAGAGTCAAAAACCTTATTAAGCACTGTCCCAT  300

seq1  TGTGTTCTTTCTTTCCTATGTGGAGTCCTTGATTTAGACCAATGGTAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTCTTTCTTTCCTATGTGGAGTCCTTGATTTAGACCAATGGTAGAA  350

seq1  CACAAATTTAAACAGTTTACACAATTTTTATATTTGCAAGGTTCTCTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATTTAAACAGTTTACACAATTTTTATATTTGCAAGGTTCTCTGGT  400

seq1  GTTTCCAGTTTCATGTCTGTTTACGTTTGATGACTCAACATGTGTATCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCAGTTTCATGTCTGTTTACGTTTGATGACTCAACATGTGTATCCC  450

seq1  TGAAGTTATCTTGGTAAAGTACACTTTGGGTGTATTCCTGGATGATTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTTATCTTGGTAAAGTACACTTTGGGTGTATTCCTGGATGATTTTG  500

seq1  CCATGCTCATAATATTTATAAGACTTCTTTTGGATAGTTACATGCTTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTCATAATATTTATAAGACTTCTTTTGGATAGTTACATGCTTGTG  550

seq1  AACAATATGCTGTGTGTCTTGATCCAAGCCATTCTCATATTTAGGAAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATATGCTGTGTGTCTTGATCCAAGCCATTCTCATATTTAGGAAAAA  600

seq1  TGCAAAGATTCTCTGAAAAAAAAAAGTACAATTAAAGACCATAGGGACTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGATTCTCTGAAAAAAAAAAGTACAATTAAAGACCATAGGGACTA  650

seq1  ATGGATAAGTAAGACAATATCCCATGTTTCCTGACATTTTTCTAATGTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATAAGTAAGACAATATCCCATGTTTCCTGACATTTTTCTAATGTAA  700

seq1  TTTAATGATTCTCAAGAATACAGCTCTCAAAAGTGGTCTTTTTCACAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGATTCTCAAGAATACAGCTCTCAAAAGTGGTCTTTTTCACAATC  750

seq1  ATTACATGGATGCTTAGAACAACCTTAAATCTTTATAACAAATAACAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATGGATGCTTAGAACAACCTTAAATCTTTATAACAAATAACAGGA  800

seq1  AATGATAGTAGACTCAAAACCCTTATTTAAACAGTGTATTTTGGAGAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATAGTAGACTCAAAACCCTTATTTAAACAGTGTATTTTGGAGAAGG  850

seq1  TGGAAAAAATAGCTTGAGCAGTAAACTTTGAAAAAGGAGCAAACTAAAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAAAATAGCTTGAGCAGTAAACTTTGAAAAAGGAGCAAACTAAAAT  900

seq1  ATCATATCAAAAATTGTTTCTCTATTTTGTTGTTTATGCTTTATGACAGT  950
      ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATATC--AAATTGTTTCTCTA-TTTGTTGTTTATGCTTTATGACAGT  947

seq1  GACACTATGTAGCTTTGGTCAGCTACAAACTCATTATATAATCCACATTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GACACTATGTAGCTTTGGTCAGCTACAAACTCATTATAT-ATCCACATTG  996

seq1  GTGTGGAATTCACAATTCAAAGACCATGCT-GTGCCAGTACCAAACATAG  1049
      ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  GTGTGGAATTCAC-ATTCAAAGACCATGCTGGTGCCAGTACC-AACATAG  1044

seq1  -AGACCAACATATAAAAAAGTGAA--GAGGTAACAACAAAACTCTCCAAC  1096
       ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||  ||||  ||
seq2  AAGACCAACATAT--AAAAGTGAAAGAAGGTAACAACAAACTTCTC--AC  1090

seq1  CAACAGCTCTT-------------TCTCCATTT  1116
        |||||||||             | |||||||
seq2  --ACAGCTCTTTTCCTCATTAACCTGTCCATTT  1121