BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-272P07
Chromosome17 (Build37)
Map Location 74,383,252 - 74,645,052
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSrd5a2, Memo1, EG668716
Upstream geneLycat, LOC668709, Capn13, LOC100043666, Galnt14, Ehd3, LOC240160, Xdh
Downstream gene2810410M20Rik, LOC668773, LOC668775, Spast, Slc30a6, Nlrc4, LOC100043883, LOC624159, Yipf4, Birc6, Ttc27, LOC100043672, Ltbp1, EG621988
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-272P07.bB6Ng01-272P07.g
ACCGA074649GA074650
length9071,016
definitionB6Ng01-272P07.b B6Ng01-272P07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,383,252 - 74,384,158)(74,644,085 - 74,645,052)
sequence
gaattcacaccccttacaaagccctgtcctaggagcacgagcaaagtgag
gcaggcgtccgccctaatggatcatcattcactcatggaccactcactgg
cagtttcatgctacatgcttcatgtcatggatgtcatgaagatttctgtc
ttaacacaccccaaacaagatccctgatcccccactctccccaaacctct
ccctccccctccctctcccgctccccttccccctcccttcctctctttct
ccccccctactcccctcccttcctcctccttcctttcttctctctccctc
cctctccctctccccccacctcaggtaaattgattagcaagtgccatcat
ctctatggtagaaccttacttccaaaactcagccatatctcacccactcc
acaacccttgaattcaaatcagcactaaaatcctcctgaagaagtttgca
agatccttcgcacttggcactcacactacttccactgcagtctcttctcc
ctgtgtggcaaacccagttatgccctaagctggatcacatcgccttccct
gaaacacacctttctctccctcacatcttcctcccttccccccttccctt
ctccccctccctctccctctgccctttctccctcccttcctcaatctttc
cctctccctcttcccctacaatgcccccccttttctcacccagagaccaa
aaaaaagaaaatgtaacctcactcctatcaacaaacaaacaaaaaaaaaa
aaaattcagagaaatttctcccaccccaccactgagctgggaaaagcact
tgaagccttgtccagttgtcagagagctgaaagggagccagggctttctg
gtttttccatattctctctgtgcaagtgagactttgtggggatcttttca
tcctgac
gaattccaaggactgtggttttagttcacagaagtcttacttccttatat
ttctggaaaactagaaacctagtgtaattaatggcctggtggggttggtt
tttttgaagctcctctttttggctgctaggcctcttactgcatgactggt
aggcatgtccttggagtcatgtgttgtggttgtctcccatgtgtcttcca
cccctcccccatttccaggatcttattacgaaatcctggccagctagaac
tcactatgtaacccaggttggcttcaaatttggagtagtccttgcctcaa
gggtccaacattctgggataatattggacaccagtcctggctttgaagtc
tatttatgtcaagttgataagggcctcattttaactccattagctcttga
aaaaagttatctccaaattggcctgcagtcagatgtgggaagctggaact
ttagtatatggattttgatgagaatatagttaagctcttacgttcacaga
atgtagtaaaagtaggccatcagcgtggaaaaacaagtacaatttaaagt
tacttttcctttttttatttaataagatttgtgtagaagtacatttgttc
tgtgtttctgttgtgtatctcccagccggagaattttcatccttgggcct
tcccatcatgtgcccctgtctcgatgtgcactctccagtgtggatatata
taggactcctctgtatgatcttcgtattgaccaaaagagtaagtatatag
aaatcatagctcttaaaatagctaaagctcacttaataaagattgcaatt
taattttaagatattttaaaagatacaaatataaataatattctaaacta
aaaagttttggtaaactaatctgtatacgccagacacaaaagtggtattt
tccttcataaattacaaaaaatattgttaaaaggcactttagcctccata
ccatagtgggtttacatttatatttaggagaaaataccttgccttggtgg
ctataccatgaaagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_74383252_74384158
seq2: B6Ng01-272P07.b_45_951

seq1  GAATTCACACCCCTTACAAAGCCCTGTCCTAGGAGCACGAGCAAAGTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACCCCTTACAAAGCCCTGTCCTAGGAGCACGAGCAAAGTGAG  50

seq1  GCAGGCGTCCGCCCTAATGGATCATCATTCACTCATGGACCACTCACTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCGTCCGCCCTAATGGATCATCATTCACTCATGGACCACTCACTGG  100

seq1  CAGTTTCATGCTACATGCTTCATGTCATGGATGTCATGAAGATTTCTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTCATGCTACATGCTTCATGTCATGGATGTCATGAAGATTTCTGTC  150

seq1  TTAACACACCCCAAACAAGATCCCTGATCCCCCACTCTCCCCAAACCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACACCCCAAACAAGATCCCTGATCCCCCACTCTCCCCAAACCTCT  200

seq1  CCCTCCCCCTCCCTCTCCCGCTCCCCTTCCCCCTCCCTTCCTCTCTTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCCCTCCCTCTCCCGCTCCCCTTCCCCCTCCCTTCCTCTCTTTCT  250

seq1  CCCCCCCTACTCCCCTCCCTTCCTCCTCCTTCCTTTCTTCTCTCTCCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCTACTCCCCTCCCTTCCTCCTCCTTCCTTTCTTCTCTCTCCCTC  300

seq1  CCTCTCCCTCTCCCCCCACCTCAGGTAAATTGATTAGCAAGTGCCATCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCCCTCTCCCCCCACCTCAGGTAAATTGATTAGCAAGTGCCATCAT  350

seq1  CTCTATGGTAGAACCTTACTTCCAAAACTCAGCCATATCTCACCCACTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGGTAGAACCTTACTTCCAAAACTCAGCCATATCTCACCCACTCC  400

seq1  ACAACCCTTGAATTCAAATCAGCACTAAAATCCTCCTGAAGAAGTTTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCCTTGAATTCAAATCAGCACTAAAATCCTCCTGAAGAAGTTTGCA  450

seq1  AGATCCTTCGCACTTGGCACTCACACTACTTCCACTGCAGTCTCTTCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCTTCGCACTTGGCACTCACACTACTTCCACTGCAGTCTCTTCTCC  500

seq1  CTGTGTGGCAAACCCAGTTATGCCCTAAGCTGGATCACATCGCCTTCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGGCAAACCCAGTTATGCCCTAAGCTGGATCACATCGCCTTCCCT  550

seq1  GAAACACACCTTTCTCTCCCTCACATCTTCCTCCCTTCCCCCCTTCCCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACACACCTTTCTCTCCCTCACATCTTCCTCCCTTCCCCCCTTCCCTT  600

seq1  CTCCCCCTCCCTCTCCCTCTGCCCTTTCTCCCTCCCTTCCTCAATCTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCCTCCCTCTCCCTCTGCCCTTTCTCCCTCCCTTCCTCAATCTTTC  650

seq1  CCTCTCCCTCTTCCCCTACAATGCCCCCCC-TTTCTCACCCAGAGACCAA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCCCTCTTCCCCTACAATGCCCCCCCTTTTCTCACCCAGAGACCAA  700

seq1  GAAAAAGAAAATGTAACCTCACTCCTATCAAACAAACAAAC-AAAAAAAA  748
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  AAAAAAGAAAATGTAACCTCACTCCTATC-AACAAACAAACAAAAAAAAA  749

seq1  AAAAATTCAGAGAAATTTCTCCCACCCCACCACTGAGCTGGGAAAAGCAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTCAGAGAAATTTCTCCCACCCCACCACTGAGCTGGGAAAAGCAC  799

seq1  TTGAAGCCTTGTCCAGTTGTCAGAGAGCTGAAAGGGAGCCAGGGCTTTCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCCTTGTCCAGTTGTCAGAGAGCTGAAAGGGAGCCAGGGCTTTCT  849

seq1  GG-TTTTCCATATTCTCTCTGTGCAAGGTGAGATCTTGTGGGGAATCTTT  897
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||
seq2  GGTTTTTCCATATTCTCTCTGTGCAA-GTGAGACTTTGTGGGG-ATCTTT  897

seq1  TCATCCTGAC  907
      ||||||||||
seq2  TCATCCTGAC  907

seq1: chr17_74644085_74645052
seq2: B6Ng01-272P07.g_70_1052 (reverse)

seq1  TTTCT-CTAAATATAAATGTAA--CCACTATGGTATGGA-GCT-AAGTGC  45
      ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||
seq2  TTTCTCCTAAATATAAATGTAAACCCACTATGGTATGGAGGCTAAAGTGC  50

seq1  C-TTTAAC-ATATTTTTTGTAA-TTATG-AGGAAAATACCACTTTTGTGT  91
      | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAACAATATTTTTTGTAATTTATGAAGGAAAATACCACTTTTGTGT  100

seq1  CTGGCGTATACAGATTAG-TTACCAAAAC-TTTTAGTTTAG-ATATTA-T  137
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
seq2  CTGGCGTATACAGATTAGTTTACCAAAACTTTTTAGTTTAGAATATTATT  150

seq1  TATATTTGTATCTTTTAAAATATCTT-AAATTAAATTGCAATCTTTATTA  186
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTGTATCTTTTAAAATATCTTAAAATTAAATTGCAATCTTTATTA  200

seq1  AGTGAGCTTTAGCTA-TTTAAGAGCTATGATTTCTATATACTTACTCTTT  235
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCTTTAGCTATTTTAAGAGCTATGATTTCTATATACTTACTCTTT  250

seq1  TGGTCAATACGAAGATCATACAGAGGAGTCCTATATATATCCACACTGGA  285
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAATACGAAGATCATACAGAGGAGTCCTATATATATCCACACTGGA  300

seq1  GAGTGCACATCGAGACAGGGGCACATGATGGGAAGGCCCAAGGATGAAAA  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCACATCGAGACAGGGGCACATGATGGGAAGGCCCAAGGATGAAAA  350

seq1  TTCTCCGGCTGGGAGATACACAACAGAAACACAGAACAAATGTACTTCTA  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCGGCTGGGAGATACACAACAGAAACACAGAACAAATGTACTTCTA  400

seq1  CACAAATCTTATTAAATAAAAAAAGGAAAAGTAACTTTAAATTGTACTTG  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATCTTATTAAATAAAAAAAGGAAAAGTAACTTTAAATTGTACTTG  450

seq1  TTTTTCCACGCTGATGGCCTACTTTTACTACATTCTGTGAACGTAAGAGC  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCCACGCTGATGGCCTACTTTTACTACATTCTGTGAACGTAAGAGC  500

seq1  TTAACTATATTCTCATCAAAATCCATATACTAAAGTTCCAGCTTCCCACA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTATATTCTCATCAAAATCCATATACTAAAGTTCCAGCTTCCCACA  550

seq1  TCTGACTGCAGGCCAATTTGGAGATAACTTTTTTCAAGAGCTAATGGAGT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACTGCAGGCCAATTTGGAGATAACTTTTTTCAAGAGCTAATGGAGT  600

seq1  TAAAATGAGGCCCTTATCAACTTGACATAAATAGACTTCAAAGCCAGGAC  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGAGGCCCTTATCAACTTGACATAAATAGACTTCAAAGCCAGGAC  650

seq1  TGGTGTCCAATATTATCCCAGAATGTTGGACCCTTGAGGCAAGGACTACT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTCCAATATTATCCCAGAATGTTGGACCCTTGAGGCAAGGACTACT  700

seq1  CCAAATTTGAAGCCAACCTGGGTTACATAGTGAGTTCTAGCTGGCCAGGA  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATTTGAAGCCAACCTGGGTTACATAGTGAGTTCTAGCTGGCCAGGA  750

seq1  TTTCGTAATAAGATCCTGGAAATGGGGGAGGGGTGGAAGACACATGGGAG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCGTAATAAGATCCTGGAAATGGGGGAGGGGTGGAAGACACATGGGAG  800

seq1  ACAACCACAACACATGACTCCAAGGACATGCCTACCAGTCATGCAGTAAG  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCACAACACATGACTCCAAGGACATGCCTACCAGTCATGCAGTAAG  850

seq1  AGGCCTAGCAGCCAAAAAGAGGAGCTTCAAAAAAACCAACCCCACCAGGC  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTAGCAGCCAAAAAGAGGAGCTTCAAAAAAACCAACCCCACCAGGC  900

seq1  CATTAATTACACTAGGTTTCTAGTTTTCCAGAAATATAAGGAAGTAAGAC  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATTACACTAGGTTTCTAGTTTTCCAGAAATATAAGGAAGTAAGAC  950

seq1  TTCTGTGAACTAAAACCACAGTCCTTGGAATTC  968
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTGAACTAAAACCACAGTCCTTGGAATTC  983