BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-286E07
Chromosome17 (Build37)
Map Location 21,799,300 - 21,924,017
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp760, BC043476
Upstream geneEG433073, V1re2, V1re6, LOC100041976, V1re3, V1re1, V1re8, V1re7, V1re4, LOC627884, Ppp2r1a, V1rf5, Zfp160, LOC627912, LOC435509, EG627924, 4933430A09, EG665654, EG665662, LOC665666, EG665669, V1rf1, V1rf2, V1rf4, V1rf3, A830058L05Rik, Zfp54, Zfp51, Zfp53, LOC100042508, Zfp52, BC049807
Downstream gene4930515G13Rik, 2610036F08Rik, LOC624960, 3110048L19Rik, 4930432O21Rik, LOC665820, LOC665825, LOC674332, LOC631010, EG665844, EG210853, LOC671007, EG240038, EG631624, 6330416L07Rik, Zfp758, 1300003B13Rik, EG210876, LOC100042656, EG628185, ENSMUSG00000046088, EG383218, EG433078, LOC100042679
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-286E07.bB6Ng01-286E07.g
ACCGA084510GA084511
length1,1151,056
definitionB6Ng01-286E07.b B6Ng01-286E07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,799,300 - 21,800,416)(21,922,962 - 21,924,017)
sequence
gaattcagctcttaagatacattcgaaaattcatactggtgagaaacctt
acaaatgtatggaatgtgacaagtcctttactcataactcaaatcttaga
gcacatcagagagttcatactggagagaaaccttataaatgtacagaatg
tgacaaatcttttactaggtgctcctaccttagagcacatcagaaaattc
atacttgagagaaaccttataaatgctaagactgtgacaaacctttatcc
acctttcaaatcttagaagacatcagagagttcatactagagagaaacat
accaatgtaaatcatgtgatatagcatttatccagtattatattggctta
caaatcctaacattatacgtaatagaaacataaggatgagaaacttgtga
aagcttttaatgaagttttttaaatcttagaaaatatcacagaatttaag
ttaaaattttgcaaatgctattgtgtgaaaagttcccttccccctccctc
ttcctttgtgtgtgtgagtgtatagatgcttttgtggttgtatcattgca
ctacattgcatagtgcgcatggaggccagaagctggcaagaaatcccctg
aagctggagttaaagacatttgtgtctttgggaattttagagaattgggg
cattgattccccaatcctctaaaagattagctcttgcttttatatgctaa
tctatctctctaccccctgggcagattagcaattaaaacatcttgttcat
cttccaaaaattcataataaaattattaatcccatgcacgtttgtgagca
ccatttaatcccagcactcaacaaaggaaagaagatacctgtgaattcaa
ggttgtcttgttatggacaactcaaggacaggtagaactatataaatgtg
tctcaaaaaataataatgatgacaaatgtaataacattaaaaatatggca
gagatctctaattgttctgtacatcacaaagtttatatttctgagaaacc
atataaagttataccatatatagttccatgtcttgctctcattgggatta
tacctccccccaaatgcattgattggacaaagctatttaccttagtgcct
gaatgctgaaataaa
gaattcacattcatacaaagtaggtaaatacaaaggataagtcagggatt
ctacaagaagaacattcttacctacaaagactagattgctgtaattctcc
aatatcacatccatgtacaaagccctctgagcagagtccaggcattccca
ctcctcctgagagaagtccacagtcacatctctgaatgtcaacaaaccct
ataatggaaaattacccatttaccatgtgcagctgggggaggggggttgt
tttcttagataaaaggaaattacctaatgaattagatctaatgaattaga
gacatttttgtaatatagagaaggacaactatttaatgataaaagttttc
tagaggtactacagagatggttcagaaggaaacagcacaagatgctcttc
cataggacccacacttggttcccagcacccacatcatgctaaacaagaga
ttccacctccagttgtatcagatctaatgctttcttctgaattctgaagg
tatagcattcacaaatacattaaagcaaatatattcacagacataaaata
aaaatgaaagttaattttaataaaggatactttgagctgagcatggtggc
acatgcctttaatcccaaaacttgttaggcagaggcaggcagatctctgt
gagttcgaggctagcctgatctacaaagaaagttccaaggcattcacggc
tacacacatacacacacccacacacaaacacacaaaccaaaaaacaaaca
aacaaacaaaaacctgtcacaaaaaaaaatctaataaataagggctggag
agatggttcagcaattaagaacattgactcttcttccagaggtccttgag
tttaatttccagcaactaacatggtggtttacaaagtatctataatgggg
atccaatgccctcttctggtgtgttgagagcgcaatagtgtacttacata
cctaaataatctttttttaaaaatcaaataaaatagtcaaataatacttt
cttggaacagtcttggctctatcttggtatttcctatctctgtgaaatag
ggattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_21799300_21800416
seq2: B6Ng01-286E07.b_45_1159

seq1  GAATTCAGCTCTTAAGATACATTCGAAAATTCATACTGGTGAGAAACCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTCTTAAGATACATTCGAAAATTCATACTGGTGAGAAACCTT  50

seq1  ACAAATGTATGGAATGTGACAAGTCCTTTACTCATAACTCAAATCTTAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGTATGGAATGTGACAAGTCCTTTACTCATAACTCAAATCTTAGA  100

seq1  GCACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTACAGAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAATGTACAGAATG  150

seq1  TGACAAATCTTTTACTAGGTGCTCCTACCTTAGAGCACATCAGAAAATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAATCTTTTACTAGGTGCTCCTACCTTAGAGCACATCAGAAAATTC  200

seq1  ATACTTGAGAGAAACCTTATAAATGCTAAGACTGTGACAAACCTTTATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGAGAGAAACCTTATAAATGCTAAGACTGTGACAAACCTTTATCC  250

seq1  ACCTTTCAAATCTTAGAAGACATCAGAGAGTTCATACTAGAGAGAAACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTCAAATCTTAGAAGACATCAGAGAGTTCATACTAGAGAGAAACAT  300

seq1  ACCAATGTAAATCATGTGATATAGCATTTATCCAGTATTATATTGGCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATGTAAATCATGTGATATAGCATTTATCCAGTATTATATTGGCTTA  350

seq1  CAAATCCTAACATTATACGTAATAGAAACATAAGGATGAGAAACTTGTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCCTAACATTATACGTAATAGAAACATAAGGATGAGAAACTTGTGA  400

seq1  AAGCTTTTAATGAAGTTTTTTAAATCTTAGAAAATATCACAGAATTTAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTTTAATGAAGTTTTTTAAATCTTAGAAAATATCACAGAATTTAAG  450

seq1  TTAAAATTTTGCAAATGCTATTGTGTGAAAAGTTCCCTTCCCCCTCCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATTTTGCAAATGCTATTGTGTGAAAAGTTCCCTTCCCCCTCCCTC  500

seq1  TTCCTTTGTGTGTGTGAGTGTATAGATGCTTTTGTGGTTGTATCATTGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTGTGTGTGTGAGTGTATAGATGCTTTTGTGGTTGTATCATTGCA  550

seq1  CTACATTGCATAGTGCGCATGGAGGCCAGAAGCTGGCAAGAAATCCCCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTGCATAGTGCGCATGGAGGCCAGAAGCTGGCAAGAAATCCCCTG  600

seq1  AAGCTGGAGTTAAAGACATTTGTGTCTTTGGGAATTTTAGAGAATTGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGAGTTAAAGACATTTGTGTCTTTGGGAATTTTAGAGAATTGGGG  650

seq1  CATTGATTCCCCAATCCTCTAAAAGATTAGCTCTTGCTTTTATATGCTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATTCCCCAATCCTCTAAAAGATTAGCTCTTGCTTTTATATGCTAA  700

seq1  TCTATCTCTCTACCCCCTGGGCAGATTAGCAATTAAAACATCTTGTTCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTCTCTACCCCCTGGGCAGATTAGCAATTAAAACATCTTGTTCAT  750

seq1  CTTCCAAAAATTCATAATAAAATTATTAATCCCATGCACGTTTGTGAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAAAAATTCATAATAAAATTATTAATCCCATGCACGTTTGTGAGCA  800

seq1  CCATTTAATCCCAGCACTCAACAAAGGAAAGAAGATACCTGTGAATTCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTAATCCCAGCACTCAACAAAGGAAAGAAGATACCTGTGAATTCAA  850

seq1  GGTTGTCTTGTTATGGACAACTCAAGGACAGGTAGAACTATATAAATGTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTCTTGTTATGGACAACTCAAGGACAGGTAGAACTATATAAATGTG  900

seq1  TCTCAAAAAATAATAATGATGACAAAATGTAATAACATTAAAAATATGGC  950
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAAAAATAATAATGATGAC-AAATGTAATAACATTAAAAATATGGC  949

seq1  AGAGATCTCTAATTGTTCTGTACATCACAAAGTTTATATTTCTGAGAAAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATCTCTAATTGTTCTGTACATCACAAAGTTTATATTTCTGAGAAAC  999

seq1  CATATAAAGTTATACCATATATAGTTCCATGTCTTGCTCTTCATTGGGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  CATATAAAGTTATACCATATATAGTTCCATGTCTTGCTC-TCATTGGG-A  1047

seq1  TTATACCT-CCCCCAAATGCATTGAATTTGACAAAGCTA-TTACC-TAGT  1097
      |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||
seq2  TTATACCTCCCCCCAAATGCATTG-ATTGGACAAAGCTATTTACCTTAGT  1096

seq1  G-CTGAAATTGCTGACATAAA  1117
      | |||||  |||||| |||||
seq2  GCCTGAA--TGCTGAAATAAA  1115

seq1: chr17_21922962_21924017
seq2: B6Ng01-286E07.g_66_1121 (reverse)

seq1  CAATCATCCTATTTTCACAGAGATAGGAAATA-CAAGATAGAG-CATGAC  48
      |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||
seq2  CAATC--CCTA-TTTCACAGAGATAGGAAATACCAAGATAGAGCCAAGAC  47

seq1  TGTTCC-AGAAAGTATTATTTTGACTTATTTATTTGATTTTTAAAAAAGA  97
      |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  
seq2  TGTTCCAAGAAAGTATTA-TTTGACTATTTTATTTGATTTTTAAAAAAAG  96

seq1  TTTATTTTATGTATGTAAGTACACTATTGCGCTCTTCAAACACACCAGAA  147
       ||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||
seq2  ATTA-TTTAGGTATGTAAGTACACTATTGCGCTCT--CAACACACCAGAA  143

seq1  GAGGGCATTGGAT-CCCATTATAGATAC-TTGTAAACCACCATG-TAGTT  194
      ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  GAGGGCATTGGATCCCCATTATAGATACTTTGTAAACCACCATGTTAGTT  193

seq1  GCTGGAAATTAAACTC-AGGACCTCTGGAAGAAGAGTCAATGTTCTTAAT  243
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAAATTAAACTCAAGGACCTCTGGAAGAAGAGTCAATGTTCTTAAT  243

seq1  TGCTGAACCATCTCTCCAGCCCTTATTTATTAGATTTTTTTTTGTGACAG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAACCATCTCTCCAGCCCTTATTTATTAGATTTTTTTTTGTGACAG  293

seq1  GTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGGTTTGTGTGTTTGTGTGTGGGTGT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGGTTTGTGTGTTTGTGTGTGGGTGT  343

seq1  GTGTATGTGTGTAGCCGTGAATGCCTTGGAACTTTCTTTGTAGATCAGGC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTGTGTAGCCGTGAATGCCTTGGAACTTTCTTTGTAGATCAGGC  393

seq1  TAGCCTCGAACTCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGCCTAACAAGTTTTGGG  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTCGAACTCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGCCTAACAAGTTTTGGG  443

seq1  ATTAAAGGCATGTGCCACCATGCTCAGCTCAAAGTATCCTTTATTAAAAT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGGCATGTGCCACCATGCTCAGCTCAAAGTATCCTTTATTAAAAT  493

seq1  TAACTTTCATTTTTATTTTATGTCTGTGAATATATTTGCTTTAATGTATT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTCATTTTTATTTTATGTCTGTGAATATATTTGCTTTAATGTATT  543

seq1  TGTGAATGCTATACCTTCAGAATTCAGAAGAAAGCATTAGATCTGATACA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAATGCTATACCTTCAGAATTCAGAAGAAAGCATTAGATCTGATACA  593

seq1  ACTGGAGGTGGAATCTCTTGTTTAGCATGATGTGGGTGCTGGGAACCAAG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGGTGGAATCTCTTGTTTAGCATGATGTGGGTGCTGGGAACCAAG  643

seq1  TGTGGGTCCTATGGAAGAGCATCTTGTGCTGTTTCCTTCTGAACCATCTC  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTCCTATGGAAGAGCATCTTGTGCTGTTTCCTTCTGAACCATCTC  693

seq1  TGTAGTACCTCTAGAAAACTTTTATCATTAAATAGTTGTCCTTCTCTATA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTACCTCTAGAAAACTTTTATCATTAAATAGTTGTCCTTCTCTATA  743

seq1  TTACAAAAATGTCTCTAATTCATTAGATCTAATTCATTAGGTAATTTCCT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAAAATGTCTCTAATTCATTAGATCTAATTCATTAGGTAATTTCCT  793

seq1  TTTATCTAAGAAAACAACCCCCCTCCCCCAGCTGCACATGGTAAATGGGT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTAAGAAAACAACCCCCCTCCCCCAGCTGCACATGGTAAATGGGT  843

seq1  AATTTTCCATTATAGGGTTTGTTGACATTCAGAGATGTGACTGTGGACTT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCCATTATAGGGTTTGTTGACATTCAGAGATGTGACTGTGGACTT  893

seq1  CTCTCAGGAGGAGTGGGAATGCCTGGACTCTGCTCAGAGGGCTTTGTACA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAGGAGGAGTGGGAATGCCTGGACTCTGCTCAGAGGGCTTTGTACA  943

seq1  TGGATGTGATATTGGAGAATTACAGCAATCTAGTCTTTGTAGGTAAGAAT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTGATATTGGAGAATTACAGCAATCTAGTCTTTGTAGGTAAGAAT  993

seq1  GTTCTTCTTGTAGAATCCCTGACTTATCCTTTGTATTTACCTACTTTGTA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTCTTGTAGAATCCCTGACTTATCCTTTGTATTTACCTACTTTGTA  1043

seq1  TGAATGTGAATTC  1056
      |||||||||||||
seq2  TGAATGTGAATTC  1056