BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302I11
Chromosome17 (Build37)
Map Location 73,220,453 - 73,221,524
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneAlk, Ypel5
Downstream geneLbh, Lycat, LOC668709, Capn13, LOC100043666, Galnt14, Ehd3, LOC240160
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302I11.bB6Ng01-302I11.g
ACCGA096553GA096554
length3111,077
definitionB6Ng01-302I11.b B6Ng01-302I11.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
tagccaaatgccagtgcctggcaaatacagaagtggatgctcacagtcat
ctatcggatggaacacagggcccccaatggaggacctagagaaagtaccc
aaggagctgaaggggtctgcaaccctataggtggaacaacattatgaact
aaccagtacccccagagctcttatctctagctgcatatgtagcagaggat
ggcctagttagccatcattgggaagagaggccccttggtcttgcaaactt
tatctgccccaatacaggggaacaccagggccaagaagtgggagtggtgg
gtaggggagca

gaattccagcccctttccctccctgctgtgcccatcttaggaaccttcga
cttcaccccaggaccacactccactggcactgtatccttgtgagaagcac
aagatcaagaaaccagctacagctggtttcatctttgtgttctcagatcc
tcacaaaacattgcaactgttcaaaaaggagtgtgacaggcccgtgcagg
agggggggggagctttgtctttgccatggtagacatgaaaaccgaccttc
aatctgtgtctcagctaagtcagtttgcccattctcggctgttccctttc
gacttcgagcctgctgagatggttgcaaagaatttaatggcagaatctcc
agttgtattgttctctgtccaagctatagatagctatttaatctcatcca
gtatctatttacttacatttctgtgtgttcagctccaatggtatcactct
ctccattactagacagacccttagcagcagtgactatgcgcgtgggctag
agtgggctgaggaagtgcttgctaaataaacagtatgagagagtggtagg
aactcaggaggcagggagtaggatatttgattctgttgattcactctgat
cgctgtaggggcttgccttgtttcccaaaggaagtctgagttccagtgag
ctgagacaagagacacagtgccctgttgaaaccacccccattcatcttca
caccaacacatgaatggatttgtaccaaccctgctggctcaacttttatt
gtcgatcttttaaaaattggttctacttctttcaacatcccccaccacaa
cctcaagtcccccactaaaacttggtgttaacaacctggtaagtttcttc
ctgtgttgttctcagttgagagagacttacatataaagacatgtgactat
acctatgtgctaccatacttcagcaatgggggctgctatagcttcaggca
gaggatatatgtatgggtatgtgtatatgtatgtgtacatatatccttga
agggctcaagtgtttggctttttccaatccgatatatggtgaaaatctga
tccagctccattgggagcattcctcta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_73220453_73221524
seq2: B6Ng01-302I11.g_67_1143 (reverse)

seq1  TAGAG--ATGCT-CCAATGGACTTGGAT-AAATTTTCACCATATATC-GA  45
      |||||  ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||
seq2  TAGAGGAATGCTCCCAATGGAGCTGGATCAGATTTTCACCATATATCGGA  50

seq1  TTGGAAAAAGCAAAACACTTGTGCCTTTAAAGGATATATGTACACATACA  95
      ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAAAAGCCAAACACTTGAGCCCTTCAAGGATATATGTACACATACA  100

seq1  TATACACATACCCATACATATATCCTCTTGCCTGAAGCTATAGCAG-CCC  144
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||
seq2  TATACACATACCCATACATATATCCTC-TGCCTGAAGCTATAGCAGCCCC  149

seq1  CATTGCTG-AGTATGGTAGCACATAGGTATAGTCACATGTCTTTATATGT  193
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTGAAGTATGGTAGCACATAGGTATAGTCACATGTCTTTATATGT  199

seq1  AAGTCTCTCTCAACTGAGAACAACACAGGAAGAAACTTACCAGGTTGTTA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTCTCTCAACTGAGAACAACACAGGAAGAAACTTACCAGGTTGTTA  249

seq1  ACACCAAGTTTTTAGTGGGGGACTTGAGGTTGTGGTGGGGGATGTTGAAA  293
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAAG-TTTTAGTGGGGGACTTGAGGTTGTGGTGGGGGATGTTGAAA  298

seq1  GAAGTAGAACCAATTTTTAAAAGATCGACAATAAAAGTTGAGCCAGCAGG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGAACCAATTTTTAAAAGATCGACAATAAAAGTTGAGCCAGCAGG  348

seq1  GTTGGTACAAATCCATTCATGTGTTGGTGTGAAGATGAATGGGGGTGGTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGTACAAATCCATTCATGTGTTGGTGTGAAGATGAATGGGGGTGGTT  398

seq1  TCAACAGGGCACTGTGTCTCTTGTCTCAGCTCACTGGAACTCAGACTTCC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAGGGCACTGTGTCTCTTGTCTCAGCTCACTGGAACTCAGACTTCC  448

seq1  TTTGGGAAACAAGGCAAGCCCCTACAGCGATCAGAGTGAATCAACAGAAT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGAAACAAGGCAAGCCCCTACAGCGATCAGAGTGAATCAACAGAAT  498

seq1  CAAATATCCTACTCCCTGCCTCCTGAGTTCCTACCACTCTCTCATACTGT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATATCCTACTCCCTGCCTCCTGAGTTCCTACCACTCTCTCATACTGT  548

seq1  TTATTTAGCAAGCACTTCCTCAGCCCACTCTAGCCCACGCGCATAGTCAC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAGCAAGCACTTCCTCAGCCCACTCTAGCCCACGCGCATAGTCAC  598

seq1  TGCTGCTAAGGGTCTGTCTAGTAATGGAGAGAGTGATACCATTGGAGCTG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTAAGGGTCTGTCTAGTAATGGAGAGAGTGATACCATTGGAGCTG  648

seq1  AACACACAGAAATGTAAGTAAATAGATACTGGATGAGATTAAATAGCTAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACAGAAATGTAAGTAAATAGATACTGGATGAGATTAAATAGCTAT  698

seq1  CTATAGCTTGGACAGAGAACAATACAACTGGAGATTCTGCCATTAAATTC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGCTTGGACAGAGAACAATACAACTGGAGATTCTGCCATTAAATTC  748

seq1  TTTGCAACCATCTCAGCAGGCTCGAAGTCGAAAGGGAACAGCCGAGAATG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAACCATCTCAGCAGGCTCGAAGTCGAAAGGGAACAGCCGAGAATG  798

seq1  GGCAAACTGACTTAGCTGAGACACAGATTGAAGGTCGGTTTTCATGTCTA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAACTGACTTAGCTGAGACACAGATTGAAGGTCGGTTTTCATGTCTA  848

seq1  CCATGGCAAAGACAAAGCTCCCCCCCCCTCCTGCACGGGCCTGTCACACT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGCAAAGACAAAGCTCCCCCCCCCTCCTGCACGGGCCTGTCACACT  898

seq1  CCTTTTTGAACAGTTGCAATGTTTTGTGAGGATCTGAGAACACAAAGATG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTGAACAGTTGCAATGTTTTGTGAGGATCTGAGAACACAAAGATG  948

seq1  AAACCAGCTGTAGCTGGTTTCTTGATCTTGTGCTTCTCACAAGGATACAG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAGCTGTAGCTGGTTTCTTGATCTTGTGCTTCTCACAAGGATACAG  998

seq1  TGCCAGTGGAGTGTGGTCCTGGGGTGAAGTCGAAGGTTCCTAAGATGGGC  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGTGGAGTGTGGTCCTGGGGTGAAGTCGAAGGTTCCTAAGATGGGC  1048

seq1  ACAGCAGGGAGGGAAAGGGGCTGGAATTC  1072
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGGGAGGGAAAGGGGCTGGAATTC  1077


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |