BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-310L09
Chromosome17 (Build37)
Map Location 93,545,320 - 93,665,880
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdcyap1
Upstream geneEG640442, LOC627395, LOC676141, LOC668877, LOC100043746, LOC100043747, LOC100043748, LOC100043907
Downstream geneLOC676157, LOC627503
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-310L09.bB6Ng01-310L09.g
ACCGA102617GA102618
length1,0751,121
definitionB6Ng01-310L09.b B6Ng01-310L09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,664,814 - 93,665,880)(93,545,320 - 93,546,442)
sequence
gaattctgtgttgccttaggcttcacagaggtgttatttcactatgtcca
tcactaaagtctttgttacatcattgtaagtcttatttgtggtttcctaa
cttctaagtgagaacccaaatctgtggagggttaaatcagaggctaaata
actttaattcaccctcctgctctaccccaccctcagcactgccattctca
cctaaagctccacggcccttgaaatgttgcctttagaataaaatcttgct
aaaagtacatacacagatactttcagtctgaaatttcttccatgctttcc
atgtctaactgacagaagtgcagtcagtaaatgctcactgaataagcaag
gacacactttgaaaaacttaaatgtaagaaaattgcattactctaaaagc
aatatgtaaataatcattattatcgttaaaagttttccaacataattaca
tgaaaaccttatagtacacaagagttcataaaggtgctgttcccaaaagc
caaactgtggaaatacccaaatactcattaccccatgagaataaatacaa
tgaggtagatccatatgatagcatagtattcagttattaaagaagcaggt
atagtatgctgaataaatgaaacacttgaaatgacccatgttataacctg
gatgaaccttttagcacctcatgtttctaggagctggagagacagctcag
atgttaaaagcactccttgttcttccttaggacctgagttcagtacccag
aactcacattaggtacctcacaaccacctgtaacaccaattctaaggtat
ctgataccctattttttttcagcatcaccacatacatgatgtacattttt
cacaaatgtgcgcgcgcgtgtgcgcgcacacacacacacacacacaatta
acttaaaaagatgtattggatccccaccatcaaacctctgacagtaacca
aatttggataatgtctttacatggtgatcaaattaatgaggtcatcagaa
tgagtcctagaccaacagagtcagtgtcctggtgggaggggtaaacatta
gcataggaaaagaatgtcctgaaaa

gaattcagttctttgtttcctcaaaggctagttacaatgtttccacaaca
tgctaaagctattcttgatagaataactcttgtcaaagtcaatggttgaa
tttctggctcttcctccttgacctctcttgggaatttgctgtcactggcc
ttcttcatccttcagctgtgtcttcaattctgacacgactcttcagactc
tcatctagtcctcagtttacatttccaggaactatgagcttgctgtgtgt
gcatatgtgataagctccaaagaagtgccagctactacaagtttgcatca
atttttctcatggaatactttgctcaatctgatgaaaaagatatttgcac
ttccatttgacaagaggaatgcaaccctcagagaggttaaatatatgggt
caatgagcagcaagggacagattcagtcccagggacctggctgtttggag
gggaatctcttgttctctggtgcttcttggagttaagcctttccaaccct
ttctaaccctaaccctgatgctgcccacagtttcttctcttcatttcccc
agtaagaaaacatgacaaaggcaacttatagaagaaattggggcttcaca
tttcagaaggatagagtccatgtccgtgatggtggggcacacgggagctg
gcaggcagaaacggtgctggagtaataactgacaacttacatcttgagac
acaactatgaagcacagaaagctaagtggggatggcaccagcttttgaaa
ccttaaaccctgacttcctcccatcagtggcacatcttttccaactgggg
aacaagtattcaaacatatgagcctatgaggacaattctcattcaaacta
ccacagcttcgttattgtttttctgccttcactaaaagataagttccttg
aggtcaactcatttgtttagagactatggctattcatatacatacattgt
gcactgggcaaggaagcgctagctgaggtagaagaatgggctaaaatata
gtttttctatatttgctcccagagtgctgtctttttaaaatgatttagca
ataaatttagctgattagtgcgctgcatatatctttgctcaatagtatat
ttcaggaagacttaaaacagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_93664814_93665880
seq2: B6Ng01-310L09.b_46_1120 (reverse)

seq1  TTTTCAGGACATTCTTT--CTATGCTAATGTTTA-CCCTCC--ACAGGAC  45
      |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||||||
seq2  TTTTCAGGACATTCTTTTCCTATGCTAATGTTTACCCCTCCCACCAGGAC  50

seq1  ACTGACTCTGTTGGTCTAGGACTCATTCTGATGACCTCATTAATTTGATC  95
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACTCTGTTGGTCTAGGACTCATTCTGATGACCTCATTAATTTGATC  100

seq1  A-CATGTAAAGACATTATCCAAATTTGGTTACTGTCAGAGGTTTGATGGT  144
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTAAAGACATTATCCAAATTTGGTTACTGTCAGAGGTTTGATGGT  150

seq1  GGGGATCCAATACATCTTTTTAAGTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATCCAATACATCTTTTTAAGTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC  200

seq1  GCGCACACGCGCGCGCACATTTGTG-AAAATGTACATCATGTATGTGGTG  243
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCACACGCGCGCGCACATTTGTGAAAAATGTACATCATGTATGTGGTG  250

seq1  ATGCTG-AAAAAAATAGGGTATCAGATACCTTAGAATTGGTGTTACAGGT  292
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGAAAAAAAATAGGGTATCAGATACCTTAGAATTGGTGTTACAGGT  300

seq1  GGTTGTGAGGTACCTAATGTGAGTTCTGGGTACTGAACTCAGGTCCTAAG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTGAGGTACCTAATGTGAGTTCTGGGTACTGAACTCAGGTCCTAAG  350

seq1  GAAGAACAAGGAGTGCTTTTAACATCTGAGCTGTCTCTCCAGCTCCTAGA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACAAGGAGTGCTTTTAACATCTGAGCTGTCTCTCCAGCTCCTAGA  400

seq1  AACATGAGGTGCTAAAAGGTTCATCCAGGTTATAACATGGGTCATTTCAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGAGGTGCTAAAAGGTTCATCCAGGTTATAACATGGGTCATTTCAA  450

seq1  GTGTTTCATTTATTCAGCATACTATACCTGCTTCTTTAATAACTGAATAC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCATTTATTCAGCATACTATACCTGCTTCTTTAATAACTGAATAC  500

seq1  TATGCTATCATATGGATCTACCTCATTGTATTTATTCTCATGGGGTAATG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTATCATATGGATCTACCTCATTGTATTTATTCTCATGGGGTAATG  550

seq1  AGTATTTGGGTATTTCCACAGTTTGGCTTTTGGGAACAGCACCTTTATGA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTGGGTATTTCCACAGTTTGGCTTTTGGGAACAGCACCTTTATGA  600

seq1  ACTCTTGTGTACTATAAGGTTTTCATGTAATTATGTTGGAAAACTTTTAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTGTGTACTATAAGGTTTTCATGTAATTATGTTGGAAAACTTTTAA  650

seq1  CGATAATAATGATTATTTACATATTGCTTTTAGAGTAATGCAATTTTCTT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATAATAATGATTATTTACATATTGCTTTTAGAGTAATGCAATTTTCTT  700

seq1  ACATTTAAGTTTTTCAAAGTGTGTCCTTGCTTATTCAGTGAGCATTTACT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTAAGTTTTTCAAAGTGTGTCCTTGCTTATTCAGTGAGCATTTACT  750

seq1  GACTGCACTTCTGTCAGTTAGACATGGAAAGCATGGAAGAAATTTCAGAC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCACTTCTGTCAGTTAGACATGGAAAGCATGGAAGAAATTTCAGAC  800

seq1  TGAAAGTATCTGTGTATGTACTTTTAGCAAGATTTTATTCTAAAGGCAAC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTATCTGTGTATGTACTTTTAGCAAGATTTTATTCTAAAGGCAAC  850

seq1  ATTTCAAGGGCCGTGGAGCTTTAGGTGAGAATGGCAGTGCTGAGGGTGGG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAAGGGCCGTGGAGCTTTAGGTGAGAATGGCAGTGCTGAGGGTGGG  900

seq1  GTAGAGCAGGAGGGTGAATTAAAGTTATTTAGCCTCTGATTTAACCCTCC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGCAGGAGGGTGAATTAAAGTTATTTAGCCTCTGATTTAACCCTCC  950

seq1  ACAGATTTGGGTTCTCACTTAGAAGTTAGGAAACCACAAATAAGACTTAC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTTGGGTTCTCACTTAGAAGTTAGGAAACCACAAATAAGACTTAC  1000

seq1  AATGATGTAACAAAGACTTTAGTGATGGACATAGTGAAATAACACCTCTG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATGTAACAAAGACTTTAGTGATGGACATAGTGAAATAACACCTCTG  1050

seq1  TGAAGCCTAAGGCAACACAGAATTC  1067
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCCTAAGGCAACACAGAATTC  1075


seq1: chr17_93545320_93546442
seq2: B6Ng01-310L09.g_64_1184

seq1  GAATTCAGTTCTTTGTTTCCTCAAAGGCTAGTTACAATGTTTCCACAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCTTTGTTTCCTCAAAGGCTAGTTACAATGTTTCCACAACA  50

seq1  TGCTAAAGCTATTCTTGATAGAATAACTCTTGTCAAAGTCAATGGTTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAAGCTATTCTTGATAGAATAACTCTTGTCAAAGTCAATGGTTGAA  100

seq1  TTTCTGGCTCTTCCTCCTTGACCTCTCTTGGGAATTTGCTGTCACTGGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGCTCTTCCTCCTTGACCTCTCTTGGGAATTTGCTGTCACTGGCC  150

seq1  TTCTTCATCCTTCAGCTGTGTCTTCAATTCTGACACGACTCTTCAGACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCATCCTTCAGCTGTGTCTTCAATTCTGACACGACTCTTCAGACTC  200

seq1  TCATCTAGTCCTCAGTTTACATTTCCAGGAACTATGAGCTTGCTGTGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTAGTCCTCAGTTTACATTTCCAGGAACTATGAGCTTGCTGTGTGT  250

seq1  GCATATGTGATAAGCTCCAAAGAAGTGCCAGCTACTACAAGTTTGCATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATGTGATAAGCTCCAAAGAAGTGCCAGCTACTACAAGTTTGCATCA  300

seq1  ATTTTTCTCATGGAATACTTTGCTCAATCTGATGAAAAAGATATTTGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCTCATGGAATACTTTGCTCAATCTGATGAAAAAGATATTTGCAC  350

seq1  TTCCATTTGACAAGAGGAATGCAACCCTCAGAGAGGTTAAATATATGGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTTGACAAGAGGAATGCAACCCTCAGAGAGGTTAAATATATGGGT  400

seq1  CAATGAGCAGCAAGGGACAGATTCAGTCCCAGGGACCTGGCTGTTTGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGCAGCAAGGGACAGATTCAGTCCCAGGGACCTGGCTGTTTGGAG  450

seq1  GGGAATCTCTTGTTCTCTGGTGCTTCTTGGAGTTAAGCCTTTCCAACCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATCTCTTGTTCTCTGGTGCTTCTTGGAGTTAAGCCTTTCCAACCCT  500

seq1  TTCTAACCCTAACCCTGATGCTGCCCACAGTTTCTTCTCTTCATTTCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACCCTAACCCTGATGCTGCCCACAGTTTCTTCTCTTCATTTCCCC  550

seq1  AGTAAGAAAACATGACAAAGGCAACTTATAGAAGAAATTGGGGCTTCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGAAAACATGACAAAGGCAACTTATAGAAGAAATTGGGGCTTCACA  600

seq1  TTTCAGAAGGATAGAGTCCATGTCCGTGATGGTGGGGCACACGGGAGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAAGGATAGAGTCCATGTCCGTGATGGTGGGGCACACGGGAGCTG  650

seq1  GCAGGCAGAAACGGTGCTGGAGTAATAACTGACAACTTACATCTTGAGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCAGAAACGGTGCTGGAGTAATAACTGACAACTTACATCTTGAGAC  700

seq1  ACAACTATGAAGCACAGAAAGCTAAGTGGGGATGGCACCAGCTTTTGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTATGAAGCACAGAAAGCTAAGTGGGGATGGCACCAGCTTTTGAAA  750

seq1  CCTTAAACCCTGACTTCCTCCCATCAGTGGCACATCTTTTCCAACTGGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAACCCTGACTTCCTCCCATCAGTGGCACATCTTTTCCAACTGGGG  800

seq1  AACAAGTATTCAAACATATGAGCCTATGAGGACAATTCTCATTCAAACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTATTCAAACATATGAGCCTATGAGGACAATTCTCATTCAAACTA  850

seq1  CCACAGCTTCGTTATTGTTTTTCTGCCTTCACTAAAAGATAAGTTCCTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCTTCGTTATTGTTTTTCTGCCTTCACTAAAAGATAAGTTCCTTG  900

seq1  AGGTCAACTCATTTGTTTAGAGACTATGGCTATTCATATACATACATTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAACTCATTTGTTTAGAGACTATGGCTATTCATATACATACATTGT  950

seq1  GCACTGGGCAAGGAAGCGCTAGCTGAGGTAGAAGAATGGGCTAAAATATA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGGGCAAGGAAGCGCTAGCTGAGGTAGAAGAATGGGCTAAAATATA  1000

seq1  GTTTTTCTATATTTGCTCCCAGAAGTGCTGTCTTTTAAAAATGATTTAGG  1050
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
seq2  GTTTTTCTATATTTGCTCCCAG-AGTGCTGTCTTTTTAAAATGATTTA-G  1048

seq1  CATAAAATTTAGGCTGA-TAGTGCGCTTGGCATATATC-TTGCTCAATAG  1098
      ||  ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||
seq2  CAATAAATTTA-GCTGATTAGTGCGCT--GCATATATCTTTGCTCAATAG  1095

seq1  TTATATTTCCAG-AGAC-TAAAACAGG  1123
       ||||||||  | |||| |||||||||
seq2  -TATATTTCAGGAAGACTTAAAACAGG  1121


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |