BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-319A15
Chromosome17 (Build37)
Map Location 68,137,584 - 68,279,059
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLama1, Arhgap28
Upstream genePtprm, Lrrc30
Downstream geneD930040M24Rik, EG622645
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-319A15.bB6Ng01-319A15.g
ACCGA108773GA108774
length1,0101,113
definitionB6Ng01-319A15.b B6Ng01-319A15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,278,045 - 68,279,059)(68,137,584 - 68,138,713)
sequence
gaattctttagagtgataaaatgtatgcttctttcattttttaacaaaga
agagaaaatataagtaccaaacagtgctaaactgcctttctaatggtaaa
ctgttgtatgcatgtatgtatgtacatatatatatacacacatatgtaca
tacatacacatttatatataaacacatgtgtgtacacaatgtatacatat
acatattcatgtacacacacatatatatgtgtgtatatacacactcattc
atatatatatatatatatatatacacacacacacacatacatatatatat
atatatgagaatgaaaatgagagtgtggtatggggttcctggtttatccc
acagagaattgattatggttcagttaccaagtttatttgagttgcctaaa
ggaacccagtgagcatgaggagtcattgtcttaacagagtggccagtttg
gcttccctgtgttttctttcctttataggtgtaagctgcagtgagccttg
atttgtgtttctgtcagcttcagaactcaagagaaattgttacttagtaa
aactggcttgttggttcctaataggaaaatggagagagagtgtctccacc
atccctctacgtatcctgtggacagaagtctgccccagttgcttgggcta
aagtgttctgtgggctatcttcggtgacttgtgttgtcagagatcctgtc
tttcagagttccttgtgaatgcttgagattgtttctagctatctgatggt
tgtattccacaagtagctttccctttgtggatcagaacgtgagcctctga
agtctgaagtcacgcggtcaagtcaacttttcaattggaaatttcctttc
gcgtacgagaaaggctaagcaggttctatggctgtctggatacatgtgca
gagcaaccgaagtttatctcatgtactttcacctgatacgtttcctgtgc
ttgtctgtttttgaagacttaactaaagctagagtggatcagcagctccc
ttctctctag
gaattcactggagttaccctatacctgtttccccagtagggagcatgcag
tacgggtgatatacctgcccggggaagccattagaaattcagtatccttt
gctttactgggcgctggtcatccatagagctcatctgaatgccagactcc
cagcaggaacttagtgctcatctgaatgccagactcccggcaggaactca
gtgcttggactcccggcaggaacttagtgctcatctgaatgccagactcc
ctgcaggaactcagtgcttggactcccggcaggaacttagtgctcatctg
aatgccagactcccggcaggaactcagtgcttgtccacaatctcctggct
tgcacagtggagccactcactgtcgtatcagtgggaggagtgtgtcgata
cttacaaccttacccactggcctcgctgaagacagcttactccagcttgc
catgtgaccttgtctccacacactgcagatgatcccgggcagctgagtgg
accatttcctcctgttggcgagccaacaagtgttcaaagataacttcaat
acagaaatgtgttctgagatgagtgtaggaggggcagcatgtaccaatgg
gaccagctctttactgcctgtcttcctgtttcaggatactgatgtgcata
gagagtttccagggagtgggtagactgaggagtagaccggagcatgctat
tcttgtggagtctgcttggtgggattgcaaaaattcatgggattgcaaag
aacagcaatctaaggggaaaccacttattctccatggcttcacaagaagc
taagagtgtgatgtcaccgatccagttcatgtgattgaggccactgatca
cgtttagaaaggaatagagggaagtctcctacatagacagtagcacgcct
ttaatttcagcacttgggaggcagagacggatgggggtcgaggttagaca
aattaatccttctggtgtttgaggctagcctggtctacagagtgagttca
ggcctagcagaacacattataagatctatctcagaatagaacatggataa
tatagagagggcaatttttcttattactaagccttggtttatcatgcgac
atggcatctttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_68278045_68279059
seq2: B6Ng01-319A15.b_48_1057 (reverse)

seq1  CTAGAGAGAAGGGAGCTGCTGATCCACTCTTAGCTTTAGTTAAGTCTTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  CTAGAGAGAAGGGAGCTGCTGATCCACTC-TAGCTTTAGTTAAGTCTTCA  49

seq1  AAAACAGACAAAGCAACAGGAAA-GTATCAGGTGAAAGTACATGAAGATA  99
      ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| 
seq2  AAAACAGAC-AAGC-ACAGGAAACGTATCAGGTGAAAGTACATG-AGAT-  95

seq1  AAACTTCGGTTGCTCTGCACATGTATCCAGACAGCCATAGAAACCTGCTT  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAACTTCGGTTGCTCTGCACATGTATCCAGACAGCCATAG-AACCTGCTT  144

seq1  AGCCTTTCTCGTACGCGAAAGGAAATTTCCAATTGAAAAGTTGACTTGAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTCTCGTACGCGAAAGGAAATTTCCAATTGAAAAGTTGACTTGAC  194

seq1  CGCGTGACTTCAGACTTCAGAGGCTCACGTTCTGATCCACAAAGGGAAAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGTGACTTCAGACTTCAGAGGCTCACGTTCTGATCCACAAAGGGAAAG  244

seq1  CTACTTGTGGAATACAACCATCAGATAGCTAGAAACAATCTCAAGCATTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTGTGGAATACAACCATCAGATAGCTAGAAACAATCTCAAGCATTC  294

seq1  ACAAGGAACTCTGAAAGACAGGATCTCTGACAACACAAGTCACCGAAGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGAACTCTGAAAGACAGGATCTCTGACAACACAAGTCACCGAAGAT  344

seq1  AGCCCACAGAACACTTTAGCCCAAGCAACTGGGGCAGACTTCTGTCCACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCACAGAACACTTTAGCCCAAGCAACTGGGGCAGACTTCTGTCCACA  394

seq1  GGATACGTAGAGGGATGGTGGAGACACTCTCTCTCCATTTTCCTATTAGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACGTAGAGGGATGGTGGAGACACTCTCTCTCCATTTTCCTATTAGG  444

seq1  AACCAACAAGCCAGTTTTACTAAGTAACAATTTCTCTTGAGTTCTGAAGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACAAGCCAGTTTTACTAAGTAACAATTTCTCTTGAGTTCTGAAGC  494

seq1  TGACAGAAACACAAATCAAGGCTCACTGCAGCTTACACCTATAAAGGAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGAAACACAAATCAAGGCTCACTGCAGCTTACACCTATAAAGGAAA  544

seq1  GAAAACACAGGGAAGCCAAACTGGCCACTCTGTTAAGACAATGACTCCTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACACAGGGAAGCCAAACTGGCCACTCTGTTAAGACAATGACTCCTC  594

seq1  ATGCTCACTGGGTTCCTTTAGGCAACTCAAATAAACTTGGTAACTGAACC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCACTGGGTTCCTTTAGGCAACTCAAATAAACTTGGTAACTGAACC  644

seq1  ATAATCAATTCTCTGTGGGATAAACCAGGAACCCCATACCACACTCTCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCAATTCTCTGTGGGATAAACCAGGAACCCCATACCACACTCTCAT  694

seq1  TTTCATTCTCATATATATATATATATGTATGTGTGTGTGTGTGTATATAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTCTCATATATATATATATATGTATGTGTGTGTGTGTGTATATAT  744

seq1  ATATATATATATATATGAATGAGTGTGTATATACACACATATATATGTGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATGAATGAGTGTGTATATACACACATATATATGTGT  794

seq1  GTGTACATGAATATGTATATGTATACATTGTGTACACACATGTGTTTATA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTACATGAATATGTATATGTATACATTGTGTACACACATGTGTTTATA  844

seq1  TATAAATGTGTATGTATGTACATATGTGTGTATATATATATGTACATACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATGTGTATGTATGTACATATGTGTGTATATATATATGTACATACA  894

seq1  TACATGCATACAACAGTTTACCATTAGAAAGGCAGTTTAGCACTGTTTGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCATACAACAGTTTACCATTAGAAAGGCAGTTTAGCACTGTTTGG  944

seq1  TACTTATATTTTCTCTTCTTTGTTAAAAAATGAAAGAAGCATACATTTTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTATATTTTCTCTTCTTTGTTAAAAAATGAAAGAAGCATACATTTTA  994

seq1  TCACTCTAAAGAATTC  1015
      ||||||||||||||||
seq2  TCACTCTAAAGAATTC  1010

seq1: chr17_68137584_68138713
seq2: B6Ng01-319A15.g_65_1177

seq1  GAATTCACTGGAGTTACCCTATACCTGTTTCCCCAGTAGGGAGCATGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGGAGTTACCCTATACCTGTTTCCCCAGTAGGGAGCATGCAG  50

seq1  TACGGGTGATATACCTGCCCGGGGAAGCCATTAGAAATTCAGTATCCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGGGTGATATACCTGCCCGGGGAAGCCATTAGAAATTCAGTATCCTTT  100

seq1  GCTTTACTGGGCGCTGGTCATCCATAGAGCTCATCTGAATGCCAGACTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTACTGGGCGCTGGTCATCCATAGAGCTCATCTGAATGCCAGACTCC  150

seq1  CAGCAGGAACTTAGTGCTCATCTGAATGCCAGACTCCCGGCAGGAACTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGGAACTTAGTGCTCATCTGAATGCCAGACTCCCGGCAGGAACTCA  200

seq1  GTGCTTGGACTCCCGGCAGGAACTTAGTGCTCATCTGAATGCCAGACTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTGGACTCCCGGCAGGAACTTAGTGCTCATCTGAATGCCAGACTCC  250

seq1  CTGCAGGAACTCAGTGCTTGGACTCCCGGCAGGAACTTAGTGCTCATCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGGAACTCAGTGCTTGGACTCCCGGCAGGAACTTAGTGCTCATCTG  300

seq1  AATGCCAGACTCCCGGCAGGAACTCAGTGCTTGTCCACAATCTCCTGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCAGACTCCCGGCAGGAACTCAGTGCTTGTCCACAATCTCCTGGCT  350

seq1  TGCACAGTGGAGCCACTCACTGTCGTATCAGTGGGAGGAGTGTGTCGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGTGGAGCCACTCACTGTCGTATCAGTGGGAGGAGTGTGTCGATA  400

seq1  CTTACAACCTTACCCACTGGCCTCGCTGAAGACAGCTTACTCCAGCTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAACCTTACCCACTGGCCTCGCTGAAGACAGCTTACTCCAGCTTGC  450

seq1  CATGTGACCTTGTCTCCACACACTGCAGATGATCCCGGGCAGCTGAGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGACCTTGTCTCCACACACTGCAGATGATCCCGGGCAGCTGAGTGG  500

seq1  ACCATTTCCTCCTGTTGGCGAGCCAACAAGTGTTCAAAGATAACTTCAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTTCCTCCTGTTGGCGAGCCAACAAGTGTTCAAAGATAACTTCAAT  550

seq1  ACAGAAATGTGTTCTGAGATGAGTGTAGGAGGGGCAGCATGTACCAATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAATGTGTTCTGAGATGAGTGTAGGAGGGGCAGCATGTACCAATGG  600

seq1  GACCAGCTCTTTACTGCCTGTCTTCCTGTTTCAGGATACTGATGTGCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGCTCTTTACTGCCTGTCTTCCTGTTTCAGGATACTGATGTGCATA  650

seq1  GAGAGTTTCCAGGGAGTGGGTAGACTGAGGAGTAGACCGGAGCATGCTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTTTCCAGGGAGTGGGTAGACTGAGGAGTAGACCGGAGCATGCTAT  700

seq1  TCTTGTGGAGTCTGCTTGGTGGGATTGCAAAAATTCATGGGATTGCAAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGGAGTCTGCTTGGTGGGATTGCAAAAATTCATGGGATTGCAAAG  750

seq1  AACAGCAATCTAAGGGGAAACCACTTATTCTCCATGGCTTCACAAGAAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCAATCTAAGGGGAAACCACTTATTCTCCATGGCTTCACAAGAAGC  800

seq1  TAAGAGTGTGATGTCACCGATCCAGTTCATGTGATTGAGGCCACTGATCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGTGTGATGTCACCGATCCAGTTCATGTGATTGAGGCCACTGATCA  850

seq1  CGTTTAGAAAGGAATAGAGGGAAGTCTCCTACATAGACAGTAGCACGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTAGAAAGGAATAGAGGGAAGTCTCCTACATAGACAGTAGCACGCCT  900

seq1  TTAATTTCAGCACTTGGGAGGCAGAGACGGAT-GGGGTCGAGGTTAGACA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTAATTTCAGCACTTGGGAGGCAGAGACGGATGGGGGTCGAGGTTAGACA  950

seq1  AATTAATCCCTCT-GTGTTTGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCC  998
      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AATTAATCCTTCTGGTGTTTGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCA  1000

seq1  AGGCTAGCCAGGACAACATATTAAGATCCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAC  1048
       | |||| ||| || ||||  |||||| |||||||| || | ||      
seq2  GGCCTAG-CAGAAC-ACATTATAAGAT-CTATCTCAGAATAGAA------  1041

seq1  AATGAATAAATAAATAAGAGAGGGCAATTCTTTCTTATTTACTAAACCTT  1098
       ||| || ||||    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||
seq2  CATGGAT-AATA---TAGAGAGGGCAATT-TTTCTTA-TTACTAAGCCTT  1085

seq1  GTGTTTATCAATGGTGACAATTGCATCTTTTA  1130
      | ||||||||   | ||| || ||||||||||
seq2  G-GTTTATCA--TGCGAC-ATGGCATCTTTTA  1113