BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-119P12.T7 (MSMg01no119_p12.b1) | MSMg01-119P12.TJ (MSMg01no119_p12.g1) |
ACC | AG330456 | AG330457 |
length | 709 | 703 |
length of high quality (start - end) | 662 (48 - 709) | 494 (76 - 569) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no119_p12.b1 PHD_FILE: MSMg01no119_p12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:27:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no119_p12.g1 PHD_FILE: MSMg01no119_p12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:27:16 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NATTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCCCCTATAGCGAGGCATAGAAGCTTCACAGGACCAAGGGCCTCT
CTTCACATTGATGACTGACTAGGCCATCCTCTGCTACACATGCAGCTAGA
GCCACGAGTCCCACCATGTGTTTTCTTTGATTGGTGGTTTAGTCCCAGGG
AGCTCTGGGAGTACTGGTTAGTTCCTATTGTTGATCCTCCTACTGGGCTG
CAAACTCTTTCAGCTCCTTGGTTACTTTCTCTAGCTCCTTCATTGGGGAA
CCTGTGCTCCTGTGTACCTCCAGTGTTTGGCAATTCTTAAGATGCAAGGT
GACTATTTCTGTTCATAGATCTTCCATAGTAGATTCATCTTTAGAACTTC
CAGAGAGGGCATTCAAAATCTCAGCAAGATAAGAGCTATAGGTTGGTAGA
ACTTAAGAAGTTACCATACATGCTACCTTTCCATGTGCTTCTGTGTATTG
TAATCAATACCCTTCTTTGTATGATTTCATTATTTAAATTTATTTCTTCT
GGCACTTCATTTTTCCTCTGATTTCTCTAAGTTCCCATCTAGTATGGGGG
CCAGTTCTAGACATAAGAGACTTTGCCAAAGTGTCTGCCTCTATTATATC
ATGCAGTTTGTATGATTTTAAGTTCTTGAGGACCGTACAGCTCTCACAGT
TCTTGTTTT
| NCCGATGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGTTCTGTACCCCATTTT
TAATTGGGGTTATTCCGTTCTCTGAAGACACCAAACCCAGACACTATTGC
TGACGCCAAGAAGCTCTTGCTGACAGACTGGTATAGCTGTCCCCTGTGAG
ACTCTACCGGAGACTGACCAATACAGAGGCAGATGTTTACAGCCAACCAT
CAGACTAAGCACAGGTACCTCAATGGGGAAGGATTGAAGGAGCTAAAAGG
GGTTTTCAACCCCACAAGAAGAAAAACAATATCAACTAACCAGAGACCCC
AGGAACTAAAACACCAACCAACAAGTACACATGGAGGGACCCATGGCACC
AACTGTATATGTAGCAAAGGATTGCCTAATCTGGCATCAATAGGAGGGGA
GGCCTTTGGTCCTGTGAAGACTTGATGCCCCATTATAGGGAAATGCTAGA
GCACTGAGGTGGGGGTTGGAGGGAAACACCCTTATAGAAGCAGGGGGATG
GGATGGGGGTTTGCAGAGTTAAAATCAAGAAGGGGGATAACAGTTGAAAT
GTAAATAAAAATACCACCATTTAATAGATAAGATCTGAACAAAACAGTCC
TTGCTTTGAAAAGTCTGCTTTAAATGTTACTCTTGCTCTGATTTTTCATT
GAT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 10 10 12 11 20 29 27 20 19 13 10 9 17 8 8 8 15 19 33 43 43 31 31 31 23 19 10 14 9 12 9 12 12 12 15 15 22 19 21 21 24 24 37 37
44 36 36 36 36 33 48 50 37 37 34 28 16 13 11 11 11 11 22 23 37 33 33 33 33 33 36 47 50 36 36 36 36 37 37 37 47 47 40 40 42 47 47 57 57 68 68 57 57 68
68 50 53 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 46 46 47 47 47 50 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 50 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 68 57 57 41 41 57 57 57 57 57 68
68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 34 33 11 9 9 33 33 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 34 34 12 15 15 41 38 68 68 57 57 50 43 42 43 43 43 27 33 33 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 59 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50 50 50 50 47 47 23 19 9 9 9 19 21 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57
57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 48 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 32 32 13 18 15 34 32 57 57
57 48 48 44 46 43 46 46 57 47 57 54 48 48 50 48 48 47 48 48 54 54 54 59 57 57 54 54 48 57 48 48 43 43 43 43 43 43 43 57 46 48 48 57 57 57 48 48 48 46
46 39 39 32 22 22 10 10 10 12 16 25 34 34 47 47 40 43 43 43 43 59 59 50 47 47 39 39 35 31 31 32 25 24 28 28 34 34 40 40 47 47 39 39 37 37 37 39 30 28
17 26 29 37 31 31 39 32 32 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 10 12 11 9 9 17 16 10 10 10 16 24 32 30 30 41 42 33 33 33 33 33 33 39 23 21 9 9 9 11 9 9 9 9 9 9 19 18 26 17 21 30 30 33 36
36 48 50 50 36 36 42 29 23 18 13 13 11 10 15 19 17 21 26 23 36 40 40 41 42 53 68 68 68 68 50 40 40 40 40 40 40 48 43 43 46 51 51 51 50 50 50 50 57 57
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 68 68 51 51 50 50 50 51 51 51 51 68 51 50 50 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68
27 27 9 9 9 27 27 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57
52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43
43 43 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 39 28 16 20 16 13 13 15 26 43 44 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 45 45 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57
57 57 68 57 57 50 50 43 50 59 48 57 57 50 50 44 50 43 50 47 59 57 57 54 59 59 68 68 59 59 54 54 54 57 57 54 47 47 47 43 43 47 46 54 54 46 46 43 43 43
47 44 43 43 42 44 39 43 43 47 47 36 33 30 41 41 43 43 43 43 43 37 37 30 37 37 43 43 43 57 57 48 48 43 43 43 39 32 30 30 37 37 37 35 35 30 37 37 37 27
20 28 32 34 34 31 31 35 37 37 43 33 33 33 33 26 26 20 20 20 24 24 28 23 22 16 12 12 12 16 19 24 26 19 19 17 19 18 14 18 18 18 15 14 19 24 17 17 21 15
12 12 15 12 12 12 12 12 12 12 16 16 12 12 11 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 12 12 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 12 12 12 11 12 13 9 9 9 13 24 25 37
34 33 28 25 25 28 31 33 22 19 19 22 18 18 10 12 8 8 8 17 17 20 19 17 17 9 9 9 10 10 10 13 30 30 37 28 28 28 27 30 22 22 19 11 15 11 8 8 8 13
15 18 14 |